PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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• [24]
  

  2024 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2988343

  Bats, Bacteria, and Bat Smell V.2.0: Repeatable Sex-Specific Differences in Scent Organ Microbiota
  Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Schneeberger K, Schulze M, Scheffler I, Caspers B (2024)
  Microbial Ecology 87(1): 55.

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• [23]
  

  2023 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2968940

  Quality is a Myth - Assessing and Addressing Errors in Sequencing Data
  Jünemann S (2023)
  Bielefeld: Universität Bielefeld.

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• [22]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962824

  Changes to the gut microbiota of a wild juvenile passerine in a multidimensional urban mosaic
  Maraci Ö, Corsini M, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Sudyka J, Di Lecce I, Caspers B, Szulkin M (2022)
  Scientific Reports 12(1): 6872.

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• [21]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963726

  Timing matters: Age-dependent impacts of the social environment and host selection on the avian gut microbiota
  Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Engel K, Castillo-Gutiérrez O, Busche T, Kalinowski J, Caspers B (2022)
  Microbiome 10(1): 202.

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• [20]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957501

  Multiple Occurrences of a 168-Nucleotide Deletion in SARS-CoV-2 ORF8, Unnoticed by Standard Amplicon Sequencing and Variant Calling Pipelines
  Brandt D, Simunovic M, Busche T, Haak M, Belmann P, Jünemann S, Schulz T, Klages LJ, Vinke S, Beckstette M, Pohl E, et al. (2021)
  Viruses 13(9): 1870.

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• [19]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951630

  The Gut Microbial Composition Is Species-Specific and Individual-Specific in Two Species of Estrildid Finches, the Bengalese Finch and the Zebra Finch
  Maraci Ö, Antonatou-Papaioannou A, Jünemann S, Castillo O, Busche T, Kalinowski J, Caspers B (2021)
  Frontiers in Microbiology 12: 619141.

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• [18]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949051

  Family matters: skin microbiome reflects the social group and spatial proximity in wild zebra finches
  Engel K, Pankoke H, Jünemann S, Brandl HB, Sauer J, Griffith S, Kalinowski J, Caspers B (2020)
  BMC Ecology 20(1): 58.

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• [17]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944226

  Importance of Defluviitalea raffinosedens for Hydrolytic Biomass Degradation in Co-Culture with Hungateiclostridium thermocellum
  Rettenmaier R, Schneider M, Munk B, Lebuhn M, Jünemann S, Sczyrba A, Maus I, Zverlov V, Liebl W (2020)
  Microorganisms 8(6): 915.

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• [16]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346

  Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis
  Hagenfeld D, Koch R, Jünemann S, Prior K, Harks I, Eickholz P, Hoffmann T, Kim T-S, Kocher T, Meyle J, Kaner D, et al. (2018)
  PLOS ONE 13(4): e0195534.

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• [15]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916925

  Individual- and Species-Specific Skin Microbiomes in Three Different Estrildid Finch Species Revealed by 16S Amplicon Sequencing
  Engel K, Sauer J, Jünemann S, Winkler A, Wibberg D, Kalinowski J, Tauch A, Caspers B (2018)
  Microbial Ecology 76(2): 518-529.

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• [14]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556

  Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research
  Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, Henke C, Hassa J, Nelkner J, Stolze Y, Albaum S, Schlüter A, Goesmann A, Sczyrba A, et al. (2017)
  Journal of Biotechnology 261(SI): 10-23.

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• [13]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773

  GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers
  Jünemann S, Prior K, Albersmeier A, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2014)
  PLOS ONE 9(9): e107014.

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• [12]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309

  Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing
  Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Goesmann A, Wendisch VF, Passagilia L (2013)
  Microbial Ecology 65(3): 593-601.

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• [11]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228

  Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison
  Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
  Nature biotechnology 31(12): 1148.

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• [10]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922

  Updating benchtop sequencing performance comparison
  Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
  Nature Biotechnology 31(4): 294-296.

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• [9]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614207

  Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass silaging
  Eikmeyer FG, Köfinger P, Poschenel A, Jünemann S, Zakrzewski M, Heinl S, Mayrhuber E, Grabherr R, Pühler A, Schwab H, Schlüter A (2013)
  Journal of Biotechnology 167(3): 334-343.

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• [8]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230

  Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
  Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
  PLoS ONE 7(8): e41606.

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• [7]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618

  Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing
  Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
  Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.

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• [6]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526933

  Importance of rare taxa for bacterial diversity in the rhizosphere of Bt- and conventional maize varieties
  Dohrmann AB, Küting M, Jünemann S, Jaenicke S, Schlüter A, Tebbe CC (2012)
  The ISME journal 7(1): 37-49.

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• [5]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286

  Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information
  Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
  Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.

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• [4]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276

  Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing
  Jaenicke S, Ander C, Bekel T, Bisdorf R, Dröge M, Gartemann K-H, Jünemann S, Kaiser O, Krause L, Tille F, Zakrzewski M, et al. (2011)
  PLoS ONE 6(1): e14519.

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• [3]
  

  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751

  Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods
  Jaenicke S, Zakrzewski M, Jünemann S, Pühler A, Goesmann A, Schlüter A (2011)
  In: Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. de Bruijn FJ (Ed); Hoboken, NJ, USA: Wiley-Blackwell: 403-414.

  PUB | DOI
   
• [2]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321

  EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data
  Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, et al. (2009)
  BMC Bioinformatics 10(1): 50.

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• [1]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098

  WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads
  Gerlach W, Jünemann S, Tille F, Goesmann A, Stoye J (2009)
  BMC Bioinformatics 10(1): 430.

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