PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042

  Merten, M.; Brinkrolf, K.; Albersmeier, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen Genome Announcements,3:(2):e00183-15

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• [29]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605

  Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Buerth, C.; Kunigo, M.; Schneider, J.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Jaeger, K. - E.; Ernst, J. F. (2015): The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms Journal of Biotechnology,211: 20-30.

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• [28]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2718773

  Wippermann, A.; Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Hoffrogge, R.; Noll, T. (2015): The DNA methylation landscape of Chinese hamster ovary (CHO) DP-12 cells Journal of Biotechnology,199: 38-46.

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• [27]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365

  Tippelt, A.; Albersmeier, A.; Brinkrolf, K.; Rückert, C.; Fernández-Natal, I.; Soriano, F.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient Genome announcements,2:(6)

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• [26]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834

  Glaub, A.; Bomholt, C.; Gravermann, K.; Brinkrolf, K.; Albersmeier, A.; Rückert, C.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species Genome announcements,2:(2)

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• [25]
  

  2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694187

  Brinkrolf, K.; Hoffrogge, R.; Hackl, M.; Tauch, A.; Baumann, M.; Noll, T.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Borth, N. (2014): Functional -Omics for Cell Lines and Processes - The -Omics Technologies on the Example of CHO Cells. In: Hansjörg Hauser; Roland Wagner (Hrsg.): Animal Cell Biotechnology In Biologics Production. Berlin, Germany: Walter de Gruyter. S. 702.

  PUB
   
• [24]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988

  Jakobi, T.; Brinkrolf, K.; Tauch, A.; Noll, T.; Stoye, J.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2014): Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing Journal of Biotechnology,190: 64-75.

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• [23]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552

  Becker, J.; Timmermann, C.; Rupp, O.; Albaum, S.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Tauch, A.; Noll, T. (2014): Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.) Journal of biotechnology,178: 23-31.

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• [22]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773

  Rupp, O.; Becker, J.; Brinkrolf, K.; Timmermann, C.; Borth, N.; Pühler, A.; Noll, T.; Goesmann, A. (2014): Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines PLoS ONE,9:(1):e85568

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• [21]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377

  Bomholt, C.; Glaub, A.; Gravermann, K.; Albersmeier, A.; Brinkrolf, K.; Rückert, C.; Tauch, A. (2013): Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen Genome announcements,1:(5): e00793-13.

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• [20]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581

  Brinkrolf, K.; Rupp, O.; Laux, H.; Kollin, F.; Ernst, W.; Linke, B.; Kofler, R.; Romand, S.; Hesse, F.; Budach, W. E.; Galosy, S.; Müller, D.; Noll, T.; Wienberg, J.; Jostock, T.; Leonard, M.; Grillari, J.; Tauch, A.; Goesmann, A.; Helk, B.; Mott, J. E.; Pühler, A.; Borth, N. (2013): Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes Nature Biotechnology,31:(8): 694-695.

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• [19]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501364

  Meleady, P.; Hoffrogge, R.; Henry, M.; Rupp, O.; Bort, J. H.; Clarke, C.; Brinkrolf, K.; Kelly, S.; Müller, B.; Doolan, P.; Hackl, M.; Beckmann, T.; Noll, T.; Grillari, J.; Barron, N.; Pühler, A.; Clynes, M.; Borth, N. (2012): Utilization and evaluation of CHO-specific sequence databases for mass spectrometry based proteomics Biotechnology and Bioengineering,109:(6): 1386-1394.

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• [18]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002

  Schneider, J.; Rupp, O.; Trost, E.; Jaenicke, S.; Passoth, V.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2012): Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities FEMS Yeast Research,12:(3): 382-386.

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• [17]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526

  Hackl, M.; Jadhav, V.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Noll, T.; Borth, N.; Grillari, J. (2012): Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines Journal of Biotechnology,158:(3): 151-155.

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• [16]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885

  Brinkrolf, K.; Schneider, J.; Knecht, M.; Rückert, C.; Tauch, A. (2012): Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media Journal of Bacteriology,194:(21): 5968-5969.

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• [15]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768

  Becker, J.; Timmermann, C.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Szczepanowski, R.; Hackl, M.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Borth, N.; Grillari, J.; Pühler, A.; Noll, T.; Brinkrolf, K. (2011): Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome, In: Hansjörg Hauser (Hrsg.), BMC Proceedings,5:(Suppl. 8): P6.

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• [14]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371

  Küberl, A.; Schneider, J.; Thallinger, G. G.; Anderl, I.; Wibberg, D.; Hajek, T.; Jaenicke, S.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Szczepanowski, R.; Pühler, A.; Schwab, H.; Glieder, A.; Pichler, H. (2011): High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435 Journal of Biotechnology,154:(4): 312-320.

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• [13]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576

  Becker, J.; Hackel, M.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Borth, N.; Goesmann, A.; Grillari, J.; Kaltschmidt, C.; Noll, T.; Pühler, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2011): Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing Journal of Biotechnology,156:(3): 227-235.

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• [12]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445

  Schneider, J.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Linke, B.; Brinkrolf, K.; Neuweger, H.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2011): RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data Journal of Biotechnology,155:(1): 118-126.

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• [11]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955

  Hackl, M.; Jakobi, T.; Blom, J.; Doppmeier, D.; Brinkrolf, K.; Szczepanowski, R.; Bernhart, S. H.; Höner zu Siederdissen, C.; Bort, J. A. H.; Wieser, M.; Kunert, R.; Jeffs, S.; Hofacker, I. L.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Borth, N.; Grillari, J. (2011): Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering Journal of Biotechnology,153:(1-2): 62-75.

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• [10]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951

  Nentwich, S. S.; Brinkrolf, K.; Gaigalat, L.; Hueser, A. T.; Rey, D. A.; Mohrbach, T.; Marin, K.; Pühler, A.; Tauch, A.; Kalinowski, J. (2009): Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 MICROBIOLOGY,155:(1): 150-164.

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• [9]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078

  Brinkrolf, K.; Ploeger, S.; Solle, S.; Brune, I.; Nentwich, S. S.; Hueser, A. T.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Tauch, A. (2008): The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences MICROBIOLOGY,154:(4): 1068-1081.

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• [8]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918

  Tauch, A.; Trost, E.; Tilker, A.; Ludewig, U.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Arnold, W.; Bekel, T.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Kalinowski, J.; Kamp, P. - B.; Lobo, F. P.; Viehöver, P.; Weisshaar, B.; Soriano, F.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing Journal of Biotechnology,136:(1-2): 11-21.

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• [7]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939

  Tauch, A.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Gartemann, K. - H.; Arnold, W.; Blom, J.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Weisshaar, B.; Goesmann, A.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids Journal of Biotechnology,136:(1-2): 22-30.

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• [6]
  

  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594020

  Baumbach, J.; Wittkop, T.; Rademacher, K.; Rahmann, S.; Brinkrolf, K.; Tauch, A. (2007): CoryneRegNet 3.0 - An interactive systems biology platform for the analysis of gene regulatory networks in corynebacteria and Escherichia coli. In: Journal of Biotechnology. ELSEVIER SCIENCE BV. (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 129). S. 279-289.

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• [5]
  

  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594000

  Brinkrolf, K.; Brune, I.; Tauch, A. (2007): The transcriptional regulatory network of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum. In: Journal of Biotechnology. ELSEVIER SCIENCE BV. (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 129). S. 191-211.

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• [4]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499499

  Baumbach, J.; Brinkrolf, K.; Wittkop, T.; Tauch, A.; Rahmann, S. (2006): CoryneRegNet 2: An integrative bioinformatics approach for reconstruction and comparison of transcriptional regulatory networks in prokaryotes Journal of Integrative Bioinformatics,3:(2): 24.

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• [3]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773632

  Baumbach, J.; Brinkrolf, K.; Czaja, L. F.; Rahmann, S.; Tauch, A. (2006): CoryneRegNet: An ontology-based data warehouse of corynebacterial transcription factors and regulatory networks BMC Genomics,7:(1):24

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• [2]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596705

  Brinkrolf, K.; Brune, I.; Tauch, A. (2006): Transcriptional regulation of catabolic pathways for aromatic compounds in Corynebacterium glutamicum GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH,5:(4): 773-789.

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• [1]
  

  2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773606

  Brune, I.; Brinkrolf, K.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Tauch, A. (2005): The individual and common repertoire of DNA-binding transcriptional regulators of Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium jeikeium deduced from the complete genome sequences BMC Genomics,6:(1):86

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