Alexander Schönhuth

aschoen@cebitec.uni-bielefeld.de
ORCID logo https://orcid.org/0000-0003-3529-0856

PEVZ-ID
202729007

54 Publikationen

Alle markieren

  • [54]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2985113 OA
    Kang, X.; Xu, J.; Luo, X.; Schönhuth, A. (2023): Hybrid-hybrid correction of errors in long reads with HERO Genome Biology ,24:(1):275
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [53]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2969521
    Luo, X.; Kang, X.; Schönhuth, A. (2023): Predicting the prevalence of complex genetic diseases from individual genotype profiles using capsule networks Nature Machine Intelligence
    PUB | DOI | WoS
     
  • [52]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2966833 OA
    Luo, X.; Kang, X.; Schönhuth, A. (2022): VeChat: correcting errors in long reads using variation graphs Nature Communications,13:(1):6657
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [51]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963686 OA
    Luo, X.; Kang, X.; Schönhuth, A. (2022): Enhancing Long-Read-Based Strain-Aware Metagenome Assembly Frontiers in Genetics,13:868280
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [50]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964174 OA
    Kang, X.; Luo, X.; Schönhuth, A. (2022): StrainXpress: strain aware metagenome assembly from short reads Nucleic Acids Research ,50:(17):gkac543
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [49]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960849 OA
    Luo, X.; Kang, X.; Schönhuth, A. (2022): Strainline: full-length de novo viral haplotype reconstruction from noisy long reads Genome Biology ,23:(1):29
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [48]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2967245
    Ray, S.; Lall, S.; Mukhopadhyay, A.; Bandyopadhyay, S.; Schönhuth, A. (2022): Deep variational graph autoencoders for novel host-directed therapy options against COVID-19 Artificial Intelligence in Medicine,134:102418
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [47]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2958717 OA
    Luo, X.; Kang, X.; Schönhuth, A. (2021): phasebook: haplotype-aware de novo assembly of diploid genomes from long reads Genome Biology,22:(1):299
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [46]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2952469
    Metselaar, P. I.; Mendoza-Maldonado, L.; Li Yim, A. Y. F.; Abarkan, I.; Henneman, P.; Te Velde, A. A.; Schönhuth, A.; Bosch, J. A.; Kraneveld, A. D.; Lopez-Rincon, A. (2021): Recursive ensemble feature selection provides a robust mRNA expression signature for myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome. Scientific reports,11:(1):4541
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [45]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959624 OA
    Lahnemann, D.; Koster, J.; Fischer, U.; Borkhardt, A.; McHardy, A. C.; Schönhuth, A. (2021): Accurate and scalable variant calling from single cell DNA sequencing data with ProSolo Nature Communications,12:(1):6744
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [44]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945617
    Lopez-Rincon, A.; Mendoza-Maldonado, L.; Martinez-Archundia, M.; Schönhuth, A.; Kraneveld, A. D.; Garssen, J.; Tonda, A. (2020): Machine Learning-Based Ensemble Recursive Feature Selection of Circulating miRNAs for Cancer Tumor Classification Cancers,12:(7):1785
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [43]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943113
    Koster, J.; Dijkstra, L. J.; Marschall, T.; Schönhuth, A. (2020): Varlociraptor: enhancing sensitivity and controlling false discovery rate in somatic indel discovery. Genome biology,21:(1)
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [42]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941754
    Baaijens, J. A.; Van der Roest, B.; Köster, J.; Stougie, L.; Schönhuth, A. (2019): Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction Bioinformatics,35:(24): 5086-5094.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [41]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941756
    Yin, B.; Balvert, M.; van der Spek, R. A. A.; Dutilh, B. E.; Bohté, S.; Veldink, J.; Schönhuth, A. (2019): Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype Bioinformatics,35:(14): i538-i547.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [40]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941760
    Lopez-Rincon, A.; Martinez-Archundia, M.; Martinez-Ruiz, G. U.; Schönhuth, A.; Tonda, A. (2019): Automatic discovery of 100-miRNA signature for cancer classification using ensemble feature selection BMC Bioinformatics,20:(1):480
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [39]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941677
    Denti, L.; Previtali, M.; Bernardini, G.; Schönhuth, A.; Bonizzoni, P. (2019): MALVA: Genotyping by Mapping-free ALlele Detection of Known VAriants iScience,18: 20-27.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [38]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941761
    Baaijens, J. A.; Schönhuth, A. (2019): Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids Bioinformatics,35:(21): 4281-4289.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [37]
    2019 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941762
    Balvert, M.; Hauptfeld, T.; Schönhuth, A.; Dutilh, B. E. (2019): OGRE: Overlap Graph-based metagenomic Read clustEring bioRxiv
    PUB | Preprint
     
  • [36]
    2019 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941763
    Baaijens, J. A.; Stougie, L.; Schönhuth, A. (2019): Strain-aware assembly of genomes from mixed samples using flow variation graphs bioRxiv
    PUB | Preprint
     
  • [35]
    2019 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941764
    Laehnemann, D.; Köster, J.; Szczurek, E.; McCarthy, D. J.; Hicks, S. C.; Robinson, M. D.; Vallejos, C. A.; Beerenwinkel, N.; Campbell, K. R.; Mahfouz, A.; Pinello, L.; Skums, P.; Stamatakis, A.; Stephan-Otto Attolini, C.; Aparicio, S.; Baaijens, J.; Balvert, M.; de Barbanson, B.; Cappuccio, A.; Corleone, G.; Dutilh, B. E.; Florescu, M.; Guryev, V.; Holmer, R.; Jahn, K.; Jessurun Lobo, T.; Keizer, E. M.; Khatri, I.; Kiełbasa, S. M.; Korbel, J. O.; Kozlov, A. M.; Kuo, T. - H.; Lelieveldt, B. P. F.; Mandoiu, I. I.; Marioni, J. C.; Marschall, T.; Mölder, F.; Niknejad, A.; Rączkowski, Ł.; Reinders, M.; de Ridder, J.; Saliba, A. - E.; Somarakis, A.; Stegle, O.; Theis, F. J.; Yang, H.; Zelikovsky, A.; McHardy, A. C.; Raphael, B. J.; Shah, S. P.; Schönhuth, A. (2019): 12 Grand Challenges in Single-Cell Data Science PeerJ
    PUB
     
  • [34]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941769
    Ibrahim, B.; Arkhipova, K.; Andeweg, A.; Posada-Céspedes, S.; Enault, F.; Gruber, A.; Koonin, E.; Kupczok, A.; Lemey, P.; McHardy, A.; McMahon, D.; Pickett, B.; Robertson, D.; Scheuermann, R.; Zhernakova, A.; Zwart, M.; Schönhuth, A.; Dutilh, B.; Marz, M. (2018): Bioinformatics Meets Virology: The European Virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting Viruses,10:(5):256
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [33]
    2018 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941767
    Baaijens, J. A.; Van der Roest, B.; Köster, J.; Stougie, L.; Schönhuth, A. (2018): Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction bioRxiv
    PUB | Preprint
     
  • [32]
    2018 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941768
    Yin, B.; Balvert, M.; Zambrano, D.; Schönhuth, A.; Bohte, S. (2018): An image representation based convolutional network for DNA classification arXiv:1806.04931
    PUB | arXiv
     
  • [31]
    2018 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941765
    Chikhi, R.; Schönhuth, A. (2018): Dualities in Tree Representations arXiv:1804.04263
    PUB | arXiv
     
  • [30]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941784
    Baaijens, J. A.; Aabidine, A. Z. E.; Rivals, E.; Schönhuth, A. (2017): De novo assembly of viral quasispecies using overlap graphs Genome Research,27:(5): 835-848.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [29]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941785
    Dröge, J.; Schönhuth, A.; McHardy, A. C. (2017): A probabilistic model to recover individual genomes from metagenomes PeerJ Computer Science,3:e117
    PUB | DOI | WoS
     
  • [28]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941786
    Ebler, J.; Schönhuth, A.; Marschall, T. (2017): Genotyping inversions and tandem duplications Bioinformatics,33:(24): 4015-4023.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [27]
    2017 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941789
    Dijkstra, L. J.; Köster, J.; Marschall, T.; Schönhuth, A. (2017): Enhancing sensitivity and controlling false discovery rate in somatic indel discovery using a latent variable model bioRxiv
    PUB | Preprint
     
  • [26]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941788
    Francioli, L. C.; Cretu-Stancu, M.; Garimella, K. V.; Fromer, M.; Kloosterman, W. P.; Samocha, K. E.; Neale, B. M.; Daly, M. J.; Banks, E.; DePristo, M. A.; de Bakker, P. I. W.; Schönhuth, A. (2016): A framework for the detection of de novo mutations in family-based sequencing data European Journal of Human Genetics,25:(2): 227-233.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [25]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941793
    Gregor, I.; Schönhuth, A.; McHardy, A. C. (2016): Snowball: strain aware gene assembly of metagenomes Bioinformatics,32:(17): i649-i657.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [24]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941790
    Hehir-Kwa, J. Y.; Marschall, T.; Kloosterman, W. P.; Francioli, L. C.; Baaijens, J. A.; Dijkstra, L. J.; Abdellaoui, A.; Koval, V.; Thung, D. T.; Wardenaar, R.; Renkens, I.; Coe, B. P.; Deelen, P.; de Ligt, J.; Lameijer, E. - W.; van Dijk, F.; Hormozdiari, F.; Uitterlinden, A. G.; van Duijn, C. M.; Eichler, E. E.; de Bakker, P. I. W.; Swertz, M. A.; Wijmenga, C.; van Ommen, G. - J. B.; Slagboom, P. E.; Boomsma, D. I.; Schönhuth, A.; Ye, K.; Guryev, V. (2016): A high-quality human reference panel reveals the complexity and distribution of genomic structural variants Nature Communications,7:(1):12989
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [23]
    2016 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941794
    Martin, M.; Patterson, M.; Garg, S.; O Fischer, S.; Pisanti, N.; Klau, G. W.; Schönhuth, A.; Marschall, T. (2016): WhatsHap: fast and accurate read-based phasing bioRxiv
    PUB | Preprint
     
  • [22]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941807
    Palamara, P. F.; Francioli, L. C.; Wilton, P. R.; Genovese, G.; Gusev, A.; Finucane, H. K.; Sankararaman, S.; Sunyaev, S. R.; de Bakker, P. I. W.; Wakeley, J.; Pe’er, I.; Price, A. L.; Schönhuth, A. (2015): Leveraging Distant Relatedness to Quantify Human Mutation and Gene-Conversion Rates The American Journal of Human Genetics,97:(6): 775-789.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [21]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941797
    Kloosterman, W. P.; Francioli, L. C.; Hormozdiari, F.; Marschall, T.; Hehir-Kwa, J. Y.; Abdellaoui, A.; Lameijer, E. - W.; Moed, M. H.; Koval, V.; Renkens, I.; van Roosmalen, M. J.; Arp, P.; Karssen, L. C.; Coe, B. P.; Handsaker, R. E.; Suchiman, E. D.; Cuppen, E.; Thung, D. T.; McVey, M.; Wendl, M. C.; Uitterlinden, A.; van Duijn, C. M.; Swertz, M. A.; Wijmenga, C.; van Ommen, G. J. B.; Slagboom, P. E.; Boomsma, D. I.; Schönhuth, A.; Eichler, E. E.; de Bakker, P. I. W.; Ye, K.; Guryev, V. (2015): Characteristics of de novo structural changes in the human genome Genome Research,25:(6): 792-801.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [20]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941798
    Leung, W. Y.; Marschall, T.; Paudel, Y.; Falquet, L.; Mei, H.; Schönhuth, A.; Maoz, T. Y. (2015): SV-AUTOPILOT: optimized, automated construction of structural variation discovery and benchmarking pipelines BMC Genomics,16:(1):238
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [19]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941804
    van Leeuwen, E. M.; Karssen, L. C.; Deelen, J.; Isaacs, A.; Medina-Gomez, C.; Mbarek, H.; Kanterakis, A.; Trompet, S.; Postmus, I.; Verweij, N.; van Enckevort, D. J.; Huffman, J. E.; White, C. C.; Feitosa, M. F.; Bartz, T. M.; Manichaikul, A.; Joshi, P. K.; Peloso, G. M.; Deelen, P.; van Dijk, F.; Willemsen, G.; de Geus, E. J.; Milaneschi, Y.; Penninx, B. W. J. H.; Francioli, L. C.; Menelaou, A.; Pulit, S. L.; Rivadeneira, F.; Hofman, A.; Oostra, B. A.; Franco, O. H.; Leach, I. M.; Beekman, M.; de Craen, A. J. M.; Uh, H. - W.; Trochet, H.; Hocking, L. J.; Porteous, D. J.; Sattar, N.; Packard, C. J.; Buckley, B. M.; Brody, J. A.; Bis, J. C.; Rotter, J. I.; Mychaleckyj, J. C.; Campbell, H.; Duan, Q.; Lange, L. A.; Wilson, J. F.; Hayward, C.; Polasek, O.; Vitart, V.; Rudan, I.; Wright, A. F.; Rich, S. S.; Psaty, B. M.; Borecki, I. B.; Kearney, P. M.; Stott, D. J.; Adrienne Cupples, L.; Jukema, J. W.; van der Harst, P.; Sijbrands, E. J.; Hottenga, J. - J.; Uitterlinden, A. G.; Swertz, M. A.; van Ommen, G. - J. B.; de Bakker, P. I. W.; Eline Slagboom, P.; Boomsma, D. I.; Wijmenga, C.; van Duijn, C. M.; Schönhuth, A. (2015): Genome of the Netherlands population-specific imputations identify an ABCA6 variant associated with cholesterol levels Nature Communications,6:(1):6065
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [18]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941799
    Patterson, M.; Marschall, T.; Pisanti, N.; van Iersel, L.; Stougie, L.; Klau, G. W.; Schönhuth, A. (2015): WhatsHap: Weighted Haplotype Assembly for Future-Generation Sequencing Reads Journal of Computational Biology,22:(6): 498-509.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [17]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941803
    van Leeuwen, E. M.; Kanterakis, A.; Deelen, P.; Kattenberg, M. V.; Slagboom, P. E.; de Bakker, P. I. W.; Wijmenga, C.; Swertz, M. A.; Boomsma, D. I.; van Duijn, C. M.; Karssen, L. C.; Hottenga, J. J.; Schönhuth, A. (2015): Population-specific genotype imputations using minimac or IMPUTE2 Nature Protocols,10:(9): 1285-1296.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [16]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941805
    Francioli, L. C.; Polak, P. P.; Koren, A.; Menelaou, A.; Chun, S.; Renkens, I.; van Duijn, C. M.; Swertz, M.; Wijmenga, C.; van Ommen, G.; Slagboom, P. E.; Boomsma, D. I.; Ye, K.; Guryev, V.; Arndt, P. F.; Kloosterman, W. P.; de Bakker, P. I. W.; Sunyaev, S. R.; Schönhuth, A. (2015): Genome-wide patterns and properties of de novo mutations in humans Nature Genetics,47:(7): 822-826.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [15]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764612 OA
    Wittler, R.; Marschall, T.; Schönhuth, A.; Makinen, V. (2015): Repeat- and error-aware comparison of deletions Bioinformatics,31:(18): 2947-2954.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [14]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941795
    Cijvat, R.; Manegold, S.; Kersten, M.; Klau, G. W.; Schönhuth, A.; Marschall, T.; Zhang, Y. (2015): Genome sequence analysis with MonetDB Datenbank-Spektrum,15:(3): 185-191.
    PUB | DOI
     
  • [13]
    2015 | Preprint | PUB-ID: 2941808
    Faigle, U.; Schönhuth, A. (2015): On Hidden States in Quantum Random Walks arXiv:1601.02882
    PUB | arXiv
     
  • [12]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941816
    Deelen, P.; Menelaou, A.; van Leeuwen, E. M.; Kanterakis, A.; van Dijk, F.; Medina-Gomez, C.; Francioli, L. C.; Hottenga, J. J.; Karssen, L. C.; Estrada, K.; Kreiner-Møller, E.; Rivadeneira, F.; van Setten, J.; Gutierrez-Achury, J.; Westra, H. - J.; Franke, L.; van Enckevort, D.; Dijkstra, M.; Byelas, H.; van Duijn, C. M.; de Bakker, P. I. W.; Wijmenga, C.; Swertz, M. A.; Schönhuth, A. (2014): Improved imputation quality of low-frequency and rare variants in European samples using the ‘Genome of The Netherlands’ European Journal of Human Genetics,22:(11): 1321-1326.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [11]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941810
    Töpfer, A.; Marschall, T.; Bull, R. A.; Luciani, F.; Schönhuth, A.; Beerenwinkel, N. (2014): Viral Quasispecies Assembly via Maximal Clique Enumeration PLoS Computational Biology,10:(3):e1003515
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [10]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941835
    El-Kebir, M.; Marschall, T.; Wohlers, I.; Patterson, M.; Heringa, J.; Schönhuth, A.; Klau, G. W. (2013): Mapping proteins in the presence of paralogs using units of coevolution BMC Bioinformatics,14:(S15):S18
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [9]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941837
    Allhoff, M.; Schönhuth, A.; Martin, M.; Costa, I. G.; Rahmann, S.; Marschall, T. (2013): Discovering motifs that induce sequencing errors BMC Bioinformatics,14:(Suppl 5):S1
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [8]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941836
    Marschall, T.; Hajirasouliha, I.; Schönhuth, A. (2013): MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels Bioinformatics,29:(24): 3143-3150.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [7]
    2013 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941838
    Marschall, T.; Schönhuth, A. (2013): Sensitive Long-Indel-Aware Alignment of Sequencing Reads arXiv:1303.3520
    PUB | arXiv
     
  • [6]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941839
    Marschall, T.; Costa, I. G.; Canzar, S.; Bauer, M.; Klau, G. W.; Schliep, A.; Schönhuth, A. (2012): CLEVER: clique-enumerating variant finder Bioinformatics,28:(22): 2875-2882.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [5]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941840
    Hajirasouliha, I.; Schönhuth, A.; de Juan, D.; Valencia, A.; Sahinalp, S. C. (2012): Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies Bioinformatics,28:(9): 1202-1208.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [4]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941841
    Singer, M.; Engström, A.; Schönhuth, A.; Pachter, L. (2011): Determining Coding CpG Islands by Identifying Regions Significant for Pattern Statistics on Markov Chains Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology,10:(1): 759.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [3]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941842
    Hafemeister, C.; Costa, I. G.; Schönhuth, A.; Schliep, A. (2011): Classifying short gene expression time-courses with Bayesian estimation of piecewise constant functions Bioinformatics,27:(7): 946-952.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [2]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941814
    Schönhuth, A. (2011): Generic identification of binary-valued hidden Markov processes Journal of Algebraic Statistics,5:(1): 72-99.
    PUB
     
  • [1]
    2010 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941843
    Faigle, U.; Schönhuth, A. (2010): A Markovian Model for Joint Observations, Bell's Inequality and Hidden States arXiv:1011.1295
    PUB | arXiv
     
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