170 Publikationen

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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Bragina, E.Y.: GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180049 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180054 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R., Dosenko, V.: shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180053 (2018).
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[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R., Freidin, M.B.: Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180052 (2018).
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[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O., Sommer, B.: Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180003 (2018).
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[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I., Ivanisenko, V.A.: Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics. 11, : 15 (2018).
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[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R., Allmer, J.: Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 14, (2017).
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[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M., D'Elia, D.: The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS. 18, : 101 (2017).
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[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C., Hofestädt, R.: Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense (2017).
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs. In: Hayn, D. and Schreier, G. (eds.) Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference. Studies in Health Technology and Informatics. 236, p. 128-135. IOS Press, Amsterdam (2017).
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[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R., Chen, M.: DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 13, : 297 (2016).
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[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making. 15, : 15 (2015).
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[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U., Hofestädt, R.: Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 13, 1540007 (2015).
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[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., Sacar Demirci, M.D. eds: Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2015).
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R., Chen, M.: Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis. 4, : e177 (2015).
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[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A., Wege, D.: Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine. 54, 385-387 (2015).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
Chen, M., Hofestädt, R.: Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems. it-Information Technology. 56, 76-81 (2014).
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
Hofestädt, R., Shoshi, A. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2014).
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[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Timmer, A.: How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine. 53, 333-335 (2014).
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[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D., Hofestädt, R.: VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics. 11, 239 (2014).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In: Sommer, B. (ed.) Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. p. 9-10. Bielefeld University, Bielefeld (2014).
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[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Chen, M., Hofestädt, R. eds: Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. Springer, Berlin (2014).
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Ivanisenko, V.A.: Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics. 15, S7 (2014).
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[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
Giegerich, R., Hofestädt, R., Nattkemper, T.W. eds: German Conference on Bioinformatics 2014. GI-Edition: lecture notes in informatics. 235, (2014).
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative Bioinformatics. In: Chen, M. and Hofestädt, R. (eds.) Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell. p. 3-19. Springer, Berlin (2014).
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, 1340003 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, 1340005 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
Hofestädt, R.: Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus. 22 (2013).
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C., Timmer, A.: More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine. 52, 181-183 (2013).
PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B., Weise, S.: Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics. 10, 226 (2013).
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In: Laroque, C. (ed.) Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC). p. 1-13. IEEE, Piscataway, NJ (2012).
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
Shoshi, A., Shoshi, A., Hofestädt, R.: KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung. In: Goltz, U., Magnor, M., Appelrath, H.-J., Matthies, H.K., Balke, W.-T., and Wolf, L. (eds.) Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI). GI-Edition. Proceedings. 208, p. 1565-1574. Ges. für Informatik, Bonn (2012).
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[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B., Sudhoff, H.: Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One. 7, e52718 (2012).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2012).
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
Heiner, M., Hofestädt, R. eds: Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets. CEUR workshop proceedings. 852, (2012).
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
Hofestädt, R.: Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts. p. 122. Russian Academy of Sciences, Novosibirsk (2012).
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics. (2011).
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
Hofestädt, R.: Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 1-2. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 3-16. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 38-55. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
Chen, M., Hu, M., Hofestädt, R.: A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology. 164, 338-352 (2011).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B., Spangardt, S.: Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing. 10, 1077-1097 (2011).
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., Chen, M.: MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics. 27, 3321-3322 (2011).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
Hofestädt, R.: Fundamental Features of Metabolic Computing. In: Batyrshin, I. and Sidorov, G. (eds.) Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 7095, p. 143-152. Springer, Berlin, Heidelberg (2011).
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, p. 182-203. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Kormeier, B., Hippe, K., Hofestädt, R.: Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology. 53, 241-249 (2011).
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI. 176, p. 720-725. Ges. für Informatik, Bonn (2010).
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2010).
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F., Hofestädt, R.: RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation. 31, E1081-E1088 (2010).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, 148 (2010).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue). 7, (2010).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, : 142 (2010).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology. 10, 27-48 (2010).
PUB
 
[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, (2010).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[116]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
Hofestädt, R.: DNA-Programming Language of Life. HBSO. 13, 68-72 (2009).
PUB
 
[115]
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W., Türker, C.: Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk, R. (eds.) Informatik 2009. LNI. 154, p. 33-34. Ges. für Informatik, Bonn (2009).
PUB
 
[114]
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Chen, M., Hofestädt, R. eds: Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009).
PUB
 
[113]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
Hofestädt, R., Mayr, E.-W.: Bioinformatik. Informatik Spektrum. 32, 285-286 (2009).
PUB | DOI
 
[112]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk , R. (eds.) Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. p. 704-708. Gesellschaft für Informatik (GI), Bonn (2009).
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[111]
2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. 4. Shaker, Aachen (2008).
PUB
 
[110]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., Hofestädt, R.: Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. (2008).
PUB | DOI
 
[109]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R., Frauendienst-Egger, G.: METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease. 31, 289 (2008).
PUB
 
[108]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007. 4, 63-74 (2008).
PUB
 
[107]
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
Hofestädt, R.: DNA - Programming Language of Life? Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia (2008).
PUB
 
[106]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A., Hofestädt, R.: BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 5, (2008).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[105]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
Hofestädt, R.: Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 5, 457-466 (2007).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[104]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). (2007).
PUB
 
[103]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., Hofestädt, R.: SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. (2007).
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2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. 3. Shaker, Aachen (2007).
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
Töpel, T., Neumann, J., Hofestädt, R.: A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007). p. 7-11. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2007).
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S., Trefz, F.K.: Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 30, 3 (2007).
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2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. 2. Shaker, Aachen (2006).
PUB
 
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D., Trefz, F.: RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics. 5, 115-118 (2006).
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Kolchanov, N., Hofestädt, R., Milanesi, L. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. 1. Edition. Springer, New York (2006).
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
Hofestädt, R.: An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In: Hofestädt, R. and Kolchanov, N. (eds.) Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006. 1, p. 48-52. Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287
Prins, B., Hofestädt, R.: MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks. Journal of Integrative Bioinformatics. 3, (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589
Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 1, (2006).
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808
Chen, M., Hofestädt, R.: A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS. 39, 147-159 (2006).
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
Chen, M., Hofestädt, R.: Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In: Kolchanov, N.A., Hofestädt, R., and Milanesi, L. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. p. 355-365. Springer, New York (2005).
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271
Chen, M., Hofestädt, R.: An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology. 5, 111-128 (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856
Hofestädt, R., Töpel, T.: Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning. In: Seiffert, U., Jain, L., and Schweizer, P. (eds.) Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms. Studies in Fuzziness and Soft Computing. 176, 1. Edition. p. 1-24. Springer, Berlin (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
Hofestädt, R.: Bioinformatik. In: Lehmann, T. (ed.) Handbuch der Medizinischen Informatik. 2., vollst. neu bearb. Aufl. p. 253-298. Hanser, München (2005).
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2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
Hofestädt, R. ed: Yearbook Bioinformatics 2004. 1, 1. Edition. Köllen, Bonn (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
Chen, M., Freier, A., Hofestädt, R.: Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In: Sensen, C. (ed.) Handbook of Genome Research. 2, 1. Edition. p. 461-490. Wiley-VCH, Weinheim (2005).
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654
Hofestädt, R.: Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology. 5, 81-82 (2005).
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
Hofestädt, R., Chen, M.: Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 2, p. 68-72. (2004).
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758
Hofestädt, R., Lenhof, H.-P. eds: Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, (2004).
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2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
Kolchanov, N., Hofestädt, R. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 1. Edition. Kluwer Academic, Boston (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
Hofestädt, R., Lenhof, H.-P.: Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, 3-4 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
Chen, M., Hofestädt, R.: PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics. 3, 241-252 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
Chen, M., Hofestädt, R.: Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE. 3, 192-199 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836
Chen, M., Lin, S., Hofestädt, R.: STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research. 32, D456-D458 (2004).
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2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778
Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In: Kolčanov, N.A. and Hofestädt, R. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Kluwer, Boston (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607
Kolchanov, N., Hofestädt, R.: The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology. 3, (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667
Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology. 3, 347-365 (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology. 3, 215-227 (2003).
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2002 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797
Collado-Vides, J., Hofestädt, R. eds: Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. MIT Press, Cambridge, Mass. (2002).
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Hofestädt, R.: Bioinformatics. In: Haux, R. (ed.) Medical imaging informatics. Yearbook of Medical Informatics. 2002, p. 581-583. Schattauer, Stuttgart (2002).
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624
Hofestädt, R., Kolchanov, N., Reinitz, J.: Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology. 2, 35 (2002).
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., Stephanik, A.: BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology. 2, 37-57 (2002).
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Hofestädt, R., Schnee, R.: Studien- und Forschungsführer Bioinformatik. 1. Edition. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg (2002).
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867
Freier, A., Hofestädt, R., Töpel, T.: Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In: Borlak, J. (ed.) Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications. 1. Edition. p. 233-252. Wiley-VCH, Weinheim (2002).
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In: Kolčanov, N.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. 2, p. 123-125. (2002).
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845
Hofestädt, R., Töpel, T.: Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002). p. 129-133. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2002).
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Information Fusion and Metabolic Network Control. In: Collado-Vides, J. and Hofestädt, R. (eds.) Gene Regulation and Metabolism. p. 49-84. MIT Press, Cambridge, Mass. (2002).
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818
Töpel, T., Hofestädt, R.: Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik. 14, 315 (2002).
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Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In: Xue, G., Xue, Y., Xu, Z., and Holmes, R. (eds.) Gene Families. p. 221-232. World Scientific, Singapore (2001).
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Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology. p. 38-43. (2001).
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Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F.K.: RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation. In: Patel, V.L. (ed.) Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Studies in health technology and informatics. 84, p. 970-974. IOS Press, Amsterdam (2001).
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Hofestädt, R., Reinitz, J., Kolchanov, N.: Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik. 22, 37 (2001).
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Hofestädt, R., Pleißner, K.-P., Stephanik, A.: Informationssysteme in der Biotechnologie. Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg, Magdeburg (2000).
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Hofestädt, R. ed: Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. BIOCOM, Berlin (2000).
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Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U.: Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism. In: Hasman, A. (ed.) Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000. Studies in health technology and informatics. 77, p. 857-862. IOS Press, Amsterdam (2000).
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922
Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M., Schulze-Kremer, S.: Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering. p. 77-80. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2000).
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Hofestädt, R.: Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum. 22, 385-390 (1999).
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999
Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School. (1999).
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004
Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M., Scholz, U.: Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe. 68, 12-15 (1999).
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939
Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M., Michal, G. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways. Dagstuhl-Seminar-Report. 215, (1998).
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Hofestädt, R., Scholz, U.: Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems. 47, 91-102 (1998).
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Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98). 1, p. 86-89. (1998).
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037
Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G., Scholz, U.: Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics. In: Litwin, W., Morzy, T., and Vossen, G. (eds.) Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings. Lecture Notes in Computer Science. 1475, p. 296-304. Springer Publishing, Berlin (1998).
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Hofestädt, R.: An Integrative Molecular Information System. In: Cesnik, B., McCray, A.T., and Scherrer, J.-R. (eds.) MedInfo ’98. Studies in health technology and informatics. 52, p. 361-365. IOS Press, Amsterdam (1998).
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272
Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U., Urban, H.: Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal. 3, 29-40 (1998).
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291
Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology. 1, 39-53 (1998).
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Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M., Schomburg, D. eds: Bioinformatics. LNCS, 1278, 1. Edition. Springer, Berlin (1997).
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Hofestädt, R., Lim, H. eds: Molecular Bioinformatics. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. (1997).
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Hofestädt, R.: Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In: Steigner, C. (ed.) Arbeitsplatz-Rechensysteme. p. 285-292. Fölbach Publishing, Koblenz (1997).
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Hofestädt, R.: Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing. 3, p. 2293-2297. Mainz, Aachen (1997).
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Hofestädt, R.: Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors. In: Brender, J. (ed.) Medical Informatics Europe '96. Studies in health technology and informatics. 34, p. 542-546. IOS Press, Amsterdam (1996).
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Hofestädt, R.: Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels. Medizinische Informatik und Bioinformatik, 1. Edition. Shaker Verlag, Aachen (1996).
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Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M., Löffler, M.: Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays. 18, 333-335 (1996).
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Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M. eds: Informatik in den Biowissenschaften. Informationstechnik und technische Informatik. 38, (1996).
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773
Hofestädt, R., Löffler, M., Möller, K.: Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn. 88 (1995).
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Hofestädt, R.: Artificial Life. In: Dautenhahn, K. (ed.) Proceedings des Workshops "Artificial Life". GMD-Studien. 271, GMD-Forschungszentrum Informationstechnik, Sankt Augustin (1995).
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Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Löffler, M., Mavrovouniotis, M. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation. Dagstuhl-Seminar-Report. (1995).
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Hofestädt, R.: Metabolic Engineering. In: Sydow, A. (ed.) Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation. p. 321-326. Gordon and Breach, Amsterdam (1995).
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815
Hofestädt, R.: A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In: Greenes, R.A., Petersen, H.E., and Protti, D.J. (eds.) Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics. p. 994-999. Healthcare Computing & Communications Canada, Edmonton (1995).
PUB
 
[20]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822
Hofestädt, R., Huang, X.: Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95. p. 344-347. Publishing House of Electronics Industry (1995).
PUB
 
[19]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784
Hofestädt, R.: Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe. 13, 7-15 (1995).
PUB
 
[18]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
Hofestädt, R., Meinecke, F.: Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine. 25, 321-334 (1995).
PUB
 
[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E., Steigner, C.: Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations. Fachberichte Informatik, 9-94. Universitätf Koblenz, Koblenz (1994).
PUB
 
[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R., Huang, X.: Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In: Flieger, R. and Grebe, R. (eds.) Parallele Datenverarbeitung aktuell. p. 100-108. IOS Press, Amsterdam (1994).
PUB
 
[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
Hofestädt, R.: Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten. 66-70 (1994).
PUB
 
[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S., Huang, X.: Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In: Dekker, L., Smit, W., and Zuidervaart, J. (eds.) Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994. p. 235-242. Elsevier, Amsterdam (1994).
PUB
 
[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
Hofestädt, R.: Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In: Lim, H.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. p. 331-340. World Scientific (1994).
PUB
 
[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
Hofestädt, R., Ashauer, U.: Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In: Kunath, H. (ed.) Medizin und Information. p. 115-119. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).
PUB
 
[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
Hofestädt, R.: Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen. In: Pöppl, S.J., Lipinski, H.-G., and Mansky, T. (eds.) Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien. Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie. 77, p. 245-249. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).
PUB
 
[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
Hofestädt, R., Hörkens, U.: C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 14, 1-14 (1994).
PUB
 
[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
Hofestädt, R.: Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse. In: Kampe, G. and Zeitz, M. (eds.) Simulationstechnik. Fortschritte in der Simulationstechnik. 9, p. 1-8. Vieweg, Wiesbaden (1994).
PUB
 
[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
Hofestädt, R., Krückeberg, F., Lengauer, T. eds: Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993. Informatik Aktuell. VIII, 214 (1993).
PUB
 
[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
Hofestädt, R., Lautenbach, K., Löffler, M.: Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung". Fachberichte Informatik, 16-93. Universitätf Koblenz, Koblenz (1993).
PUB
 
[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
Hofestädt, R.: Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie. 24, 169-177 (1993).
PUB
 
[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
Hofestädt, R.: Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In: Hunter, L., Searls, D., and Shavlik, J. (eds.) Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93. p. 181-189. AAAI Press, Menlo Park (1993).
PUB
 
[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Huang, X.: Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten. Proceedings of the PARS 1993. PARS Notes. 12, p. 92-101. (1993).
PUB
 
[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
Hofestädt, R.: A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 11, 253-262 (1993).
PUB
 
[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
Hörkens, U., Hofestädt, R.: Cellular Automata Simulation Shell. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 325-330. Elsevier, Amsterdam (1992).
PUB
 
[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
Hofestädt, R., Müller, H.P.: The Simulation of Genetic Processes. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 532-528. Elsevier, Amsterdam (1992).
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[170]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Bragina, E.Y.: GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180049 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180054 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R., Dosenko, V.: shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180053 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R., Freidin, M.B.: Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180052 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O., Sommer, B.: Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180003 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I., Ivanisenko, V.A.: Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics. 11, : 15 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R., Allmer, J.: Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 14, (2017).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M., D'Elia, D.: The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS. 18, : 101 (2017).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C., Hofestädt, R.: Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense (2017).
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs. In: Hayn, D. and Schreier, G. (eds.) Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference. Studies in Health Technology and Informatics. 236, p. 128-135. IOS Press, Amsterdam (2017).
PUB | PDF | DOI
 
[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R., Chen, M.: DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 13, : 297 (2016).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making. 15, : 15 (2015).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U., Hofestädt, R.: Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 13, 1540007 (2015).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., Sacar Demirci, M.D. eds: Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2015).
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R., Chen, M.: Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis. 4, : e177 (2015).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A., Wege, D.: Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine. 54, 385-387 (2015).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
Chen, M., Hofestädt, R.: Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems. it-Information Technology. 56, 76-81 (2014).
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
Hofestädt, R., Shoshi, A. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2014).
PUB | Download (ext.)
 
[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Timmer, A.: How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine. 53, 333-335 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D., Hofestädt, R.: VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics. 11, 239 (2014).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In: Sommer, B. (ed.) Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. p. 9-10. Bielefeld University, Bielefeld (2014).
PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
 
[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Chen, M., Hofestädt, R. eds: Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. Springer, Berlin (2014).
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Ivanisenko, V.A.: Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics. 15, S7 (2014).
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
Giegerich, R., Hofestädt, R., Nattkemper, T.W. eds: German Conference on Bioinformatics 2014. GI-Edition: lecture notes in informatics. 235, (2014).
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative Bioinformatics. In: Chen, M. and Hofestädt, R. (eds.) Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell. p. 3-19. Springer, Berlin (2014).
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, 1340003 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, 1340005 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
Hofestädt, R.: Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus. 22 (2013).
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C., Timmer, A.: More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine. 52, 181-183 (2013).
PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B., Weise, S.: Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics. 10, 226 (2013).
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In: Laroque, C. (ed.) Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC). p. 1-13. IEEE, Piscataway, NJ (2012).
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
Shoshi, A., Shoshi, A., Hofestädt, R.: KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung. In: Goltz, U., Magnor, M., Appelrath, H.-J., Matthies, H.K., Balke, W.-T., and Wolf, L. (eds.) Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI). GI-Edition. Proceedings. 208, p. 1565-1574. Ges. für Informatik, Bonn (2012).
PUB | Download (ext.)
 
[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B., Sudhoff, H.: Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One. 7, e52718 (2012).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2012).
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
Heiner, M., Hofestädt, R. eds: Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets. CEUR workshop proceedings. 852, (2012).
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
Hofestädt, R.: Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts. p. 122. Russian Academy of Sciences, Novosibirsk (2012).
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics. (2011).
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
Hofestädt, R.: Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 1-2. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 3-16. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 38-55. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
Chen, M., Hu, M., Hofestädt, R.: A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology. 164, 338-352 (2011).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B., Spangardt, S.: Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing. 10, 1077-1097 (2011).
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., Chen, M.: MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics. 27, 3321-3322 (2011).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
Hofestädt, R.: Fundamental Features of Metabolic Computing. In: Batyrshin, I. and Sidorov, G. (eds.) Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 7095, p. 143-152. Springer, Berlin, Heidelberg (2011).
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, p. 182-203. IOS Press, Amsterdam (2011).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Kormeier, B., Hippe, K., Hofestädt, R.: Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology. 53, 241-249 (2011).
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI. 176, p. 720-725. Ges. für Informatik, Bonn (2010).
PUB
 
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2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F., Hofestädt, R.: RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation. 31, E1081-E1088 (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, 148 (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue). 7, (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, : 142 (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology. 10, 27-48 (2010).
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, (2010).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
Hofestädt, R.: DNA-Programming Language of Life. HBSO. 13, 68-72 (2009).
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W., Türker, C.: Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk, R. (eds.) Informatik 2009. LNI. 154, p. 33-34. Ges. für Informatik, Bonn (2009).
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Chen, M., Hofestädt, R. eds: Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
Hofestädt, R., Mayr, E.-W.: Bioinformatik. Informatik Spektrum. 32, 285-286 (2009).
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk , R. (eds.) Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. p. 704-708. Gesellschaft für Informatik (GI), Bonn (2009).
PUB | Download (ext.)
 
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2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. 4. Shaker, Aachen (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., Hofestädt, R.: Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R., Frauendienst-Egger, G.: METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease. 31, 289 (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007. 4, 63-74 (2008).
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
Hofestädt, R.: DNA - Programming Language of Life? Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A., Hofestädt, R.: BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 5, (2008).
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
Hofestädt, R.: Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 5, 457-466 (2007).
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). (2007).
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., Hofestädt, R.: SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. (2007).
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2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. 3. Shaker, Aachen (2007).
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
Töpel, T., Neumann, J., Hofestädt, R.: A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007). p. 7-11. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2007).
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S., Trefz, F.K.: Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 30, 3 (2007).
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2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. 2. Shaker, Aachen (2006).
PUB
 
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D., Trefz, F.: RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics. 5, 115-118 (2006).
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2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848
Kolchanov, N., Hofestädt, R., Milanesi, L. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. 1. Edition. Springer, New York (2006).
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
Hofestädt, R.: An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In: Hofestädt, R. and Kolchanov, N. (eds.) Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006. 1, p. 48-52. Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287
Prins, B., Hofestädt, R.: MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks. Journal of Integrative Bioinformatics. 3, (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589
Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 1, (2006).
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808
Chen, M., Hofestädt, R.: A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS. 39, 147-159 (2006).
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
Chen, M., Hofestädt, R.: Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In: Kolchanov, N.A., Hofestädt, R., and Milanesi, L. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. p. 355-365. Springer, New York (2005).
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271
Chen, M., Hofestädt, R.: An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology. 5, 111-128 (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856
Hofestädt, R., Töpel, T.: Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning. In: Seiffert, U., Jain, L., and Schweizer, P. (eds.) Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms. Studies in Fuzziness and Soft Computing. 176, 1. Edition. p. 1-24. Springer, Berlin (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
Hofestädt, R.: Bioinformatik. In: Lehmann, T. (ed.) Handbuch der Medizinischen Informatik. 2., vollst. neu bearb. Aufl. p. 253-298. Hanser, München (2005).
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2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
Hofestädt, R. ed: Yearbook Bioinformatics 2004. 1, 1. Edition. Köllen, Bonn (2005).
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
Chen, M., Freier, A., Hofestädt, R.: Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In: Sensen, C. (ed.) Handbook of Genome Research. 2, 1. Edition. p. 461-490. Wiley-VCH, Weinheim (2005).
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654
Hofestädt, R.: Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology. 5, 81-82 (2005).
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
Hofestädt, R., Chen, M.: Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 2, p. 68-72. (2004).
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758
Hofestädt, R., Lenhof, H.-P. eds: Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, (2004).
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2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
Kolchanov, N., Hofestädt, R. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 1. Edition. Kluwer Academic, Boston (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
Hofestädt, R., Lenhof, H.-P.: Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, 3-4 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
Chen, M., Hofestädt, R.: PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics. 3, 241-252 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
Chen, M., Hofestädt, R.: Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE. 3, 192-199 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836
Chen, M., Lin, S., Hofestädt, R.: STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research. 32, D456-D458 (2004).
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2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778
Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In: Kolčanov, N.A. and Hofestädt, R. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Kluwer, Boston (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607
Kolchanov, N., Hofestädt, R.: The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology. 3, (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667
Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology. 3, 347-365 (2003).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology. 3, 215-227 (2003).
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2002 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797
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Hofestädt, R., Kolchanov, N., Reinitz, J.: Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology. 2, 35 (2002).
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., Stephanik, A.: BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology. 2, 37-57 (2002).
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Hofestädt, R., Schnee, R.: Studien- und Forschungsführer Bioinformatik. 1. Edition. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg (2002).
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Freier, A., Hofestädt, R., Töpel, T.: Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In: Borlak, J. (ed.) Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications. 1. Edition. p. 233-252. Wiley-VCH, Weinheim (2002).
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Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In: Kolčanov, N.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. 2, p. 123-125. (2002).
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845
Hofestädt, R., Töpel, T.: Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002). p. 129-133. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2002).
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Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Information Fusion and Metabolic Network Control. In: Collado-Vides, J. and Hofestädt, R. (eds.) Gene Regulation and Metabolism. p. 49-84. MIT Press, Cambridge, Mass. (2002).
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Töpel, T., Hofestädt, R.: Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik. 14, 315 (2002).
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Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In: Xue, G., Xue, Y., Xu, Z., and Holmes, R. (eds.) Gene Families. p. 221-232. World Scientific, Singapore (2001).
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Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology. p. 38-43. (2001).
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974
Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F.K.: RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation. In: Patel, V.L. (ed.) Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Studies in health technology and informatics. 84, p. 970-974. IOS Press, Amsterdam (2001).
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Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M., Scholz, U.: An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks. Presented at the World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Berlin, Germany (2000).
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Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U.: Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism. In: Hasman, A. (ed.) Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000. Studies in health technology and informatics. 77, p. 857-862. IOS Press, Amsterdam (2000).
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Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M., Schulze-Kremer, S.: Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering. p. 77-80. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2000).
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Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M., Scholz, U.: Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe. 68, 12-15 (1999).
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939
Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M., Michal, G. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways. Dagstuhl-Seminar-Report. 215, (1998).
PUB
 
[43]
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682
Hofestädt, R. ed: Molekulare Bioinformatik. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. (1998).
PUB
 
[42]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384
Hofestädt, R., Scholz, U.: Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems. 47, 91-102 (1998).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[41]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966
Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98). 1, p. 86-89. (1998).
PUB
 
[40]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037
Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G., Scholz, U.: Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics. In: Litwin, W., Morzy, T., and Vossen, G. (eds.) Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings. Lecture Notes in Computer Science. 1475, p. 296-304. Springer Publishing, Berlin (1998).
PUB
 
[39]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253
Hofestädt, R.: An Integrative Molecular Information System. In: Cesnik, B., McCray, A.T., and Scherrer, J.-R. (eds.) MedInfo ’98. Studies in health technology and informatics. 52, p. 361-365. IOS Press, Amsterdam (1998).
PUB
 
[38]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272
Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U., Urban, H.: Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal. 3, 29-40 (1998).
PUB
 
[37]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291
Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology. 1, 39-53 (1998).
PUB
 
[36]
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355
Hofestädt, R.: Computer Science and Biology. Biosystems. 43, 69-71 (1997).
PUB
 
[35]
1997 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702
Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M., Schomburg, D. eds: Bioinformatics. LNCS, 1278, 1. Edition. Springer, Berlin (1997).
PUB
 
[34]
1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666
Hofestädt, R., Lim, H. eds: Molecular Bioinformatics. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. (1997).
PUB
 
[33]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441
Hofestädt, R.: Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In: Steigner, C. (ed.) Arbeitsplatz-Rechensysteme. p. 285-292. Fölbach Publishing, Koblenz (1997).
PUB
 
[32]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458
Hofestädt, R.: Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing. 3, p. 2293-2297. Mainz, Aachen (1997).
PUB
 
[31]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735
Hofestädt, R., Herre, H., Trefz, F.: Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen. Informatik-Berichte, 9. Universität Leipzig, Leipzig (1996).
PUB
 
[30]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378570
Hofestädt, R., Huang, X., Beerbohm, D.: Simulation of load balancing with cellular automata. Simulation Practice and Theory. 4, 81-96 (1996).
PUB | DOI
 
[29]
1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707
Hofestädt, R.: Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors. In: Brender, J. (ed.) Medical Informatics Europe '96. Studies in health technology and informatics. 34, p. 542-546. IOS Press, Amsterdam (1996).
PUB
 
[28]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263
Hofestädt, R.: Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels. Medizinische Informatik und Bioinformatik, 1. Edition. Shaker Verlag, Aachen (1996).
PUB
 
[27]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698
Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M., Löffler, M.: Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays. 18, 333-335 (1996).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[26]
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722
Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M. eds: Informatik in den Biowissenschaften. Informationstechnik und technische Informatik. 38, (1996).
PUB
 
[25]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773
Hofestädt, R., Löffler, M., Möller, K.: Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn. 88 (1995).
PUB
 
[24]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829
Hofestädt, R.: Artificial Life. In: Dautenhahn, K. (ed.) Proceedings des Workshops "Artificial Life". GMD-Studien. 271, GMD-Forschungszentrum Informationstechnik, Sankt Augustin (1995).
PUB
 
[23]
1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599
Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Löffler, M., Mavrovouniotis, M. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation. Dagstuhl-Seminar-Report. (1995).
PUB
 
[22]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803
Hofestädt, R.: Metabolic Engineering. In: Sydow, A. (ed.) Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation. p. 321-326. Gordon and Breach, Amsterdam (1995).
PUB
 
[21]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815
Hofestädt, R.: A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In: Greenes, R.A., Petersen, H.E., and Protti, D.J. (eds.) Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics. p. 994-999. Healthcare Computing & Communications Canada, Edmonton (1995).
PUB
 
[20]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822
Hofestädt, R., Huang, X.: Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95. p. 344-347. Publishing House of Electronics Industry (1995).
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[19]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784
Hofestädt, R.: Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe. 13, 7-15 (1995).
PUB
 
[18]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
Hofestädt, R., Meinecke, F.: Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine. 25, 321-334 (1995).
PUB
 
[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E., Steigner, C.: Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations. Fachberichte Informatik, 9-94. Universitätf Koblenz, Koblenz (1994).
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[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R., Huang, X.: Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In: Flieger, R. and Grebe, R. (eds.) Parallele Datenverarbeitung aktuell. p. 100-108. IOS Press, Amsterdam (1994).
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[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
Hofestädt, R.: Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten. 66-70 (1994).
PUB
 
[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S., Huang, X.: Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In: Dekker, L., Smit, W., and Zuidervaart, J. (eds.) Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994. p. 235-242. Elsevier, Amsterdam (1994).
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[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
Hofestädt, R.: Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In: Lim, H.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. p. 331-340. World Scientific (1994).
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[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
Hofestädt, R., Ashauer, U.: Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In: Kunath, H. (ed.) Medizin und Information. p. 115-119. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).
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[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
Hofestädt, R.: Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen. In: Pöppl, S.J., Lipinski, H.-G., and Mansky, T. (eds.) Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien. Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie. 77, p. 245-249. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).
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[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
Hofestädt, R., Hörkens, U.: C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 14, 1-14 (1994).
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[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
Hofestädt, R.: Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse. In: Kampe, G. and Zeitz, M. (eds.) Simulationstechnik. Fortschritte in der Simulationstechnik. 9, p. 1-8. Vieweg, Wiesbaden (1994).
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[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
Hofestädt, R., Krückeberg, F., Lengauer, T. eds: Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993. Informatik Aktuell. VIII, 214 (1993).
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[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
Hofestädt, R., Lautenbach, K., Löffler, M.: Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung". Fachberichte Informatik, 16-93. Universitätf Koblenz, Koblenz (1993).
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[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
Hofestädt, R.: Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie. 24, 169-177 (1993).
PUB
 
[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
Hofestädt, R.: Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In: Hunter, L., Searls, D., and Shavlik, J. (eds.) Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93. p. 181-189. AAAI Press, Menlo Park (1993).
PUB
 
[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Huang, X.: Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten. Proceedings of the PARS 1993. PARS Notes. 12, p. 92-101. (1993).
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[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
Hofestädt, R.: A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 11, 253-262 (1993).
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[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
Hörkens, U., Hofestädt, R.: Cellular Automata Simulation Shell. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 325-330. Elsevier, Amsterdam (1992).
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[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
Hofestädt, R., Müller, H.P.: The Simulation of Genetic Processes. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 532-528. Elsevier, Amsterdam (1992).
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