183 Publikationen
-
2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984737Orlov, Y.L., Chen, M., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2023). BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. de Gruyter. doi:10.1515/jib-2023-0032.
-
2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960309Allmer, J., Elloumi, M., Comin, M. & Hofestädt, R. (2021). Special Issue of the 1st International Applied Bioinformatics Conference (iABC'21). Journal of Integrative Bioinformatics, 18(4). de Gruyter. doi:10.1515/jib-2021-0042.
-
2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2957504Brinkrolf, C., Ochel, L. & Hofestädt, R. (2021). VANESA: An open-source hybrid functional Petri net modeling and simulation environment in systems biology. Biosystems: 104531. Elsevier. doi:10.1016/j.biosystems.2021.104531.
-
2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2952999Ahsan, M.A., Liu, Y., Feng, C., Hofestädt, R. & Chen, M. (2021). OverCOVID: an integrative web portal for SARS-CoV-2 bioinformatics resources. Journal of integrative bioinformatics. De Gruyter. doi:10.1515/jib-2020-0046.
-
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939859Friedrichs, M., Shoshi, A., Chmura, P.J., Ison, J., Schwämmle, V., Schreiber, F., Hofestädt, R. & Sommer, B. (2020). JIB.tools 2.0 – A Bioinformatics Registry for Journal Published Tools with Interoperability to bio.tools. Journal of Integrative Bioinformatics, 16(4): 20190059. de Gruyter. doi:10.1515/jib-2019-0059.
-
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937754Chen, M., Hofestädt, R. & Taubert, J. (2019). Integrative Bioinformatics: History and Future. Journal of integrative bioinformatics, 16(3): 20192001. de Gruyter. doi:10.1515/jib-2019-2001.
-
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938765Zolotareva, O., Saik, O.V., Königs, C., Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Ivanisenko, V.A. & Hofestädt, R. (2019). Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects. Scientific Reports, 9(1): 16302. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-019-52762-w.
-
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938754Zhu, L., Hofestädt, R. & Ester, M. (2019). Tissue-Specific Subcellular Localization Prediction Using Multi-Label Markov Random Fields. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 16(5), 1471-1482. IEEE Computer Soc. doi:10.1109/TCBB.2019.2897683.
-
2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938395Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Saik, O.V., Zolotareva, O., Goncharova, I.A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E. & Hofestädt, R. (2019). Identification of the genetic factors underlying comorbidity between bronchial asthma and hypertension. EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS (S. 1035-1036). Gehalten auf der 51st Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG) in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics (EMPAG), London: Nature Publishing Group.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O. & Sommer, B. (2018). Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. Journal of Integrative Bioinformatics, 15(2): 20180003. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.1515/jib-2018-0003.
-
2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962349Hofestädt, R., Brinkrolf, C. & Reipke, P. (2018). OMPetri: A New Petri Net Simulation Environment Based on OpenModelica. Proceedings of the 2018 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology - ICBBT '18 (S. 57-61). Gehalten auf der the 2018 10th International Conference, New York: ACM Press. doi:10.1145/3232059.3232073.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962353Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R. & Allmer, J. (2018). Visualization and Analysis of miRNAs Implicated in Amyotrophic Lateral Sclerosis Within Gene Regulatory Pathways. Studies in Health Technology and Informatics, 253, 183-187. IOS. doi:10.3233/978-1-61499-896-9-183.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E. & Bragina, E.Y. (2018). GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180049. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0049.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I. & Ivanisenko, V.A. (2018). Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics, 11(1): 15. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/s12920-018-0331-4.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R. & Freidin, M.B. (2018). Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180052. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0052.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2018). Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180054. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0054.
-
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R. & Dosenko, V. (2018). shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180053. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0053.
-
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2017). KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs (Studies in Health Technology and Informatics). In D. Hayn & G. Schreier (Hrsg.), Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (S. 128-135). Gehalten auf der 11th eHealth Conference, Amsterdam: IOS Press. doi:10.3233/978-1-61499-759-7-128.
-
2017 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962354Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016 (Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik). (2017). Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016 (Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik). (J. Allmer, C. Brinkrolf, R. Hofestädt & M.D. Sacar Demirci, Hrsg.). Aachen: Shakver Verlag.
-
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M. & D'Elia, D. (2017). The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS, 18(S5): 101. Biomed Central Ltd. doi:10.1186/s12859-017-1532-0.
-
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R. & Allmer, J. (2017). Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 14(1). Walter de Gruyter GmbH. doi:10.1515/jib-2016-0004.
-
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C. & Hofestädt, R. (2017). Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Gehalten auf der 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017.
-
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R. & Chen, M. (2016). DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 13(4): 297. Imbio E V. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-297.
-
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making, 15(1): 15. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12911-015-0139-5.
-
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U. & Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 13(1): 1540007. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720015400077.
-
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R. & Chen, M. (2015). Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis, 4(12): e177. Nature Publishing Group. doi:10.1038/oncsis.2015.40.
-
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2015). Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (J. Allmer, C. Brinkrolf, R. Hofestädt & M.D. Sacar Demirci, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
-
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A. & Wege, D. (2015). Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine, 54(5), 385-387. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME15-05-1001.
-
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2014). Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In B. Sommer (Hrsg.), Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (S. 9-10). Gehalten auf der CELLmicrocosmos neXt workshop 2014, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-next2014-3.
-
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N. & Ivanisenko, V.A. (2014). Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics, 15(Suppl 12): S7. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/1471-2164-15-S12-S7.
-
-
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2014). German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & A. Shoshi, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
-
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C. & Timmer, A. (2014). How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine, 53(5), 333-335. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME14-10-0007.
-
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D. & Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics, 11(2), 239. IMBio e.V. doi:10.2390/biecoll-jib-2014-239.
-
2014 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (2014). Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: Springer.
-
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (2014). German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (R. Giegerich, R. Hofestädt & T.W. Nattkemper, Hrsg.), 235. Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, Bonn: Ges. für Informatik.
-
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694Chen, M. & Hofestädt, R. (2014). Integrative Bioinformatics. In M. Chen & R. Hofestädt (Hrsg.), Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (S. 3-19). Berlin: Springer.
-
2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709280Shoshi, A., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2013). KALIS - A web-based system for patient-specific risk assessment of drugs. In F. Schreiber, R. Hofestädt, M. Lange, U. Scholz, T. Czauderna, R. Schnee & S. Weise (Hrsg.), Proceedings of the 9 th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013 (S. 178-178). Gehalten auf der International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013.
-
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01): 1340005. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400052.
-
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2013). Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01): 1340003. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400039.
-
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701Hofestädt, R. (2013). Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus, (4), 22.
-
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C. & Timmer, A. (2013). More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine, 52(3), 181-183. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine).
-
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B. & Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics, 10(1), 226. Walter De Gruyter Gmbh.
-
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B. & Sudhoff, H. (2012). Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One, 7(12): e52718. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0052718.
-
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2012). A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In C. Laroque (Hrsg.), Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (S. 1-13). Gehalten auf der Winter Simulation Conference (WSC), Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/WSC.2012.6465287.
-
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751Shoshi, A., Shoshi, A. & Hofestädt, R. (2012). KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung (GI-Edition. Proceedings). In U. Goltz, M. Magnor, H.-J. Appelrath, H.K. Matthies, W.-T. Balke & L. Wolf (Hrsg.), Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (S. 1565-1574). Gehalten auf der INFORMATIK 2012: Was bewegt uns in der/die Zukunft?, Bonn: Ges. für Informatik.
-
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2012). German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
-
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (2012). Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (M. Heiner & R. Hofestädt, Hrsg.), 852. Gehalten auf der 3. International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets.
-
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726Hofestädt, R. (2012). Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts (S. 122). Gehalten auf der BGRS\SB’12, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
-
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
-
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427Hofestädt, R. (2011). Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 1-2). Amsterdam: IOS Press.
-
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491Hofestädt, R. & Thelen, S. (2011). Quantitative Modeling of Biochemical Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 3-16). Amsterdam: IOS Press.
-
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523Chen, M. & Hofestädt, R. (2011). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 38-55). Amsterdam: IOS Press.
-
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112Chen, M., Hu, M. & Hofestädt, R. (2011). A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology, 164(3), 338-352. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s12010-010-9138-2.
-
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B. & Spangardt, S. (2011). Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing, 10(3), 1077-1097. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s11047-009-9151-y.
-
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C. & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr557.
-
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209Hofestädt, R. (2011). Fundamental Features of Metabolic Computing (Lecture Notes in Computer Science). In I. Batyrshin & G. Sidorov (Hrsg.), Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (S. 143-152). Gehalten auf der MICAI ; Mexican International Conference on Artificial Intelligence ; 10, Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-25330-0_13.
-
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (S. 182-203). Amsterdam: IOS Press.
-
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2010). Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 7(3), 23-34. IMBio, Informationsmanagement in der Biotechnologie e.V. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-130.
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1): 142. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-142.
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2), 3-8. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-146.
-
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data (LNI). Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik (S. 720-725). Gehalten auf der Informatik 2010, Bonn: Ges. für Informatik.
-
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2010). Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F. & Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation, 31(1), E1081-E1088. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.21169.
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 148. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-148.
-
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48. IOS Press.
-
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120Hofestädt, R. (2009). DNA-Programming Language of Life. HBSO, 13(1), 68-72.
-
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W. & Türker, C. (2009). Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle (LNI). In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Informatik 2009 (S. 33-34). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Ges. für Informatik.
-
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009). Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou.
-
-
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (S. 704-708). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).
-
2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
-
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350Hofestädt, R. (2008). DNA - Programming Language of Life? In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), . Gehalten auf der BGRS'08, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
-
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2008). Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1038/npre.2008.1943.1.
-
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R. & Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease, 31, 289. Springer.
-
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 4, 63-74. Shaker Verlag Aachen.
-
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A. & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2), 343-349. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2008-93.
-
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044Hofestädt, R. (2007). Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 5(02b), 457-466. Imperial College Press. doi:10.1142/S0219720007002904.
-
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2007). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). Gehalten auf der 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).
-
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2007). SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. Gehalten auf der 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.
-
2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
-
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256Töpel, T., Neumann, J. & Hofestädt, R. (2007). A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (S. 7-11). Gehalten auf der Proceedings of The 20th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007), Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
-
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S. & Trefz, F.K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 30(Suppl. 1), 3. SPRINGER.
-
2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
-
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D. & Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics, 5(2), 115-118. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.2165/00822942-200605020-00006.
-
2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (2006). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (N. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi, Hrsg.) (1. Edition.). New York: Springer.
-
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332Hofestädt, R. (2006). An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006 (S. 48-52). Gehalten auf der BGRS'2006, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics.
-
-
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 1, 228-231. IEEE. doi:10.1109/IEMBS.2005.1616385.
-
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
-
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 39(2), 147-159. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2005.05.005.
-
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
-
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In N.A. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II (S. 355-365). Gehalten auf der 4. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, New York: Springer.
-
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology, 5(2), 111-128. IOS Press.
-
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856Hofestädt, R. & Töpel, T. (2005). Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning (Studies in Fuzziness and Soft Computing). In U. Seiffert, L. Jain & P. Schweizer (Hrsg.), Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (1. Edition., S. 1-24). Berlin: Springer.
-
2005 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634Yearbook Bioinformatics 2004. (2005). Yearbook Bioinformatics 2004. (R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Bonn: Köllen.
-
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874Chen, M., Freier, A. & Hofestädt, R. (2005). Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In C. Sensen (Hrsg.), Handbook of Genome Research (1. Edition., S. 461-490). Weinheim: Wiley-VCH.
-
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654Hofestädt, R. (2005). Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology, 5(2), 81-82. IOS Press.
-
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364Hofestädt, R. (2005). Bioinformatik. In T. Lehmann (Hrsg.), Handbuch der Medizinischen Informatik (2., vollst. neu bearb. Aufl., S. 253-298). München: Hanser.
-
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766Hofestädt, R. & Chen, M. (2004). Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 68-72). Gehalten auf der BGRS`2004.
-
2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (2004). Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (R. Hofestädt & H.-P. Lenhof, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 46(1). Oldenbourg.
-
2004 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (2004). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (N. Kolchanov & R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, BGRS, Boston: Kluwer Academic.
-
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762Hofestädt, R. & Lenhof, H.-P. (2004). Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik, 46(1), 3-4. Oldenbourg.
-
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics, 3(4), 241-252. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.2165/00822942-200403040-00006.
-
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 3(3), 192-199. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/TNB.2004.833691.
-
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836Chen, M., Lin, S. & Hofestädt, R. (2004). STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research, 32(90001), D456-D458. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkh079.
-
2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2003). Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In N.A. Kolčanov & R. Hofestädt (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Boston: Kluwer.
-
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607Kolchanov, N. & Hofestädt, R. (2003). The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology, 3(2). IOS Press.
-
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667Chen, M. & Hofestädt, R. (2003). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology, 3(3), 347-365. IOS Press.
-
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2003). IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology, 3(2), 215-227. IOS Press.
-
2002 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (2002). Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (J. Collado-Vides & R. Hofestädt, Hrsg.). Cambridge, Mass.: MIT Press.
-
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795Hofestädt, R. (2002). Bioinformatics (Yearbook of Medical Informatics). In R. Haux (Hrsg.), Medical imaging informatics (S. 581-583). Stuttgart: Schattauer.
-
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624Hofestädt, R., Kolchanov, N. & Reinitz, J. (2002). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology, 2(2), 35. IOS Press.
-
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U. & Stephanik, A. (2002). BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology, 2(2), 37-57. IOS Press.
-
2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798Hofestädt, R. & Schnee, R. (2002). Studien- und Forschungsführer Bioinformatik (1. Edition.). Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag.
-
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867Freier, A., Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In J. Borlak (Hrsg.), Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (1. Edition., S. 233-252). Weinheim: Wiley-VCH.
-
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2002). IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 123-125). Gehalten auf der BGRS’02.
-
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (S. 129-133). Gehalten auf der CBMS 2002, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
-
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2002). Information Fusion and Metabolic Network Control. In J. Collado-Vides & R. Hofestädt (Hrsg.), Gene Regulation and Metabolism (S. 49-84). Cambridge, Mass.: MIT Press.
-
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818Töpel, T. & Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik, 14(3), 315. Springer.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T. & Scholz, U. (2001). Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 353-356). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2001). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In G. Xue, Y. Xue, Z. Xu & R. Holmes (Hrsg.), Gene Families (S. 221-232). Gehalten auf der 10th International Congress on Genes, Gene Families, and Isozymes, Singapore: World Scientific.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2001). The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology (S. 38-43). Gehalten auf der NETTAB 2001.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D. & Trefz, F.K. (2001). RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 970-974). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Freier, A. (2001). Metabolic Information Control System. In N. Callaos (Hrsg.), Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics. Gehalten auf der SCI 2001, Orlando, Fla.: IIIS.
-
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899Hofestädt, R., Reinitz, J. & Kolchanov, N. (2001). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways (Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik), 22, 37. Gehalten auf der 3. Dagstuhl Seminar for Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways, Magdeburg: Univ. Magdeburg.
-
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863Hofestädt, R. (2000). Electronical infrastructure for the detection of inborn errors. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 212-213). Gehalten auf der BRGS2000.
-
2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913Hofestädt, R., Pleißner, K.-P. & Stephanik, A. (2000). Informationssysteme in der Biotechnologie. Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg.
-
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M. & Scholz, U. (2000). An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks (S. 210-211). Gehalten auf der World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Frankfurt am Main: DECHEMA.
-
2000 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (2000). Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: BIOCOM.
-
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895Hofestädt, R., Mischke, U. & Scholz, U. (2000). Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism (Studies in health technology and informatics). In A. Hasman (Hrsg.), Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000 (S. 857-862). Gehalten auf der MIE2000 and GMDS2000, Amsterdam: IOS Press.
-
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M. & Schulze-Kremer, S. (2000). Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering (S. 77-80). Gehalten auf der IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
-
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013Hofestädt, R. (1999). Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum, 22(5), 385-390. Springer Science + Business Media.
-
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School. Gehalten auf der IBSS`99.
-
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M. & Scholz, U. (1999). Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe, 68, 12-15. IOS Press {[u.a.].
-
-
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks. In E. Wingender, R. Hofestädt, R. Giegerich, T. Lengauer, W. Mewes, D. Schomburg & M. Vingron (Hrsg.), Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99 (S. 190-194). Gehalten auf der GCB`99, Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics.
-
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015Hofestädt, R. (1999). Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal, 99(10), 12-13. LJ-Verl.
-
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (1998). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Mavrovouniotis & G. Michal, Hrsg.), 215. Gehalten auf der Modelling and simulation of gene and cell regulation and metabolic pathways, Saarbrücken: Geschäftsstelle Schloss Dagstuhl, Univ. des Saarlandes.
-
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1998). Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der workshop der GI FG 4.0.2 Informatik in den Biowissenschaften im Rahmen der Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik (GI'98), Aachen: Shaker.
-
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384Hofestädt, R. & Scholz, U. (1998). Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems, 47(1-2), 91-102. Elsevier BV. doi:10.1016/S0303-2647(98)00015-X.
-
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M. & Scholz, U. (1998). Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98) (S. 86-89). Gehalten auf der 1. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98).
-
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G. & Scholz, U. (1998). Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics (Lecture Notes in Computer Science). In W. Litwin, T. Morzy & G. Vossen (Hrsg.), Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings (S. 296-304). Gehalten auf der Second East-European Symposium on Advances in Databases and Information Systems (ADBIS'98), Berlin: Springer Publishing.
-
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253Hofestädt, R. (1998). An Integrative Molecular Information System (Studies in health technology and informatics). In B. Cesnik, A.T. McCray & J.-R. Scherrer (Hrsg.), MedInfo ’98 (S. 361-365). Gehalten auf der 9th World Congress on Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
-
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U. & Urban, H. (1998). Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal, 3(1), 29-40. Univ.
-
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291Hofestädt, R. & Thelen, S. (1998). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology, 1(1), 39-53. IOS Press,.
-
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355Hofestädt, R. (1997). Computer Science and Biology. Biosystems, 43, 69-71. Elsevier BV.
-
1997 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702Bioinformatics (LNCS). (1997). Bioinformatics (LNCS). (R. Hofestädt, T. Lengauer, M. Löffler & D. Schomburg, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, GCB, Berlin: Springer.
-
1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1997). Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & H. Lim, Hrsg.). Gehalten auf der 11. ACM International Conference on Supercomputing (ICS'97), Aachen: Shaker.
-
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441Hofestädt, R. (1997). Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In C. Steigner (Hrsg.), Arbeitsplatz-Rechensysteme (S. 285-292). Gehalten auf der 4. ITG/GI-Fachtagung Arbeitsplatz-Rechensysteme (APS), Koblenz: Fölbach Publishing.
-
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458Hofestädt, R. (1997). Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing (S. 2293-2297). Gehalten auf der EUFIT '97, Aachen: Mainz.
-
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735Hofestädt, R., Herre, H. & Trefz, F. (1996). Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen (Informatik-Berichte). Leipzig: Universität Leipzig.
-
-
1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707Hofestädt, R. (1996). Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors (Studies in health technology and informatics). In J. Brender (Hrsg.), Medical Informatics Europe '96 (S. 542-546). Gehalten auf der MIE (Medical Informatics Europe) Congress, Amsterdam: IOS Press.
-
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263Hofestädt, R. (1996). Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels (Medizinische Informatik und Bioinformatik) (1. Edition.). Aachen: Shaker Verlag.
-
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M. & Löffler, M. (1996). Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays, 18(4), 333-335. Wiley. doi:10.1002/bies.950180412.
-
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722Informatik in den Biowissenschaften. (1996). Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, T. Lengauer & M. Löffler, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 38(5). Oldenbourg-Verlag.
-
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773Hofestädt, R., Löffler, M. & Möller, K. (1995). Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn, 88. Universität Bonn.
-
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829Hofestädt, R. (1995). Artificial Life (GMD-Studien). In K. Dautenhahn & GMD-Forschungszentrum Informationstechnik (Hrsg.), Proceedings des Workshops "Artificial Life" (S. 246). Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik.
-
1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (1995). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Löffler & M. Mavrovouniotis, Hrsg.), (130). Gehalten auf der Dagstuhl Seminar, Dagstuhl: Schloss Dagstuhl.
-
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803Hofestädt, R. (1995). Metabolic Engineering. In A. Sydow (Hrsg.), Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation (S. 321-326). Gehalten auf der International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Gordon and Breach.
-
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815Hofestädt, R. (1995). A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In R.A. Greenes, H.E. Petersen & D.J. Protti (Hrsg.), Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics (S. 994-999). Gehalten auf der MEDINFO '95. Eighth World Congress on Medical Informatics, Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada.
-
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822Hofestädt, R. & Huang, X. (1995). Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95 (S. 344-347). Gehalten auf der APPT'95: International Workshop on Advanced Parallel Processing Technologies, Publishing House of Electronics Industry.
-
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784Hofestädt, R. (1995). Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe, 13, 7-15.
-
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789Hofestädt, R. & Meinecke, F. (1995). Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine, 25(3), 321-334. Pergamon-Elsevier.
-
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E. & Steigner, C. (1994). Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
-
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R. & Huang, X. (1994). Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In R. Flieger & R. Grebe (Hrsg.), Parallele Datenverarbeitung aktuell (S. 100-108). Amsterdam: IOS Press.
-
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427Hofestädt, R. (1994). Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten, (6), 66-70.
-
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S. & Huang, X. (1994). Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In L. Dekker, W. Smit & J. Zuidervaart (Hrsg.), Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994 (S. 235-242). Gehalten auf der EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Amsterdam: Elsevier.
-
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387Hofestädt, R. (1994). Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In H.A. Lim (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 331-340). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics and Genome Research, World Scientific.
-
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433Hofestädt, R. & Ashauer, U. (1994). Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In H. Kunath (Hrsg.), Medizin und Information (S. 115-119). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, München: MMV, Medizin-Verl.,.
-
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471Hofestädt, R. (1994). Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen (Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie). In S.J. Pöppl, H.-G. Lipinski & T. Mansky (Hrsg.), Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien (S. 245-249). Gehalten auf der 38. Jahrestagung der GMDS, München: MMV, Medizin-Verl.,.
-
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596Hofestädt, R. & Hörkens, U. (1994). C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 14(1), 1-14. Gordon and Breach Science Publishers.
-
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393Hofestädt, R. (1994). Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse (Fortschritte in der Simulationstechnik). In G. Kampe & M. Zeitz (Hrsg.), Simulationstechnik (S. 1-8). Gehalten auf der 9. Symposium Simulationstechnik, Wiesbaden: Vieweg.
-
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (1993). Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (R. Hofestädt, F. Krückeberg & T. Lengauer, Hrsg.), VIII, 214. Gehalten auf der 1. Fachtagung Bioinformatik, Heidelberg: Springer Publishing.
-
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486Hofestädt, R., Lautenbach, K. & Löffler, M. (1993). Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung" (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
-
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358Hofestädt, R. (1993). Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 24(4), 169-177. Gustav Fischer Verlag.
-
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301Hofestädt, R. (1993). Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In L. Hunter, D. Searls & J. Shavlik (Hrsg.), Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (S. 181-189). Gehalten auf der 1. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Menlo Park: AAAI Press.
-
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456Hofestädt, R., Beerbohm, D. & Huang, X. (1993). Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten (PARS Notes). Proceedings of the PARS 1993 (S. 92-101). Gehalten auf der PARS.
-
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590Hofestädt, R. (1993). A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 11, 253-262. Gordon and Breach Science Publishers.
-
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542Hörkens, U. & Hofestädt, R. (1992). Cellular Automata Simulation Shell. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 325-330). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.
-
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557Hofestädt, R. & Müller, H.P. (1992). The Simulation of Genetic Processes. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 532-528). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.