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[20]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945723
Kloster, M., Langenkämper, D., Zurowietz, M., Beszteri, B. & Nattkemper, T.W. (2020). Deep learning-based diatom taxonomy on virtual slides. Scientific Reports, 10(1): 14416. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-020-71165-w.
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[19]
2020 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2941174 OA
Langenkämper, D. (2020). Data-driven models for taxonomic classification in marine science. Bielefeld: Universität Bielefeld. doi:10.4119/unibi/2941174.
PUB | PDF | DOI
 
[18]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948381
Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2020). Corrigendum: BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 7: 617268. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fmars.2020.617268.
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[17]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944775
Schoening, T., Purser, A., Langenkämper, D., Suck, I., Taylor, J., Cuvelier, D., Lins, L., Simon-Lledo, E., Marcon, Y., Jones, D.O.B., Nattkemper, T.W., Koeser, K., Zurowietz, M., Gomes-Pereira, J. & Greinert, J. (2020). Megafauna community assessment of polymetallic-nodule fields with cameras: platform and methodology comparison. BIOGEOSCIENCES, 17(12), 3115-3133. Copernicus Gesellschaft Mbh. doi:10.5194/bg-17-3115-2020.
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[16]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944758 OA
Langenkämper, D., van Kevelaer, R., Purser, A. & Nattkemper, T.W. (2020). Gear-Induced Concept Drift in Marine Images and Its Effect on Deep Learning Classification. Frontiers in Marine Science, 7: 506. Frontiers Media . doi:10.3389/fmars.2020.00506.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
[15]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936069 OA
Langenkämper, D., Simon-Lledó, E., Hosking, B., Jones, D.O.B. & Nattkemper, T.W. (2019). On the impact of Citizen Science-derived data quality on deep learning based classification in marine images. PLOS ONE, 14(6): e0218086. Public Library of Science. doi:10.1371/journal.pone.0218086.
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[14]
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935366
Zurowietz, M., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (2019). BIIGLE2Go - A scalable image annotation system for easy deployment on cruises. Proceedings of IEEE OCEANS 2019. Gehalten auf der IEEE OCEANS. doi:10.1109/OCEANSE.2019.8867417.
PUB | DOI | Download (ext.)
 
[13]
2019 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2937705
Möller, T., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Wind turbine segmentation performing kNN-clustering on superpixel segmentations (Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Proceedings). In L. Bruzzone & F. Bovolo (Hrsg.), Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Gehalten auf der SPIE REMOTE SENSING.
PUB
 
[12]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932066 OA
Zurowietz, M., Langenkämper, D., Hosking, B., Ruhl, H. & Nattkemper, T.W. (2018). MAIA - A machine learning assisted image annotation method for environmental monitoring and exploration . PLoS ONE, 13(11): e0207498. PLoS. doi:10.1371/journal.pone.0207498.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2018 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2921039 OA
Langenkämper, D., van Kevelaer, R. & Nattkemper, T.W. (Accepted). Strategies for Tackling the Class Imbalance Problem in Marine Image Classification. Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition 2018, Computer Vision for Automated Analysis of Underwater Imagery Workshop.
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[10]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909190 OA
Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2017). BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 4(March): 83. Frontiers Media. doi:10.3389/fmars.2017.00083.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS
 
[9]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901477
Ahmed Raza, S.E., Langenkämper, D., Sirinukunwattana, K., Epstein, D., Nattkemper, T.W. & Rajpoot, N.M. (2016). Robust normalization protocols for multiplexed fluorescence bioimage analysis. BioData Mining, 9(1): 11. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s13040-016-0088-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900943
Langenkämper, D., Jakobi, T., Feld, D., Jelonek, L., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2016). Comparison of Acceleration Techniques for Selected Low-Level Bioinformatics Operations. Frontiers in Genetics, 7: 5. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fgene.2016.00005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2016 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2904670
Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (Accepted). COATL - A Learning Architecture for Online Real-Time Detection and Classification Assistance for Environmental Data. Proceedings of the International Conference on Pattern Recognition (ICPR). Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition (ICPR).
PUB
 
[6]
2015 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2775947
Schoening, T., Langenkämper, D., Steinbrink, B., Brün, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Rapid image processing and classification in underwater exploration using advanced high performance computing. Proc. of the IEEE Oceans. Gehalten auf der IEEE Oceans, Washington DC, USA: IEEE.
PUB
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705712 OA
Langenkämper, D., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2014). AKE - The Accelerated k-mer Exploration Web-Tool for Rapid Taxonomic Classification and Visualization. BMC Bioinformatics, 15(1): 384. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12859-014-0384-0.
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[4]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783 OA
Kölling, J., Langenkämper, D., Sylvie, A., Michale, K. & Nattkemper, T.W. (2012). WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages. Bioinformatics, 28(8), 1143-1150. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts104.
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[3]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300232 OA
Loyek, C., Kölling, J., Langenkämper, D., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). A Web2.0 Strategy for the Collaborative Analysis of Complex Bioimages (Lecture Notes in Computer Science). In J. Gama, E. Bradley & J. Hollmén (Hrsg.), Advances in Intelligent Data Analysis X: 10th International Symposium, IDA 2011, Porto, Portugal, October 29-31, 2011. Proceedings (S. 258-269). Gehalten auf der IDA (The 10th International Symposium on Intelligent Data Analysis), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-24800-9_25.
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[2]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300237 OA
Langenkämper, D., Kölling, J., Khan, M., Rajpoot, N. & Nattkemper, T.W. (2011). Towards Protein Network Analysis using TIS Imaging and Exploratory Data Analysis. Gehalten auf der Workshop on Computational Systems Biology (WCSB).
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[1]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2323705 OA
Langenkämper, D., Kölling, J., Abouna, S., Khan, M., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). TICAL - a web-tool for multivariate image clustering and data topology preserving visualization. Gehalten auf der Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB).
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945723
Kloster, M., Langenkämper, D., Zurowietz, M., Beszteri, B. & Nattkemper, T.W. (2020). Deep learning-based diatom taxonomy on virtual slides. Scientific Reports, 10(1): 14416. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-020-71165-w.
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[19]
2020 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2941174 OA
Langenkämper, D. (2020). Data-driven models for taxonomic classification in marine science. Bielefeld: Universität Bielefeld. doi:10.4119/unibi/2941174.
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[18]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948381
Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2020). Corrigendum: BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 7: 617268. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fmars.2020.617268.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944775
Schoening, T., Purser, A., Langenkämper, D., Suck, I., Taylor, J., Cuvelier, D., Lins, L., Simon-Lledo, E., Marcon, Y., Jones, D.O.B., Nattkemper, T.W., Koeser, K., Zurowietz, M., Gomes-Pereira, J. & Greinert, J. (2020). Megafauna community assessment of polymetallic-nodule fields with cameras: platform and methodology comparison. BIOGEOSCIENCES, 17(12), 3115-3133. Copernicus Gesellschaft Mbh. doi:10.5194/bg-17-3115-2020.
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[16]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944758 OA
Langenkämper, D., van Kevelaer, R., Purser, A. & Nattkemper, T.W. (2020). Gear-Induced Concept Drift in Marine Images and Its Effect on Deep Learning Classification. Frontiers in Marine Science, 7: 506. Frontiers Media . doi:10.3389/fmars.2020.00506.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936069 OA
Langenkämper, D., Simon-Lledó, E., Hosking, B., Jones, D.O.B. & Nattkemper, T.W. (2019). On the impact of Citizen Science-derived data quality on deep learning based classification in marine images. PLOS ONE, 14(6): e0218086. Public Library of Science. doi:10.1371/journal.pone.0218086.
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2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935366
Zurowietz, M., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (2019). BIIGLE2Go - A scalable image annotation system for easy deployment on cruises. Proceedings of IEEE OCEANS 2019. Gehalten auf der IEEE OCEANS. doi:10.1109/OCEANSE.2019.8867417.
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[13]
2019 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2937705
Möller, T., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Wind turbine segmentation performing kNN-clustering on superpixel segmentations (Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Proceedings). In L. Bruzzone & F. Bovolo (Hrsg.), Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Gehalten auf der SPIE REMOTE SENSING.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932066 OA
Zurowietz, M., Langenkämper, D., Hosking, B., Ruhl, H. & Nattkemper, T.W. (2018). MAIA - A machine learning assisted image annotation method for environmental monitoring and exploration . PLoS ONE, 13(11): e0207498. PLoS. doi:10.1371/journal.pone.0207498.
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2018 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2921039 OA
Langenkämper, D., van Kevelaer, R. & Nattkemper, T.W. (Accepted). Strategies for Tackling the Class Imbalance Problem in Marine Image Classification. Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition 2018, Computer Vision for Automated Analysis of Underwater Imagery Workshop.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909190 OA
Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2017). BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 4(March): 83. Frontiers Media. doi:10.3389/fmars.2017.00083.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901477
Ahmed Raza, S.E., Langenkämper, D., Sirinukunwattana, K., Epstein, D., Nattkemper, T.W. & Rajpoot, N.M. (2016). Robust normalization protocols for multiplexed fluorescence bioimage analysis. BioData Mining, 9(1): 11. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s13040-016-0088-2.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900943
Langenkämper, D., Jakobi, T., Feld, D., Jelonek, L., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2016). Comparison of Acceleration Techniques for Selected Low-Level Bioinformatics Operations. Frontiers in Genetics, 7: 5. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fgene.2016.00005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2016 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2904670
Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (Accepted). COATL - A Learning Architecture for Online Real-Time Detection and Classification Assistance for Environmental Data. Proceedings of the International Conference on Pattern Recognition (ICPR). Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition (ICPR).
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2015 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2775947
Schoening, T., Langenkämper, D., Steinbrink, B., Brün, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Rapid image processing and classification in underwater exploration using advanced high performance computing. Proc. of the IEEE Oceans. Gehalten auf der IEEE Oceans, Washington DC, USA: IEEE.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705712 OA
Langenkämper, D., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2014). AKE - The Accelerated k-mer Exploration Web-Tool for Rapid Taxonomic Classification and Visualization. BMC Bioinformatics, 15(1): 384. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12859-014-0384-0.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783 OA
Kölling, J., Langenkämper, D., Sylvie, A., Michale, K. & Nattkemper, T.W. (2012). WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages. Bioinformatics, 28(8), 1143-1150. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts104.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300232 OA
Loyek, C., Kölling, J., Langenkämper, D., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). A Web2.0 Strategy for the Collaborative Analysis of Complex Bioimages (Lecture Notes in Computer Science). In J. Gama, E. Bradley & J. Hollmén (Hrsg.), Advances in Intelligent Data Analysis X: 10th International Symposium, IDA 2011, Porto, Portugal, October 29-31, 2011. Proceedings (S. 258-269). Gehalten auf der IDA (The 10th International Symposium on Intelligent Data Analysis), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-24800-9_25.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300237 OA
Langenkämper, D., Kölling, J., Khan, M., Rajpoot, N. & Nattkemper, T.W. (2011). Towards Protein Network Analysis using TIS Imaging and Exploratory Data Analysis. Gehalten auf der Workshop on Computational Systems Biology (WCSB).
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2323705 OA
Langenkämper, D., Kölling, J., Abouna, S., Khan, M., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). TICAL - a web-tool for multivariate image clustering and data topology preserving visualization. Gehalten auf der Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB).
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