16 Publikationen

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[16]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, Schlagenhauf U, Ehmke B, Harmsen D (2018)
Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis.
PLOS ONE 13(4): e0195534.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916925
Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing.
Microbial Ecology 76(2): 518-529.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, Stoye J (2017)
Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research.
Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers.
PLOS ONE 9(9): e107014.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison.
Nature biotechnology 31(12): 1148.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Updating benchtop sequencing performance comparison.
Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging.
Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing.
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing.
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties.
The ISME journal 7(1): 37-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing.
PLoS ONE 7(8): e41606.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information.
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods.
In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Wiley-Blackwell: 403-414.
PUB | DOI
 
[3]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, Pühler A, Schlüter A, Goesmann A (2011)
Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing.
PLoS ONE 6(1): e14519.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, Neuweger H, Runte KJ, Tauch A, Tille F, Pühler A, Goesmann A (2009)
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data.
BMC Bioinformatics 10(1): 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads.
BMC Bioinformatics 10(1): 430.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, Schlagenhauf U, Ehmke B, Harmsen D (2018)
Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis.
PLOS ONE 13(4): e0195534.
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Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing.
Microbial Ecology 76(2): 518-529.
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Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, Stoye J (2017)
Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research.
Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers.
PLOS ONE 9(9): e107014.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison.
Nature biotechnology 31(12): 1148.
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[11]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Updating benchtop sequencing performance comparison.
Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
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[10]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging.
Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.
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[9]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing.
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
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[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing.
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
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[7]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties.
The ISME journal 7(1): 37-49.
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[6]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing.
PLoS ONE 7(8): e41606.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information.
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
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[4]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods.
In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Wiley-Blackwell: 403-414.
PUB | DOI
 
[3]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, Pühler A, Schlüter A, Goesmann A (2011)
Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing.
PLoS ONE 6(1): e14519.
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[2]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, Neuweger H, Runte KJ, Tauch A, Tille F, Pühler A, Goesmann A (2009)
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data.
BMC Bioinformatics 10(1): 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
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