PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2961451

  Hahn, J.; Koch, D.; Niehaus, K.; Ortseifen, V. (2022): Analysis of Gum proteins involved in xanthan biosynthesis throughout multiple cell fractions in a "single-tube" Journal of Proteomics ,257:104513

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• [18]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2961446

  Steffens, T.; Vorhölter, F. - J.; Teckentrup, J.; Hublik, G.; Walhorn, V.; Anselmetti, D.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Ortseifen, V. (2022): Two Flagellar mutants of Xanthomonas campestris are characterized by enhanced xanthan production and higher xanthan viscosity Journal of Biotechnology ,347: 9-17.

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• [17]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2958751

  Ostaszewski, M.; Niarakis, A.; Mazein, A.; Kuperstein, I.; Phair, R.; Orta-Resendiz, A.; Singh, V.; Aghamiri, S. S.; Acencio, M. L.; Glaab, E.; Ruepp, A.; Fobo, G.; Montrone, C.; Brauner, B.; Frishman, G.; Monraz Gomez, L. C.; Somers, J.; Hoch, M.; Kumar Gupta, S.; Scheel, J.; Borlinghaus, H.; Czauderna, T.; Schreiber, F.; Montagud, A.; Ponce de Leon, M.; Funahashi, A.; Hiki, Y.; Hiroi, N.; Yamada, T. G.; Drager, A.; Renz, A.; Naveez, M.; Bocskei, Z.; Messina, F.; Bornigen, D.; Fergusson, L.; Conti, M.; Rameil, M.; Nakonecnij, V.; Vanhoefer, J.; Schmiester, L.; Wang, M.; Ackerman, E. E.; Shoemaker, J. E.; Zucker, J.; Oxford, K.; Teuton, J.; Kocakaya, E.; Summak, G. Y.; Hanspers, K.; Kutmon, M.; Coort, S.; Eijssen, L.; Ehrhart, F.; Rex, D. A. B.; Slenter, D.; Martens, M.; Pham, N.; Haw, R.; Jassal, B.; Matthews, L.; Orlic-Milacic, M.; Senff Ribeiro, A.; Rothfels, K.; Shamovsky, V.; Stephan, R.; Sevilla, C.; Varusai, T.; Ravel, J. - M.; Fraser, R.; Ortseifen, V.; Marchesi, S.; Gawron, P.; Smula, E.; Heirendt, L.; Satagopam, V.; Wu, G.; Riutta, A.; Golebiewski, M.; Owen, S.; Goble, C.; Hu, X.; Overall, R. W.; Maier, D.; Bauch, A.; Gyori, B. M.; Bachman, J. A.; Vega, C.; Groues, V.; Vazquez, M.; Porras, P.; Licata, L.; Iannuccelli, M.; Sacco, F.; Nesterova, A.; Yuryev, A.; de Waard, A.; Turei, D.; Luna, A.; Babur, O.; Soliman, S.; Valdeolivas, A.; Esteban-Medina, M.; Pena-Chilet, M.; Rian, K.; Helikar, T.; Puniya, B. L.; Modos, D.; Treveil, A.; Olbei, M.; De Meulder, B.; Ballereau, S.; Dugourd, A.; Naldi, A.; Noel, V.; Calzone, L.; Sander, C.; Demir, E.; Korcsmaros, T.; Freeman, T. C.; Auge, F.; Beckmann, J. S.; Hasenauer, J.; Wolkenhauer, O.; Wilighagen, E. L.; Pico, A. R.; Evelo, C. T.; Gillespie, M. E.; Stein, L. D.; Hermjakob, H.; D'Eustachio, P.; Saez-Rodriguez, J.; Dopazo, J.; Valencia, A.; Kitano, H.; Barillot, E.; Auffray, C.; Balling, R.; Schneider, R. (2021): COVID19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus-host interaction mechanisms Molecular systems biology,17:(10):e10387

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• [16]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956600

  Schaffert, L.; Ruwe, M.; Milse, J.; Hanuschka, K.; Ortseifen, V.; Droste, J.; Brandt, D.; Schlüter, L.; Kutter, Y.; Vinke, S.; Viehöfer, P.; Jacob, L.; Lübke, N. - C.; Schulte-Berndt, E.; Hain, C.; Linder, M.; Schmidt, P.; Wollenschläger, L.; Luttermann, T.; Thieme, E.; Hassa, J.; Haak, M.; Wittchen, M.; Mentz, A.; Persicke, M.; Busche, T.; Rückert, C. (2021): Classification of three corynebacterial strains isolated from a small paddock in North Rhine-Westphalia: proposal of Corynebacterium kalinowskii sp. nov., Corynebacterium comes sp. nov. and Corynebacterium occultum sp. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,71:(8)

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
   
• [15]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948721

  Ortseifen, V.; Viefhues, M.; Wobbe, L.; Grünberger, A. (2020): Microfluidics for Biotechnology: Bridging Gaps to Foster Microfluidic Applications Frontiers in Bioengineering and Biotechnology,8:589074

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• [14]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949080

  Droste, J.; Ortseifen, V.; Schaffert, L.; Persicke, M.; Schneiker-Bekel, S.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2020): The expression of the acarbose biosynthesis gene cluster in Actinoplanes sp. SE50/110 is dependent on the growth phase. BMC genomics,21:818

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• [13]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936329

  Ismail, M.; Frese, M.; Patschkowski, T.; Ortseifen, V.; Niehaus, K.; Sewald, N. (2019): Flavin-Dependent Halogenases from Xanthomonas campestris pv. campestris B100 Prefer Bromination over Chlorination ADVANCED SYNTHESIS & CATALYSIS,361:(11): 2475-2486.

  PUB | DOI | WoS
   
• [12]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933337

  Schulte, F.; Leßmeier, L.; Voß, J.; Ortseifen, V.; Vorhölter, F. - J.; Niehaus, K. (2019): Regulatory associations between the metabolism of sulfur-containing amino acids and xanthan biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris B100. FEMS microbiology letters,366:(2):fnz005

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• [11]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510

  Alkhateeb, R.; Vorhölter, F. - J.; Steffens, T.; Rückert, C.; Ortseifen, V.; Hublik, G.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2018): Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase Applied Microbiology and Biotechnology,102:(15): 6613-6625.

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• [10]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913116

  Wolf, T.; Droste, J.; Gren, T.; Ortseifen, V.; Schneiker-Bekel, S.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2017): The MalR type regulator AcrC is a transcriptional repressor of acarbose biosynthetic genes in Actinoplanes sp. SE50/110 BMC Genomics,18:(1):562

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• [9]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914538

  Ortseifen, V.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Rückert, C. (2017): The complete genome sequence of the actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) carrying gene clusters for the biosynthesis of tetracenomycin C, 5`-hydroxy streptomycin, and acarbose. J Biotechnol,262: 84-88.

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• [8]
  

  2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2904907

  Ortseifen, V. (2016): Genombasierte Modellbildung zur Biosynthese von Acarviostatin-Metaboliten in drei Actinoplanes sp. SE50/110-Stämmen. Bielefeld: Universität Bielefeld.

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• [7]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905630

  Gren, T.; Ortseifen, V.; Wibberg, D.; Schneiker-Bekel, S.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Zemke, T.; Persicke, M.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2016): Genetic engineering in Actinoplanes sp SE50/110-development of an intergeneric conjugation system for the introduction of actinophage-based integrative vectors Journal of Biotechnology,232: 79-88.

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• [6]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905632

  Walter, F.; Grenz, S.; Ortseifen, V.; Persicke, M.; Kalinowski, J. (2016): Corynebacterium glutamicum ggtB encodes a functional gamma-glutamyl transpeptidase with gamma-glutamyl dipeptide synthetic and hydrolytic activity Journal of Biotechnology,232: 99-109.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [5]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901243

  Wendler, S.; Otto, A.; Ortseifen, V.; Bonn, F.; Neshat, A.; Schneiker-Bekel, S.; Wolf, T.; Zemke, T.; Wehmeier, U. F.; Hecker, M.; Kalinowski, J.; Becher, D.; Pühler, A. (2016): Comparative proteome analysis of Actinoplanes sp SE50/110 grown with maltose or glucose shows Minor differences for acarbose biosynthesis proteins but major differences for saccharide transporters Journal of Proteomics,131: 140-148.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [4]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904234

  Ortseifen, V.; Stolze, Y.; Maus, I.; Sczyrba, A.; Bremges, A.; Albaum, S.; Jaenicke, S.; Fracowiak, J.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): An integrated metagenome and -proteome analysis of the microbial community residing in a biogas production plant Journal of Biotechnology,231: 268-279.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [3]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709783

  Ortseifen, V.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Wendler, S.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) consisting of a linear chromosome and one linear plasmid Journal of Biotechnology,194: 81-83.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [2]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764307

  Wendler, S.; Otto, A.; Ortseifen, V.; Bonn, F.; Neshat, A.; Schneiker-Bekel, S.; Walter, F.; Wolf, T.; Zemke, T.; Wehmeier, U. F.; Hecker, M.; Kalinowski, J.; Becher, D.; Pühler, A. (2015): Comprehensive proteome analysis of Actinoplanes sp SE50/110 highlighting the location of proteins encoded by the acarbose and the pyochelin biosynthesis gene cluster Journal of Proteomics,125: 1-16.

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• [1]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710431

  Wendler, S.; Ortseifen, V.; Persicke, M.; Klein, A.; Neshat, A.; Niehaus, K.; Schneiker-Bekel, S.; Walter, F.; Wehmeier, U. F.; Kalinowski, J.; Pühler, A. (2014): Carbon source dependent biosynthesis of acarviose metabolites in Actinoplanes sp SE50/110 Journal of Biotechnology,191: 113-120.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC