170 Publikationen

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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
A. Shoshi, R. Hofestädt, O. Zolotareva, M. Friedrichs, A. Maier, V. A. Ivanisenko, V. E. Dosenko, and E. Y. Bragina, “GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180049.
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[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
V. Saik, Olga, P. S. Demenkov, V. Ivanisenko, Timofey, E. Y. Bragina, M. B. Freidin, V. E. Dosenko, O. Zolotareva, E. L. Choynzonov, R. Hofestädt, and V. A. Ivanisenko, “Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180054.
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[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
T. Drevytska, R. Morhachov, L. Tumanovska, G. Portnichenko, V. Nagibin, O. Boldyriev, T. Lapikova-Bryhinska, V. Gurianova, B. Dons'koi, M. Freidin, et al., “shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180053.
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[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
E. Y. Bragina, I. A. Goncharova, A. F. Garaeva, V. Nemerov, Evgeniy, A. A. Babovskaya, A. B. Karpov, V. Semenova, Yulia, I. Z. Zhalsanova, D. E. Gomboeva, V. Saik, Olga, et al., “Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180052.
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[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
N. Biere, M. Ghaffar, A. Doebbe, D. Jaeger, N. Rothe, B. M. Friedrich, R. Hofestädt, F. Schreiber, O. Kruse, and B. Sommer, “Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180003.
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[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
O. V. Saik, P. S. Demenkov, T. V. Ivanisenko, E. Y. Bragina, M. B. Freidin, I. A. Goncharova, V. E. Dosenko, O. Zolotareva, R. Hofestädt, I. N. Lavrik, et al., “Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks”, BMC Medical Genomics, 2018, 11, : 15.
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[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
H. Hamzeiy, R. Suluyayla, C. Brinkrolf, S. J. Janowski, R. Hofestädt, and J. Allmer, “Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2017, 14.
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[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
P. Romano, R. Hofestädt, M. Lange, and D. D'Elia, “The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes”, BMC BIOINFORMATICS, 2017, 18, : 101.
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[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
A. Shoshi, O. Zolotareva, M. Kleine, C. Königs, and R. Hofestädt, 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
A. Shoshi, U. Müller, A. Shoshi, V. Ogultarhan, and R. Hofestädt, in Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (Eds.: D. Hayn, G. Schreier), Ios Press, Amsterdam, 2017, p. 128-135.
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[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Q. Li, Y. Zhou, Y. Jiao, Z. Zhang, L. Bai, L. Tong, X. Yang, B. Sommer, R. Hofestädt, and M. Chen, “DaTo: an atlas of biological databases and tools”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2016, 13, : 297.
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[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
A. Shoshi, T. Hoppe, B. Kormeier, V. Ogultarhan, and R. Hofestädt, “GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data”, BMC Medical Informatics and Decision Making, 2015, 15, : 15.
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[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
A. Shoshi, V. Ogultarhan, T. Hoppe, B. Kormeier, U. Müller, and R. Hofestädt, “Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2015, 13, 1540007.
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[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
“Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2015.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
X. Meng, J. Wang, C. Yuan, X. Li, Y. Zhou, R. Hofestädt, and M. Chen, “Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types”, Oncogenesis, 2015, 4, : e177.
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[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, U. Huebnert, P. Knaup-Gregori, C. Ose, C. Schmoor, A. Timmer, and D. Wege, “Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems)”, Methods of Information in Medicine, 2015, 54, 385-387.
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[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
M. Chen, and R. Hofestädt, “Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems”, it-Information Technology, 2014, 56, 76-81.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
“German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2014.
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[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, P. Knaup-Gregori, C. Ose, and A. Timmer, “How to Use Information Technology to Improve Medication Safety”, Methods of Information in Medicine, 2014, 53, 333-335.
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[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
C. Brinkrolf, S. J. Janowski, B. Kormeier, M. Lewinski, K. Hippe, D. Borck, and R. Hofestädt, “VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2014, 11, 239.
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[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
O. V. Popik, B. Sommer, R. Hofestädt, and V. A. Ivanisenko, in Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (Ed.: B. Sommer), Bielefeld University, Bielefeld, 2014, p. 9-10.
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[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell, Springer, Berlin, 2014.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
O. V. Popik, O. V. Saik, E. D. Petrovskiy, B. Sommer, R. Hofestädt, I. N. Lavrik, and V. A. Ivanisenko, “Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions”, BMC Genomics, 2014, 15, S7.
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[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
“German Conference on Bioinformatics 2014”, GI-Edition: lecture notes in informatics, 2014, 235.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
M. Chen, and R. Hofestädt, in Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (Eds.: M. Chen, R. Hofestädt), Springer, Berlin, 2014, p. 3-19.
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
H. - M. Lee, K. - J. Dietz, and R. Hofestädt, “Computational construction of specialized biological networks”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11, 1340003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
B. Sommer, B. Kormeier, P. S. Demenkov, P. Arrigo, K. Hippe, Ö. Ates, A. V. Kochetov, V. A. Ivanisenko, N. A. Kolchanov, and R. Hofestädt, “Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11, 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
R. Hofestädt, “Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen”, Management & Krankenhaus, 2013, 22.
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, P. Knaup-Gregorit, C. Ose, and A. Timmer, “More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published”, Methods Of Information In Medicine, 2013, 52, 181-183.
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[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
R. Hofestädt, B. Kormeier, M. Lange, F. Schreiber, B. Sommer, and S. Weise, “Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2013, 10, 226.
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
S. Proß, B. Bachmann, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, in Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (Ed.: C. Laroque), Ieee, Piscataway, NJ, 2012, p. 1-13.
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
A. Shoshi, A. Shoshi, and R. Hofestädt, in Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (Eds.: U. Goltz, M. Magnor, H.-J. Appelrath, H.K. Matthies, W.-T. Balke, L. Wolf), Ges. Für Informatik, Bonn, 2012, p. 1565-1574.
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[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
C. Klenke, S. J. Janowski, D. Borck, D. Widera, J. Ebmeyer, J. Kalinowski, A. Leichtle, R. Hofestädt, T. Upile, C. Kaltschmidt, et al., “Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays”, PLoS One, 2012, 7, e52718.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
“German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2012.
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
“Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets”, CEUR workshop proceedings, 2012, 852.
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
R. Hofestädt, in The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts, Russian Academy Of Sciences, Novosibirsk, 2012, p. 122.
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
K. Hippe, B. Kormeier, S. J. Janowski, T. Töpel, and R. Hofestädt, in Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics, 2011.
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
R. Hofestädt, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 1-2.
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
R. Hofestädt, and S. Thelen, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 3-16.
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
M. Chen, and R. Hofestädt, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 38-55.
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
M. Chen, M. Hu, and R. Hofestädt, “A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes”, Applied Biochemistry and Biotechnology, 2011, 164, 338-352.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
M. Chen, S. Hariharaputran, R. Hofestädt, B. Kormeier, and S. Spangardt, “Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks”, Natural Computing, 2011, 10, 1077-1097.
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
D. Huang, Y. Huang, Y. Bai, D. Chen, R. Hofestädt, C. Klukas, and M. Chen, “MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web”, Bioinformatics, 2011, 27, 3321-3322.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
R. Hofestädt, in Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (Eds.: I. Batyrshin, G. Sidorov), Springer, Berlin, Heidelberg, 2011, p. 143-152.
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
S. J. Janowski, B. Kormeier, T. Töpel, K. Hippe, R. Hofestädt, N. Willassen, R. Friesen, S. Rubert, D. Borck, P. Haugen, et al., in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 182-203.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
B. Kormeier, K. Hippe, and R. Hofestädt, “Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data”, it Information Technology, 2011, 53, 241-249.
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
K. Hippe, B. Kormeier, T. Töpel, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, in Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik, Ges. Für Informatik, Bonn, 2010, p. 720-725.
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
“Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2010.
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
T. Töpel, D. Scheible, F. Trefz, and R. Hofestädt, “RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases”, Human Mutation, 2010, 31, E1081-E1088.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
B. Sommer, E. S. Tiys, B. Kormeier, K. Hippe, S. J. Janowski, T. V. Ivanisenko, A. O. Bragin, P. Arrigo, P. S. Demenkov, A. V. Kochetov, et al., “Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7, 148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
H. - M. Lee, K. - J. Dietz, and R. Hofestädt, “Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues.”, Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 2010, 7.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
B. Kormeier, K. Hippe, T. Töpel, and R. Hofestädt, “CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7, : 142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
S. J. Janowski, B. Kormeier, T. Töpel, K. Hippe, R. Hofestädt, N. Willassen, R. Friesen, S. Rubert, D. Borck, P. Haugen, et al., “Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing”, In Silico Biology, 2010, 10, 27-48.
PUB
 
[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
B. Kormeier, K. Hippe, P. Arrigo, T. Töpel, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, “Reconstruction of biological networks based on life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[116]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
R. Hofestädt, “DNA-Programming Language of Life”, HBSO, 2009, 13, 68-72.
PUB
 
[115]
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
R. Hofestädt, K. Kuhn, W. Müller, and C. Türker, in Informatik 2009 (Eds.: S. Fischer, E. Maehle, R. Reischuk), Ges. Für Informatik, Bonn, 2009, p. 33-34.
PUB
 
[114]
2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou, 2009.
PUB
 
[113]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
R. Hofestädt, and E. - W. Mayr, “Bioinformatik”, Informatik Spektrum, 2009, 32, 285-286.
PUB | DOI
 
[112]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
B. Kormeier, K. Hippe, T. Töpel, and R. Hofestädt, in Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (Eds.: S. Fischer, E. Maehle, R. Reischuk), Gesellschaft Für Informatik (Gi), Bonn, 2009, p. 704-708.
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[111]
2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007, Shaker, Aachen, 2008.
PUB
 
[110]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
S. Hariharaputran, T. Töpel, T. Oberwahrenbrock, and R. Hofestädt, “Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification”, Nature Precedings, 2008.
PUB | DOI
 
[109]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
F. Trefz, D. Scheible, H. Götz, T. Töpel, R. Hofestädt, and G. Frauendienst-Egger, “METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism”, Journal of Inherited Metabolic Disease, 2008, 31, 289.
PUB
 
[108]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
S. Hariharaputran, T. Töpel, B. Brockschmidt, and R. Hofestädt, “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data”, Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 2008, 4, 63-74.
PUB
 
[107]
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350
R. Hofestädt, in (Eds.: R. Hofestädt, N. Kolchanov), Russian Academy Of Sciences, Novosibirsk, 2008.
PUB
 
[106]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
T. Töpel, B. Kormeier, A. Klassen, and R. Hofestädt, “BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2008, 5.
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[105]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044
R. Hofestädt, “Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2007, 5, 457-466.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[104]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274
S. Hariharaputran, T. Töpel, B. Brockschmidt, and R. Hofestädt, in Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07), 2007.
PUB
 
[103]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265
S. Hariharaputran, T. Töpel, T. Oberwahrenbrock, and R. Hofestädt, in Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems, 2007.
PUB
 
[102]
2007 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006, Shaker, Aachen, 2007.
PUB
 
[101]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256
T. Töpel, J. Neumann, and R. Hofestädt, in Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (Ed.: P. Kokol), Ieee Computer Society, Los Alamitos, Calif., 2007, p. 7-11.
PUB
 
[100]
2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474
D. Scheible, T. Töpel, G. Frauendienst-Egger, R. Hofestädt, S. Wallner, and F. K. Trefz, “Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry”, JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, 2007, 30, 3.
PUB | WoS
 
[99]
2006 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005, Shaker, Aachen, 2006.
PUB
 
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
R. Hofestädt, in Simulationstechnik (Eds.: G. Kampe, M. Zeitz), Vieweg, Wiesbaden, 1994, p. 1-8.
PUB
 
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1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
“Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993”, Informatik Aktuell, 1993, VIII, 214.
PUB
 
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1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
R. Hofestädt, K. Lautenbach, and M. Löffler, Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung", Universitätf Koblenz, Koblenz, 1993.
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
R. Hofestädt, “Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars”, Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 1993, 24, 169-177.
PUB
 
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
R. Hofestädt, in Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (Eds.: L. Hunter, D. Searls, J. Shavlik), Aaai Press, Menlo Park, 1993, p. 181-189.
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
R. Hofestädt, D. Beerbohm, and X. Huang, in Proceedings of the PARS 1993, 1993, p. 92-101.
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[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
R. Hofestädt, “A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways”, Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 1993, 11, 253-262.
PUB
 
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
U. Hörkens, and R. Hofestädt, in Computational Systems Analysis (Ed.: A. Sydow), Elsevier, Amsterdam, 1992, p. 325-330.
PUB
 
[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
R. Hofestädt, and H. P. Müller, in Computational Systems Analysis (Ed.: A. Sydow), Elsevier, Amsterdam, 1992, p. 532-528.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313
A. Shoshi, R. Hofestädt, O. Zolotareva, M. Friedrichs, A. Maier, V. A. Ivanisenko, V. E. Dosenko, and E. Y. Bragina, “GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180049.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[169]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312
V. Saik, Olga, P. S. Demenkov, V. Ivanisenko, Timofey, E. Y. Bragina, M. B. Freidin, V. E. Dosenko, O. Zolotareva, E. L. Choynzonov, R. Hofestädt, and V. A. Ivanisenko, “Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180054.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[168]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310
T. Drevytska, R. Morhachov, L. Tumanovska, G. Portnichenko, V. Nagibin, O. Boldyriev, T. Lapikova-Bryhinska, V. Gurianova, B. Dons'koi, M. Freidin, et al., “shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180053.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[167]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309
E. Y. Bragina, I. A. Goncharova, A. F. Garaeva, V. Nemerov, Evgeniy, A. A. Babovskaya, A. B. Karpov, V. Semenova, Yulia, I. Z. Zhalsanova, D. E. Gomboeva, V. Saik, Olga, et al., “Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180052.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[166]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278
N. Biere, M. Ghaffar, A. Doebbe, D. Jaeger, N. Rothe, B. M. Friedrich, R. Hofestädt, F. Schreiber, O. Kruse, and B. Sommer, “Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2018, 15, : 20180003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[165]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515
O. V. Saik, P. S. Demenkov, T. V. Ivanisenko, E. Y. Bragina, M. B. Freidin, I. A. Goncharova, V. E. Dosenko, O. Zolotareva, R. Hofestädt, I. N. Lavrik, et al., “Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks”, BMC Medical Genomics, 2018, 11, : 15.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[164]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589
H. Hamzeiy, R. Suluyayla, C. Brinkrolf, S. J. Janowski, R. Hofestädt, and J. Allmer, “Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2017, 14.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[163]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493
P. Romano, R. Hofestädt, M. Lange, and D. D'Elia, “The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes”, BMC BIOINFORMATICS, 2017, 18, : 101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[162]
2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298
A. Shoshi, O. Zolotareva, M. Kleine, C. Königs, and R. Hofestädt, 2017.
PUB
 
[161]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290
A. Shoshi, U. Müller, A. Shoshi, V. Ogultarhan, and R. Hofestädt, in Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (Eds.: D. Hayn, G. Schreier), Ios Press, Amsterdam, 2017, p. 128-135.
PUB | PDF | DOI
 
[160]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099
Q. Li, Y. Zhou, Y. Jiao, Z. Zhang, L. Bai, L. Tong, X. Yang, B. Sommer, R. Hofestädt, and M. Chen, “DaTo: an atlas of biological databases and tools”, JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 2016, 13, : 297.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[159]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
A. Shoshi, T. Hoppe, B. Kormeier, V. Ogultarhan, and R. Hofestädt, “GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data”, BMC Medical Informatics and Decision Making, 2015, 15, : 15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[158]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
A. Shoshi, V. Ogultarhan, T. Hoppe, B. Kormeier, U. Müller, and R. Hofestädt, “Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2015, 13, 1540007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[157]
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626
“Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2015.
PUB
 
[156]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356
X. Meng, J. Wang, C. Yuan, X. Li, Y. Zhou, R. Hofestädt, and M. Chen, “Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types”, Oncogenesis, 2015, 4, : e177.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[155]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, U. Huebnert, P. Knaup-Gregori, C. Ose, C. Schmoor, A. Timmer, and D. Wege, “Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems)”, Methods of Information in Medicine, 2015, 54, 385-387.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[154]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901634
M. Chen, and R. Hofestädt, “Open Problems in Petri Net Modeling and Simulation of Biological Systems”, it-Information Technology, 2014, 56, 76-81.
PUB | DOI
 
[153]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259
“German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2014.
PUB | Download (ext.)
 
[152]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, P. Knaup-Gregori, C. Ose, and A. Timmer, “How to Use Information Technology to Improve Medication Safety”, Methods of Information in Medicine, 2014, 53, 333-335.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[151]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
C. Brinkrolf, S. J. Janowski, B. Kormeier, M. Lewinski, K. Hippe, D. Borck, and R. Hofestädt, “VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2014, 11, 239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[150]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586
O. V. Popik, B. Sommer, R. Hofestädt, and V. A. Ivanisenko, in Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (Ed.: B. Sommer), Bielefeld University, Bielefeld, 2014, p. 9-10.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
 
[149]
2014 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693
Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell, Springer, Berlin, 2014.
PUB
 
[148]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884
O. V. Popik, O. V. Saik, E. D. Petrovskiy, B. Sommer, R. Hofestädt, I. N. Lavrik, and V. A. Ivanisenko, “Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions”, BMC Genomics, 2014, 15, S7.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[147]
2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
“German Conference on Bioinformatics 2014”, GI-Edition: lecture notes in informatics, 2014, 235.
PUB
 
[146]
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694
M. Chen, and R. Hofestädt, in Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (Eds.: M. Chen, R. Hofestädt), Springer, Berlin, 2014, p. 3-19.
PUB
 
[145]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
H. - M. Lee, K. - J. Dietz, and R. Hofestädt, “Computational construction of specialized biological networks”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11, 1340003.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[144]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
B. Sommer, B. Kormeier, P. S. Demenkov, P. Arrigo, K. Hippe, Ö. Ates, A. V. Kochetov, V. A. Ivanisenko, N. A. Kolchanov, and R. Hofestädt, “Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets”, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2013, 11, 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[143]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701
R. Hofestädt, “Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen”, Management & Krankenhaus, 2013, 22.
PUB
 
[142]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116
A. Winter, R. - D. Hilgers, R. Hofestädt, P. Knaup-Gregorit, C. Ose, and A. Timmer, “More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published”, Methods Of Information In Medicine, 2013, 52, 181-183.
PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[141]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
R. Hofestädt, B. Kormeier, M. Lange, F. Schreiber, B. Sommer, and S. Weise, “Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2013, 10, 226.
PUB
 
[140]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730
S. Proß, B. Bachmann, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, in Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (Ed.: C. Laroque), Ieee, Piscataway, NJ, 2012, p. 1-13.
PUB | DOI
 
[139]
2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751
A. Shoshi, A. Shoshi, and R. Hofestädt, in Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (Eds.: U. Goltz, M. Magnor, H.-J. Appelrath, H.K. Matthies, W.-T. Balke, L. Wolf), Ges. Für Informatik, Bonn, 2012, p. 1565-1574.
PUB | Download (ext.)
 
[138]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867
C. Klenke, S. J. Janowski, D. Borck, D. Widera, J. Ebmeyer, J. Kalinowski, A. Leichtle, R. Hofestädt, T. Upile, C. Kaltschmidt, et al., “Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays”, PLoS One, 2012, 7, e52718.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[137]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727
“German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2012.
PUB
 
[136]
2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724
“Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets”, CEUR workshop proceedings, 2012, 852.
PUB
 
[135]
2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726
R. Hofestädt, in The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts, Russian Academy Of Sciences, Novosibirsk, 2012, p. 122.
PUB
 
[134]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
K. Hippe, B. Kormeier, S. J. Janowski, T. Töpel, and R. Hofestädt, in Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics, 2011.
PUB
 
[133]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
R. Hofestädt, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 1-2.
PUB
 
[132]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
R. Hofestädt, and S. Thelen, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 3-16.
PUB
 
[131]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
M. Chen, and R. Hofestädt, in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 38-55.
PUB
 
[130]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
M. Chen, M. Hu, and R. Hofestädt, “A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes”, Applied Biochemistry and Biotechnology, 2011, 164, 338-352.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[129]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
M. Chen, S. Hariharaputran, R. Hofestädt, B. Kormeier, and S. Spangardt, “Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks”, Natural Computing, 2011, 10, 1077-1097.
PUB | DOI | WoS
 
[128]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
D. Huang, Y. Huang, Y. Bai, D. Chen, R. Hofestädt, C. Klukas, and M. Chen, “MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web”, Bioinformatics, 2011, 27, 3321-3322.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[127]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
R. Hofestädt, in Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (Eds.: I. Batyrshin, G. Sidorov), Springer, Berlin, Heidelberg, 2011, p. 143-152.
PUB | DOI
 
[126]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
S. J. Janowski, B. Kormeier, T. Töpel, K. Hippe, R. Hofestädt, N. Willassen, R. Friesen, S. Rubert, D. Borck, P. Haugen, et al., in Biological Petri Nets (Ed.: E. Wingender), Ios Press, Amsterdam, 2011, p. 182-203.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[125]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
B. Kormeier, K. Hippe, and R. Hofestädt, “Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data”, it Information Technology, 2011, 53, 241-249.
PUB | DOI
 
[124]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
K. Hippe, B. Kormeier, T. Töpel, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, in Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik, Ges. Für Informatik, Bonn, 2010, p. 720-725.
PUB
 
[123]
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
“Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology”, Medizinische Informatik und Bioinformatik, 2010.
PUB
 
[122]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
T. Töpel, D. Scheible, F. Trefz, and R. Hofestädt, “RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases”, Human Mutation, 2010, 31, E1081-E1088.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[121]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
B. Sommer, E. S. Tiys, B. Kormeier, K. Hippe, S. J. Janowski, T. V. Ivanisenko, A. O. Bragin, P. Arrigo, P. S. Demenkov, A. V. Kochetov, et al., “Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7, 148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[120]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
H. - M. Lee, K. - J. Dietz, and R. Hofestädt, “Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues.”, Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 2010, 7.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[119]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
B. Kormeier, K. Hippe, T. Töpel, and R. Hofestädt, “CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7, : 142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[118]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
S. J. Janowski, B. Kormeier, T. Töpel, K. Hippe, R. Hofestädt, N. Willassen, R. Friesen, S. Rubert, D. Borck, P. Haugen, et al., “Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing”, In Silico Biology, 2010, 10, 27-48.
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[117]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
B. Kormeier, K. Hippe, P. Arrigo, T. Töpel, S. J. Janowski, and R. Hofestädt, “Reconstruction of biological networks based on life science data integration”, Journal of Integrative Bioinformatics, 2010, 7.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120
R. Hofestädt, “DNA-Programming Language of Life”, HBSO, 2009, 13, 68-72.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132
R. Hofestädt, K. Kuhn, W. Müller, and C. Türker, in Informatik 2009 (Eds.: S. Fischer, E. Maehle, R. Reischuk), Ges. Für Informatik, Bonn, 2009, p. 33-34.
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644
Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou, 2009.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105
R. Hofestädt, and E. - W. Mayr, “Bioinformatik”, Informatik Spektrum, 2009, 32, 285-286.
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
B. Kormeier, K. Hippe, T. Töpel, and R. Hofestädt, in Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (Eds.: S. Fischer, E. Maehle, R. Reischuk), Gesellschaft Für Informatik (Gi), Bonn, 2009, p. 704-708.
PUB | Download (ext.)
 
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2008 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295
Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007, Shaker, Aachen, 2008.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654
S. Hariharaputran, T. Töpel, T. Oberwahrenbrock, and R. Hofestädt, “Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification”, Nature Precedings, 2008.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666
F. Trefz, D. Scheible, H. Götz, T. Töpel, R. Hofestädt, and G. Frauendienst-Egger, “METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism”, Journal of Inherited Metabolic Disease, 2008, 31, 289.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678
S. Hariharaputran, T. Töpel, B. Brockschmidt, and R. Hofestädt, “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data”, Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 2008, 4, 63-74.
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S. Hariharaputran, T. Töpel, T. Oberwahrenbrock, and R. Hofestädt, in Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems, 2007.
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T. Töpel, J. Neumann, and R. Hofestädt, in Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (Ed.: P. Kokol), Ieee Computer Society, Los Alamitos, Calif., 2007, p. 7-11.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332
R. Hofestädt, in Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006 (Eds.: R. Hofestädt, N. Kolchanov), Russian Academy Of Sciences Siberian Branch; Institute Of Cytology And Genetics, Novosibirsk, 2006, p. 48-52.
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361
F. K. Trefz, T. Töpel, D. Scheible, G. Frauendienst-Egger, and R. Hofestädt, “Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders”, JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, 2006, 29, 84.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350
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R. Hofestädt, and T. Töpel, in Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (Eds.: U. Seiffert, L. Jain, P. Schweizer), Springer, Berlin, 2005, p. 1-24.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364
R. Hofestädt, in Handbuch der Medizinischen Informatik (Ed.: T. Lehmann), Hanser, München, 2005, p. 253-298.
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2005 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874
M. Chen, A. Freier, and R. Hofestädt, in Handbook of Genome Research (Ed.: C. Sensen), Wiley-Vch, Weinheim, 2005, p. 461-490.
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R. Hofestädt, “Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics”, In Silico Biology, 2005, 5, 81-82.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766
R. Hofestädt, and M. Chen, in Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 2004, p. 68-72.
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“Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik”, Informationstechnik und technische Informatik, 2004, 46.
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2004 | Herausgeber Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Kluwer Academic, Boston, 2004.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762
R. Hofestädt, and H. - P. Lenhof, “Molekulare Bioinformatik”, Informationstechnik und technische Informatik, 2004, 46, 3-4.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774
M. Chen, and R. Hofestädt, “PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment”, Applied Bioinformatics, 2004, 3, 241-252.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526
M. Chen, and R. Hofestädt, “Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways”, IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 2004, 3, 192-199.
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M. Chen, S. Lin, and R. Hofestädt, “STCDB: Signal Transduction Classification Database”, Nucleic Acids Research, 2004, 32, D456-D458.
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R. Hofestädt, A. Freier, and M. Lange, in Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (Eds.: N.A. Kolčanov, R. Hofestädt), Kluwer, Boston, 2003.
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N. Kolchanov, and R. Hofestädt, “The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure”, In Silico Biology, 2003, 3.
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M. Chen, and R. Hofestädt, “Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell”, In Silico Biology, 2003, 3, 347-365.
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A. Freier, R. Hofestädt, and M. Lange, “IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks”, In Silico Biology, 2003, 3, 215-227.
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Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches, Mit Press, Cambridge, Mass., 2002.
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R. Hofestädt, in Medical imaging informatics (Ed.: R. Haux), Schattauer, Stuttgart, 2002, p. 581-583.
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R. Hofestädt, and T. Töpel, in Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (Ed.: P. Kokol), Ieee Computer Society, Los Alamitos, Calif., 2002, p. 129-133.
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A. Freier, R. Hofestädt, and T. Töpel, in Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (Ed.: J. Borlak), Wiley-Vch, Weinheim, 2002, p. 233-252.
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R. Hofestädt, J. Köhler, M. Lange, and S. Schulze-Kremer, in IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering, Ieee Computer Society, Los Alamitos, Calif., 2000, p. 77-80.
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R. Hofestädt, M. Höding, G. Saake, and U. Scholz, in Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings (Eds.: W. Litwin, T. Morzy, G. Vossen), Springer Publishing, Berlin, 1998, p. 296-304.
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R. Hofestädt, in MedInfo ’98 (Eds.: B. Cesnik, A.T. McCray, J.-R. Scherrer), Ios Press, Amsterdam, 1998, p. 361-365.
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R. Hofestädt, M. Prüß, U. Scholz, and H. Urban, “Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen”, Magdeburger Wissenschaftsjournal, 1998, 3, 29-40.
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789
R. Hofestädt, and F. Meinecke, “Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks”, Computers in Biology and Medicine, 1995, 25, 321-334.
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[17]
1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405
R. Hofestädt, K. - E. Großpietsch, and C. Steigner, Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations, Universitätf Koblenz, Koblenz, 1994.
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[16]
1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417
D. Beerbohm, S. Bresken, R. Hofestädt, and X. Huang, in Parallele Datenverarbeitung aktuell (Eds.: R. Flieger, R. Grebe), Ios Press, Amsterdam, 1994, p. 100-108.
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[15]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427
R. Hofestädt, “Computer-Aided Metabolic Engineering”, it+ti Nachrichten, 1994, 66-70.
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[14]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441
R. Hofestädt, D. Beerbohm, S. Bresken, and X. Huang, in Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994 (Eds.: L. Dekker, W. Smit, J. Zuidervaart), Elsevier, Amsterdam, 1994, p. 235-242.
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[13]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387
R. Hofestädt, in Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (Ed.: H.A. Lim), World Scientific, 1994, p. 331-340.
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[12]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433
R. Hofestädt, and U. Ashauer, in Medizin und Information (Ed.: H. Kunath), Mmv, Medizin-Verl.,, München, 1994, p. 115-119.
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[11]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471
R. Hofestädt, in Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien (Eds.: S.J. Pöppl, H.-G. Lipinski, T. Mansky), Mmv, Medizin-Verl.,, München, 1994, p. 245-249.
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[10]
1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596
R. Hofestädt, and U. Hörkens, “C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata”, Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 1994, 14, 1-14.
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[9]
1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393
R. Hofestädt, in Simulationstechnik (Eds.: G. Kampe, M. Zeitz), Vieweg, Wiesbaden, 1994, p. 1-8.
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[8]
1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450
“Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993”, Informatik Aktuell, 1993, VIII, 214.
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[7]
1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486
R. Hofestädt, K. Lautenbach, and M. Löffler, Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung", Universitätf Koblenz, Koblenz, 1993.
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[6]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358
R. Hofestädt, “Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars”, Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 1993, 24, 169-177.
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[5]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301
R. Hofestädt, in Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (Eds.: L. Hunter, D. Searls, J. Shavlik), Aaai Press, Menlo Park, 1993, p. 181-189.
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[4]
1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456
R. Hofestädt, D. Beerbohm, and X. Huang, in Proceedings of the PARS 1993, 1993, p. 92-101.
PUB
 
[3]
1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590
R. Hofestädt, “A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways”, Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 1993, 11, 253-262.
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[2]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542
U. Hörkens, and R. Hofestädt, in Computational Systems Analysis (Ed.: A. Sydow), Elsevier, Amsterdam, 1992, p. 325-330.
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[1]
1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557
R. Hofestädt, and H. P. Müller, in Computational Systems Analysis (Ed.: A. Sydow), Elsevier, Amsterdam, 1992, p. 532-528.
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