183 Publikationen
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984737Orlov YL, Chen M, Kolchanov NA, Hofestädt R (2023)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration.
Journal of Integrative Bioinformatics. -
2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960309Allmer J, Elloumi M, Comin M, Hofestädt R (2021)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Special Issue of the 1st International Applied Bioinformatics Conference (iABC'21).
Journal of Integrative Bioinformatics 18(4). -
2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2957504Brinkrolf C, Ochel L, Hofestädt R (2021)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
VANESA: An open-source hybrid functional Petri net modeling and simulation environment in systems biology.
Biosystems: 104531. -
2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2952999Ahsan MA, Liu Y, Feng C, Hofestädt R, Chen M (2021)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
OverCOVID: an integrative web portal for SARS-CoV-2 bioinformatics resources.
Journal of integrative bioinformatics. -
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939859Friedrichs M, Shoshi A, Chmura PJ, Ison J, Schwämmle V, Schreiber F, Hofestädt R, Sommer B (2020)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
JIB.tools 2.0 – A Bioinformatics Registry for Journal Published Tools with Interoperability to bio.tools.
Journal of Integrative Bioinformatics 16(4): 20190059. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937754Chen M, Hofestädt R, Taubert J (2019)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Integrative Bioinformatics: History and Future.
Journal of integrative bioinformatics 16(3): 20192001. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938765Zolotareva O, Saik OV, Königs C, Bragina EY, Goncharova IA, Freidin MB, Dosenko VE, Ivanisenko VA, Hofestädt R (2019)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects.
Scientific Reports 9(1): 16302. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938754Zhu L, Hofestädt R, Ester M (2019)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Tissue-Specific Subcellular Localization Prediction Using Multi-Label Markov Random Fields.
IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 16(5): 1471-1482. -
2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938395Bragina EY, Freidin MB, Saik OV, Zolotareva O, Goncharova IA, Ivanisenko VA, Dosenko VE, Hofestädt R (2019)PUB | WoS
Identification of the genetic factors underlying comorbidity between bronchial asthma and hypertension.
In: EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 27. London: Nature Publishing Group: 1035-1036. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278Biere N, Ghaffar M, Doebbe A, Jaeger D, Rothe N, Friedrich BM, Hofestädt R, Schreiber F, Kruse O, Sommer B (2018)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell.
Journal of Integrative Bioinformatics 15(2): 20180003. -
2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962349Hofestädt R, Brinkrolf C, Reipke P (2018)PUB | DOI
OMPetri: A New Petri Net Simulation Environment Based on OpenModelica.
In: Proceedings of the 2018 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology - ICBBT '18. New York: ACM Press: 57-61. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962353Hamzeiy H, Suluyayla R, Brinkrolf C, Janowski SJ, Hofestädt R, Allmer J (2018)PUB | DOI
Visualization and Analysis of miRNAs Implicated in Amyotrophic Lateral Sclerosis Within Gene Regulatory Pathways.
Studies in Health Technology and Informatics 253: 183-187. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313Shoshi A, Hofestädt R, Zolotareva O, Friedrichs M, Maier A, Ivanisenko VA, Dosenko VE, Bragina EY (2018)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15(4): 20180049. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515Saik OV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Bragina EY, Freidin MB, Goncharova IA, Dosenko VE, Zolotareva O, Hofestädt R, Lavrik IN, Rogaev EI, Ivanisenko VA (2018)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks.
BMC Medical Genomics 11(1): 15. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309Bragina EY, Goncharova IA, Garaeva AF, Nemerov, Evgeniy V, Babovskaya AA, Karpov AB, Semenova, Yulia V, Zhalsanova IZ, Gomboeva DE, Saik, Olga V, Zolotareva O, Ivanisenko VA, Dosenko VE, Hofestädt R, Freidin MB (2018)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15(4): 20180052. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312Saik, Olga V, Demenkov PS, Ivanisenko, Timofey V, Bragina EY, Freidin MB, Dosenko VE, Zolotareva O, Choynzonov EL, Hofestädt R, Ivanisenko VA (2018)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15(4): 20180054. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310Drevytska T, Morhachov R, Tumanovska L, Portnichenko G, Nagibin V, Boldyriev O, Lapikova-Bryhinska T, Gurianova V, Dons'koi B, Freidin M, Ivanisenko V, Bragina EY, Hofestädt R, Dosenko V (2018)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15(4): 20180053. -
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290Shoshi A, Müller U, Shoshi A, Ogultarhan V, Hofestädt R (2017)PUB | PDF | DOI
KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs.
In: Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference. Hayn D, Schreier G (Eds); Studies in Health Technology and Informatics, 236. Amsterdam: IOS Press: 128-135. -
2017 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962354Allmer J, Brinkrolf C, Hofestädt R, Sacar Demirci MD (Eds) (2017)PUB
Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016.
Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik. -
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493Romano P, Hofestädt R, Lange M, D'Elia D (2017)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes.
BMC BIOINFORMATICS 18(S5): 101. -
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589Hamzeiy H, Suluyayla R, Brinkrolf C, Janowski SJ, Hofestädt R, Allmer J (2017)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 14(1). -
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298Shoshi A, Zolotareva O, Kleine M, Königs C, Hofestädt R (2017)PUB
Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease.
Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense. -
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099Li Q, Zhou Y, Jiao Y, Zhang Z, Bai L, Tong L, Yang X, Sommer B, Hofestädt R, Chen M (2016)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
DaTo: an atlas of biological databases and tools.
JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 13(4): 297. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi A, Hoppe T, Kormeier B, Ogultarhan V, Hofestädt R (2015)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data.
BMC Medical Informatics and Decision Making 15(1): 15. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi A, Ogultarhan V, Hoppe T, Kormeier B, Müller U, Hofestädt R (2015)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping.
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 13(1): 1540007. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356Meng X, Wang J, Yuan C, Li X, Zhou Y, Hofestädt R, Chen M (2015)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types.
Oncogenesis 4(12): e177. -
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626Allmer J, Brinkrolf C, Hofestädt R, Sacar Demirci MD (Eds) (2015)PUB
Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015.
Medizinische Informatik und Bioinformatik. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891Winter A, Hilgers R-D, Hofestädt R, Huebnert U, Knaup-Gregori P, Ose C, Schmoor C, Timmer A, Wege D (2015)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems).
Methods of Information in Medicine 54(5): 385-387. -
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586Popik OV, Sommer B, Hofestädt R, Ivanisenko VA (2014)PUB | PDF | DOI
Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract).
In: Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Sommer B (Ed); Bielefeld: Bielefeld University: 9-10. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884Popik OV, Saik OV, Petrovskiy ED, Sommer B, Hofestädt R, Lavrik IN, Ivanisenko VA (2014)PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions.
BMC Genomics 15(Suppl 12): S7. -
-
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259Hofestädt R, Shoshi A (Eds) (2014)PUB | Download (ext.)
German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014.
Medizinische Informatik und Bioinformatik. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648Winter A, Hilgers R-D, Hofestädt R, Knaup-Gregori P, Ose C, Timmer A (2014)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
How to Use Information Technology to Improve Medication Safety.
Methods of Information in Medicine 53(5): 333-335. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf C, Janowski SJ, Kormeier B, Lewinski M, Hippe K, Borck D, Hofestädt R (2014)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications.
Journal of Integrative Bioinformatics 11(2): 239. -
2014 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693Chen M, Hofestädt R (Eds) (2014)PUB
Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell.
Berlin: Springer. -
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695Giegerich R, Hofestädt R, Nattkemper TW (Eds) (2014)PUB
German Conference on Bioinformatics 2014.
GI-Edition: lecture notes in informatics 235. -
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694Chen M, Hofestädt R (2014)PUB
Integrative Bioinformatics.
In: Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell. Chen M, Hofestädt R (Eds); Berlin: Springer: 3-19. -
2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709280Shoshi A, Ogultarhan V, Hofestädt R (2013)PUB
KALIS - A web-based system for patient-specific risk assessment of drugs.
In: Proceedings of the 9 th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013. Schreiber F, Hofestädt R, Lange M, Scholz U, Czauderna T, Schnee R, Weise S (Eds); 178-178. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer B, Kormeier B, Demenkov PS, Arrigo P, Hippe K, Ates Ö, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R (2013)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets.
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11(01): 1340005. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811Lee H-M, Dietz K-J, Hofestädt R (2013)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Computational construction of specialized biological networks.
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11(01): 1340003. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701Hofestädt R (2013)PUB
Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen.
Management & Krankenhaus (4): 22. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116Winter A, Hilgers R-D, Hofestädt R, Knaup-Gregorit P, Ose C, Timmer A (2013)PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published.
Methods Of Information In Medicine 52(3): 181-183. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt R, Kormeier B, Lange M, Schreiber F, Sommer B, Weise S (2013)PUB
Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap.
Journal of Integrative Bioinformatics 10(1): 226. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867Klenke C, Janowski SJ, Borck D, Widera D, Ebmeyer J, Kalinowski J, Leichtle A, Hofestädt R, Upile T, Kaltschmidt C, Kaltschmidt B, Sudhoff H (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays.
PLoS One 7(12): e52718. -
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730Proß S, Bachmann B, Janowski SJ, Hofestädt R (2012)PUB | DOI
A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica.
In: Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC). Laroque C (Ed); Piscataway, NJ: IEEE: 1-13. -
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751Shoshi A, Shoshi A, Hofestädt R (2012)PUB | Download (ext.)
KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung.
In: Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI). Goltz U, Magnor M, Appelrath H-J, Matthies HK, Balke W-T, Wolf L (Eds); GI-Edition. Proceedings, 208. Bonn: Ges. für Informatik: 1565-1574. -
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727Hofestädt R, Kolchanov N (Eds) (2012)PUB
German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012.
Medizinische Informatik und Bioinformatik. -
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724Heiner M, Hofestädt R (Eds) (2012)PUB
Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets.
CEUR workshop proceedings 852. -
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726Hofestädt R (2012)PUB
Modeling aspects of the virtuell cell.
In: The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts. Novosibirsk: Russian Academy of Sciences: 122. -
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe K, Kormeier B, Janowski SJ, Töpel T, Hofestädt R (2011)PUB
DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data.
In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics. . -
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427Hofestädt R (2011)PUB
Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks.
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press: 1-2. -
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491Hofestädt R, Thelen S (2011)PUB
Quantitative Modeling of Biochemical Networks.
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press: 3-16. -
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523Chen M, Hofestädt R (2011)PUB
Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell.
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press: 38-55. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112Chen M, Hu M, Hofestädt R (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes.
Applied Biochemistry and Biotechnology 164(3): 338-352. -
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590Huang D, Huang Y, Bai Y, Chen D, Hofestädt R, Klukas C, Chen M (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web.
Bioinformatics 27(23): 3321-3322. -
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209Hofestädt R (2011)PUB | DOI
Fundamental Features of Metabolic Computing.
In: Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II. Batyrshin I, Sidorov G (Eds); Lecture Notes in Computer Science, 7095. Berlin, Heidelberg: Springer: 143-152. -
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2011)PUB | PubMed | Europe PMC
Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing.
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. Amsterdam: IOS Press: 182-203. -
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607Lee H-M, Dietz K-J, Hofestädt R (2010)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues.
Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue) 7(3): 23-34. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2010)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases.
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 142. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier B, Hippe K, Arrigo P, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
Reconstruction of biological networks based on life science data integration.
Journal of Integrative Bioinformatics 7(2): 3-8. -
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe K, Kormeier B, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)PUB
DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data.
In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI, 176. Bonn: Ges. für Informatik: 720-725. -
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605Hofestädt R, Kolchanov N (Eds) (2010)PUB
Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology.
Medizinische Informatik und Bioinformatik. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400Töpel T, Scheible D, Trefz F, Hofestädt R (2010)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases.
Human Mutation 31(1): E1081-E1088. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R (2010)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches.
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 148. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2010)PUB
Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing.
In Silico Biology 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120Hofestädt R (2009)PUB
DNA-Programming Language of Life.
HBSO 13(1): 68-72. -
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132Hofestädt R, Kuhn K, Müller W, Türker C (2009)PUB
Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle.
In: Informatik 2009. Fischer S, Maehle E, Reischuk R (Eds); LNI, 154. Bonn: Ges. für Informatik: 33-34. -
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644Chen M, Hofestädt R (Eds) (2009)PUB
Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. -
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2009)PUB | Download (ext.)
CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases.
In: Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Fischer S, Maehle E, Reischuk R (Eds); Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI): 704-708. -
2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295Hofestädt R, Töpel T (Eds) (2008)PUB
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007.; 4.
Aachen: Shaker. -
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350Hofestädt R (2008)PUB
DNA - Programming Language of Life?
Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia. -
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666Trefz F, Scheible D, Götz H, Töpel T, Hofestädt R, Frauendienst-Egger G (2008)PUB
METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism.
Journal of Inherited Metabolic Disease 31: 289. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678Hariharaputran S, Töpel T, Brockschmidt B, Hofestädt R (2008)PUB
VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data.
Integrative Bioinformatics Yearbook 2007 4: 63-74. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel T, Kormeier B, Klassen A, Hofestädt R (2008)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration.
Journal of Integrative Bioinformatics 5(2): 343-349. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044Hofestädt R (2007)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome.
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 5(02b): 457-466. -
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274Hariharaputran S, Töpel T, Brockschmidt B, Hofestädt R (2007)PUB
VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data.
In: Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). . -
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265Hariharaputran S, Töpel T, Oberwahrenbrock T, Hofestädt R (2007)PUB
SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information.
In: Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. . -
2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320Hofestädt R, Töpel T (Eds) (2007)PUB
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006.; 3.
Aachen: Shaker. -
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256Töpel T, Neumann J, Hofestädt R (2007)PUB
A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS.
In: Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007). Kokol P (Ed); Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society: 7-11. -
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474Scheible D, Töpel T, Frauendienst-Egger G, Hofestädt R, Wallner S, Trefz FK (2007)PUB | WoS
Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry.
JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 30(Suppl. 1): 3. -
2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343Hofestädt R, Töpel T (Eds) (2006)PUB
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005.; 2.
Aachen: Shaker. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354Töpel T, Hofestädt R, Scheible D, Trefz F (2006)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
RAMEDIS, the rare metabolic diseases database.
Applied Bioinformatics 5(2): 115-118. -
2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848Kolchanov N, Hofestädt R, Milanesi L (Eds) (2006)PUB
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II., 1. Edition.
New York: Springer. -
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332Hofestädt R (2006)PUB
An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences.
In: Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006. Hofestädt R, Kolchanov N (Eds);1. Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics: 48-52. -
-
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589Chen M, Hofestädt R (2006)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics.
Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc 1: 228-231. -
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367Trefz FK, Töpel T, Scheible D, Frauendienst-Egger G, Hofestädt R (2006)PUB | WoS
www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases.
JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 29(Suppl. 1): 84. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808Chen M, Hofestädt R (2006)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis.
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS 39(2): 147-159. -
2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361Trefz FK, Töpel T, Scheible D, Frauendienst-Egger G, Hofestädt R (2006)PUB | WoS
Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders.
JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 29(Suppl. 1): 84. -
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350Chen M, Hofestädt R (2005)PUB
Prediction and Alignment of Metabolic Pathways.
In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. Kolchanov NA, Hofestädt R, Milanesi L (Eds); New York: Springer: 355-365. -
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271Chen M, Hofestädt R (2005)PUB
An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment.
In Silico Biology 5(2): 111-128. -
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856Hofestädt R, Töpel T (2005)PUB
Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning.
In: Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms. Seiffert U, Jain L, Schweizer P (Eds); Studies in Fuzziness and Soft Computing, 176. 1. Edition. Berlin: Springer: 1-24. -
2005 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634Hofestädt R (Ed) (2005)PUB
Yearbook Bioinformatics 2004.; 1, 1. Edition.
Bonn: Köllen. -
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874Chen M, Freier A, Hofestädt R (2005)PUB
Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways.
In: Handbook of Genome Research. Sensen C (Ed);2. 1. Edition. Weinheim: Wiley-VCH: 461-490. -
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654Hofestädt R (2005)PUB
Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics.
In Silico Biology 5(2): 81-82. -
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364Hofestädt R (2005)PUB
Bioinformatik.
In: Handbuch der Medizinischen Informatik. Lehmann T (Ed); 2., vollst. neu bearb. Aufl. München: Hanser: 253-298. -
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766Hofestädt R, Chen M (2004)PUB
Metabolic Pathway Prediction/Alignment.
In: Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 2. 68-72. -
2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758Hofestädt R, Lenhof H-P (Eds) (2004)PUB
Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik.
Informationstechnik und technische Informatik 46(1). -
2004 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812Kolchanov N, Hofestädt R (Eds) (2004)PUB
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure., 1. Edition.
Boston: Kluwer Academic. -
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762Hofestädt R, Lenhof H-P (2004)PUB
Molekulare Bioinformatik.
Informationstechnik und technische Informatik 46(1): 3-4. -
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774Chen M, Hofestädt R (2004)PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment.
Applied Bioinformatics 3(4): 241-252. -
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526Chen M, Hofestädt R (2004)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways.
IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE 3(3): 192-199. -
-
2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778Hofestädt R, Freier A, Lange M (2003)PUB
Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling.
In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Kolčanov NA, Hofestädt R (Eds); Boston: Kluwer. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607Kolchanov N, Hofestädt R (2003)PUB
The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure.
In Silico Biology 3(2). -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667Chen M, Hofestädt R (2003)PUB | PubMed | Europe PMC
Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell.
In Silico Biology 3(3): 347-365. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610Freier A, Hofestädt R, Lange M (2003)PUB | PubMed | Europe PMC
IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks.
In Silico Biology 3(2): 215-227. -
2002 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797Collado-Vides J, Hofestädt R (Eds) (2002)PUB
Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches.
Cambridge, Mass.: MIT Press. -
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795Hofestädt R (2002)PUB
Bioinformatics.
In: Medical imaging informatics. Haux R (Ed); Yearbook of Medical Informatics, 2002. Stuttgart: Schattauer: 581-583. -
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624Hofestädt R, Kolchanov N, Reinitz J (2002)PUB
Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways.
In Silico Biology 2(2): 35. -
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648Freier A, Hofestädt R, Lange M, Scholz U, Stephanik A (2002)PUB | PubMed | Europe PMC
BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data.
In Silico Biology 2(2): 37-57. -
2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798Hofestädt R, Schnee R (2002)PUB
Studien- und Forschungsführer Bioinformatik., 1. Edition.
Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag. -
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867Freier A, Hofestädt R, Töpel T (2002)PUB
Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling.
In: Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications. Borlak J (Ed); 1. Edition. Weinheim: Wiley-VCH: 233-252. -
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838Freier A, Hofestädt R, Lange M (2002)PUB
IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks.
In: Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. Kolčanov NA (Ed);2. 123-125. -
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845Hofestädt R, Töpel T (2002)PUB
Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data.
In: Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002). Kokol P (Ed); Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society: 129-133. -
2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806Freier A, Hofestädt R, Lange M, Scholz U (2002)PUB
Information Fusion and Metabolic Network Control.
In: Gene Regulation and Metabolism. Collado-Vides J, Hofestädt R (Eds); Cambridge, Mass.: MIT Press: 49-84. -
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818Töpel T, Hofestädt R (2002)PUB
Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data.
Medizinische Genetik 14(3): 315. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918Hofestädt R, Kauert R, Töpel T, Scholz U (2001)PUB
Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases.
In: Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Patel VL (Ed); Studies in health technology and informatics, 84. Amsterdam: IOS Press: 353-356. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481Hofestädt R, Lange M, Scholz U (2001)PUB
Molecular Information Fusion for Metabolic Networks.
In: Gene Families. Xue G, Xue Y, Xu Z, Holmes R (Eds); Singapore: World Scientific: 221-232. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854Hofestädt R, Freier A, Lange M (2001)PUB
The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks.
In: Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology. 38-43. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974Hofestädt R, Mischke U, Scholz U, Töpel T, Scheible D, Trefz FK (2001)PUB
RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation.
In: Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Patel VL (Ed); Studies in health technology and informatics, 84. Amsterdam: IOS Press: 970-974. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959Stephanik A, Hofestädt R, Lange M, Freier A (2001)PUB
Metabolic Information Control System.
In: Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics. Callaos N (Ed); Orlando, Fla.: IIIS. -
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899Hofestädt R, Reinitz J, Kolchanov N (2001)PUB
Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways.
Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik 22: 37. -
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863Hofestädt R (2000)PUB
Electronical infrastructure for the detection of inborn errors.
In: Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Kolčanov NA (Ed);1. 212-213. -
2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913Hofestädt R, Pleißner K-P, Stephanik A (2000)PUB
Informationssysteme in der Biotechnologie.
Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg. -
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846Hofestädt R, Freier A, Lange M, Scholz U (2000)PUB
An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks.
Presented at the World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Berlin, Germany. -
2000 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010Hofestädt R (Ed) (2000)PUB
Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften.
Berlin: BIOCOM. -
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895Hofestädt R, Mischke U, Scholz U (2000)PUB
Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism.
In: Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000. Hasman A (Ed); Studies in health technology and informatics, 77. Amsterdam: IOS Press: 857-862. -
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922Hofestädt R, Köhler J, Lange M, Schulze-Kremer S (2000)PUB
Logical and Semantic Database Integration.
In: IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering. Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society: 77-80. -
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013Hofestädt R (1999)PUB
Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering.
Informatik Spektrum 22(5): 385-390. -
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999Hofestädt R, Lange M, Scholz U (1999)PUB
Molecular Information Fusion for Metabolic Networks.
In: Courses of The First International Bioinformatics Summer School. . -
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004Hofestädt R, Mischke U, Prüß M, Scholz U (1999)PUB
Metabolic Drug Pointing and Information Processing.
Medical Informatics Europe 68: 12-15. -
-
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985Freier A, Hofestädt R, Lange M, Scholz U (1999)PUB
MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks.
In: Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99. Wingender E, Hofestädt R, Giegerich R, Lengauer T, Mewes W, Schomburg D, Vingron M (Eds); Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics: 190-194. -
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015Hofestädt R (1999)PUB
Das Bioinformatik-Dilemma.
Laborjournal 99(10): 12-13. -
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939Collado-Vides J, Hofestädt R, Mavrovouniotis M, Michal G (Eds) (1998)PUB
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways.
Dagstuhl-Seminar-Report 215. -
1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682Hofestädt R (Ed) (1998)PUB
Molekulare Bioinformatik.
Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. -
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384Hofestädt R, Scholz U (1998)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors.
Biosystems 47(1-2): 91-102. -
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966Hofestädt R, Freier A, Höding M, Lange M, Scholz U (1998)PUB
Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control.
In: Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98). 1. 86-89. -
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037Hofestädt R, Höding M, Saake G, Scholz U (1998)PUB
Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics.
In: Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings. Litwin W, Morzy T, Vossen G (Eds); Lecture Notes in Computer Science, 1475. Berlin: Springer Publishing: 296-304. -
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253Hofestädt R (1998)PUB
An Integrative Molecular Information System.
In: MedInfo ’98. Cesnik B, McCray AT, Scherrer J-R (Eds); Studies in health technology and informatics, 52. Amsterdam: IOS Press: 361-365. -
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272Hofestädt R, Prüß M, Scholz U, Urban H (1998)PUB
Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen.
Magdeburger Wissenschaftsjournal 3(1): 29-40. -
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291Hofestädt R, Thelen S (1998)PUB
Quantitative Modeling of Biochemical Networks.
Silico Biology 1(1): 39-53. -
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355Hofestädt R (1997)PUB
Computer Science and Biology.
Biosystems 43: 69-71. -
1997 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702Hofestädt R, Lengauer T, Löffler M, Schomburg D (Eds) (1997)PUB
Bioinformatics. LNCS; 1278, 1. Edition.
Berlin: Springer. -
1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666Hofestädt R, Lim H (Eds) (1997)PUB
Molecular Bioinformatics.
Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. -
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441Hofestädt R (1997)PUB
Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements.
In: Arbeitsplatz-Rechensysteme. Steigner C (Ed); Koblenz: Fölbach Publishing: 285-292. -
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458Hofestädt R (1997)PUB
Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases).
In: Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing. 3. Aachen: Mainz: 2293-2297. -
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735Hofestädt R, Herre H, Trefz F (1996)PUB
Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen. Informatik-Berichte; 9.
Leipzig: Universität Leipzig. -
-
1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707Hofestädt R (1996)PUB
Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors.
In: Medical Informatics Europe '96. Brender J (Ed); Studies in health technology and informatics, 34. Amsterdam: IOS Press: 542-546. -
1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263Hofestädt R (1996)PUB
Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels. Medizinische Informatik und Bioinformatik, 1. Edition.
Aachen: Shaker Verlag. -
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698Hofestädt R, Colado-Vides J, Mavrovouniotis M, Löffler M (1996)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation.
BioEssays 18(4): 333-335. -
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722Hofestädt R, Lengauer T, Löffler M (Eds) (1996)PUB
Informatik in den Biowissenschaften.
Informationstechnik und technische Informatik 38(5). -
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773Hofestädt R, Löffler M, Möller K (1995)PUB
Modellierung des Immunsystems.
Informatik Bericht Universität Bonn: 88. -
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829Hofestädt R (1995)PUB
Artificial Life.
In: Proceedings des Workshops "Artificial Life". Dautenhahn K, GMD-Forschungszentrum Informationstechnik (Eds); GMD-Studien, 271. Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik: 246. -
1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599Collado-Vides J, Hofestädt R, Löffler M, Mavrovouniotis M (Eds) (1995)PUB
Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation.
Dagstuhl-Seminar-Report (130). -
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803Hofestädt R (1995)PUB
Metabolic Engineering.
In: Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation. Sydow A (Ed); Amsterdam: Gordon and Breach: 321-326. -
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815Hofestädt R (1995)PUB
A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases.
In: Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics. Greenes RA, Petersen HE, Protti DJ (Eds); Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada: 994-999. -
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822Hofestädt R, Huang X (1995)PUB
Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster.
In: Proceedings of APPT '95. Publishing House of Electronics Industry: 344-347. -
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784Hofestädt R (1995)PUB
Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics.
Journal EUROSIM - Simulation News Europe 13: 7-15. -
1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789Hofestädt R, Meinecke F (1995)PUB
Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks.
Computers in Biology and Medicine 25(3): 321-334. -
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405Hofestädt R, Großpietsch K-E, Steigner C (1994)PUB
Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations. Fachberichte Informatik; 9-94.
Koblenz: Universitätf Koblenz. -
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417Beerbohm D, Bresken S, Hofestädt R, Huang X (1994)PUB
Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich.
In: Parallele Datenverarbeitung aktuell. Flieger R, Grebe R (Eds); Amsterdam: IOS Press: 100-108. -
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427Hofestädt R (1994)PUB
Computer-Aided Metabolic Engineering.
it+ti Nachrichten (6): 66-70. -
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441Hofestädt R, Beerbohm D, Bresken S, Huang X (1994)PUB
Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata.
In: Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994. Dekker L, Smit W, Zuidervaart J (Eds); Amsterdam: Elsevier: 235-242. -
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387Hofestädt R (1994)PUB
Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks.
In: Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. Lim HA (Ed); World Scientific: 331-340. -
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433Hofestädt R, Ashauer U (1994)PUB
Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten.
In: Medizin und Information. Kunath H (Ed); München: MMV, Medizin-Verl.,: 115-119. -
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471Hofestädt R (1994)PUB
Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen.
In: Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien. Pöppl SJ, Lipinski H-G, Mansky T (Eds); Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, 77. München: MMV, Medizin-Verl.,: 245-249. -
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596Hofestädt R, Hörkens U (1994)PUB
C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata.
Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS) 14(1): 1-14. -
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393Hofestädt R (1994)PUB
Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse.
In: Simulationstechnik. Kampe G, Zeitz M (Eds); Fortschritte in der Simulationstechnik, 9. Wiesbaden: Vieweg: 1-8. -
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450Hofestädt R, Krückeberg F, Lengauer T (Eds) (1993)PUB
Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993.
Informatik Aktuell: VIII, 214. -
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486Hofestädt R, Lautenbach K, Löffler M (1993)PUB
Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung". Fachberichte Informatik; 16-93.
Koblenz: Universitätf Koblenz. -
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358Hofestädt R (1993)PUB
Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars.
Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 24(4): 169-177. -
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301Hofestädt R (1993)PUB
Grammatical Formalization of Metabolic Processes.
In: Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93. Hunter L, Searls D, Shavlik J (Eds); Menlo Park: AAAI Press: 181-189. -
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456Hofestädt R, Beerbohm D, Huang X (1993)PUB
Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten.
In: Proceedings of the PARS 1993. PARS Notes, 12. 92-101. -
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590Hofestädt R (1993)PUB
A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways.
Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS) 11: 253-262. -
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542Hörkens U, Hofestädt R (1992)PUB
Cellular Automata Simulation Shell.
In: Computational Systems Analysis. Sydow A (Ed); Amsterdam: Elsevier: 325-330. -
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557Hofestädt R, Müller HP (1992)PUB
The Simulation of Genetic Processes.
In: Computational Systems Analysis. Sydow A (Ed); Amsterdam: Elsevier: 532-528.