Sebastian Jünemann

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5185664

25 Publikationen

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  • [25]
    2024 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2988343
    Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Schneeberger K, Schulze M, Scheffler I, Caspers B (2024)
    Bats, Bacteria, and Bat Smell V.2.0: Repeatable Sex-Specific Differences in Scent Organ Microbiota.
    Microbial Ecology 87(1): 55.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [24]
    2023 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2968940 OA
    Jünemann S (2023)
    Quality is a Myth - Assessing and Addressing Errors in Sequencing Data.
    Bielefeld: Universität Bielefeld.
    PUB | PDF | DOI
     
  • [23]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963726 OA
    Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Engel K, Castillo-Gutiérrez O, Busche T, Kalinowski J, Caspers B (2022)
    Timing matters: Age-dependent impacts of the social environment and host selection on the avian gut microbiota.
    Microbiome 10(1): 202.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | Preprint
     
  • [22]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962824 OA
    Maraci Ö, Corsini M, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Sudyka J, Di Lecce I, Caspers B, Szulkin M (2022)
    Changes to the gut microbiota of a wild juvenile passerine in a multidimensional urban mosaic.
    Scientific Reports 12(1): 6872.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [21]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957501 OA
    Brandt D, Simunovic M, Busche T, Haak M, Belmann P, Jünemann S, Schulz T, Klages LJ, Vinke S, Beckstette M, Pohl E, Scherer C, Sczyrba A, Kalinowski J (2021)
    Multiple Occurrences of a 168-Nucleotide Deletion in SARS-CoV-2 ORF8, Unnoticed by Standard Amplicon Sequencing and Variant Calling Pipelines.
    Viruses 13(9): 1870.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [20]
    2021 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2955069
    Maraci Ö, Corsini M, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Sudyka J, Lecce ID, Caspers B, Szulkin M (2021)
    Alterations to the Gut Microbiota of a Wild Juvenile Passerine in an Urban Mosaic.
    bioRxiv.
    PUB | DOI | Preprint
     
  • [19]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951630 OA
    Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Castillo O, Busche T, Kalinowski J, Caspers B (2021)
    The Gut Microbial Composition Is Species-Specific and Individual-Specific in Two Species of Estrildid Finches, the Bengalese Finch and the Zebra Finch.
    Frontiers in Microbiology 12: 619141.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [18]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949051 OA
    Engel K, Pankoke H, Jünemann S, Brandl HB, Sauer J, Griffith S, Kalinowski J, Caspers B (2020)
    Family matters: skin microbiome reflects the social group and spatial proximity in wild zebra finches.
    BMC Ecology 20(1): 58.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [17]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944226 OA
    Rettenmaier R, Schneider M, Munk B, Lebuhn M, Jünemann S, Sczyrba A, Maus I, Zverlov V, Liebl W (2020)
    Importance of Defluviitalea raffinosedens for Hydrolytic Biomass Degradation in Co-Culture with Hungateiclostridium thermocellum.
    Microorganisms 8(6): 915.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [16]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
    Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, Schlagenhauf U, Ehmke B, Harmsen D (2018)
    Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis.
    PLOS ONE 13(4): e0195534.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [15]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916925
    Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
    Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing.
    Microbial Ecology 76(2): 518-529.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [14]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
    Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, Stoye J (2017)
    Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research.
    Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [13]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
    Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
    GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers.
    PLOS ONE 9(9): e107014.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [12]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
    Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Goesmann A, Wendisch VF, Passagilia L (2013)
    Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing.
    Microbial Ecology 65(3): 593-601.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [11]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
    Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
    Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison.
    Nature biotechnology 31(12): 1148.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [10]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
    Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
    Updating benchtop sequencing performance comparison.
    Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [9]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
    Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
    Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging.
    Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [8]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
    Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
    Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing.
    PLoS ONE 7(8): e41606.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [7]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
    Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
    Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing.
    Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [6]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
    Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
    Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties.
    The ISME journal 7(1): 37-49.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [5]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
    Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
    Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information.
    Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [4]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
    Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, Pühler A, Schlüter A, Goesmann A (2011)
    Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing.
    PLoS ONE 6(1): e14519.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [3]
    2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
    Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
    Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods.
    In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Hoboken, NJ, USA: Wiley-Blackwell: 403-414.
    PUB | DOI
     
  • [2]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321 OA
    Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, Neuweger H, Runte KJ, Tauch A, Tille F, Pühler A, Goesmann A (2009)
    EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data.
    BMC Bioinformatics 10(1): 50.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [1]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098 OA
    Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
    WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads.
    BMC Bioinformatics 10(1): 430.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
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