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544 Publikationen

2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710114
Townsend, P. D.; Jungwirth, B.; Pojer, F.; Bußmann, M.; Money, V. A.; Cole, S. T.; Pühler, A.; Tauch, A.; Bott, M.; Cann, M. J.; Pohl, E. (2014): The Crystal Structures of Apo and cAMP-Bound GlxR from Corynebacterium glutamicum Reveal Structural and Dynamic Changes upon cAMP Binding in CRP/FNR Family Transcription Factors PloS one,9:(12): 113265.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710431
Wendler, S.; Ortseifen, V.; Persicke, M.; Klein, A.; Neshat, A.; Niehaus, K.; Schneiker-Bekel, S.; Walter, F.; Wehmeier, U. F.; Kalinowski, J.; Pühler, A. (2014): Carbon source dependent biosynthesis of acarviose metabolites in Actinoplanes sp SE50/110 Journal of Biotechnology,191: 113-120.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676049
Schlüter, A.; Nordmann, P.; Bonnin, R. A.; Millemann, Y.; Eikmeyer, F. G.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Poirel, L. (2014): IncH-type plasmid harboring the blaCTX-M-15, blaDHA-1, and qnrB4 genes recovered from animal isolates Antimicrobial Agents and Chemotherapy,58:(7): 3768-3773.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662055
Wibberg, D.; Luque-Almagro, V. M.; Igeño, M. I.; Bremges, A.; Roldán, M. D.; Merchán, F.; Sáez, L. P.; Guijo, M. I.; Manso, M. I.; Macías, D.; Cabello, P.; Becerra, G.; Ibáñez, M. I.; Carmona, M. I.; Escribano, M. P.; Castillo, F.; Sczyrba, A.; Moreno-Vivián, C.; Blasco, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2014): Complete genome sequence of the cyanide-degrading bacterium Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344 Journal of biotechnology,175: 67-68.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631969
Mentz, A.; Neshat, A.; Pfeifer-Sancar, K.; Pühler, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): Comprehensive discovery and characterization of small RNAs in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 BMC Genomics,14:(1): 714.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605193
Eikmeyer, F. G.; Rademacher, A.; Hanreich, A.; Hennig, M.; Jaenicke, S.; Maus, I.; Wibberg, D.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2013): Detailed analysis of metagenome datasets obtained from biogas-producing microbial communities residing in biogas reactors does not indicate the presence of putative pathogenic microorganisms Biotechnology for Biofuels,6:(1):49
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548270
Jungwirth, B.; Sala, C.; Kohl, T. A.; Uplekar, S.; Baumbach, J.; Cole, S. T.; Pühler, A.; Tauch, A. (2013): High-resolution detection of DNA binding sites of the global transcriptional regulator GlxR in Corynebacterium glutamicum Microbiology,159:(Pt_1): 12-22.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2549908
Wibberg, D.; Jelonek, L.; Rupp, O.; Kröber, M.; Eikmeyer, F. G.; Goesmann, A.; Hartmann, A.; Borriss, R.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2013): Establishment and interpretation of the genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB isolate 7/3/14 Journal of Biotechnology,167:(2): 142-155.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2633427
Wibberg, D.; Blom, J.; Rückert, C.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Scharf, B. E. (2013): Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti RU11/001, a model organism for flagellum structure, motility and chemotaxis Journal of Biotechnology,168:(4): 731-733.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Köhler, K. A. K.; Rückert, C.; Schatschneider, S.; Vorhölter, F. - J.; Szczepanowski, R.; Blank, L. M.; Niehaus, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Schmid, A. (2013): Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil Journal of Biotechnology,168:(4): 729-730.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614906
Wendler, S.; Hürtgen, D.; Kalinowski, J.; Klein, A.; Niehaus, K.; Schulte, F.; Schwientek, P.; Wehlmann, H.; Wehmeier, U. F.; Pühler, A. (2013): The cytosolic and extracellular proteomes of Actinoplanes sp. SE50/110 led to the identification of gene products involved in acarbose metabolism Journal of Biotechnology,167:(2): 178-189.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581
Brinkrolf, K.; Rupp, O.; Laux, H.; Kollin, F.; Ernst, W.; Linke, B.; Kofler, R.; Romand, S.; Hesse, F.; Budach, W. E.; Galosy, S.; Müller, D.; Noll, T.; Wienberg, J.; Jostock, T.; Leonard, M.; Grillari, J.; Tauch, A.; Goesmann, A.; Helk, B.; Mott, J. E.; Pühler, A.; Borth, N. (2013): Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes Nature Biotechnology,31:(8): 694-695.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645247
Maus, I.; Wibberg, D.; Stantscheff, R.; Cibis, K.; Eikmeyer, F. G.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2013): Complete genome sequence of the hydrogenotrophic Archaeon Methanobacterium sp Mb1 isolated from a production-scale biogas plant Journal of Biotechnology,168:(4): 734-736.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2565642
Dagan, T.; Roettger, M.; Stucken, K.; Landan, G.; Koch, R.; Major, P.; Gould, S. B.; Goremykin, V. V.; Rippka, R.; de Marsac, N. T.; Gugger, M.; Lockhart, P. J.; Allen, J. F.; Brune, I.; Maus, I.; Pühler, A.; Martin, W. F. (2013): Genomes of Stigonematalean Cyanobacteria (Subsection V) and the Evolution of Oxygenic Photosynthesis from Prokaryotes to Plastids Genome Biology And Evolution,5:(1): 31-44.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605230
Hanreich, A.; Schimpf, U.; Zakrzewski, M.; Schlüter, A.; Benndorf, D.; Heyer, R.; Rapp, E.; Pühler, A.; Reichl, U.; Klocke, M. (2013): Metagenome and metaproteome analyses of microbial communities in mesophilic biogas-producing anaerobic batch fermentations indicate concerted plant carbohydrate degradation Systematic and Applied Microbiology,36:(5): 330-338.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605244
Schatschneider, S.; Persicke, M.; Watt, T.; Hublik, G.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Vorhölter, F. - J. (2013): Establishment, in silico analysis, and experimental verification of a large-scale metabolic network of the xanthan producing Xanthomonas campestris pv. campestris strain B100 Journal of Biotechnology,167:(2): 123-134.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631956
Rückert, C.; Szczepanowski, R.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Iftime, D.; Musiol, E. M.; Blin, K.; Wohlleben, W.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Weber, T. (2013): Complete genome sequence of the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365 consisting of a linear chromosome and two linear plasmids Journal of Biotechnology,168:(4): 739-740.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2635526
Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Koellmeier, T.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Zverlov, V. V.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2013): Draft genome sequence of the cellulolytic Clostridium thermocellum wild-type strain BC1 playing a role in cellulosic biomass degradation Journal of Biotechnology,168:(1): 62-63.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557779
Weidner, S.; Baumgarth, B.; Göttfert, M.; Jaenicke, S.; Pühler, A.; Schneiker-Bekel, S.; Serrania, J.; Szczepanowski, R.; Becker, A. (2013): Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Rm41 Genome Announcements,1:(1): e00013-12.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557080
Bonnin, R. A.; Poirel, L.; Nordmann, P.; Eikmeyer, F. G.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2013): Complete sequence of broad-host-range plasmid pNOR-2000 harbouring the metallo-beta-lactamase gene blaVIM-2 from Pseudomonas aeruginosa Journal of Antimicrobial Chemotherapy,68:(5): 1060-1065.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
Eikmeyer, F. G.; Köfinger, P.; Poschenel, A.; Jünemann, S.; Zakrzewski, M.; Heinl, S.; Mayrhuber, E.; Grabherr, R.; Pühler, A.; Schwab, H.; Schlüter, A. (2013): Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging Journal of Biotechnology,167:(3): 334-343.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548236
Schwientek, P.; Wendler, S.; Neshat, A.; Eirich, C.; Rückert, C.; Klein, A.; Wehmeier, U. F.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Pühler, A. (2013): Comparative RNA-sequencing of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 cultivated in different growth media Journal of Biotechnology,167:(2): 166-177.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548286
Luque-Almagro, V. M.; Acera, F.; Igeño, M. I.; Wibberg, D.; Roldán, M. D.; Sáez, L. P.; Hennig, M.; Quesada, A.; Huertas, M. J.; Blom, J.; Merchán, F.; Escribano, M. P.; Jaenicke, S.; Estepa, J.; Guijo, M. I.; Martínez-Luque, M.; Macías, D.; Szczepanowski, R.; Becerra, G.; Ramirez, S.; Carmona, M. I.; Gutiérrez, O.; Manso, I.; Pühler, A.; Castillo, F.; Moreno-Vivián, C.; Schlüter, A.; Blasco, R. (2013): Draft whole genome sequence of the cyanide-degrading bacterium Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344 Environmental Microbiology,15:(1): 253-270.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555355
Plassmeier, J.; Busche, T.; Molck, S.; Persicke, M.; Pühler, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): A propionate-inducible expression system based on the Corynebacterium glutamicum prpD2 promoter and PrpR activator and its application for the redirection of amino acid biosynthesis pathways Journal of Biotechnology,163:(2): 225-232.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2546244
Wibberg, D.; Szczepanowski, R.; Eikmeyer, F. G.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2013): The IncF plasmid pRSB225 isolated from a municipal wastewater treatment plant’s on-site preflooder combining antibiotic resistance and putative virulence functions is highly related to virulence plasmids identified in pathogenic E. coli isolates Plasmid,69:(2): 127-137.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529202
Zakrzewski, M.; Bekel, T.; Ander, C.; Pühler, A.; Rupp, O.; Stoye, J.; Schlüter, A.; Goesmann, A. (2013): MetaSAMS - A novel software platform for taxonomic classification, functional annotation and comparative analysis of metagenome datasets Journal of Biotechnology,167:(2): 156-165.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2553286
Jungbauer, A.; Scheper, T.; Pühler, A. (2012): Current research and future perspectives of applied biotechnology Journal of Biotechnology,162:(4): 355.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473849
Weidner, S.; Becker, A.; Bonilla, I.; Jaenicke, S.; Lloret, J.; Margaret, I.; Pühler, A.; Ruiz-Sainz, J. E.; Schneiker-Bekel, S.; Szczepanowski, R.; Vinardell, J. M.; Zehner, S.; Göttfert, M. (2012): Genome Sequence of the Soybean Symbiont Sinorhizobium fredii HH103 Journal of Bacteriology,194:(6): 1617-1618.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Zakrzewski, M.; Goesmann, A.; Jaenicke, S.; Jünemann, S.; Eikmeyer, F. G.; Szczepanowski, R.; Al-Soud, W. A.; Sørensen, S.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2012): Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing Journal of Biotechnology,158:(4): 248-258.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2537690
Vorhölter, F. - J.; Wiggerich, H. - G.; Scheidle, H.; Sidhu, V. K.; Mrozek, K.; Küster, H.; Pühler, A.; Niehaus, K. (2012): Involvement of bacterial TonB-dependent signaling in the generation of an oligogalacturonide damage-associated molecular pattern from plant cell walls exposed to Xanthomonas campestris pv. campestris pectate lyases BMC Microbiology,12:(1): 239.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2472279
Eikmeyer, F. G.; Hadiati, A.; Szczepanowski, R.; Wibberg, D.; Schneiker-Bekel, S.; Rogers, L. M.; Brown, C. B.; Top, E. M.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2012): The complete genome sequences of four new IncN plasmids from wastewater treatment plant effluent provide new insights into IncN plasmid diversity and evolution Plasmid,68:(1): 13-24.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535
Heinl, S.; Wibberg, D.; Eikmeyer, F. G.; Szczepanowski, R.; Blom, J.; Linke, B.; Goesmann, A.; Grabherr, R.; Schwab, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2012): Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silage Journal of Biotechnology,161:(2): 153-166.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471681
Rademacher, A.; Zakrzewski, M.; Schlüter, A.; Schonberg, M.; Szczepanowski, R.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Klocke, M. (2012): Characterization of microbial biofilms in a thermophilic biogas system by high-throughput metagenome sequencing FEMS Microbiology Ecology,79:(3): 785-799.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486060
Schwientek, P.; Szczepanowski, R.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Klein, A.; Selber, K.; Wehmeier, U. F.; Stoye, J.; Pühler, A. (2012): The complete genome sequence of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 BMC Genomics,13:(1):112
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501307
Pietruszka, J.; Pühler, A.; Schembecker, G. (2012): Research on industrial biotechnology within the CLIB-Graduate Cluster - Part I Journal of Biotechnology,159:(3): 121-122.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501364
Meleady, P.; Hoffrogge, R.; Henry, M.; Rupp, O.; Bort, J. H.; Clarke, C.; Brinkrolf, K.; Kelly, S.; Müller, B.; Doolan, P.; Hackl, M.; Beckmann, T.; Noll, T.; Grillari, J.; Barron, N.; Pühler, A.; Clynes, M.; Borth, N. (2012): Utilization and evaluation of CHO-specific sequence databases for mass spectrometry based proteomics Biotechnology and Bioengineering,109:(6): 1386-1394.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526
Hackl, M.; Jadhav, V.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Noll, T.; Borth, N.; Grillari, J. (2012): Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines Journal of Biotechnology,158:(3): 151-155.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501774
Wendisch, V. F.; Pühler, A. (2012): Microbes and industrial biotechnology Journal of Biotechnology,158:(4): 157-158.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500966
Hain, T.; Ghai, R.; Billion, A.; Kuenne, C. T.; Steinweg, C.; Izar, B.; Mohamed, W.; Mraheil, M.; Domann, E.; Schaffrath, S.; Kärst, U.; Goesmann, A.; Oehm, S.; Pühler, A.; Merkl, R.; Vorwerk, S.; Glaser, P.; Garrido, P.; Rusniok, C.; Buchrieser, C.; Goebel, W.; Chakraborty, T. (2012): Comparative genomics and transcriptomics of lineages I, II, and III strains of Listeria monocytogenes BMC Genomics,13:(1): 144.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774
Schneider, J.; Andrea, H.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Rückert, C.; Schorsch, C.; Szczepanowski, R.; Farwick, M.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Schaffer, S.; Tauch, A.; Köhler, T.; Brinkrolf, K. (2012): Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10 Eukaryotic Cell,11:(12): 1582-1583.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526269
Strobel, T.; Al-Dilaimi, A.; Blom, J.; Gessner, A.; Kalinowski, J.; Luzhetska, M.; Pühler, A.; Szczepanowski, R.; Bechthold, A.; Rückert, C. (2012): Complete genome sequence of Saccharothrix espanaensis DSM 44229T and comparison to the other completely sequenced Pseudonocardiaceae BMC Genomics,13:(1): 465.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529610
Schork, S.; Schlüter, A.; Blom, J.; Schneiker-Bekel, S.; Pühler, A.; Goesmann, A.; Frosch, M.; Schoen, C. (2012): Genome Sequence of a Neisseria meningitidis Capsule Null Locus Strain from the Clonal Complex of Sequence Type 198 Journal of Bacteriology,194:(18): 5144-5145.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526298
Maus, I.; Wibberg, D.; Stantscheff, R.; Eikmeyer, F. G.; Seffner, A.; Boelter, J.; Szczepanowski, R.; Blom, J.; Jaenicke, S.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2012): Complete Genome Sequence of the Hydrogenotrophic, Methanogenic Archaeon Methanoculleus bourgensis Strain MS2T, Isolated from a Sewage Sludge Digester Journal of Bacteriology,194:(19): 5487-5488.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2513297
Pauling, J.; Rottger, R.; Neuner, A.; Salgado, H.; Collado-Vides, J.; Kalaghatgi, P.; Azevedo, V.; Tauch, A.; Pühler, A.; Baumbach, J. (2012): On the trail of EHEC/EAEC-unraveling the gene regulatory networks of human pathogenic Escherichia coli bacteria Integrative Biology,4:(7): 728-733.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354746
Schwientek, P.; Szczepanowski, R.; Rückert, C.; Stoye, J.; Pühler, A. (2011): Sequencing of high G + C microbial genomes using the ultrafast pyrosequencing technology Journal of Biotechnology,155:(1): 68-77.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2401477
Mattiasson, B.; Pühler, A. (2011): Towards sustainable biotechnology Journal of Biotechnology,152:(4): 113.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375634
Pothier, J. F.; Vorhölter, F. - J.; Blom, J.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Smits, T. H.; Duffy, B. (2011): The ubiquitous plasmid pXap41 in the invasive phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni: complete sequence and comparative genomic analysis FEMS Microbiology Letters,323:(1): 52-60.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354731
Wibberg, D.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Kollin, F.; Rupp, O.; Scharf, B.; Schneiker-Bekel, S.; Szczepanowski, R.; Goesmann, A.; Setubal, J. C.; Schmitt, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2011): Complete genome sequencing of Agrobacterium sp. H13-3, the former Rhizobium lupini H13-3, reveals a tripartite genome consisting of a circular and a linear chromosome and an accessory plasmid but lacking a tumor-inducing Ti-plasmid Journal of Biotechnology,155:(1): 50-62.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371
Küberl, A.; Schneider, J.; Thallinger, G. G.; Anderl, I.; Wibberg, D.; Hajek, T.; Jaenicke, S.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Szczepanowski, R.; Pühler, A.; Schwab, H.; Glieder, A.; Pichler, H. (2011): High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435 Journal of Biotechnology,154:(4): 312-320.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Becker, J.; Hackel, M.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Borth, N.; Goesmann, A.; Grillari, J.; Kaltschmidt, C.; Noll, T.; Pühler, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2011): Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing Journal of Biotechnology,156:(3): 227-235.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289494
Persicke, M.; Plassmeier, J.; Neuweger, H.; Rückert, C.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2011): Size exclusion chromatography-An improved method to harvest Corynebacterium glutamicum cells for the analysis of cytosolic metabolites Journal of Biotechnology,154:(2-3): 171-178.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375954
Borriss, R.; Chen, X. - H.; Rückert, C.; Blom, J.; Becker, A.; Baumgarth, B.; Fan, B.; Pukall, R.; Schumann, P.; Sproer, C.; Junge, H.; Vater, J.; Pühler, A.; Klenk, H. - P. (2011): Relationship of Bacillus amyloliquefaciens clades associated with strains DSM 7T and FZB42T: a proposal for Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens subsp. nov. and Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum subsp. nov. based on complete genome sequence comparisons Int J Syst Evol Microbiol,61:(8): 1786-1801.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326481
Mayer, L.; Vendruscolo, C. T.; da Silva, W. P.; Vorhölter, F. - J.; Becker, A.; Pühler, A. (2011): Insights into the genome of the xanthan-producing phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni 109 by comparative genomic hybridization Journal of Biotechnology,155:(1): 40-49.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404808
Plassmeier, J.; Persicke, M.; Pühler, A.; Sterthoff, C.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2011): Molecular characterization of PrpR, the transcriptional activator of propionate catabolism in Corynebacterium glutamicum Journal of Biotechnology,159:(1-2): 1-11.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Becker, J.; Timmermann, C.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Szczepanowski, R.; Hackl, M.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Borth, N.; Grillari, J.; Pühler, A.; Noll, T.; Brinkrolf, K. (2011): Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome, In: Hansjörg Hauser (Hrsg.), BMC Proceedings,5:(Suppl. 8): P6.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404874
Schatschneider, S.; Vorhölter, F. - J.; Rückert, C.; Becker, A.; Eisenreich, W.; Pühler, A.; Niehaus, K. (2011): Genome-enabled determination of amino acid biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris and identification of biosynthetic pathways for alanine, glycine, and isoleucine by 13C-isotopologue profiling Molecular Genetics and Genomics,286:(3-4): 247-259.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Jaenicke, S.; Zakrzewski, M.; Jünemann, S.; Pühler, A.; Goesmann, A.; Schlüter, A. (2011): Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods. In: Frans J. de Bruijn (Hrsg.): Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. Wiley-Blackwell. S. 403-414.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317680
Zhou, L.; Vorhölter, F. - J.; He, Y. - Q.; Jiang, B. - L.; Tang, J. - L.; Xu, Y.; Pühler, A.; He, Y. - W. (2011): Gene discovery by genome-wide CDS re-prediction and microarray-based transcriptional analysis in phytopathogen Xanthomonas campestris BMC Genomics,12:(1): 359.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892
Schneiker-Bekel, S.; Wibberg, D.; Bekel, T.; Blom, J.; Linke, B.; Neuweger, H.; Stiens, M.; Vorhölter, F. - J.; Weidner, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Schlüter, A. (In Press): The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genome Journal of Biotechnology,155:(1): 20-33.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Jaenicke, S.; Ander, C.; Bekel, T.; Bisdorf, R.; Dröge, M.; Gartemann, K. - H.; Jünemann, S.; Kaiser, O.; Krause, L.; Tille, F.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Goesmann, A. (2011): Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing PLoS ONE,6:(1): e14519.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955
Hackl, M.; Jakobi, T.; Blom, J.; Doppmeier, D.; Brinkrolf, K.; Szczepanowski, R.; Bernhart, S. H.; Höner zu Siederdissen, C.; Bort, J. A. H.; Wieser, M.; Kunert, R.; Jeffs, S.; Hofacker, I. L.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Borth, N.; Grillari, J. (2011): Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering Journal of Biotechnology,153:(1-2): 62-75.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1968039
Torres Tejerizo, G.; Florencia Del Papa, M.; Eugenia Soria-Diaz, M.; Draghi, W.; Lozano, M.; de los Angeles Giusti, M.; Manyani, H.; Megias, M.; Gil Serrano, A.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Lagares, A.; Pistorio, M. (2011): The Nodulation of Alfalfa by the Acid-Tolerant Rhizobium sp. Strain LPU83 Does Not Require Sulfated Forms of Lipochitooligosaccharide Nodulation Signals Journal of Bacteriology,193:(1): 30-39.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486400
Kalinowski, J.; Rückert, C.; Szczepanowski, R.; Pühler, A. (2010): Advanced Genomics and Transcriptomics of Industrial Microorganisms Chemie Ingenieur Technik,82:(9): 1518-1519.
PUB | DOI
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1903875
de Lucena, D. K.; Pühler, A.; Weidner, S. (2010): The role of sigma factor RpoH1 in the pH stress response of Sinorhizobium meliloti BMC Microbiology,10:(1): 256.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275
Trost, E.; Götker, S.; Schneider, J.; Schneiker-Bekel, S.; Szczepanowski, R.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Arnold, W.; Bekel, T.; Blom, J.; Gartemann, K. - H.; Linke, B.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Shukla, S. K.; Tauch, A. (2010): Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion BMC Genomics,11:(1):91
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588692
Steinweg, C.; Kuenne, C. T.; Billion, A.; Mraheil, M. A.; Domann, E.; Ghai, R.; Barbuddhe, S. B.; Kaerst, U.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Weisshaar, B.; Wehland, J.; Lampidis, R.; Kreft, J.; Goebel, W.; Chakraborty, T.; Hain, T. (2010): Complete Genome Sequence of Listeria seeligeri, a Nonpathogenic Member of the Genus Listeria Journal of Bacteriology,192:(5): 1473-1474.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929311
Gölzhäuser, A.; Nattkemper, T. W.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Sauer, M. (2010): BioImaging: Contributions from biology, physics and informatics Journal of Biotechnology,149:(4): 227-228.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635309
Hellweg, C.; Pühler, A.; Weidner, S. (2009): The time course of the transcriptomic response of Sinorhizobium meliloti 1021 following a shift to acidic pH BMC MICROBIOLOGY,9:(1): 37.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187
Blom, J.; Albaum, S.; Doppmeier, D.; Pühler, A.; Vorhölter, F. - J.; Zakrzewski, M.; Goesmann, A. (2009): EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes BMC Bioinformatics,10:(1):154
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951
Nentwich, S. S.; Brinkrolf, K.; Gaigalat, L.; Hueser, A. T.; Rey, D. A.; Mohrbach, T.; Marin, K.; Pühler, A.; Tauch, A.; Kalinowski, J. (2009): Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 MICROBIOLOGY,155:(1): 150-164.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634097
Strittmatter, A. W.; Liesegang, H.; Rabus, R.; Decker, I.; Amann, J.; Andres, S.; Henne, A.; Fricke, W. F.; Martinez-Arias, R.; Bartels, D.; Goesmann, A.; Krause, L.; Pühler, A.; Klenk, H. - P.; Richter, M.; Schueler, M.; Gloeckner, F. O.; Meyerdierks, A.; Gottschalk, G.; Amann, R. (2009): Genome sequence of Desulfobacterium autotrophicum HRM2, a marine sulfate reducer oxidizing organic carbon completely to carbon dioxide ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY,11:(5): 1038-1055.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634443
Pühler, A.; Selbitschka, W. (2009): Functional genome research on bacteria relevant for agriculture, environment and biotechnology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,140:(1-2): 1-2.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634467
Becker, A.; Barnett, M. J.; Capela, D.; Dondrup, M.; Kamp, P. - B.; Krol, E.; Linke, B.; Rüberg, S.; Runte, K.; Schroeder, B. K.; Weidner, S.; Yurgel, S. N.; Batut, J.; Long, S. R.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2009): A portal for rhizobial genomes: RhizoGATE integrates a Sinorhizobium meliloti genome annotation update with postgenome data JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,140:(1-2): 45-50.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup, M.; Albaum, S.; Griebel, T.; Henckel, K.; Jünemann, S.; Kahlke, T.; Kleindt, C. K.; Kuester, H.; Linke, B.; Mertens, D.; Mittard-Runte, V.; Neuweger, H.; Runte, K. J.; Tauch, A.; Tille, F.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2009): EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data BMC Bioinformatics,10:(1):50
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591546
Szczepanowski, R.; Linke, B.; Krahn, I.; Gartemann, K. - H.; Guetzkow, T.; Eichler, W.; Pühler, A.; Schlueter, A. (2009): Detection of 140 clinically relevant antibiotic-resistance genes in the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to selected antibiotics MICROBIOLOGY,155:(7): 2306-2319.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591844
Kroeber, M.; Bekel, T.; Diaz, N. N.; Goesmann, A.; Jaenicke, S.; Krause, L.; Miller, D.; Runte, K. J.; Viehoever, P.; Pühler, A.; Schlueter, A. (2009): Phylogenetic characterization of a biogas plant microbial community integrating clone library 16S-rDNA sequences and metagenome sequence data obtained by 454-pyrosequencing JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,142:(1): 38-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633812
Jochmann, N.; Kurze, A. - K.; Czaja, L. F.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Hueser, A. T.; Hansmeier, N.; Pühler, A.; Borovok, I.; Tauch, A. (2009): Genetic makeup of the Corynebacterium glutamicum LexA regulon deduced from comparative transcriptomics and in vitro DNA band shift assays MICROBIOLOGY,155:(5): 1459-1477.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447
Bekel, T.; Henckel, K.; Küster, H.; Meyer, F.; Mittard-Runte, V.; Neuweger, H.; Paarmann, D.; Rupp, O.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Stoye, J.; Goesmann, A. (2009): The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies Journal of Biotechnology,140:(1-2): 3-12.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292
Gross, R.; Guzman, C. A.; Sebaihia, M.; Martins dos Santos, V. A. P.; Pieper, D. H.; Koebnik, R.; Lechner, M.; Bartels, D.; Buhrmester, J.; Choudhuri, J. V.; Ebensen, T.; Gaigalat, L.; Herrmann, S.; Khachane, A. N.; Larisch, C.; Link, S.; Linke, B.; Meyer, F.; Mormann, S.; Nakunst, D.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Schulze, K.; Vorhölter, F. - J.; Yevsa, T.; Engle, J. T.; Goldman, W. E. .; Pühler, A.; Göbel, U. B.; Goesmann, A.; Blöcker, H.; Kaiser, O.; Martinez-Arias, R. (2008): The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic Bordetellae BMC Genomics,9:(1): 449.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024
Vorhölter, F. - J.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Krause, L.; Bekel, T.; Kaiser, O.; Linke, B.; Patschkowski, T.; Rückert, C.; Schmid, J.; Sidhu, V. K.; Sieber, V.; Tauch, A.; Watt, S. A.; Weisshaar, B.; Becker, A.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2008): The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis Journal of Biotechnology,134:(1-2): 33-45.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585980
Schlueter, A.; Krause, L.; Szczepanowski, R.; Goesmann, A.; Pühler, A. (2008): Genetic diversity and composition of a plasmid metagenome from a wastewater treatment plant Journal of Biotechnology,136:(1-2): 65-76.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078
Brinkrolf, K.; Ploeger, S.; Solle, S.; Brune, I.; Nentwich, S. S.; Hueser, A. T.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Tauch, A. (2008): The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences MICROBIOLOGY,154:(4): 1068-1081.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592318
Meschini, E. P.; Blanco, F. A.; Zanetti, M. E.; Beker, M. P.; Küster, H.; Pühler, A.; Aguilar, O. M. (2008): Host genes involved in nodulation preference in common bean (Phaseolus vulgaris)-Rhizobium etli symbiosis revealed - by suppressive subtractive hybridization MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS,21:(4): 459-468.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585560
Rückert, C.; Milse, J.; Albersmeier, A.; Koch, D. J.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2008): The dual transcriptional regulator CysR in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 controls a subset of genes of the McbR regulon in response to the availability of sulphide acceptor molecules BMC GENOMICS,9:(1): 483.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585914
Pühler, A.; Selbitschka, W. (2008): Genome research in the light of ultrafast sequencing technologies JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 1-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585969
Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Goesmann, A.; Krause, L.; Kroemeke, H.; Kaiser, O.; Eichler, W.; Pühler, A.; Schlueter, A. (2008): Insight into the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to antimicrobial drugs analysed by the 454-pyrosequencing technology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 54-64.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592210
Jungwirth, B.; Emer, D.; Brune, I.; Hansmeier, N.; Pühler, A.; Eikmanns, B. J.; Tauch, A. (2008): Triple transcriptional control of the resuscitation promoting factor 2 (rpf2) gene of Corynebacterium glutamicum by the regulators of acetate metabolism RamA and RamB and the cAMP-dependent regulator GlxR FEMS MICROBIOLOGY LETTERS,281:(2): 190-197.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Krause, L.; Diaz, N. N.; Edwards, R. A.; Gartemann, K. - H.; Krömeke, H.; Neuweger, H.; Pühler, A.; Runte, K. J.; Schlüter, A.; Stoye, J.; Szczepanowski, R.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2008): Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 91-101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586869
Serrania, J.; Vorhölter, F. - J.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Becker, A. (2008): Identification of Xanthomonas campestris pv. campestris galactose utilization genes from transcriptome data Journal of Biotechnology,135:(3): 309-317.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585956
Stiens, M.; Becker, A.; Bekel, T.; Gödde, V.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Schneiker-Bekel, S.; Selbitschka, W.; Weidner, S.; Schlüter, A.; Pühler, A. (2008): Comparative genomic hybridisation and ultrafast pyrosequencing revealed remarkable differences between the Sinorhizobium meliloti genomes of the model strain Rm1021 and the field isolate SM11 Journal of Biotechnology,136:(1-2): 31-37.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987
Schlüter, A.; Bekel, T.; Diaz, N. N.; Dondrup, M.; Eichenlaub, R.; Gartemann, K. - H.; Krahn, I.; Krause, L.; Kroemeke, H.; Kruse, O.; Mussgnug, J. H.; Neuweger, H.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Runte, K. J.; Szczepanowski, R.; Tauch, A.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Goesmann, A. (2008): The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology Journal of Biotechnology,136:(1-2): 77-90.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586719
Kohl, T.; Baumbach, J.; Jungwirth, B.; Pühler, A.; Tauch, A. (2008): The GlxR regulon of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum: In silico and in vitro detection of DNA binding sites of a global transcription regulator JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,135:(4): 340-350.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918
Tauch, A.; Trost, E.; Tilker, A.; Ludewig, U.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Arnold, W.; Bekel, T.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Kalinowski, J.; Kamp, P. - B.; Lobo, F. P.; Viehöver, P.; Weisshaar, B.; Soriano, F.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing Journal of Biotechnology,136:(1-2): 11-21.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592345
Gartemann, K. - H.; Abt, B.; Bekel, T.; Burger, A.; Engemann, J.; Fluegel, M.; Gaigalat, L.; Goesmann, A.; Graefen, I.; Kalinowski, J.; Kaup, O.; Kirchner, O.; Krause, L.; Linke, B.; McHardy, A.; Meyer, F.; Pohle, S.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Zellermann, E. - M.; Pühler, A.; Eichenlaub, R.; Kaiser, O.; Bartels, D. (2008): The genome sequence of the tomato-pathogenic actinomycete Clavibacter michiganensis subsp michiganensis NCPPB382 reveals a large island involved in pathogenicity JOURNAL OF BACTERIOLOGY,190:(6): 2138-2149.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Tauch, A.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Gartemann, K. - H.; Arnold, W.; Blom, J.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Weisshaar, B.; Goesmann, A.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids Journal of Biotechnology,136:(1-2): 22-30.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631126
Kuhn, S.; Stiens, M.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2008): Prevalence of pSmeSM11a-like plasmids in indigenous Sinorhizobium meliloti strains isolated in the course of a field release experiment with genetically modified S-meliloti strains FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY,63:(1): 118-131.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1990198
Strauch, E.; Hammerl, J. A.; Konietzny, A.; Schneiker-Bekel, S.; Arnold, W.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Beutin, L. (2008): Bacteriophage 2851 is a prototype phage for dissemination of the Shiga toxin variant gene 2c in Escherichia coli O157:H7 Infection and Immunity,76:(12): 5466-5477.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914794
Schotter, J.; Panhorst, M.; Brzeska, M.; Kamp, P. - B.; Becker, A.; Pühler, A.; Reiss, G.; Brückl, H. (2007): Molecular Detection with Magnetic Labels and Magnetoresistive Sensors. In: Rudolf Gross; Anatolie Sidorenko; Lenar Tagirov (Hrsg.): Nanoscale Devices - Fundamentals and Applications. Dordrecht: Springer Netherlands. (NATO Science Series, 233). S. 35-46.
PUB | DOI
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783754
Neuweger, H.; Baumbach, J.; Albaum, S.; Bekel, T.; Dondrup, M.; Hüser, A. T.; Kalinowski, J.; Oehm, S.; Pühler, A.; Rahmann, S.; Weile, J.; Goesmann, A. (2007): CoryneCenter: an online resource for the integrated analysis of corynebacterial genome and transcriptome data BMC Systems Biology,1:(1): 55.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327
Schneiker-Bekel, S.; Perlova, O.; Kaiser, O.; Gerth, K.; Alici, A.; Altmeyer, M. O.; Bartels, D.; Bekel, T.; Beyer, S.; Bode, E.; Bode, H. B.; Bolten, C. J.; Choudhuri, J. V.; Doss, S.; Elnakady, Y. A.; Frank, B.; Gaigalat, L.; Goesmann, A.; Groeger, C.; Gross, F.; Jelsbak, L.; Jelsbak, L.; Kalinowski, J.; Kegler, C.; Knauber, T.; Konietzny, S.; Kopp, M.; Krause, L.; Krug, D.; Linke, B.; Mahmud, T.; Martinez-Arias, R.; McHardy, A. C.; Merai, M.; Meyer, F.; Mormann, S.; Munoz-Dorado, J.; Perez, J.; Pradella, S.; Rachid, S.; Raddatz, G.; Rosenau, F.; Rückert, C.; Sasse, F.; Scharfe, M.; Schuster, S. C.; Suen, G.; Treuner-Lange, A.; Velicer, G. J.; Vorhölter, F. - J.; Weissman, K. J.; Welch, R. D.; Wenzel, S. C.; Whitworth, D. E.; Wilhelm, S.; Wittmann, C.; Bloecker, H.; Pühler, A.; Mueller, R. (2007): Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum Nature Biotechnology,25:(11): 1281-1289.
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