Karina Brinkrolf
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30 Publikationen
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042Merten, M., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Kutter, Y., Rückert, C., & Tauch, A. (2015). Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen. Genome Announcements, 3(2), e00183-15. doi:10.1128/genomeA.00183-15
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., et al. (2015). The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology, 211, 20-30. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.06.423
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2718773Wippermann, A., Rupp, O., Brinkrolf, K., Hoffrogge, R., & Noll, T. (2015). The DNA methylation landscape of Chinese hamster ovary (CHO) DP-12 cells. Journal of Biotechnology, 199, 38-46. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.01.014
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365Tippelt, A., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C., Fernández-Natal, I., Soriano, F., & Tauch, A. (2014). Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient. Genome announcements, 2(6). doi:10.1128/genomeA.01211-14
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834Glaub, A., Bomholt, C., Gravermann, K., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Rückert, C., & Tauch, A. (2014). Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species. Genome announcements, 2(2). doi:10.1128/genomeA.00158-14
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694187Brinkrolf, K., Hoffrogge, R., Hackl, M., Tauch, A., Baumann, M., Noll, T., Goesmann, A., et al. (2014). Functional -Omics for Cell Lines and Processes - The -Omics Technologies on the Example of CHO Cells. In H. Hauser & R. Wagner (Eds.), Animal Cell Biotechnology In Biologics Production (p. 702). Berlin, Germany: Walter de Gruyter.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988Jakobi, T., Brinkrolf, K., Tauch, A., Noll, T., Stoye, J., Pühler, A., & Goesmann, A. (2014). Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing. Journal of Biotechnology, 190, 64-75. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.07.437
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552Becker, J., Timmermann, C., Rupp, O., Albaum, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., et al. (2014). Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.). Journal of biotechnology, 178, 23-31. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.02.021
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773Rupp, O., Becker, J., Brinkrolf, K., Timmermann, C., Borth, N., Pühler, A., Noll, T., et al. (2014). Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines. PLoS ONE, 9(1), e85568. doi:10.1371/journal.pone.0085568
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377Bomholt, C., Glaub, A., Gravermann, K., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C., & Tauch, A. (2013). Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen. Genome announcements, 1(5), e00793-13. doi:10.1128/genomeA.00793-13
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Brinkrolf, K., Rupp, O., Laux, H., Kollin, F., Ernst, W., Linke, B., Kofler, R., et al. (2013). Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes. Nature Biotechnology, 31(8), 694-695. doi:10.1038/nbt.2645
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501364Meleady, P., Hoffrogge, R., Henry, M., Rupp, O., Bort, J. H., Clarke, C., Brinkrolf, K., et al. (2012). Utilization and evaluation of CHO-specific sequence databases for mass spectrometry based proteomics. Biotechnology and Bioengineering, 109(6), 1386-1394. doi:10.1002/bit.24476
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A., et al. (2012). Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research, 12(3), 382-386. doi:10.1111/j.1567-1364.2012.00791.x
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526Hackl, M., Jadhav, V., Jakobi, T., Rupp, O., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., et al. (2012). Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines. Journal of Biotechnology, 158(3), 151-155. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.01.019
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf, K., Schneider, J., Knecht, M., Rückert, C., & Tauch, A. (2012). Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media. Journal of Bacteriology, 194(21), 5968-5969. doi:10.1128/JB.01412-12
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768Becker, J., Timmermann, C., Jakobi, T., Rupp, O., Szczepanowski, R., Hackl, M., Goesmann, A., et al. (2011). Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome. BMC Proceedings, 5(Suppl. 8), P6. doi:10.1186/1753-6561-5-S8-P6
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G. G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., et al. (2011). High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology, 154(4), 312-320. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2011.04.014
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., et al. (2011). Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology, 156(3), 227-235. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2011.09.014
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A., et al. (2011). RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology, 155(1), 118-126. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2010.10.076
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955Hackl, M., Jakobi, T., Blom, J., Doppmeier, D., Brinkrolf, K., Szczepanowski, R., Bernhart, S. H., et al. (2011). Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering. Journal of Biotechnology, 153(1-2), 62-75. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2011.02.011
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951Nentwich, S. S., Brinkrolf, K., Gaigalat, L., Hueser, A. T., Rey, D. A., Mohrbach, T., Marin, K., et al. (2009). Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. MICROBIOLOGY, 155(1), 150-164. https://doi.org/10.1099/mic.0.020388-0
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078Brinkrolf, K., Ploeger, S., Solle, S., Brune, I., Nentwich, S. S., Hueser, A. T., Kalinowski, J., et al. (2008). The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences. MICROBIOLOGY, 154(4), 1068-1081. https://doi.org/10.1099/mic.0.2007/014001-0
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918Tauch, A., Trost, E., Tilker, A., Ludewig, U., Schneiker-Bekel, S., Goesmann, A., Arnold, W., et al. (2008). The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 11-21. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2008.02.009
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K. - H., Arnold, W., et al. (2008). Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 22-30. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2008.03.004
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594020Baumbach, J., Wittkop, T., Rademacher, K., Rahmann, S., Brinkrolf, K., & Tauch, A. (2007). CoryneRegNet 3.0 - An interactive systems biology platform for the analysis of gene regulatory networks in corynebacteria and Escherichia coli. Journal of Biotechnology, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 129, 279-289. ELSEVIER SCIENCE BV. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2006.12.012
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594000Brinkrolf, K., Brune, I., & Tauch, A. (2007). The transcriptional regulatory network of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum. Journal of Biotechnology, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 129, 191-211. ELSEVIER SCIENCE BV. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2006.12.013
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499499Baumbach, J., Brinkrolf, K., Wittkop, T., Tauch, A., & Rahmann, S. (2006). CoryneRegNet 2: An integrative bioinformatics approach for reconstruction and comparison of transcriptional regulatory networks in prokaryotes. Journal of Integrative Bioinformatics, 3(2), 24. doi:10.2390/biecoll-jib-2006-24
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773632Baumbach, J., Brinkrolf, K., Czaja, L. F., Rahmann, S., & Tauch, A. (2006). CoryneRegNet: An ontology-based data warehouse of corynebacterial transcription factors and regulatory networks. BMC Genomics, 7(1), 24. https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-24
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596705Brinkrolf, K., Brune, I., & Tauch, A. (2006). Transcriptional regulation of catabolic pathways for aromatic compounds in Corynebacterium glutamicum. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, 5(4), 773-789.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773606Brune, I., Brinkrolf, K., Kalinowski, J., Pühler, A., & Tauch, A. (2005). The individual and common repertoire of DNA-binding transcriptional regulators of Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium jeikeium deduced from the complete genome sequences. BMC Genomics, 6(1), 86. https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-86