A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation

Nattkemper TW (2001)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.

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Bielefeld Dissertation | English
Author
Supervisor
Ritter, Helge (Prof. Dr.)
Abstract
In dieser Arbeit wird ein System zur automatischen Auswertung von Mikroskopiebildern vorgestellt. Die Bilder werden mittels Fluoreszenzmikroskopie gewonnen und zeigen Zellen im Gewebe. Das System detektiert die Zellen und berechnet deren Konturen. Hierbei werden unterschiedliche Architekturen künstlicher neuronaler Netze eingesetzt. Neben der Detektion von Zellen werden auch lokal korrespondierende Fluoreszenzsignale in einer multi-Parameter-Aufnahme analysiert. Zur Bewertung der Detektionsgenauigkeit des Systems wird diese zuerst für menschliche Experten erfasst. Anschließend werden die menschlichen Ergebnisse bei der Zelldetektion mit den algorithmischen verglichen. Es stellt sich heraus, dass der Algorithmus ebenso genau die Zellen detektieren kann wie die weniger erfahrenen Experten. Mittels der Zelldetektionsergebnisse kann für jede Zelle ein Parametervektor gebildet werden, der das Oberflächenproteom der Zelle beschreibt. Es werden Visualisierungs- und Sonifikationsmethoden vorgestellt, mit denen die Analyse einer großen Menge von Mustern unterstützt werden kann. Das Gesamtsystem verarbeitet die Bilder in ausreichend kurzer Zeit und ausreichend genau. Treten Änderungen in der Bilddomäne auf (Vergrößerungsfaktor), so ist es zum großen Teil einfach zu adaptieren.
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Nattkemper TW. A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University; 2001.
Nattkemper, T. W. (2001). A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
Nattkemper, T. W. (2001). A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
Nattkemper, T.W., 2001. A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation, Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
T.W. Nattkemper, A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation, Bielefeld (Germany): Bielefeld University, 2001.
Nattkemper, T.W.: A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
Nattkemper, Tim Wilhelm. A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University, 2001.
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