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[16]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis
Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, et al. (2018)
PLOS ONE 13(4): e0195534.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916925
Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing
Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
Microbial Ecology 76(2): 518-529.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research
Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, et al. (2017)
Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers
Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
PLOS ONE 9(9): e107014.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature biotechnology 31(12): 1148.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging
Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties
Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
The ISME journal 7(1): 37-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
PLoS ONE 7(8): e41606.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods
Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Wiley-Blackwell: 403-414.
PUB | DOI
 
[3]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing
Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, et al. (2011)
PLoS ONE 6(1): e14519.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, et al. (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads
Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 430.
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Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis
Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, et al. (2018)
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Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing
Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
Microbial Ecology 76(2): 518-529.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556
Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research
Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, et al. (2017)
Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.
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[13]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers
Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
PLOS ONE 9(9): e107014.
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[12]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature biotechnology 31(12): 1148.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
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[10]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207
Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging
Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.
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[9]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
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[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933
Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties
Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
The ISME journal 7(1): 37-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
PLoS ONE 7(8): e41606.
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[5]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods
Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Wiley-Blackwell: 403-414.
PUB | DOI
 
[3]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing
Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, et al. (2011)
PLoS ONE 6(1): e14519.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, et al. (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads
Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 430.
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