Karina Brinkrolf
PEVZ-ID
30 Publikationen
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042Merten, M., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Kutter, Y., Rückert, C., Tauch, A.: Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen. Genome Announcements. 3, : e00183-15 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Pühler, A., Jaeger, K.-E., Ernst, J.F.: The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology. 211, 20-30 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2718773Wippermann, A., Rupp, O., Brinkrolf, K., Hoffrogge, R., Noll, T.: The DNA methylation landscape of Chinese hamster ovary (CHO) DP-12 cells. Journal of Biotechnology. 199, 38-46 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365Tippelt, A., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C., Fernández-Natal, I., Soriano, F., Tauch, A.: Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient. Genome announcements. 2, (2014).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834Glaub, A., Bomholt, C., Gravermann, K., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Rückert, C., Tauch, A.: Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species. Genome announcements. 2, (2014).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694187Brinkrolf, K., Hoffrogge, R., Hackl, M., Tauch, A., Baumann, M., Noll, T., Goesmann, A., Pühler, A., Borth, N.: Functional -Omics for Cell Lines and Processes - The -Omics Technologies on the Example of CHO Cells. In: Hauser, H. and Wagner, R. (eds.) Animal Cell Biotechnology In Biologics Production. p. 702. Walter de Gruyter, Berlin, Germany (2014).PUB
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988Jakobi, T., Brinkrolf, K., Tauch, A., Noll, T., Stoye, J., Pühler, A., Goesmann, A.: Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing. Journal of Biotechnology. 190, 64-75 (2014).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552Becker, J., Timmermann, C., Rupp, O., Albaum, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Tauch, A., Noll, T.: Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.). Journal of biotechnology. 178, 23-31 (2014).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773Rupp, O., Becker, J., Brinkrolf, K., Timmermann, C., Borth, N., Pühler, A., Noll, T., Goesmann, A.: Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines. PLoS ONE. 9, : e85568 (2014).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377Bomholt, C., Glaub, A., Gravermann, K., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C., Tauch, A.: Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen. Genome announcements. 1, e00793-13 (2013).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Brinkrolf, K., Rupp, O., Laux, H., Kollin, F., Ernst, W., Linke, B., Kofler, R., Romand, S., Hesse, F., Budach, W.E., Galosy, S., Müller, D., Noll, T., Wienberg, J., Jostock, T., Leonard, M., Grillari, J., Tauch, A., Goesmann, A., Helk, B., Mott, J.E., Pühler, A., Borth, N.: Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes. Nature Biotechnology. 31, 694-695 (2013).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501364Meleady, P., Hoffrogge, R., Henry, M., Rupp, O., Bort, J.H., Clarke, C., Brinkrolf, K., Kelly, S., Müller, B., Doolan, P., Hackl, M., Beckmann, T., Noll, T., Grillari, J., Barron, N., Pühler, A., Clynes, M., Borth, N.: Utilization and evaluation of CHO-specific sequence databases for mass spectrometry based proteomics. Biotechnology and Bioengineering. 109, 1386-1394 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A., Brinkrolf, K.: Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research. 12, 382-386 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526Hackl, M., Jadhav, V., Jakobi, T., Rupp, O., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Noll, T., Borth, N., Grillari, J.: Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines. Journal of Biotechnology. 158, 151-155 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf, K., Schneider, J., Knecht, M., Rückert, C., Tauch, A.: Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media. Journal of Bacteriology. 194, 5968-5969 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768Becker, J., Timmermann, C., Jakobi, T., Rupp, O., Szczepanowski, R., Hackl, M., Goesmann, A., Tauch, A., Borth, N., Grillari, J., Pühler, A., Noll, T., Brinkrolf, K.: Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome. BMC Proceedings. 5, P6 (2011).PUB | DOI
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G.G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A., Pichler, H.: High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology. 154, 312-320 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., Borth, N., Goesmann, A., Grillari, J., Kaltschmidt, C., Noll, T., Pühler, A., Tauch, A., Brinkrolf, K.: Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology. 156, 227-235 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A., Goesmann, A.: RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology. 155, 118-126 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955Hackl, M., Jakobi, T., Blom, J., Doppmeier, D., Brinkrolf, K., Szczepanowski, R., Bernhart, S.H., Höner zu Siederdissen, C., Bort, J.A.H., Wieser, M., Kunert, R., Jeffs, S., Hofacker, I.L., Goesmann, A., Pühler, A., Borth, N., Grillari, J.: Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering. Journal of Biotechnology. 153, 62-75 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951Nentwich, S.S., Brinkrolf, K., Gaigalat, L., Hueser, A.T., Rey, D.A., Mohrbach, T., Marin, K., Pühler, A., Tauch, A., Kalinowski, J.: Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. MICROBIOLOGY. 155, 150-164 (2009).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078Brinkrolf, K., Ploeger, S., Solle, S., Brune, I., Nentwich, S.S., Hueser, A.T., Kalinowski, J., Pühler, A., Tauch, A.: The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences. MICROBIOLOGY. 154, 1068-1081 (2008).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918Tauch, A., Trost, E., Tilker, A., Ludewig, U., Schneiker-Bekel, S., Goesmann, A., Arnold, W., Bekel, T., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Kalinowski, J., Kamp, P.-B., Lobo, F.P., Viehöver, P., Weisshaar, B., Soriano, F., Droege, M., Pühler, A.: The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing. Journal of Biotechnology. 136, 11-21 (2008).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K.-H., Arnold, W., Blom, J., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Weisshaar, B., Goesmann, A., Droege, M., Pühler, A.: Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology. 136, 22-30 (2008).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594020Baumbach, J., Wittkop, T., Rademacher, K., Rahmann, S., Brinkrolf, K., Tauch, A.: CoryneRegNet 3.0 - An interactive systems biology platform for the analysis of gene regulatory networks in corynebacteria and Escherichia coli. Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 129, p. 279-289. ELSEVIER SCIENCE BV (2007).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594000Brinkrolf, K., Brune, I., Tauch, A.: The transcriptional regulatory network of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum. Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 129, p. 191-211. ELSEVIER SCIENCE BV (2007).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499499Baumbach, J., Brinkrolf, K., Wittkop, T., Tauch, A., Rahmann, S.: CoryneRegNet 2: An integrative bioinformatics approach for reconstruction and comparison of transcriptional regulatory networks in prokaryotes. Journal of Integrative Bioinformatics. 3, 24 (2006).PUB | DOI
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773632Baumbach, J., Brinkrolf, K., Czaja, L.F., Rahmann, S., Tauch, A.: CoryneRegNet: An ontology-based data warehouse of corynebacterial transcription factors and regulatory networks. BMC Genomics. 7, : 24 (2006).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596705Brinkrolf, K., Brune, I., Tauch, A.: Transcriptional regulation of catabolic pathways for aromatic compounds in Corynebacterium glutamicum. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. 5, 773-789 (2006).PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773606Brune, I., Brinkrolf, K., Kalinowski, J., Pühler, A., Tauch, A.: The individual and common repertoire of DNA-binding transcriptional regulators of Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium jeikeium deduced from the complete genome sequences. BMC Genomics. 6, : 86 (2005).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC