170 Publikationen

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[170]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
A. Shoshi, et al., “GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180049.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
V. Saik, Olga, et al., “Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180054.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
T. Drevytska, et al., “shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180053.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
E.Y. Bragina, et al., “Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180052.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
N. Biere, et al., “Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
O.V. Saik, et al., “Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks”, BMC Medical Genomics, vol. 11, 2018, : 15.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
H. Hamzeiy, et al., “Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 14, 2017.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
P. Romano, et al., “The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes”, BMC BIOINFORMATICS, vol. 18, 2017, : 101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
A. Shoshi, et al., “Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease”, Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense, 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
A. Shoshi, et al., “KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs”, Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference, D. Hayn and G. Schreier, eds., Studies in Health Technology and Informatics, vol. 236, Amsterdam: IOS Press, 2017, pp.128-135.
PUB | PDF | DOI
 
[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Q. Li, et al., “DaTo: an atlas of biological databases and tools”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 13, 2016, : 297.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
A. Shoshi, et al., “GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data”, BMC Medical Informatics and Decision Making, vol. 15, 2015, : 15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
A. Shoshi, et al., “Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 13, 2015, pp. 1540007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
J. Allmer, et al., eds., “Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2015.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
X. Meng, et al., “Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types”, Oncogenesis, vol. 4, 2015, : e177.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
A. Winter, et al., “Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems)”, Methods of Information in Medicine, vol. 54, 2015, pp. 385-387.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
M. Chen and R. Hofestädt, “Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems”, it-Information Technology, vol. 56, 2014, pp. 76-81.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
R. Hofestädt and A. Shoshi, eds., “German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2014.
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[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
A. Winter, et al., “How to Use Information Technology to Improve Medication Safety”, Methods of Information in Medicine, vol. 53, 2014, pp. 333-335.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
C. Brinkrolf, et al., “VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 11, 2014, pp. 239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
O.V. Popik, et al., “Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract)”, Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop, B. Sommer, ed., Bielefeld: Bielefeld University, 2014, pp.9-10.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
 
[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
M. Chen and R. Hofestädt, eds., Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell, Berlin: Springer, 2014.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
O.V. Popik, et al., “Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions”, BMC Genomics, vol. 15, 2014, pp. S7.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
R. Giegerich, R. Hofestädt, and T.W. Nattkemper, eds., “German Conference on Bioinformatics 2014”, GI-Edition: lecture notes in informatics, vol. 235, 2014.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
M. Chen and R. Hofestädt, “Integrative Bioinformatics”, Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell, M. Chen and R. Hofestädt, eds., Berlin: Springer, 2014, pp.3-19.
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
H.-M. Lee, K.-J. Dietz, and R. Hofestädt, “Computational construction of specialized biological networks”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 11, 2013, pp. 1340003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
B. Sommer, et al., “Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 11, 2013, pp. 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
R. Hofestädt, “Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen”, Management & Krankenhaus, 2013, pp. 22.
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
A. Winter, et al., “More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published”, Methods Of Information In Medicine, vol. 52, 2013, pp. 181-183.
PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
R. Hofestädt, et al., “Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 10, 2013, pp. 226.
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
S. Proß, et al., “A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica”, Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC), C. Laroque, ed., Piscataway, NJ: IEEE, 2012, pp.1-13.
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
A. Shoshi, A. Shoshi, and R. Hofestädt, “KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung”, Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), U. Goltz, et al., eds., GI-Edition. Proceedings, vol. 208, Bonn: Ges. für Informatik, 2012, pp.1565-1574.
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[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
C. Klenke, et al., “Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays”, PLoS One, vol. 7, 2012, pp. e52718.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
R. Hofestädt and N. Kolchanov, eds., “German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2012.
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
M. Heiner and R. Hofestädt, eds., “Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets”, CEUR workshop proceedings, vol. 852, 2012.
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
R. Hofestädt, “Modeling aspects of the virtuell cell”, The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences, 2012, pp.122.
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
K. Hippe, et al., “DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data”, Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics, 2011.
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
R. Hofestädt, “Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.1-2.
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
R. Hofestädt and S. Thelen, “Quantitative Modeling of Biochemical Networks”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.3-16.
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
M. Chen and R. Hofestädt, “Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.38-55.
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
M. Chen, M. Hu, and R. Hofestädt, “A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes”, Applied Biochemistry and Biotechnology, vol. 164, 2011, pp. 338-352.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
M. Chen, et al., “Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks”, Natural Computing, vol. 10, 2011, pp. 1077-1097.
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
D. Huang, et al., “MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web”, Bioinformatics, vol. 27, 2011, pp. 3321-3322.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
R. Hofestädt, “Fundamental Features of Metabolic Computing”, Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II, I. Batyrshin and G. Sidorov, eds., Lecture Notes in Computer Science, vol. 7095, Berlin, Heidelberg: Springer, 2011, pp.143-152.
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
S.J. Janowski, et al., “Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.182-203.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
B. Kormeier, K. Hippe, and R. Hofestädt, “Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data”, it Information Technology, vol. 53, 2011, pp. 241-249.
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
K. Hippe, et al., “DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data”, Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik, LNI, vol. 176, Bonn: Ges. für Informatik, 2010, pp.720-725.
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
R. Hofestädt and N. Kolchanov, eds., “Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2010.
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
T. Töpel, et al., “RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases”, Human Mutation, vol. 31, 2010, pp. E1081-E1088.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
B. Sommer, et al., “Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010, pp. 148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
H.-M. Lee, K.-J. Dietz, and R. Hofestädt, “Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues.”, Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), vol. 7, 2010.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
B. Kormeier, et al., “CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010, : 142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
S.J. Janowski, et al., “Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing”, In Silico Biology, vol. 10, 2010, pp. 27-48.
PUB
 
[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
B. Kormeier, et al., “Reconstruction of biological networks based on life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[116]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
R. Hofestädt, “DNA-Programming Language of Life”, HBSO, vol. 13, 2009, pp. 68-72.
PUB
 
[115]
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
R. Hofestädt, et al., “Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle”, Informatik 2009, S. Fischer, E. Maehle, and R. Reischuk, eds., LNI, vol. 154, Bonn: Ges. für Informatik, 2009, pp.33-34.
PUB
 
[114]
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
M. Chen and R. Hofestädt, eds., Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou, 2009.
PUB
 
[113]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
R. Hofestädt and E.-W. Mayr, “Bioinformatik”, Informatik Spektrum, vol. 32, 2009, pp. 285-286.
PUB | DOI
 
[112]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
B. Kormeier, et al., “CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases”, Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck, S. Fischer, E. Maehle, and R. Reischuk, eds., Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI), 2009, pp.704-708.
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[111]
2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
R. Hofestädt and T. Töpel, eds., Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007, vol. 4, Aachen: Shaker, 2008.
PUB
 
[110]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
S. Hariharaputran, et al., “Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification”, Nature Precedings, 2008.
PUB | DOI
 
[109]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
F. Trefz, et al., “METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism”, Journal of Inherited Metabolic Disease, vol. 31, 2008, pp. 289.
PUB
 
[108]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
S. Hariharaputran, et al., “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data”, Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, vol. 4, 2008, pp. 63-74.
PUB
 
[107]
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
R. Hofestädt, “DNA - Programming Language of Life?”, Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences, 2008.
PUB
 
[106]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
T. Töpel, et al., “BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 5, 2008.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[105]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
R. Hofestädt, “Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 5, 2007, pp. 457-466.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[104]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
S. Hariharaputran, et al., “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data.”, Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07), 2007.
PUB
 
[103]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
S. Hariharaputran, et al., “SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information”, Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems, 2007.
PUB
 
[102]
2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
R. Hofestädt and T. Töpel, eds., Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006, vol. 3, Aachen: Shaker, 2007.
PUB
 
[101]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
T. Töpel, J. Neumann, and R. Hofestädt, “A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS”, Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007), P. Kokol, ed., Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society, 2007, pp.7-11.
PUB
 
[100]
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
D. Scheible, et al., “Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry”, JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, vol. 30, 2007, pp. 3.
PUB | WoS
 
[99]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
R. Hofestädt and T. Töpel, eds., Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005, vol. 2, Aachen: Shaker, 2006.
PUB
 
[98]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
T. Töpel, et al., “RAMEDIS, the rare metabolic diseases database”, Applied Bioinformatics, vol. 5, 2006, pp. 115-118.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[97]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848
N. Kolchanov, R. Hofestädt, and L. Milanesi, eds., Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II, 1. Edition., New York: Springer, 2006.
PUB
 
[96]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
R. Hofestädt, “An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences.”, Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006, R. Hofestädt and N. Kolchanov, eds., vol. 1, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics, 2006, pp.48-52.
PUB
 
[95]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287
B. Prins and R. Hofestädt, “MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 3, 2006.
PUB | DOI
 
[94]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589
M. Chen and R. Hofestädt, “Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics”, Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, vol. 1, 2006.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[93]
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367
F.K. Trefz, et al., “www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases”, JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, vol. 29, 2006, pp. 84.
PUB | WoS
 
[92]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808
M. Chen and R. Hofestädt, “A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis”, JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, vol. 39, 2006, pp. 147-159.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
F.K. Trefz, et al., “Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders”, JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, vol. 29, 2006, pp. 84.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
M. Chen and R. Hofestädt, “Prediction and Alignment of Metabolic Pathways”, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II, N.A. Kolchanov, R. Hofestädt, and L. Milanesi, eds., New York: Springer, 2005, pp.355-365.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271
M. Chen and R. Hofestädt, “An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment”, In Silico Biology, vol. 5, 2005, pp. 111-128.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856
R. Hofestädt and T. Töpel, “Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning”, Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms, U. Seiffert, L. Jain, and P. Schweizer, eds., Studies in Fuzziness and Soft Computing, vol. 176, 1. Edition., Berlin: Springer, 2005, pp.1-24.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
R. Hofestädt, “Bioinformatik”, Handbuch der Medizinischen Informatik, T. Lehmann, ed., 2., vollst. neu bearb. Aufl., München: Hanser, 2005, pp.253-298.
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2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
R. Hofestädt, ed., Yearbook Bioinformatics 2004, vol. 1, 1. Edition., Bonn: Köllen, 2005.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
M. Chen, A. Freier, and R. Hofestädt, “Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways”, Handbook of Genome Research, C. Sensen, ed., vol. 2, 1. Edition., Weinheim: Wiley-VCH, 2005, pp.461-490.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654
R. Hofestädt, “Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics”, In Silico Biology, vol. 5, 2005, pp. 81-82.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
R. Hofestädt and M. Chen, “Metabolic Pathway Prediction/Alignment”, Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, vol. 2, 2004, pp.68-72.
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758
R. Hofestädt and H.-P. Lenhof, eds., “Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik”, Informationstechnik und technische Informatik, vol. 46, 2004.
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2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
N. Kolchanov and R. Hofestädt, eds., Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 1. Edition., Boston: Kluwer Academic, 2004.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
R. Hofestädt and H.-P. Lenhof, “Molekulare Bioinformatik”, Informationstechnik und technische Informatik, vol. 46, 2004, pp. 3-4.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
M. Chen and R. Hofestädt, “PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment”, Applied Bioinformatics, vol. 3, 2004, pp. 241-252.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
M. Chen and R. Hofestädt, “Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways”, IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, vol. 3, 2004, pp. 192-199.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836
M. Chen, S. Lin, and R. Hofestädt, “STCDB: Signal Transduction Classification Database”, Nucleic Acids Research, vol. 32, 2004, pp. D456-D458.
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R. Hofestädt, A. Freier, and M. Lange, “Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling”, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, N.A. Kolčanov and R. Hofestädt, eds., Boston: Kluwer, 2003.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607
N. Kolchanov and R. Hofestädt, “The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure”, In Silico Biology, vol. 3, 2003.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667
M. Chen and R. Hofestädt, “Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell”, In Silico Biology, vol. 3, 2003, pp. 347-365.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610
A. Freier, R. Hofestädt, and M. Lange, “IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks”, In Silico Biology, vol. 3, 2003, pp. 215-227.
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2002 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797
J. Collado-Vides and R. Hofestädt, eds., Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches, Cambridge, Mass.: MIT Press, 2002.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795
R. Hofestädt, “Bioinformatics”, Medical imaging informatics, R. Haux, ed., Yearbook of Medical Informatics, vol. 2002, Stuttgart: Schattauer, 2002, pp.581-583.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624
R. Hofestädt, N. Kolchanov, and J. Reinitz, “Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways”, In Silico Biology, vol. 2, 2002, pp. 35.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648
A. Freier, et al., “BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data”, In Silico Biology, vol. 2, 2002, pp. 37-57.
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2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798
R. Hofestädt and R. Schnee, Studien- und Forschungsführer Bioinformatik, 1. Edition., Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag, 2002.
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838
A. Freier, R. Hofestädt, and M. Lange, “IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks”, Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research, N.A. Kolčanov, ed., vol. 2, 2002, pp.123-125.
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845
R. Hofestädt and T. Töpel, “Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data”, Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002), P. Kokol, ed., Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society, 2002, pp.129-133.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867
A. Freier, R. Hofestädt, and T. Töpel, “Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling”, Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications, J. Borlak, ed., 1. Edition., Weinheim: Wiley-VCH, 2002, pp.233-252.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806
A. Freier, et al., “Information Fusion and Metabolic Network Control”, Gene Regulation and Metabolism, J. Collado-Vides and R. Hofestädt, eds., Cambridge, Mass.: MIT Press, 2002, pp.49-84.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818
T. Töpel and R. Hofestädt, “Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data”, Medizinische Genetik, vol. 14, 2002, pp. 315.
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R. Hofestädt, et al., “Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases”, Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics, V.L. Patel, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 84, Amsterdam: IOS Press, 2001, pp.353-356.
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R. Hofestädt, et al., “RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation”, Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics, V.L. Patel, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 84, Amsterdam: IOS Press, 2001, pp.970-974.
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R. Hofestädt, U. Mischke, and U. Scholz, “Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism”, Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000, A. Hasman, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 77, Amsterdam: IOS Press, 2000, pp.857-862.
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R. Hofestädt, et al., “Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics”, Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings, W. Litwin, T. Morzy, and G. Vossen, eds., Lecture Notes in Computer Science, vol. 1475, Berlin: Springer Publishing, 1998, pp.296-304.
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R. Hofestädt, “An Integrative Molecular Information System”, MedInfo ’98, B. Cesnik, A.T. McCray, and J.-R. Scherrer, eds., Studies in health technology and informatics, vol. 52, Amsterdam: IOS Press, 1998, pp.361-365.
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272
R. Hofestädt, et al., “Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen”, Magdeburger Wissenschaftsjournal, vol. 3, 1998, pp. 29-40.
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R. Hofestädt, “Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements”, Arbeitsplatz-Rechensysteme, C. Steigner, ed., Koblenz: Fölbach Publishing, 1997, pp.285-292.
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458
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1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
R. Hofestädt, F. Krückeberg, and T. Lengauer, eds., “Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993”, Informatik Aktuell, 1993, pp. VIII, 214.
PUB
 
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1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
R. Hofestädt, K. Lautenbach, and M. Löffler, Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung", Fachberichte Informatik, vol. 16-93, Koblenz: Universitätf Koblenz, 1993.
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
R. Hofestädt, “Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars”, Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, vol. 24, 1993, pp. 169-177.
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
R. Hofestädt, “Grammatical Formalization of Metabolic Processes”, Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93, L. Hunter, D. Searls, and J. Shavlik, eds., Menlo Park: AAAI Press, 1993, pp.181-189.
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
R. Hofestädt, D. Beerbohm, and X. Huang, “Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten”, Proceedings of the PARS 1993, PARS Notes, vol. 12, 1993, pp.92-101.
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
R. Hofestädt, “A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways”, Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), vol. 11, 1993, pp. 253-262.
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
U. Hörkens and R. Hofestädt, “Cellular Automata Simulation Shell”, Computational Systems Analysis, A. Sydow, ed., Amsterdam: Elsevier, 1992, pp.325-330.
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
R. Hofestädt and H.P. Müller, “The Simulation of Genetic Processes”, Computational Systems Analysis, A. Sydow, ed., Amsterdam: Elsevier, 1992, pp.532-528.
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[170]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
A. Shoshi, et al., “GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180049.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
V. Saik, Olga, et al., “Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180054.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
T. Drevytska, et al., “shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180053.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
E.Y. Bragina, et al., “Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180052.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
N. Biere, et al., “Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 15, 2018, : 20180003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
O.V. Saik, et al., “Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks”, BMC Medical Genomics, vol. 11, 2018, : 15.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
H. Hamzeiy, et al., “Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 14, 2017.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
P. Romano, et al., “The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes”, BMC BIOINFORMATICS, vol. 18, 2017, : 101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
A. Shoshi, et al., “Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease”, Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense, 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
A. Shoshi, et al., “KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs”, Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference, D. Hayn and G. Schreier, eds., Studies in Health Technology and Informatics, vol. 236, Amsterdam: IOS Press, 2017, pp.128-135.
PUB | PDF | DOI
 
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Q. Li, et al., “DaTo: an atlas of biological databases and tools”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, vol. 13, 2016, : 297.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
A. Shoshi, et al., “GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data”, BMC Medical Informatics and Decision Making, vol. 15, 2015, : 15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
A. Shoshi, et al., “Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 13, 2015, pp. 1540007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
J. Allmer, et al., eds., “Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2015.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
X. Meng, et al., “Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types”, Oncogenesis, vol. 4, 2015, : e177.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
A. Winter, et al., “Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems)”, Methods of Information in Medicine, vol. 54, 2015, pp. 385-387.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
M. Chen and R. Hofestädt, “Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems”, it-Information Technology, vol. 56, 2014, pp. 76-81.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
R. Hofestädt and A. Shoshi, eds., “German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2014.
PUB | Download (ext.)
 
[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
A. Winter, et al., “How to Use Information Technology to Improve Medication Safety”, Methods of Information in Medicine, vol. 53, 2014, pp. 333-335.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
C. Brinkrolf, et al., “VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 11, 2014, pp. 239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
O.V. Popik, et al., “Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract)”, Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop, B. Sommer, ed., Bielefeld: Bielefeld University, 2014, pp.9-10.
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2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
M. Chen and R. Hofestädt, eds., Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell, Berlin: Springer, 2014.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
O.V. Popik, et al., “Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions”, BMC Genomics, vol. 15, 2014, pp. S7.
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[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
R. Giegerich, R. Hofestädt, and T.W. Nattkemper, eds., “German Conference on Bioinformatics 2014”, GI-Edition: lecture notes in informatics, vol. 235, 2014.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
M. Chen and R. Hofestädt, “Integrative Bioinformatics”, Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell, M. Chen and R. Hofestädt, eds., Berlin: Springer, 2014, pp.3-19.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
H.-M. Lee, K.-J. Dietz, and R. Hofestädt, “Computational construction of specialized biological networks”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 11, 2013, pp. 1340003.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
B. Sommer, et al., “Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 11, 2013, pp. 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
R. Hofestädt, “Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen”, Management & Krankenhaus, 2013, pp. 22.
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[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
A. Winter, et al., “More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published”, Methods Of Information In Medicine, vol. 52, 2013, pp. 181-183.
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[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
R. Hofestädt, et al., “Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 10, 2013, pp. 226.
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
S. Proß, et al., “A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica”, Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC), C. Laroque, ed., Piscataway, NJ: IEEE, 2012, pp.1-13.
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
A. Shoshi, A. Shoshi, and R. Hofestädt, “KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung”, Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), U. Goltz, et al., eds., GI-Edition. Proceedings, vol. 208, Bonn: Ges. für Informatik, 2012, pp.1565-1574.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
C. Klenke, et al., “Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays”, PLoS One, vol. 7, 2012, pp. e52718.
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
R. Hofestädt and N. Kolchanov, eds., “German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2012.
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[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
M. Heiner and R. Hofestädt, eds., “Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets”, CEUR workshop proceedings, vol. 852, 2012.
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
R. Hofestädt, “Modeling aspects of the virtuell cell”, The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences, 2012, pp.122.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
K. Hippe, et al., “DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data”, Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics, 2011.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
R. Hofestädt, “Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.1-2.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
R. Hofestädt and S. Thelen, “Quantitative Modeling of Biochemical Networks”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.3-16.
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[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
M. Chen and R. Hofestädt, “Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition., Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.38-55.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
M. Chen, M. Hu, and R. Hofestädt, “A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes”, Applied Biochemistry and Biotechnology, vol. 164, 2011, pp. 338-352.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
M. Chen, et al., “Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks”, Natural Computing, vol. 10, 2011, pp. 1077-1097.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
D. Huang, et al., “MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web”, Bioinformatics, vol. 27, 2011, pp. 3321-3322.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
R. Hofestädt, “Fundamental Features of Metabolic Computing”, Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II, I. Batyrshin and G. Sidorov, eds., Lecture Notes in Computer Science, vol. 7095, Berlin, Heidelberg: Springer, 2011, pp.143-152.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
S.J. Janowski, et al., “Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing”, Biological Petri Nets, E. Wingender, ed., Studies in health technology and informatics, vol. 162, Amsterdam: IOS Press, 2011, pp.182-203.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
B. Kormeier, K. Hippe, and R. Hofestädt, “Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data”, it Information Technology, vol. 53, 2011, pp. 241-249.
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
K. Hippe, et al., “DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data”, Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik, LNI, vol. 176, Bonn: Ges. für Informatik, 2010, pp.720-725.
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2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
R. Hofestädt and N. Kolchanov, eds., “Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2010.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
T. Töpel, et al., “RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases”, Human Mutation, vol. 31, 2010, pp. E1081-E1088.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
B. Sommer, et al., “Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010, pp. 148.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
H.-M. Lee, K.-J. Dietz, and R. Hofestädt, “Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues.”, Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), vol. 7, 2010.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
B. Kormeier, et al., “CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010, : 142.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
S.J. Janowski, et al., “Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing”, In Silico Biology, vol. 10, 2010, pp. 27-48.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
B. Kormeier, et al., “Reconstruction of biological networks based on life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 7, 2010.
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R. Hofestädt, et al., “Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle”, Informatik 2009, S. Fischer, E. Maehle, and R. Reischuk, eds., LNI, vol. 154, Bonn: Ges. für Informatik, 2009, pp.33-34.
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
M. Chen and R. Hofestädt, eds., Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou, 2009.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
R. Hofestädt and E.-W. Mayr, “Bioinformatik”, Informatik Spektrum, vol. 32, 2009, pp. 285-286.
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
B. Kormeier, et al., “CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases”, Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck, S. Fischer, E. Maehle, and R. Reischuk, eds., Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI), 2009, pp.704-708.
PUB | Download (ext.)
 
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S. Hariharaputran, et al., “Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification”, Nature Precedings, 2008.
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F. Trefz, et al., “METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism”, Journal of Inherited Metabolic Disease, vol. 31, 2008, pp. 289.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
S. Hariharaputran, et al., “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data”, Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, vol. 4, 2008, pp. 63-74.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
R. Hofestädt, “DNA - Programming Language of Life?”, Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences, 2008.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
T. Töpel, et al., “BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, vol. 5, 2008.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
R. Hofestädt, “Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 5, 2007, pp. 457-466.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
S. Hariharaputran, et al., “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data.”, Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07), 2007.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
S. Hariharaputran, et al., “SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information”, Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems, 2007.
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2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
R. Hofestädt and T. Töpel, eds., Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006, vol. 3, Aachen: Shaker, 2007.
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
R. Hofestädt and F. Meinecke, “Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks”, Computers in Biology and Medicine, vol. 25, 1995, pp. 321-334.
PUB
 
[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
R. Hofestädt, K.-E. Großpietsch, and C. Steigner, Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations, Fachberichte Informatik, vol. 9-94, Koblenz: Universitätf Koblenz, 1994.
PUB
 
[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
D. Beerbohm, et al., “Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich”, Parallele Datenverarbeitung aktuell, R. Flieger and R. Grebe, eds., Amsterdam: IOS Press, 1994, pp.100-108.
PUB
 
[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
R. Hofestädt, “Computer-Aided Metabolic Engineering”, it+ti Nachrichten, 1994, pp. 66-70.
PUB
 
[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
R. Hofestädt, et al., “Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata”, Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994, L. Dekker, W. Smit, and J. Zuidervaart, eds., Amsterdam: Elsevier, 1994, pp.235-242.
PUB
 
[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
R. Hofestädt, “Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks”, Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research, H.A. Lim, ed., World Scientific, 1994, pp.331-340.
PUB
 
[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
R. Hofestädt and U. Ashauer, “Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten”, Medizin und Information, H. Kunath, ed., München: MMV, Medizin-Verl., 1994, pp.115-119.
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[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
R. Hofestädt, “Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen”, Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien, S.J. Pöppl, H.-G. Lipinski, and T. Mansky, eds., Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, vol. 77, München: MMV, Medizin-Verl., 1994, pp.245-249.
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[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
R. Hofestädt and U. Hörkens, “C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata”, Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), vol. 14, 1994, pp. 1-14.
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[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
R. Hofestädt, “Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse”, Simulationstechnik, G. Kampe and M. Zeitz, eds., Fortschritte in der Simulationstechnik, vol. 9, Wiesbaden: Vieweg, 1994, pp.1-8.
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[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
R. Hofestädt, F. Krückeberg, and T. Lengauer, eds., “Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993”, Informatik Aktuell, 1993, pp. VIII, 214.
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[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
R. Hofestädt, K. Lautenbach, and M. Löffler, Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung", Fachberichte Informatik, vol. 16-93, Koblenz: Universitätf Koblenz, 1993.
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[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
R. Hofestädt, “Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars”, Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, vol. 24, 1993, pp. 169-177.
PUB
 
[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
R. Hofestädt, “Grammatical Formalization of Metabolic Processes”, Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93, L. Hunter, D. Searls, and J. Shavlik, eds., Menlo Park: AAAI Press, 1993, pp.181-189.
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[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
R. Hofestädt, D. Beerbohm, and X. Huang, “Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten”, Proceedings of the PARS 1993, PARS Notes, vol. 12, 1993, pp.92-101.
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[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
R. Hofestädt, “A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways”, Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), vol. 11, 1993, pp. 253-262.
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[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
U. Hörkens and R. Hofestädt, “Cellular Automata Simulation Shell”, Computational Systems Analysis, A. Sydow, ed., Amsterdam: Elsevier, 1992, pp.325-330.
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[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
R. Hofestädt and H.P. Müller, “The Simulation of Genetic Processes”, Computational Systems Analysis, A. Sydow, ed., Amsterdam: Elsevier, 1992, pp.532-528.
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