Karina Brinkrolf
PEVZ-ID
30 Publikationen
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042Merten, M., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Kutter, Y., Rückert, C. & Tauch, A. (2015). Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen. Genome Announcements, 3(2): e00183-15. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.00183-15.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Pühler, A., Jaeger, K.-E. & Ernst, J.F. (2015). The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology, 211, 20-30. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.06.423.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2718773Wippermann, A., Rupp, O., Brinkrolf, K., Hoffrogge, R. & Noll, T. (2015). The DNA methylation landscape of Chinese hamster ovary (CHO) DP-12 cells. Journal of Biotechnology, 199, 38-46. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.01.014.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365Tippelt, A., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C., Fernández-Natal, I., Soriano, F. & Tauch, A. (2014). Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient. Genome announcements, 2(6). American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.01211-14.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834Glaub, A., Bomholt, C., Gravermann, K., Brinkrolf, K., Albersmeier, A., Rückert, C. & Tauch, A. (2014). Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species. Genome announcements, 2(2). American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.00158-14.
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694187Brinkrolf, K., Hoffrogge, R., Hackl, M., Tauch, A., Baumann, M., Noll, T., Goesmann, A., Pühler, A. & Borth, N. (2014). Functional -Omics for Cell Lines and Processes - The -Omics Technologies on the Example of CHO Cells. In H. Hauser & R. Wagner (Hrsg.), Animal Cell Biotechnology In Biologics Production (S. 702). Berlin, Germany: Walter de Gruyter.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988Jakobi, T., Brinkrolf, K., Tauch, A., Noll, T., Stoye, J., Pühler, A. & Goesmann, A. (2014). Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing. Journal of Biotechnology, 190, 64-75. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.07.437.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552Becker, J., Timmermann, C., Rupp, O., Albaum, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Tauch, A. & Noll, T. (2014). Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.). Journal of biotechnology, 178, 23-31. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.02.021.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773Rupp, O., Becker, J., Brinkrolf, K., Timmermann, C., Borth, N., Pühler, A., Noll, T. & Goesmann, A. (2014). Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines. PLoS ONE, 9(1): e85568. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0085568.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377Bomholt, C., Glaub, A., Gravermann, K., Albersmeier, A., Brinkrolf, K., Rückert, C. & Tauch, A. (2013). Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen. Genome announcements, 1(5), e00793-13. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.00793-13.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Brinkrolf, K., Rupp, O., Laux, H., Kollin, F., Ernst, W., Linke, B., Kofler, R., Romand, S., Hesse, F., Budach, W.E., Galosy, S., Müller, D., Noll, T., Wienberg, J., Jostock, T., Leonard, M., Grillari, J., Tauch, A., Goesmann, A., Helk, B., Mott, J.E., Pühler, A. & Borth, N. (2013). Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes. Nature Biotechnology, 31(8), 694-695. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nbt.2645.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501364Meleady, P., Hoffrogge, R., Henry, M., Rupp, O., Bort, J.H., Clarke, C., Brinkrolf, K., Kelly, S., Müller, B., Doolan, P., Hackl, M., Beckmann, T., Noll, T., Grillari, J., Barron, N., Pühler, A., Clynes, M. & Borth, N. (2012). Utilization and evaluation of CHO-specific sequence databases for mass spectrometry based proteomics. Biotechnology and Bioengineering, 109(6), 1386-1394. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/bit.24476.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2012). Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research, 12(3), 382-386. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1567-1364.2012.00791.x.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526Hackl, M., Jadhav, V., Jakobi, T., Rupp, O., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Noll, T., Borth, N. & Grillari, J. (2012). Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines. Journal of Biotechnology, 158(3), 151-155. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.01.019.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf, K., Schneider, J., Knecht, M., Rückert, C. & Tauch, A. (2012). Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media. Journal of Bacteriology, 194(21), 5968-5969. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.01412-12.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768Becker, J., Timmermann, C., Jakobi, T., Rupp, O., Szczepanowski, R., Hackl, M., Goesmann, A., Tauch, A., Borth, N., Grillari, J., Pühler, A., Noll, T. & Brinkrolf, K. (2011). Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome (BMC Proceedings). (H. Hauser, Hrsg.), 5(Suppl. 8), P6. Gehalten auf der 22nd European Society for Animal Cell Technology (ESACT) Meeting on Cell Based Technologies, BioMed Central. doi:10.1186/1753-6561-5-S8-P6.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G.G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A. & Pichler, H. (2011). High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology, 154(4), 312-320. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.04.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., Borth, N., Goesmann, A., Grillari, J., Kaltschmidt, C., Noll, T., Pühler, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2011). Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology, 156(3), 227-235. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.09.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A. & Goesmann, A. (2011). RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology, 155(1), 118-126. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.10.076.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955Hackl, M., Jakobi, T., Blom, J., Doppmeier, D., Brinkrolf, K., Szczepanowski, R., Bernhart, S.H., Höner zu Siederdissen, C., Bort, J.A.H., Wieser, M., Kunert, R., Jeffs, S., Hofacker, I.L., Goesmann, A., Pühler, A., Borth, N. & Grillari, J. (2011). Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering. Journal of Biotechnology, 153(1-2), 62-75. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.02.011.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951Nentwich, S.S., Brinkrolf, K., Gaigalat, L., Hueser, A.T., Rey, D.A., Mohrbach, T., Marin, K., Pühler, A., Tauch, A. & Kalinowski, J. (2009). Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. MICROBIOLOGY, 155(1), 150-164. Society for General Microbiology. doi:10.1099/mic.0.020388-0.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078Brinkrolf, K., Ploeger, S., Solle, S., Brune, I., Nentwich, S.S., Hueser, A.T., Kalinowski, J., Pühler, A. & Tauch, A. (2008). The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences. MICROBIOLOGY, 154(4), 1068-1081. SOC GENERAL MICROBIOLOGY. doi:10.1099/mic.0.2007/014001-0.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918Tauch, A., Trost, E., Tilker, A., Ludewig, U., Schneiker-Bekel, S., Goesmann, A., Arnold, W., Bekel, T., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Kalinowski, J., Kamp, P.-B., Lobo, F.P., Viehöver, P., Weisshaar, B., Soriano, F., Droege, M. & Pühler, A. (2008). The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 11-21. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.02.009.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K.-H., Arnold, W., Blom, J., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Weisshaar, B., Goesmann, A., Droege, M. & Pühler, A. (2008). Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 22-30. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.03.004.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594020Baumbach, J., Wittkop, T., Rademacher, K., Rahmann, S., Brinkrolf, K. & Tauch, A. (2007). CoryneRegNet 3.0 - An interactive systems biology platform for the analysis of gene regulatory networks in corynebacteria and Escherichia coli (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY). Journal of Biotechnology (S. 279-289). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.12.012.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594000Brinkrolf, K., Brune, I. & Tauch, A. (2007). The transcriptional regulatory network of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY). Journal of Biotechnology (S. 191-211). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.12.013.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499499Baumbach, J., Brinkrolf, K., Wittkop, T., Tauch, A. & Rahmann, S. (2006). CoryneRegNet 2: An integrative bioinformatics approach for reconstruction and comparison of transcriptional regulatory networks in prokaryotes. Journal of Integrative Bioinformatics, 3(2), 24. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2006-24.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773632Baumbach, J., Brinkrolf, K., Czaja, L.F., Rahmann, S. & Tauch, A. (2006). CoryneRegNet: An ontology-based data warehouse of corynebacterial transcription factors and regulatory networks. BMC Genomics, 7(1): 24. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/1471-2164-7-24.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596705Brinkrolf, K., Brune, I. & Tauch, A. (2006). Transcriptional regulation of catabolic pathways for aromatic compounds in Corynebacterium glutamicum. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, 5(4), 773-789. FUNPEC-EDITORA.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773606Brune, I., Brinkrolf, K., Kalinowski, J., Pühler, A. & Tauch, A. (2005). The individual and common repertoire of DNA-binding transcriptional regulators of Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium jeikeium deduced from the complete genome sequences. BMC Genomics, 6(1): 86. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/1471-2164-6-86.