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207 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932884
Whole-genome sequence of the bovine blood fluke Schistosoma bovis supports interspecific hybridization with S. haematobium
Oey H, Zakrzewski M, Gravermann K, Young ND, Korhonen PK, Gobert GN, Nawaratna S, Hasan S, Martínez DM, You H, Lavin M, et al. (2019)
PLOS Pathogens 15(1): e1007513.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918481
Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework
Luhmann N, Chauve C, Stoye J, Wittler R (2018)
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 15(6): 2094-2100.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919006
Computing the family-free DCJ similarity
Rubert D, Hoshino EA, Dias Vieira Braga M, Stoye J, Martinez FHV (2018)
BMC Bioinformatics 19(Suppl. 6): 152.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data
Schulz T, Stoye J, Dörr D (2018)
BMC Genomics 19(Suppl. 5): 308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2919356 PUB | PDF
 
2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2918485
Pan-genome Search and Storage
Holley G (2018)
Bielefeld: Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930445
Identifying Maximal Perfect Haplotype Blocks
Cunha L, Diekmann Y, Kowada L, Stoye J (2018)
In: Proceedings of BSB 2018. LNBI, 11228. Springer Verlag: 26-37.
PUB | DOI
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930268
Dynamic Alignment-Free and Reference-Free Read Compression
Holley G, Wittler R, Stoye J, Hach F (2018)
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY 25(7): 825-836.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913921
Pan-genome Storage and Analysis Techniques
Zekic T, Holley G, Stoye J (2018)
In: Comparative Genomics. Methods and Protocols. Setubal JC, Stadler P, Stoye J (Eds); Methods in Molecular Biology, 1704. New York: Springer Verlag: 29-53.
PUB
 
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Family-Free Genome Comparison
Dörr D, Feijão P, Stoye J (2018)
In: Comparative Genomics: Methods and Protocols. Setubal JC, Stadler P, Stoye J (Eds); Methods in Molecular Biology, 1704. New York: Springer Verlag: 331-342.
PUB
 
2018 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913920
Comparative Genomics: Methods and Protocols
Setubal JC, Stadler P, Stoye J (Eds) (2018) Methods in Molecular Biology; 1704.
New York: Springer Verlag.
PUB
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919012
Flexible metagenome analysis using the MGX framework
Jaenicke S, Albaum S, Blumenkamp P, Linke B, Stoye J, Goesmann A (2018)
Microbiome 6: 76.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research
Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, et al. (2017)
Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913015
Algorithms for Computing the Family-Free Genomic Similarity under DCJ
Rubert D, Medeiros GL, Hoshino EA, Dias Vieira Braga M, Stoye J, Martinez FHV (2017)
In: Comparative Genomics. RECOMB-CG 2017. Meidanis J, Nakhleh L (Eds); Lecture Notes in Bioinformatics, 10562. Cham: Springer Verlag: 76-100.
PUB | DOI
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909057
Approximating the DCJ distance of balanced genomes in linear time
Rubert D, Feijão P, Dias Vieira Braga M, Stoye J, Martinez FHV (2017)
Algorithms for Molecular Biology 12: 3.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2909213
Phylogenetic assembly of paleogenomes integrating ancient DNA data
Luhmann N (2017)
Bielefeld: Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916552
Genomic Distance with High Indel Costs
da Silva PH, Machado R, Dantas S, Dias Vieira Braga M (2017)
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 14(3): 728-732.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492 PUB | DOI | WoS
 
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909409
Fast and Simple Jumbled Indexing for Binary Run-Length Encoded Strings
Cunha L, Dantas S, Gagie T, Wittler R, Kowada L, Stoye J (2017)
In: Proceedings of CPM 2017. LIPIcs, 78. 19:1-19:9.
PUB | DOI
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
The gene family-free median of three
Dörr D, Balaban M, Feijão P, Chauve C (2017)
Algorithms for Molecular Biology 12: 14.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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