Sebastian Jünemann

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5185664

25 Publikationen

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  • [25]
    2024 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2988343
    Ö. Maraci, A. Antonatou-Papaioannou, S. Jünemann, K. Schneeberger, M. Schulze, I. Scheffler, and B. Caspers, “Bats, Bacteria, and Bat Smell V.2.0: Repeatable Sex-Specific Differences in Scent Organ Microbiota”, Microbial Ecology , 2024, 87, : 55.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [24]
    2023 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2968940 OA
    S. Jünemann, Quality is a Myth - Assessing and Addressing Errors in Sequencing Data, Universität Bielefeld, Bielefeld, 2023.
    PUB | PDF | DOI
     
  • [23]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963726 OA
    Ö. Maraci, A. Antonatou-Papaioannou, S. Jünemann, K. Engel, O. Castillo-Gutiérrez, T. Busche, J. Kalinowski, and B. Caspers, “Timing matters: Age-dependent impacts of the social environment and host selection on the avian gut microbiota”, Microbiome, 2022, 10, 202.
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  • [22]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962824 OA
    Ö. Maraci, M. Corsini, A. Antonatou-Papaioannou, S. Jünemann, J. Sudyka, I. Di Lecce, B. Caspers, and M. Szulkin, “Changes to the gut microbiota of a wild juvenile passerine in a multidimensional urban mosaic”, Scientific Reports, 2022, 12, : 6872.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [21]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957501 OA
    D. Brandt, M. Simunovic, T. Busche, M. Haak, P. Belmann, S. Jünemann, T. Schulz, L. J. Klages, S. Vinke, M. Beckstette, et al., “Multiple Occurrences of a 168-Nucleotide Deletion in SARS-CoV-2 ORF8, Unnoticed by Standard Amplicon Sequencing and Variant Calling Pipelines”, Viruses, 2021, 13, : 1870.
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  • [20]
    2021 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2955069
    Ö. Maraci, M. Corsini, A. Antonatou-Papaioannou, S. Jünemann, J. Sudyka, I. D. Lecce, B. Caspers, and M. Szulkin, “Alterations to the Gut Microbiota of a Wild Juvenile Passerine in an Urban Mosaic”, bioRxiv, 2021.
    PUB | DOI | Preprint
     
  • [19]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951630 OA
    Ö. Maraci, A. Antonatou-Papaioannou, S. Jünemann, O. Castillo, T. Busche, J. Kalinowski, and B. Caspers, “The Gut Microbial Composition Is Species-Specific and Individual-Specific in Two Species of Estrildid Finches, the Bengalese Finch and the Zebra Finch”, Frontiers in Microbiology, 2021, 12, : 619141.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [18]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949051 OA
    K. Engel, H. Pankoke, S. Jünemann, H. B. Brandl, J. Sauer, S. Griffith, J. Kalinowski, and B. Caspers, “Family matters: skin microbiome reflects the social group and spatial proximity in wild zebra finches”, BMC Ecology, 2020, 20, : 58.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [17]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944226 OA
    R. Rettenmaier, M. Schneider, B. Munk, M. Lebuhn, S. Jünemann, A. Sczyrba, I. Maus, V. Zverlov, and W. Liebl, “Importance of Defluviitalea raffinosedens for Hydrolytic Biomass Degradation in Co-Culture with Hungateiclostridium thermocellum”, Microorganisms, 2020, 8, : 915.
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  • [16]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
    D. Hagenfeld, R. Koch, S. Jünemann, K. Prior, I. Harks, P. Eickholz, T. Hoffmann, T. - S. Kim, T. Kocher, J. Meyle, et al., “Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis”, PLOS ONE, 2018, 13, : e0195534.
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  • [15]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916925
    K. Engel, J. Sauer, S. Jünemann, A. Winkler, D. Wibberg, J. Kalinowski, A. Tauch, and B. Caspers, “Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing”, Microbial Ecology, 2018, 76, 518-529.
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  • [14]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
    S. Jünemann, N. Kleinbölting, S. Jaenicke, C. Henke, J. Hassa, J. Nelkner, Y. Stolze, S. Albaum, A. Schlüter, A. Goesmann, et al., “Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research”, Journal of Biotechnology, 2017, 261, 10-23.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [13]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
    S. Jünemann, K. Prior, A. Albersmeier, S. Albaum, J. Kalinowski, A. Goesmann, J. Stoye, and D. Harmsen, “GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers”, PLOS ONE, 2014, 9, : e107014.
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  • [12]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
    S. Bolzan de Campos, J. - W. Youn, R. Farina, S. Jaenicke, S. Jünemann, R. Szczepanowski, A. Beneduzi, L. K. Vargas, A. Goesmann, V. F. Wendisch, et al., “Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing”, Microbial Ecology, 2013, 65, 593-601.
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  • [11]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
    S. Jünemann, F. J. Sedlazeck, K. Prior, A. Albersmeier, U. John, J. Kalinowski, A. Mellmann, A. Goesmann, A. von Haeseler, J. Stoye, et al., “Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison”, Nature biotechnology, 2013, 31, 1148.
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  • [10]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
    S. Jünemann, F. J. Sedlazeck, K. Prior, A. Albersmeier, U. John, J. Kalinowski, A. Mellmann, A. Goesmann, A. von Haeseler, J. Stoye, et al., “Updating benchtop sequencing performance comparison”, Nature Biotechnology, 2013, 31, 294-296.
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  • [9]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
    F. G. Eikmeyer, P. Köfinger, A. Poschenel, S. Jünemann, M. Zakrzewski, S. Heinl, E. Mayrhuber, R. Grabherr, A. Pühler, H. Schwab, et al., “Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging”, Journal of Biotechnology, 2013, 167, 334-343.
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  • [8]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
    S. Jünemann, K. Prior, R. Szczepanowski, I. Harks, B. Ehmke, A. Goesmann, J. Stoye, and D. Harmsen, “Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing”, PLoS ONE, 2012, 7, : e41606.
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  • [7]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
    M. Zakrzewski, A. Goesmann, S. Jaenicke, S. Jünemann, F. G. Eikmeyer, R. Szczepanowski, W. A. Al-Soud, S. Sørensen, A. Pühler, and A. Schlüter, “Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing”, Journal of Biotechnology, 2012, 158, 248-258.
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  • [6]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
    A. B. Dohrmann, M. Küting, S. Jünemann, S. Jaenicke, A. Schlüter, and C. C. Tebbe, “Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties”, The ISME journal, 2012, 7, 37-49.
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  • [5]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
    U. Vogel, R. Szczepanowski, H. Claus, S. Jünemann, K. Prior, and D. Harmsen, “Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information”, Journal of clinical microbiology, 2012, 50, 1889-1894.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [4]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
    S. Jaenicke, C. Ander, T. Bekel, R. Bisdorf, M. Dröge, K. - H. Gartemann, S. Jünemann, O. Kaiser, L. Krause, F. Tille, et al., “Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing”, PLoS ONE, 2011, 6, : e14519.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [3]
    2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
    S. Jaenicke, M. Zakrzewski, S. Jünemann, A. Pühler, A. Goesmann, and A. Schlüter, in Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats (Ed.: F.J. de Bruijn), Wiley-Blackwell, Hoboken, NJ, USA, 2011, p. 403-414.
    PUB | DOI
     
  • [2]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321 OA
    M. Dondrup, S. Albaum, T. Griebel, K. Henckel, S. Jünemann, T. Kahlke, C. K. Kleindt, H. Kuester, B. Linke, D. Mertens, et al., “EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, : 50.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [1]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098 OA
    W. Gerlach, S. Jünemann, F. Tille, A. Goesmann, and J. Stoye, “WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, 430.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
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