170 Publikationen

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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E. & Bragina, E.Y. (2018). GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180049. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0049.
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[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2018). Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180054. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0054.
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[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R. & Dosenko, V. (2018). shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180053. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0053.
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[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R. & Freidin, M.B. (2018). Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180052. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0052.
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[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O. & Sommer, B. (2018). Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(2): 20180003. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.1515/jib-2018-0003.
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[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I. & Ivanisenko, V.A. (2018). Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics, 11(1): 15. doi:10.1186/s12920-018-0331-4.
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[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R. & Allmer, J. (2017). Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 14(1). Walter de Gruyter GmbH. doi:10.1515/jib-2016-0004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M. & D'Elia, D. (2017). The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS, 18: 101. Biomed Central Ltd. doi:10.1186/s12859-017-1532-0.
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[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C. & Hofestädt, R. (2017). Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Gehalten auf der 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2017). KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs (Studies in Health Technology and Informatics). In D. Hayn & G. Schreier (Hrsg.), Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (S. 128-135). Gehalten auf der 11th eHealth Conference, Amsterdam: IOS Press. doi:10.3233/978-1-61499-759-7-128.
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[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R. & Chen, M. (2016). DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 13(4): 297. Imbio E V. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-297.
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[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making, 15: 15. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12911-015-0139-5.
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[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U. & Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 13(1), 1540007. doi:10.1142/S0219720015400077.
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[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2015). Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (J. Allmer, C. Brinkrolf, R. Hofestädt & M.D. Sacar Demirci, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R. & Chen, M. (2015). Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis, 4: e177. Nature Publishing Group. doi:10.1038/oncsis.2015.40.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A. & Wege, D. (2015). Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine, 54(5), 385-387. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME15-05-1001.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
Chen, M. & Hofestädt, R. (2014). Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems. it-Information Technology, 56(2), 76-81. doi:10.1515/itit-2013-1021.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2014). German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & A. Shoshi, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
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[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C. & Timmer, A. (2014). How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine, 53(5), 333-335. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME14-10-0007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D. & Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics, 11(2), 239. IMBio e.V. doi:10.2390/biecoll-jib-2014-239.
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[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2014). Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In B. Sommer (Hrsg.), Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (S. 9-10). Gehalten auf der CELLmicrocosmos neXt workshop 2014, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-next2014-3.
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[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (2014). Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: Springer.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N. & Ivanisenko, V.A. (2014). Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics, 15(Suppl 12), S7. doi:10.1186/1471-2164-15-S12-S7.
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[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (2014). German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (R. Giegerich, R. Hofestädt & T.W. Nattkemper, Hrsg.), 235. Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
Chen, M. & Hofestädt, R. (2014). Integrative Bioinformatics. In M. Chen & R. Hofestädt (Hrsg.), Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (S. 3-19). Berlin: Springer.
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2013). Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340003. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400039.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340005. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400052.
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[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
Hofestädt, R. (2013). Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus, (4), 22.
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C. & Timmer, A. (2013). More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine, 52(3), 181-183. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine).
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[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B. & Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics, 10(1), 226.
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2012). A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In C. Laroque (Hrsg.), Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (S. 1-13). Gehalten auf der Winter Simulation Conference (WSC), Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/WSC.2012.6465287.
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[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
Shoshi, A., Shoshi, A. & Hofestädt, R. (2012). KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung (GI-Edition. Proceedings). In U. Goltz, M. Magnor, H.-J. Appelrath, H.K. Matthies, W.-T. Balke & L. Wolf (Hrsg.), Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (S. 1565-1574). Gehalten auf der INFORMATIK 2012: Was bewegt uns in der/die Zukunft?, Bonn: Ges. für Informatik.
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[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B. & Sudhoff, H. (2012). Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One, 7(12), e52718. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0052718.
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[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2012). German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (2012). Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (M. Heiner & R. Hofestädt, Hrsg.), 852. Gehalten auf der 3. International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets.
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
Hofestädt, R. (2012). Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts (S. 122). Gehalten auf der BGRS\SB’12, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
Hofestädt, R. (2011). Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 1-2). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
Hofestädt, R. & Thelen, S. (2011). Quantitative Modeling of Biochemical Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 3-16). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
Chen, M. & Hofestädt, R. (2011). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 38-55). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
Chen, M., Hu, M. & Hofestädt, R. (2011). A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology, 164(3), 338-352. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s12010-010-9138-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B. & Spangardt, S. (2011). Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing, 10(3), 1077-1097. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s11047-009-9151-y.
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C. & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr557.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
Hofestädt, R. (2011). Fundamental Features of Metabolic Computing (Lecture Notes in Computer Science). In I. Batyrshin & G. Sidorov (Hrsg.), Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (S. 143-152). Gehalten auf der MICAI ; Mexican International Conference on Artificial Intelligence ; 10, Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-25330-0_13.
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (S. 182-203). Amsterdam: IOS Press.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Kormeier, B., Hippe, K. & Hofestädt, R. (2011). Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology, 53(5), 241-249. Walter de Gruyter GmbH. doi:10.1524/itit.2011.0649.
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data (LNI). Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik (S. 720-725). Gehalten auf der Informatik 2010, Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2010). Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F. & Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation, 31(1), E1081-E1088. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.21169.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 148. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2010). Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 7(3). doi:10.2390/biecoll-jib-2010-130.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1): 142. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48.
PUB
 
[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2010-146.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[116]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
Hofestädt, R. (2009). DNA-Programming Language of Life. HBSO, 13(1), 68-72.
PUB
 
[115]
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W. & Türker, C. (2009). Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle (LNI). In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Informatik 2009 (S. 33-34). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[114]
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009). Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou.
PUB
 
[113]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
Hofestädt, R. & Mayr, E.-W. (2009). Bioinformatik. Informatik Spektrum, 32(4), 285-286. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00287-009-0353-6.
PUB | DOI
 
[112]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (S. 704-708). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).
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[111]
2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[110]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2008). Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. doi:10.1038/npre.2008.1943.1.
PUB | DOI
 
[109]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R. & Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease, 31, 289.
PUB
 
[108]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 4, 63-74. Shaker Verlag Aachen.
PUB
 
[107]
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
Hofestädt, R. (2008). DNA - Programming Language of Life? In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), . Gehalten auf der BGRS'08, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
PUB
 
[106]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A. & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2008-93.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[105]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
Hofestädt, R. (2007). Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 5(02b), 457-466. Imperial College Press. doi:10.1142/S0219720007002904.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[104]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2007). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). Gehalten auf der 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).
PUB
 
[103]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2007). SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. Gehalten auf der 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.
PUB
 
[102]
2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[101]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
Töpel, T., Neumann, J. & Hofestädt, R. (2007). A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (S. 7-11). Gehalten auf der Proceedings of The 20th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007), Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[100]
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S. & Trefz, F.K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 30(Suppl. 1), 3. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[99]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[98]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D. & Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics, 5(2), 115-118. doi:10.2165/00822942-200605020-00006.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[97]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (2006). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (N. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi, Hrsg.) (1. Edition.). New York: Springer.
PUB
 
[96]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
Hofestädt, R. (2006). An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006 (S. 48-52). Gehalten auf der BGRS'2006, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics.
PUB
 
[95]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287
Prins, B. & Hofestädt, R. (2006). MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks. Journal of Integrative Bioinformatics, 3(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2006-45.
PUB | DOI
 
[94]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589
Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 1. doi:10.1109/IEMBS.2005.1616385.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[93]
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[92]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808
Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 39(2), 147-159. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2005.05.005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[91]
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[90]
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In N.A. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II (S. 355-365). Gehalten auf der 4. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, New York: Springer.
PUB
 
[89]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271
Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology, 5(2), 111-128. IOS Press.
PUB
 
[88]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856
Hofestädt, R. & Töpel, T. (2005). Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning (Studies in Fuzziness and Soft Computing). In U. Seiffert, L. Jain & P. Schweizer (Hrsg.), Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (1. Edition., S. 1-24). Berlin: Springer.
PUB
 
[87]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
Chen, M., Freier, A. & Hofestädt, R. (2005). Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In C. Sensen (Hrsg.), Handbook of Genome Research (1. Edition., S. 461-490). Weinheim: Wiley-VCH.
PUB
 
[86]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654
Hofestädt, R. (2005). Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology, 5(2), 81-82. IOS Press.
PUB
 
[85]
2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
Yearbook Bioinformatics 2004. (2005). Yearbook Bioinformatics 2004. (R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Bonn: Köllen.
PUB
 
[84]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
Hofestädt, R. (2005). Bioinformatik. In T. Lehmann (Hrsg.), Handbuch der Medizinischen Informatik (2., vollst. neu bearb. Aufl., S. 253-298). München: Hanser.
PUB
 
[83]
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
Hofestädt, R. & Chen, M. (2004). Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 68-72). Gehalten auf der BGRS`2004.
PUB
 
[82]
2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758
Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (2004). Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (R. Hofestädt & H.-P. Lenhof, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 46(1). Oldenbourg.
PUB
 
[81]
2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (2004). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (N. Kolchanov & R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, BGRS, Boston: Kluwer Academic.
PUB
 
[80]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
Hofestädt, R. & Lenhof, H.-P. (2004). Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik, 46(1), 3-4. Oldenbourg.
PUB
 
[79]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics, 3(4), 241-252. doi:10.2165/00822942-200403040-00006.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[78]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 3(3), 192-199. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/TNB.2004.833691.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[77]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836
Chen, M., Lin, S. & Hofestädt, R. (2004). STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research, 32(90001), D456-D458. doi:10.1093/nar/gkh079.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[76]
2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778
Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2003). Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In N.A. Kolčanov & R. Hofestädt (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Boston: Kluwer.
PUB
 
[75]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607
Kolchanov, N. & Hofestädt, R. (2003). The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology, 3(2). IOS Press.
PUB
 
[74]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667
Chen, M. & Hofestädt, R. (2003). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology, 3(3), 347-365.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[73]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610
Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2003). IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology, 3(2), 215-227.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[72]
2002 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797
Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (2002). Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (J. Collado-Vides & R. Hofestädt, Hrsg.). Cambridge, Mass.: MIT Press.
PUB
 
[71]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624
Hofestädt, R., Kolchanov, N. & Reinitz, J. (2002). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology, 2(2), 35. IOS Press.
PUB
 
[70]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U. & Stephanik, A. (2002). BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology, 2(2), 37-57. IOS Press.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[69]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795
Hofestädt, R. (2002). Bioinformatics (Yearbook of Medical Informatics). In R. Haux (Hrsg.), Medical imaging informatics (S. 581-583). Stuttgart: Schattauer.
PUB
 
[68]
2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798
Hofestädt, R. & Schnee, R. (2002). Studien- und Forschungsführer Bioinformatik (1. Edition.). Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag.
PUB
 
[67]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838
Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2002). IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 123-125). Gehalten auf der BGRS’02.
PUB
 
[66]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845
Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (S. 129-133). Gehalten auf der CBMS 2002, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[65]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867
Freier, A., Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In J. Borlak (Hrsg.), Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (1. Edition., S. 233-252). Weinheim: Wiley-VCH.
PUB
 
[64]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2002). Information Fusion and Metabolic Network Control. In J. Collado-Vides & R. Hofestädt (Hrsg.), Gene Regulation and Metabolism (S. 49-84). Cambridge, Mass.: MIT Press.
PUB
 
[63]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818
Töpel, T. & Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik, 14(3), 315.
PUB
 
[62]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918
Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T. & Scholz, U. (2001). Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 353-356). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[61]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481
Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2001). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In G. Xue, Y. Xue, Z. Xu & R. Holmes (Hrsg.), Gene Families (S. 221-232). Gehalten auf der 10th International Congress on Genes, Gene Families, and Isozymes, Singapore: World Scientific.
PUB
 
[60]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854
Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2001). The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology (S. 38-43). Gehalten auf der NETTAB 2001.
PUB
 
[59]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974
Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D. & Trefz, F.K. (2001). RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 970-974). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[58]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959
Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Freier, A. (2001). Metabolic Information Control System. In N. Callaos (Hrsg.), Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics. Gehalten auf der SCI 2001, Orlando, Fla.: IIIS.
PUB
 
[57]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899
Hofestädt, R., Reinitz, J. & Kolchanov, N. (2001). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways (Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik), 22, 37. Gehalten auf der 3. Dagstuhl Seminar for Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways, Magdeburg: Univ. Magdeburg.
PUB
 
[56]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863
Hofestädt, R. (2000). Electronical infrastructure for the detection of inborn errors. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 212-213). Gehalten auf der BRGS2000.
PUB
 
[55]
2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913
Hofestädt, R., Pleißner, K.-P. & Stephanik, A. (2000). Informationssysteme in der Biotechnologie. Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg.
PUB
 
[54]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846
Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M. & Scholz, U. (2000). An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks (S. 210-211). Gehalten auf der World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Frankfurt am Main: DECHEMA.
PUB
 
[53]
2000 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010
Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (2000). Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: BIOCOM.
PUB
 
[52]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895
Hofestädt, R., Mischke, U. & Scholz, U. (2000). Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism (Studies in health technology and informatics). In A. Hasman (Hrsg.), Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000 (S. 857-862). Gehalten auf der MIE2000 and GMDS2000, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[51]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922
Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M. & Schulze-Kremer, S. (2000). Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering (S. 77-80). Gehalten auf der IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[50]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013
Hofestädt, R. (1999). Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum, 22(5), 385-390.
PUB
 
[49]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999
Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School. Gehalten auf der IBSS`99.
PUB
 
[48]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004
Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M. & Scholz, U. (1999). Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe, 68, 12-15.
PUB
 
[47]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396954
Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M. & Michal, G. (1999). Modeling and simulation of gene regulation and metabolic pathways. BioSystems, 49(1), 79-82. doi:10.1016/S0303-2647(98)00081-1.
PUB | DOI
 
[46]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks. In E. Wingender, R. Hofestädt, R. Giegerich, T. Lengauer, W. Mewes, D. Schomburg & M. Vingron (Hrsg.), Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99 (S. 190-194). Gehalten auf der GCB`99, Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics.
PUB
 
[45]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015
Hofestädt, R. (1999). Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal, 99(10), 12-13.
PUB
 
[44]
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (1998). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Mavrovouniotis & G. Michal, Hrsg.), 215. Gehalten auf der Modelling and simulation of gene and cell regulation and metabolic pathways, Saarbrücken: Geschäftsstelle Schloss Dagstuhl, Univ. des Saarlandes.
PUB
 
[43]
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682
Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1998). Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der workshop der GI FG 4.0.2 Informatik in den Biowissenschaften im Rahmen der Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik (GI'98), Aachen: Shaker.
PUB
 
[42]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384
Hofestädt, R. & Scholz, U. (1998). Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems, 47(1-2), 91-102. doi:10.1016/S0303-2647(98)00015-X.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[41]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966
Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M. & Scholz, U. (1998). Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98) (S. 86-89). Gehalten auf der 1. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98).
PUB
 
[40]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037
Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G. & Scholz, U. (1998). Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics (Lecture Notes in Computer Science). In W. Litwin, T. Morzy & G. Vossen (Hrsg.), Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings (S. 296-304). Gehalten auf der Second East-European Symposium on Advances in Databases and Information Systems (ADBIS'98), Berlin: Springer Publishing.
PUB
 
[39]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253
Hofestädt, R. (1998). An Integrative Molecular Information System (Studies in health technology and informatics). In B. Cesnik, A.T. McCray & J.-R. Scherrer (Hrsg.), MedInfo ’98 (S. 361-365). Gehalten auf der 9th World Congress on Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[38]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272
Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U. & Urban, H. (1998). Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal, 3(1), 29-40.
PUB
 
[37]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291
Hofestädt, R. & Thelen, S. (1998). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology, 1(1), 39-53. IOS Press,.
PUB
 
[36]
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355
Hofestädt, R. (1997). Computer Science and Biology. Biosystems, 43, 69-71.
PUB
 
[35]
1997 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702
Bioinformatics (LNCS). (1997). Bioinformatics (LNCS). (R. Hofestädt, T. Lengauer, M. Löffler & D. Schomburg, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, GCB, Berlin: Springer.
PUB
 
[34]
1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666
Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1997). Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & H. Lim, Hrsg.). Gehalten auf der 11. ACM International Conference on Supercomputing (ICS'97), Aachen: Shaker.
PUB
 
[33]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441
Hofestädt, R. (1997). Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In C. Steigner (Hrsg.), Arbeitsplatz-Rechensysteme (S. 285-292). Gehalten auf der 4. ITG/GI-Fachtagung Arbeitsplatz-Rechensysteme (APS), Koblenz: Fölbach Publishing.
PUB
 
[32]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458
Hofestädt, R. (1997). Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing (S. 2293-2297). Gehalten auf der EUFIT '97, Aachen: Mainz.
PUB
 
[31]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735
Hofestädt, R., Herre, H. & Trefz, F. (1996). Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen (Informatik-Berichte). Leipzig: Universität Leipzig.
PUB
 
[30]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378570
Hofestädt, R., Huang, X. & Beerbohm, D. (1996). Simulation of load balancing with cellular automata. Simulation Practice and Theory, 4(2), 81-96. Elsevier. doi:10.1016/0928-4869(95)00045-3.
PUB | DOI
 
[29]
1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707
Hofestädt, R. (1996). Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors (Studies in health technology and informatics). In J. Brender (Hrsg.), Medical Informatics Europe '96 (S. 542-546). Gehalten auf der MIE (Medical Informatics Europe) Congress, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[28]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263
Hofestädt, R. (1996). Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels (Medizinische Informatik und Bioinformatik) (1. Edition.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[27]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698
Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M. & Löffler, M. (1996). Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays, 18(4), 333-335. doi:10.1002/bies.950180412.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[26]
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722
Informatik in den Biowissenschaften. (1996). Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, T. Lengauer & M. Löffler, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 38(5). Oldenbourg-Verlag.
PUB
 
[25]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773
Hofestädt, R., Löffler, M. & Möller, K. (1995). Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn, 88. Universität Bonn.
PUB
 
[24]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829
Hofestädt, R. (1995). Artificial Life (GMD-Studien). In K. Dautenhahn (Hrsg.), Proceedings des Workshops "Artificial Life". Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik.
PUB
 
[23]
1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (1995). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Löffler & M. Mavrovouniotis, Hrsg.), (130). Gehalten auf der Dagstuhl Seminar, Dagstuhl: Schloss Dagstuhl.
PUB
 
[22]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803
Hofestädt, R. (1995). Metabolic Engineering. In A. Sydow (Hrsg.), Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation (S. 321-326). Gehalten auf der International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Gordon and Breach.
PUB
 
[21]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815
Hofestädt, R. (1995). A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In R.A. Greenes, H.E. Petersen & D.J. Protti (Hrsg.), Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics (S. 994-999). Gehalten auf der MEDINFO '95. Eighth World Congress on Medical Informatics, Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada.
PUB
 
[20]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822
Hofestädt, R. & Huang, X. (1995). Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95 (S. 344-347). Gehalten auf der APPT'95: International Workshop on Advanced Parallel Processing Technologies, Publishing House of Electronics Industry.
PUB
 
[19]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784
Hofestädt, R. (1995). Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe, 13, 7-15.
PUB
 
[18]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
Hofestädt, R. & Meinecke, F. (1995). Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine, 25(3), 321-334.
PUB
 
[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E. & Steigner, C. (1994). Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
PUB
 
[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R. & Huang, X. (1994). Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In R. Flieger & R. Grebe (Hrsg.), Parallele Datenverarbeitung aktuell (S. 100-108). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
Hofestädt, R. (1994). Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten, (6), 66-70.
PUB
 
[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S. & Huang, X. (1994). Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In L. Dekker, W. Smit & J. Zuidervaart (Hrsg.), Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994 (S. 235-242). Gehalten auf der EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Amsterdam: Elsevier.
PUB
 
[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
Hofestädt, R. (1994). Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In H.A. Lim (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 331-340). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics and Genome Research, World Scientific.
PUB
 
[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
Hofestädt, R. & Ashauer, U. (1994). Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In H. Kunath (Hrsg.), Medizin und Information (S. 115-119). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, München: MMV, Medizin-Verl.,.
PUB
 
[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
Hofestädt, R. (1994). Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen (Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie). In S.J. Pöppl, H.-G. Lipinski & T. Mansky (Hrsg.), Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien (S. 245-249). Gehalten auf der 38. Jahrestagung der GMDS, München: MMV, Medizin-Verl.,.
PUB
 
[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
Hofestädt, R. & Hörkens, U. (1994). C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 14(1), 1-14. Gordon and Breach Science Publishers.
PUB
 
[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
Hofestädt, R. (1994). Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse (Fortschritte in der Simulationstechnik). In G. Kampe & M. Zeitz (Hrsg.), Simulationstechnik (S. 1-8). Gehalten auf der 9. Symposium Simulationstechnik, Wiesbaden: Vieweg.
PUB
 
[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (1993). Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (R. Hofestädt, F. Krückeberg & T. Lengauer, Hrsg.), VIII, 214. Gehalten auf der 1. Fachtagung Bioinformatik, Heidelberg: Springer Publishing.
PUB
 
[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
Hofestädt, R., Lautenbach, K. & Löffler, M. (1993). Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung" (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
PUB
 
[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
Hofestädt, R. (1993). Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 24(4), 169-177. Gustav Fischer Verlag.
PUB
 
[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
Hofestädt, R. (1993). Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In L. Hunter, D. Searls & J. Shavlik (Hrsg.), Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (S. 181-189). Gehalten auf der 1. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Menlo Park: AAAI Press.
PUB
 
[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
Hofestädt, R., Beerbohm, D. & Huang, X. (1993). Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten (PARS Notes). Proceedings of the PARS 1993 (S. 92-101). Gehalten auf der PARS.
PUB
 
[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
Hofestädt, R. (1993). A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 11, 253-262. Gordon and Breach Science Publishers.
PUB
 
[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
Hörkens, U. & Hofestädt, R. (1992). Cellular Automata Simulation Shell. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 325-330). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.
PUB
 
[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
Hofestädt, R. & Müller, H.P. (1992). The Simulation of Genetic Processes. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 532-528). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.
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[170]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E. & Bragina, E.Y. (2018). GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180049. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0049.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2018). Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180054. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0054.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R. & Dosenko, V. (2018). shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180053. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0053.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R. & Freidin, M.B. (2018). Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4): 20180052. WALTER DE GRUYTER GMBH. doi:10.1515/jib-2018-0052.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O. & Sommer, B. (2018). Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(2): 20180003. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.1515/jib-2018-0003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I. & Ivanisenko, V.A. (2018). Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics, 11(1): 15. doi:10.1186/s12920-018-0331-4.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R. & Allmer, J. (2017). Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 14(1). Walter de Gruyter GmbH. doi:10.1515/jib-2016-0004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M. & D'Elia, D. (2017). The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS, 18: 101. Biomed Central Ltd. doi:10.1186/s12859-017-1532-0.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C. & Hofestädt, R. (2017). Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Gehalten auf der 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2017). KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs (Studies in Health Technology and Informatics). In D. Hayn & G. Schreier (Hrsg.), Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (S. 128-135). Gehalten auf der 11th eHealth Conference, Amsterdam: IOS Press. doi:10.3233/978-1-61499-759-7-128.
PUB | PDF | DOI
 
[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R. & Chen, M. (2016). DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 13(4): 297. Imbio E V. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-297.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making, 15: 15. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12911-015-0139-5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U. & Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 13(1), 1540007. doi:10.1142/S0219720015400077.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2015). Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (J. Allmer, C. Brinkrolf, R. Hofestädt & M.D. Sacar Demirci, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R. & Chen, M. (2015). Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis, 4: e177. Nature Publishing Group. doi:10.1038/oncsis.2015.40.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A. & Wege, D. (2015). Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine, 54(5), 385-387. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME15-05-1001.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
Chen, M. & Hofestädt, R. (2014). Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems. it-Information Technology, 56(2), 76-81. doi:10.1515/itit-2013-1021.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2014). German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & A. Shoshi, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB | Download (ext.)
 
[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C. & Timmer, A. (2014). How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine, 53(5), 333-335. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine). doi:10.3414/ME14-10-0007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D. & Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics, 11(2), 239. IMBio e.V. doi:10.2390/biecoll-jib-2014-239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R. & Ivanisenko, V.A. (2014). Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In B. Sommer (Hrsg.), Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (S. 9-10). Gehalten auf der CELLmicrocosmos neXt workshop 2014, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-next2014-3.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
 
[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (2014). Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: Springer.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N. & Ivanisenko, V.A. (2014). Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics, 15(Suppl 12), S7. doi:10.1186/1471-2164-15-S12-S7.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (2014). German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (R. Giegerich, R. Hofestädt & T.W. Nattkemper, Hrsg.), 235. Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
Chen, M. & Hofestädt, R. (2014). Integrative Bioinformatics. In M. Chen & R. Hofestädt (Hrsg.), Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (S. 3-19). Berlin: Springer.
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2013). Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340003. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400039.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340005. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400052.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
Hofestädt, R. (2013). Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus, (4), 22.
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C. & Timmer, A. (2013). More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine, 52(3), 181-183. Schattauer Gmbh (Methods Of Information In Medicine).
PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B. & Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics, 10(1), 226.
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2012). A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In C. Laroque (Hrsg.), Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (S. 1-13). Gehalten auf der Winter Simulation Conference (WSC), Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/WSC.2012.6465287.
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
Shoshi, A., Shoshi, A. & Hofestädt, R. (2012). KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung (GI-Edition. Proceedings). In U. Goltz, M. Magnor, H.-J. Appelrath, H.K. Matthies, W.-T. Balke & L. Wolf (Hrsg.), Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (S. 1565-1574). Gehalten auf der INFORMATIK 2012: Was bewegt uns in der/die Zukunft?, Bonn: Ges. für Informatik.
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[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B. & Sudhoff, H. (2012). Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One, 7(12), e52718. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0052718.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2012). German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012 (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (2012). Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets (CEUR workshop proceedings). (M. Heiner & R. Hofestädt, Hrsg.), 852. Gehalten auf der 3. International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets.
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
Hofestädt, R. (2012). Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts (S. 122). Gehalten auf der BGRS\SB’12, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
Hofestädt, R. (2011). Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 1-2). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
Hofestädt, R. & Thelen, S. (2011). Quantitative Modeling of Biochemical Networks (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 3-16). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
Chen, M. & Hofestädt, R. (2011). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (1. Edition., S. 38-55). Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
Chen, M., Hu, M. & Hofestädt, R. (2011). A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology, 164(3), 338-352. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s12010-010-9138-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B. & Spangardt, S. (2011). Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing, 10(3), 1077-1097. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s11047-009-9151-y.
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C. & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr557.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
Hofestädt, R. (2011). Fundamental Features of Metabolic Computing (Lecture Notes in Computer Science). In I. Batyrshin & G. Sidorov (Hrsg.), Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (S. 143-152). Gehalten auf der MICAI ; Mexican International Conference on Artificial Intelligence ; 10, Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-25330-0_13.
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (S. 182-203). Amsterdam: IOS Press.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Kormeier, B., Hippe, K. & Hofestädt, R. (2011). Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology, 53(5), 241-249. Walter de Gruyter GmbH. doi:10.1524/itit.2011.0649.
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data (LNI). Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik (S. 720-725). Gehalten auf der Informatik 2010, Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (2010). Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology (Medizinische Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & N. Kolchanov, Hrsg.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F. & Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation, 31(1), E1081-E1088. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.21169.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 148. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
Lee, H.-M., Dietz, K.-J. & Hofestädt, R. (2010). Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 7(3). doi:10.2390/biecoll-jib-2010-130.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1): 142. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48.
PUB
 
[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2010-146.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[116]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
Hofestädt, R. (2009). DNA-Programming Language of Life. HBSO, 13(1), 68-72.
PUB
 
[115]
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W. & Türker, C. (2009). Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle (LNI). In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Informatik 2009 (S. 33-34). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Ges. für Informatik.
PUB
 
[114]
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009). Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (M. Chen & R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou.
PUB
 
[113]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
Hofestädt, R. & Mayr, E.-W. (2009). Bioinformatik. Informatik Spektrum, 32(4), 285-286. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00287-009-0353-6.
PUB | DOI
 
[112]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (S. 704-708). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).
PUB | Download (ext.)
 
[111]
2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[110]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2008). Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. doi:10.1038/npre.2008.1943.1.
PUB | DOI
 
[109]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R. & Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease, 31, 289.
PUB
 
[108]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 4, 63-74. Shaker Verlag Aachen.
PUB
 
[107]
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
Hofestädt, R. (2008). DNA - Programming Language of Life? In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), . Gehalten auf der BGRS'08, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
PUB
 
[106]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A. & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2008-93.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[105]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
Hofestädt, R. (2007). Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 5(02b), 457-466. Imperial College Press. doi:10.1142/S0219720007002904.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[104]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2007). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). Gehalten auf der 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).
PUB
 
[103]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2007). SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. Gehalten auf der 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.
PUB
 
[102]
2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[101]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
Töpel, T., Neumann, J. & Hofestädt, R. (2007). A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (S. 7-11). Gehalten auf der Proceedings of The 20th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007), Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[100]
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S. & Trefz, F.K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 30(Suppl. 1), 3. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[99]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.
PUB
 
[98]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D. & Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics, 5(2), 115-118. doi:10.2165/00822942-200605020-00006.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[97]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (2006). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (N. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi, Hrsg.) (1. Edition.). New York: Springer.
PUB
 
[96]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
Hofestädt, R. (2006). An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Hrsg.), Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006 (S. 48-52). Gehalten auf der BGRS'2006, Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics.
PUB
 
[95]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287
Prins, B. & Hofestädt, R. (2006). MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks. Journal of Integrative Bioinformatics, 3(2). doi:10.2390/biecoll-jib-2006-45.
PUB | DOI
 
[94]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589
Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 1. doi:10.1109/IEMBS.2005.1616385.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[93]
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[92]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808
Chen, M. & Hofestädt, R. (2006). A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 39(2), 147-159. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2005.05.005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[91]
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.
PUB | WoS
 
[90]
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In N.A. Kolchanov, R. Hofestädt & L. Milanesi (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II (S. 355-365). Gehalten auf der 4. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, New York: Springer.
PUB
 
[89]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271
Chen, M. & Hofestädt, R. (2005). An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology, 5(2), 111-128. IOS Press.
PUB
 
[88]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856
Hofestädt, R. & Töpel, T. (2005). Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning (Studies in Fuzziness and Soft Computing). In U. Seiffert, L. Jain & P. Schweizer (Hrsg.), Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (1. Edition., S. 1-24). Berlin: Springer.
PUB
 
[87]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
Chen, M., Freier, A. & Hofestädt, R. (2005). Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In C. Sensen (Hrsg.), Handbook of Genome Research (1. Edition., S. 461-490). Weinheim: Wiley-VCH.
PUB
 
[86]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654
Hofestädt, R. (2005). Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology, 5(2), 81-82. IOS Press.
PUB
 
[85]
2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
Yearbook Bioinformatics 2004. (2005). Yearbook Bioinformatics 2004. (R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Bonn: Köllen.
PUB
 
[84]
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
Hofestädt, R. (2005). Bioinformatik. In T. Lehmann (Hrsg.), Handbuch der Medizinischen Informatik (2., vollst. neu bearb. Aufl., S. 253-298). München: Hanser.
PUB
 
[83]
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
Hofestädt, R. & Chen, M. (2004). Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 68-72). Gehalten auf der BGRS`2004.
PUB
 
[82]
2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758
Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (2004). Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. (R. Hofestädt & H.-P. Lenhof, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 46(1). Oldenbourg.
PUB
 
[81]
2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (2004). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. (N. Kolchanov & R. Hofestädt, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, BGRS, Boston: Kluwer Academic.
PUB
 
[80]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
Hofestädt, R. & Lenhof, H.-P. (2004). Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik, 46(1), 3-4. Oldenbourg.
PUB
 
[79]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics, 3(4), 241-252. doi:10.2165/00822942-200403040-00006.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[78]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
Chen, M. & Hofestädt, R. (2004). Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 3(3), 192-199. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/TNB.2004.833691.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[77]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836
Chen, M., Lin, S. & Hofestädt, R. (2004). STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research, 32(90001), D456-D458. doi:10.1093/nar/gkh079.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[76]
2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778
Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2003). Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In N.A. Kolčanov & R. Hofestädt (Hrsg.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Boston: Kluwer.
PUB
 
[75]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607
Kolchanov, N. & Hofestädt, R. (2003). The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology, 3(2). IOS Press.
PUB
 
[74]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667
Chen, M. & Hofestädt, R. (2003). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology, 3(3), 347-365.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[73]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610
Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2003). IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology, 3(2), 215-227.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[72]
2002 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797
Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (2002). Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. (J. Collado-Vides & R. Hofestädt, Hrsg.). Cambridge, Mass.: MIT Press.
PUB
 
[71]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624
Hofestädt, R., Kolchanov, N. & Reinitz, J. (2002). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology, 2(2), 35. IOS Press.
PUB
 
[70]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U. & Stephanik, A. (2002). BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology, 2(2), 37-57. IOS Press.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[69]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795
Hofestädt, R. (2002). Bioinformatics (Yearbook of Medical Informatics). In R. Haux (Hrsg.), Medical imaging informatics (S. 581-583). Stuttgart: Schattauer.
PUB
 
[68]
2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798
Hofestädt, R. & Schnee, R. (2002). Studien- und Forschungsführer Bioinformatik (1. Edition.). Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag.
PUB
 
[67]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838
Freier, A., Hofestädt, R. & Lange, M. (2002). IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 123-125). Gehalten auf der BGRS’02.
PUB
 
[66]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845
Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (S. 129-133). Gehalten auf der CBMS 2002, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[65]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867
Freier, A., Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In J. Borlak (Hrsg.), Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (1. Edition., S. 233-252). Weinheim: Wiley-VCH.
PUB
 
[64]
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2002). Information Fusion and Metabolic Network Control. In J. Collado-Vides & R. Hofestädt (Hrsg.), Gene Regulation and Metabolism (S. 49-84). Cambridge, Mass.: MIT Press.
PUB
 
[63]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818
Töpel, T. & Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik, 14(3), 315.
PUB
 
[62]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918
Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T. & Scholz, U. (2001). Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 353-356). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[61]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481
Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (2001). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In G. Xue, Y. Xue, Z. Xu & R. Holmes (Hrsg.), Gene Families (S. 221-232). Gehalten auf der 10th International Congress on Genes, Gene Families, and Isozymes, Singapore: World Scientific.
PUB
 
[60]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854
Hofestädt, R., Freier, A. & Lange, M. (2001). The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology (S. 38-43). Gehalten auf der NETTAB 2001.
PUB
 
[59]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974
Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D. & Trefz, F.K. (2001). RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 970-974). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[58]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959
Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Freier, A. (2001). Metabolic Information Control System. In N. Callaos (Hrsg.), Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics. Gehalten auf der SCI 2001, Orlando, Fla.: IIIS.
PUB
 
[57]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899
Hofestädt, R., Reinitz, J. & Kolchanov, N. (2001). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways (Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik), 22, 37. Gehalten auf der 3. Dagstuhl Seminar for Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways, Magdeburg: Univ. Magdeburg.
PUB
 
[56]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863
Hofestädt, R. (2000). Electronical infrastructure for the detection of inborn errors. In N.A. Kolčanov (Hrsg.), Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (S. 212-213). Gehalten auf der BRGS2000.
PUB
 
[55]
2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913
Hofestädt, R., Pleißner, K.-P. & Stephanik, A. (2000). Informationssysteme in der Biotechnologie. Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg.
PUB
 
[54]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846
Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M. & Scholz, U. (2000). An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks (S. 210-211). Gehalten auf der World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Frankfurt am Main: DECHEMA.
PUB
 
[53]
2000 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010
Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (2000). Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, Hrsg.). Berlin: BIOCOM.
PUB
 
[52]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895
Hofestädt, R., Mischke, U. & Scholz, U. (2000). Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism (Studies in health technology and informatics). In A. Hasman (Hrsg.), Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000 (S. 857-862). Gehalten auf der MIE2000 and GMDS2000, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[51]
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922
Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M. & Schulze-Kremer, S. (2000). Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering (S. 77-80). Gehalten auf der IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
PUB
 
[50]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013
Hofestädt, R. (1999). Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum, 22(5), 385-390.
PUB
 
[49]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999
Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School. Gehalten auf der IBSS`99.
PUB
 
[48]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004
Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M. & Scholz, U. (1999). Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe, 68, 12-15.
PUB
 
[47]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396954
Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M. & Michal, G. (1999). Modeling and simulation of gene regulation and metabolic pathways. BioSystems, 49(1), 79-82. doi:10.1016/S0303-2647(98)00081-1.
PUB | DOI
 
[46]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985
Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M. & Scholz, U. (1999). MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks. In E. Wingender, R. Hofestädt, R. Giegerich, T. Lengauer, W. Mewes, D. Schomburg & M. Vingron (Hrsg.), Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99 (S. 190-194). Gehalten auf der GCB`99, Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics.
PUB
 
[45]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015
Hofestädt, R. (1999). Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal, 99(10), 12-13.
PUB
 
[44]
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (1998). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Mavrovouniotis & G. Michal, Hrsg.), 215. Gehalten auf der Modelling and simulation of gene and cell regulation and metabolic pathways, Saarbrücken: Geschäftsstelle Schloss Dagstuhl, Univ. des Saarlandes.
PUB
 
[43]
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682
Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1998). Molekulare Bioinformatik (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt, Hrsg.). Gehalten auf der workshop der GI FG 4.0.2 Informatik in den Biowissenschaften im Rahmen der Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik (GI'98), Aachen: Shaker.
PUB
 
[42]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384
Hofestädt, R. & Scholz, U. (1998). Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems, 47(1-2), 91-102. doi:10.1016/S0303-2647(98)00015-X.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[41]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966
Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M. & Scholz, U. (1998). Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98) (S. 86-89). Gehalten auf der 1. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98).
PUB
 
[40]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037
Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G. & Scholz, U. (1998). Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics (Lecture Notes in Computer Science). In W. Litwin, T. Morzy & G. Vossen (Hrsg.), Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings (S. 296-304). Gehalten auf der Second East-European Symposium on Advances in Databases and Information Systems (ADBIS'98), Berlin: Springer Publishing.
PUB
 
[39]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253
Hofestädt, R. (1998). An Integrative Molecular Information System (Studies in health technology and informatics). In B. Cesnik, A.T. McCray & J.-R. Scherrer (Hrsg.), MedInfo ’98 (S. 361-365). Gehalten auf der 9th World Congress on Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[38]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272
Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U. & Urban, H. (1998). Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal, 3(1), 29-40.
PUB
 
[37]
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291
Hofestädt, R. & Thelen, S. (1998). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology, 1(1), 39-53. IOS Press,.
PUB
 
[36]
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355
Hofestädt, R. (1997). Computer Science and Biology. Biosystems, 43, 69-71.
PUB
 
[35]
1997 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702
Bioinformatics (LNCS). (1997). Bioinformatics (LNCS). (R. Hofestädt, T. Lengauer, M. Löffler & D. Schomburg, Hrsg.) (1. Edition.). Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, GCB, Berlin: Springer.
PUB
 
[34]
1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666
Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (1997). Molecular Bioinformatics (Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik). (R. Hofestädt & H. Lim, Hrsg.). Gehalten auf der 11. ACM International Conference on Supercomputing (ICS'97), Aachen: Shaker.
PUB
 
[33]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441
Hofestädt, R. (1997). Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In C. Steigner (Hrsg.), Arbeitsplatz-Rechensysteme (S. 285-292). Gehalten auf der 4. ITG/GI-Fachtagung Arbeitsplatz-Rechensysteme (APS), Koblenz: Fölbach Publishing.
PUB
 
[32]
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458
Hofestädt, R. (1997). Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing (S. 2293-2297). Gehalten auf der EUFIT '97, Aachen: Mainz.
PUB
 
[31]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735
Hofestädt, R., Herre, H. & Trefz, F. (1996). Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen (Informatik-Berichte). Leipzig: Universität Leipzig.
PUB
 
[30]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378570
Hofestädt, R., Huang, X. & Beerbohm, D. (1996). Simulation of load balancing with cellular automata. Simulation Practice and Theory, 4(2), 81-96. Elsevier. doi:10.1016/0928-4869(95)00045-3.
PUB | DOI
 
[29]
1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707
Hofestädt, R. (1996). Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors (Studies in health technology and informatics). In J. Brender (Hrsg.), Medical Informatics Europe '96 (S. 542-546). Gehalten auf der MIE (Medical Informatics Europe) Congress, Amsterdam: IOS Press.
PUB
 
[28]
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263
Hofestädt, R. (1996). Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels (Medizinische Informatik und Bioinformatik) (1. Edition.). Aachen: Shaker Verlag.
PUB
 
[27]
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698
Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M. & Löffler, M. (1996). Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays, 18(4), 333-335. doi:10.1002/bies.950180412.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[26]
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722
Informatik in den Biowissenschaften. (1996). Informatik in den Biowissenschaften. (R. Hofestädt, T. Lengauer & M. Löffler, Hrsg.)Informationstechnik und technische Informatik, 38(5). Oldenbourg-Verlag.
PUB
 
[25]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773
Hofestädt, R., Löffler, M. & Möller, K. (1995). Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn, 88. Universität Bonn.
PUB
 
[24]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829
Hofestädt, R. (1995). Artificial Life (GMD-Studien). In K. Dautenhahn (Hrsg.), Proceedings des Workshops "Artificial Life". Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik.
PUB
 
[23]
1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (1995). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation (Dagstuhl-Seminar-Report). (J. Collado-Vides, R. Hofestädt, M. Löffler & M. Mavrovouniotis, Hrsg.), (130). Gehalten auf der Dagstuhl Seminar, Dagstuhl: Schloss Dagstuhl.
PUB
 
[22]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803
Hofestädt, R. (1995). Metabolic Engineering. In A. Sydow (Hrsg.), Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation (S. 321-326). Gehalten auf der International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Gordon and Breach.
PUB
 
[21]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815
Hofestädt, R. (1995). A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In R.A. Greenes, H.E. Petersen & D.J. Protti (Hrsg.), Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics (S. 994-999). Gehalten auf der MEDINFO '95. Eighth World Congress on Medical Informatics, Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada.
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[20]
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822
Hofestädt, R. & Huang, X. (1995). Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95 (S. 344-347). Gehalten auf der APPT'95: International Workshop on Advanced Parallel Processing Technologies, Publishing House of Electronics Industry.
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[19]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784
Hofestädt, R. (1995). Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe, 13, 7-15.
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[18]
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
Hofestädt, R. & Meinecke, F. (1995). Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine, 25(3), 321-334.
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[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E. & Steigner, C. (1994). Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
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[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R. & Huang, X. (1994). Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In R. Flieger & R. Grebe (Hrsg.), Parallele Datenverarbeitung aktuell (S. 100-108). Amsterdam: IOS Press.
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[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
Hofestädt, R. (1994). Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten, (6), 66-70.
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[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S. & Huang, X. (1994). Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In L. Dekker, W. Smit & J. Zuidervaart (Hrsg.), Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994 (S. 235-242). Gehalten auf der EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Amsterdam: Elsevier.
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[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
Hofestädt, R. (1994). Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In H.A. Lim (Hrsg.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (S. 331-340). Gehalten auf der 3. International Conference on Bioinformatics and Genome Research, World Scientific.
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[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
Hofestädt, R. & Ashauer, U. (1994). Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In H. Kunath (Hrsg.), Medizin und Information (S. 115-119). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, München: MMV, Medizin-Verl.,.
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[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
Hofestädt, R. (1994). Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen (Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie). In S.J. Pöppl, H.-G. Lipinski & T. Mansky (Hrsg.), Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien (S. 245-249). Gehalten auf der 38. Jahrestagung der GMDS, München: MMV, Medizin-Verl.,.
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[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
Hofestädt, R. & Hörkens, U. (1994). C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 14(1), 1-14. Gordon and Breach Science Publishers.
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[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
Hofestädt, R. (1994). Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse (Fortschritte in der Simulationstechnik). In G. Kampe & M. Zeitz (Hrsg.), Simulationstechnik (S. 1-8). Gehalten auf der 9. Symposium Simulationstechnik, Wiesbaden: Vieweg.
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[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (1993). Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993 (Informatik Aktuell). (R. Hofestädt, F. Krückeberg & T. Lengauer, Hrsg.), VIII, 214. Gehalten auf der 1. Fachtagung Bioinformatik, Heidelberg: Springer Publishing.
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[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
Hofestädt, R., Lautenbach, K. & Löffler, M. (1993). Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung" (Fachberichte Informatik). Koblenz: Universitätf Koblenz.
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[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
Hofestädt, R. (1993). Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 24(4), 169-177. Gustav Fischer Verlag.
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[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
Hofestädt, R. (1993). Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In L. Hunter, D. Searls & J. Shavlik (Hrsg.), Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (S. 181-189). Gehalten auf der 1. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Menlo Park: AAAI Press.
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[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
Hofestädt, R., Beerbohm, D. & Huang, X. (1993). Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten (PARS Notes). Proceedings of the PARS 1993 (S. 92-101). Gehalten auf der PARS.
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[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
Hofestädt, R. (1993). A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 11, 253-262. Gordon and Breach Science Publishers.
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[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
Hörkens, U. & Hofestädt, R. (1992). Cellular Automata Simulation Shell. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 325-330). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.
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[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
Hofestädt, R. & Müller, H.P. (1992). The Simulation of Genetic Processes. In A. Sydow (Hrsg.), Computational Systems Analysis (S. 532-528). Gehalten auf der 4th International Symposium on Systems Analysis and Simulation, Amsterdam: Elsevier.
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