183 Publikationen
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984737Orlov, Y.L., Chen, M., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. (2023).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960309Allmer, J., Elloumi, M., Comin, M., Hofestädt, R.: Special Issue of the 1st International Applied Bioinformatics Conference (iABC'21). Journal of Integrative Bioinformatics. 18, (2021).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2957504Brinkrolf, C., Ochel, L., Hofestädt, R.: VANESA: An open-source hybrid functional Petri net modeling and simulation environment in systems biology. Biosystems. : 104531 (2021).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2952999Ahsan, M.A., Liu, Y., Feng, C., Hofestädt, R., Chen, M.: OverCOVID: an integrative web portal for SARS-CoV-2 bioinformatics resources. Journal of integrative bioinformatics. (2021).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939859Friedrichs, M., Shoshi, A., Chmura, P.J., Ison, J., Schwämmle, V., Schreiber, F., Hofestädt, R., Sommer, B.: JIB.tools 2.0 – A Bioinformatics Registry for Journal Published Tools with Interoperability to bio.tools. Journal of Integrative Bioinformatics. 16, : 20190059 (2020).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937754Chen, M., Hofestädt, R., Taubert, J.: Integrative Bioinformatics: History and Future. Journal of integrative bioinformatics. 16, : 20192001 (2019).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938765Zolotareva, O., Saik, O.V., Königs, C., Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Ivanisenko, V.A., Hofestädt, R.: Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects. Scientific Reports. 9, : 16302 (2019).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938754Zhu, L., Hofestädt, R., Ester, M.: Tissue-Specific Subcellular Localization Prediction Using Multi-Label Markov Random Fields. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 16, 1471-1482 (2019).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938395Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Saik, O.V., Zolotareva, O., Goncharova, I.A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R.: Identification of the genetic factors underlying comorbidity between bronchial asthma and hypertension. EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 27, p. 1035-1036. Nature Publishing Group, London (2019).PUB | WoS
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B.M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O., Sommer, B.: Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. Journal of Integrative Bioinformatics. 15, : 20180003 (2018).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962349Hofestädt, R., Brinkrolf, C., Reipke, P.: OMPetri: A New Petri Net Simulation Environment Based on OpenModelica. Proceedings of the 2018 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology - ICBBT '18. p. 57-61. ACM Press, New York (2018).PUB | DOI
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962353Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R., Allmer, J.: Visualization and Analysis of miRNAs Implicated in Amyotrophic Lateral Sclerosis Within Gene Regulatory Pathways. Studies in Health Technology and Informatics. 253, 183-187 (2018).PUB | DOI
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Bragina, E.Y.: GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180049 (2018).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515Saik, O.V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, T.V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Goncharova, I.A., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Rogaev, E.I., Ivanisenko, V.A.: Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics. 11, : 15 (2018).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309Bragina, E.Y., Goncharova, I.A., Garaeva, A.F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A.A., Karpov, A.B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I.Z., Gomboeva, D.E., Saik, Olga, V., Zolotareva, O., Ivanisenko, V.A., Dosenko, V.E., Hofestädt, R., Freidin, M.B.: Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180052 (2018).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312Saik, Olga, V., Demenkov, P.S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E.Y., Freidin, M.B., Dosenko, V.E., Zolotareva, O., Choynzonov, E.L., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180054 (2018).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., Ivanisenko, V., Bragina, E.Y., Hofestädt, R., Dosenko, V.: shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 15, : 20180053 (2018).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs. In: Hayn, D. and Schreier, G. (eds.) Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference. Studies in Health Technology and Informatics. 236, p. 128-135. IOS Press, Amsterdam (2017).PUB | PDF | DOI
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2017 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962354Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., Sacar Demirci, M.D. eds: Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016. Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik. (2017).PUB
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M., D'Elia, D.: The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS. 18, : 101 (2017).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Hofestädt, R., Allmer, J.: Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 14, (2017).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C., Hofestädt, R.: Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense (2017).PUB
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R., Chen, M.: DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS. 13, : 297 (2016).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making. 15, : 15 (2015).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U., Hofestädt, R.: Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 13, : 1540007 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R., Chen, M.: Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis. 4, : e177 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., Sacar Demirci, M.D. eds: Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2015).PUB
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A., Wege, D.: Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine. 54, 385-387 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586Popik, O.V., Sommer, B., Hofestädt, R., Ivanisenko, V.A.: Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In: Sommer, B. (ed.) Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. p. 9-10. Bielefeld University, Bielefeld (2014).PUB | PDF | DOI
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884Popik, O.V., Saik, O.V., Petrovskiy, E.D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I.N., Ivanisenko, V.A.: Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics. 15, : S7 (2014).PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259Hofestädt, R., Shoshi, A. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2014).PUB | Download (ext.)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Timmer, A.: How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine. 53, 333-335 (2014).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D., Hofestädt, R.: VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics. 11, 239 (2014).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2014 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693Chen, M., Hofestädt, R. eds: Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. Springer, Berlin (2014).PUB
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695Giegerich, R., Hofestädt, R., Nattkemper, T.W. eds: German Conference on Bioinformatics 2014. GI-Edition: lecture notes in informatics. 235, (2014).PUB
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative Bioinformatics. In: Chen, M. and Hofestädt, R. (eds.) Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell. p. 3-19. Springer, Berlin (2014).PUB
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2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709280Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hofestädt, R.: KALIS - A web-based system for patient-specific risk assessment of drugs. In: Schreiber, F., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., Czauderna, T., Schnee, R., and Weise, S. (eds.) Proceedings of the 9 th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013. p. 178-178. (2013).PUB
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, : 1340005 (2013).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 11, : 1340003 (2013).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701Hofestädt, R.: Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus. 22 (2013).PUB
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116Winter, A., Hilgers, R.-D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C., Timmer, A.: More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine. 52, 181-183 (2013).PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B., Weise, S.: Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics. 10, 226 (2013).PUB
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867Klenke, C., Janowski, S.J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., Kaltschmidt, B., Sudhoff, H.: Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One. 7, : e52718 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In: Laroque, C. (ed.) Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC). p. 1-13. IEEE, Piscataway, NJ (2012).PUB | DOI
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751Shoshi, A., Shoshi, A., Hofestädt, R.: KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung. In: Goltz, U., Magnor, M., Appelrath, H.-J., Matthies, H.K., Balke, W.-T., and Wolf, L. (eds.) Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI). GI-Edition. Proceedings. 208, p. 1565-1574. Ges. für Informatik, Bonn (2012).PUB | Download (ext.)
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2012).PUB
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724Heiner, M., Hofestädt, R. eds: Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets. CEUR workshop proceedings. 852, (2012).PUB
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726Hofestädt, R.: Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts. p. 122. Russian Academy of Sciences, Novosibirsk (2012).PUB
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics. (2011).PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427Hofestädt, R.: Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 1-2. IOS Press, Amsterdam (2011).PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 3-16. IOS Press, Amsterdam (2011).PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, 1. Edition. p. 38-55. IOS Press, Amsterdam (2011).PUB
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112Chen, M., Hu, M., Hofestädt, R.: A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology. 164, 338-352 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., Chen, M.: MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics. 27, 3321-3322 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209Hofestädt, R.: Fundamental Features of Metabolic Computing. In: Batyrshin, I. and Sidorov, G. (eds.) Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II. Lecture Notes in Computer Science. 7095, p. 143-152. Springer, Berlin, Heidelberg (2011).PUB | DOI
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Wingender, E. (ed.) Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. 162, p. 182-203. IOS Press, Amsterdam (2011).PUB | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607Lee, H.-M., Dietz, K.-J., Hofestädt, R.: Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue). 7, 23-34 (2010).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, : 142 (2010).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, 3-8 (2010).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J., Hofestädt, R.: DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI. 176, p. 720-725. Ges. für Informatik, Bonn (2010).PUB
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2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605Hofestädt, R., Kolchanov, N. eds: Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology. Medizinische Informatik und Bioinformatik. (2010).PUB
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F., Hofestädt, R.: RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation. 31, E1081-E1088 (2010).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A., Hofestädt, R.: Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics. 7, 148 (2010).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., Chen, M.: Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology. 10, 27-48 (2010).PUB
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120Hofestädt, R.: DNA-Programming Language of Life. HBSO. 13, 68-72 (2009).PUB
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W., Türker, C.: Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk, R. (eds.) Informatik 2009. LNI. 154, p. 33-34. Ges. für Informatik, Bonn (2009).PUB
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644Chen, M., Hofestädt, R. eds: Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou. (2009).PUB
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., Hofestädt, R.: CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk , R. (eds.) Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. p. 704-708. Gesellschaft für Informatik (GI), Bonn (2009).PUB | Download (ext.)
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2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. 4. Shaker, Aachen (2008).PUB
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350Hofestädt, R.: DNA - Programming Language of Life? Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia (2008).PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R., Frauendienst-Egger, G.: METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease. 31, 289 (2008).PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007. 4, 63-74 (2008).PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A., Hofestädt, R.: BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 5, 343-349 (2008).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044Hofestädt, R.: Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 5, 457-466 (2007).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., Hofestädt, R.: VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). (2007).PUB
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., Hofestädt, R.: SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. (2007).PUB
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2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. 3. Shaker, Aachen (2007).PUB
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256Töpel, T., Neumann, J., Hofestädt, R.: A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007). p. 7-11. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2007).PUB
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S., Trefz, F.K.: Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 30, 3 (2007).PUB | WoS
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2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343Hofestädt, R., Töpel, T. eds: Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. 2. Shaker, Aachen (2006).PUB
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D., Trefz, F.: RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics. 5, 115-118 (2006).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848Kolchanov, N., Hofestädt, R., Milanesi, L. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. 1. Edition. Springer, New York (2006).PUB
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332Hofestädt, R.: An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In: Hofestädt, R. and Kolchanov, N. (eds.) Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006. 1, p. 48-52. Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk (2006).PUB
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589Chen, M., Hofestädt, R.: Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 1, 228-231 (2006).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).PUB | WoS
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808Chen, M., Hofestädt, R.: A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS. 39, 147-159 (2006).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R.: Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE. 29, 84 (2006).PUB | WoS
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350Chen, M., Hofestädt, R.: Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In: Kolchanov, N.A., Hofestädt, R., and Milanesi, L. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. p. 355-365. Springer, New York (2005).PUB
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271Chen, M., Hofestädt, R.: An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology. 5, 111-128 (2005).PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856Hofestädt, R., Töpel, T.: Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning. In: Seiffert, U., Jain, L., and Schweizer, P. (eds.) Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms. Studies in Fuzziness and Soft Computing. 176, 1. Edition. p. 1-24. Springer, Berlin (2005).PUB
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2005 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634Hofestädt, R. ed: Yearbook Bioinformatics 2004. 1, 1. Edition. Köllen, Bonn (2005).PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874Chen, M., Freier, A., Hofestädt, R.: Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In: Sensen, C. (ed.) Handbook of Genome Research. 2, 1. Edition. p. 461-490. Wiley-VCH, Weinheim (2005).PUB
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654Hofestädt, R.: Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology. 5, 81-82 (2005).PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364Hofestädt, R.: Bioinformatik. In: Lehmann, T. (ed.) Handbuch der Medizinischen Informatik. 2., vollst. neu bearb. Aufl. p. 253-298. Hanser, München (2005).PUB
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766Hofestädt, R., Chen, M.: Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 2, p. 68-72. (2004).PUB
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758Hofestädt, R., Lenhof, H.-P. eds: Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, (2004).PUB
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2004 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812Kolchanov, N., Hofestädt, R. eds: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 1. Edition. Kluwer Academic, Boston (2004).PUB
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762Hofestädt, R., Lenhof, H.-P.: Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik. 46, 3-4 (2004).PUB
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774Chen, M., Hofestädt, R.: PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics. 3, 241-252 (2004).PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526Chen, M., Hofestädt, R.: Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE. 3, 192-199 (2004).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In: Kolčanov, N.A. and Hofestädt, R. (eds.) Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. Kluwer, Boston (2003).PUB
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607Kolchanov, N., Hofestädt, R.: The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology. 3, (2003).PUB
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667Chen, M., Hofestädt, R.: Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology. 3, 347-365 (2003).PUB | PubMed | Europe PMC
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology. 3, 215-227 (2003).PUB | PubMed | Europe PMC
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2002 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797Collado-Vides, J., Hofestädt, R. eds: Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. MIT Press, Cambridge, Mass. (2002).PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795Hofestädt, R.: Bioinformatics. In: Haux, R. (ed.) Medical imaging informatics. Yearbook of Medical Informatics. 2002, p. 581-583. Schattauer, Stuttgart (2002).PUB
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624Hofestädt, R., Kolchanov, N., Reinitz, J.: Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology. 2, 35 (2002).PUB
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., Stephanik, A.: BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology. 2, 37-57 (2002).PUB | PubMed | Europe PMC
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2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798Hofestädt, R., Schnee, R.: Studien- und Forschungsführer Bioinformatik. 1. Edition. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg (2002).PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867Freier, A., Hofestädt, R., Töpel, T.: Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In: Borlak, J. (ed.) Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications. 1. Edition. p. 233-252. Wiley-VCH, Weinheim (2002).PUB
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M.: IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In: Kolčanov, N.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. 2, p. 123-125. (2002).PUB
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845Hofestädt, R., Töpel, T.: Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In: Kokol, P. (ed.) Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002). p. 129-133. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2002).PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Information Fusion and Metabolic Network Control. In: Collado-Vides, J. and Hofestädt, R. (eds.) Gene Regulation and Metabolism. p. 49-84. MIT Press, Cambridge, Mass. (2002).PUB
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818Töpel, T., Hofestädt, R.: Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik. 14, 315 (2002).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T., Scholz, U.: Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases. In: Patel, V.L. (ed.) Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Studies in health technology and informatics. 84, p. 353-356. IOS Press, Amsterdam (2001).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In: Xue, G., Xue, Y., Xu, Z., and Holmes, R. (eds.) Gene Families. p. 221-232. World Scientific, Singapore (2001).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M.: The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology. p. 38-43. (2001).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F.K.: RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation. In: Patel, V.L. (ed.) Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Studies in health technology and informatics. 84, p. 970-974. IOS Press, Amsterdam (2001).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M., Freier, A.: Metabolic Information Control System. In: Callaos, N. (ed.) Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics. IIIS, Orlando, Fla. (2001).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899Hofestädt, R., Reinitz, J., Kolchanov, N.: Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik. 22, 37 (2001).PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863Hofestädt, R.: Electronical infrastructure for the detection of inborn errors. In: Kolčanov, N.A. (ed.) Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 1, p. 212-213. (2000).PUB
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2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913Hofestädt, R., Pleißner, K.-P., Stephanik, A.: Informationssysteme in der Biotechnologie. Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg, Magdeburg (2000).PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M., Scholz, U.: An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks. Presented at the World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Berlin, Germany (2000).PUB
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2000 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010Hofestädt, R. ed: Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. BIOCOM, Berlin (2000).PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U.: Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism. In: Hasman, A. (ed.) Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000. Studies in health technology and informatics. 77, p. 857-862. IOS Press, Amsterdam (2000).PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M., Schulze-Kremer, S.: Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering. p. 77-80. IEEE Computer Society, Los Alamitos, Calif. (2000).PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013Hofestädt, R.: Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum. 22, 385-390 (1999).PUB
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School. (1999).PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M., Scholz, U.: Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe. 68, 12-15 (1999).PUB
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U.: MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks. In: Wingender, E., Hofestädt, R., Giegerich, R., Lengauer, T., Mewes, W., Schomburg, D., and Vingron, M. (eds.) Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99. p. 190-194. GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics, Braunschweig (1999).PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015Hofestädt, R.: Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal. 99, 12-13 (1999).PUB
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M., Michal, G. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways. Dagstuhl-Seminar-Report. 215, (1998).PUB
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682Hofestädt, R. ed: Molekulare Bioinformatik. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. (1998).PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384Hofestädt, R., Scholz, U.: Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems. 47, 91-102 (1998).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M., Scholz, U.: Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98). 1, p. 86-89. (1998).PUB
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G., Scholz, U.: Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics. In: Litwin, W., Morzy, T., and Vossen, G. (eds.) Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings. Lecture Notes in Computer Science. 1475, p. 296-304. Springer Publishing, Berlin (1998).PUB
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253Hofestädt, R.: An Integrative Molecular Information System. In: Cesnik, B., McCray, A.T., and Scherrer, J.-R. (eds.) MedInfo ’98. Studies in health technology and informatics. 52, p. 361-365. IOS Press, Amsterdam (1998).PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U., Urban, H.: Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal. 3, 29-40 (1998).PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291Hofestädt, R., Thelen, S.: Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology. 1, 39-53 (1998).PUB
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1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355Hofestädt, R.: Computer Science and Biology. Biosystems. 43, 69-71 (1997).PUB
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1997 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M., Schomburg, D. eds: Bioinformatics. LNCS, 1278, 1. Edition. Springer, Berlin (1997).PUB
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1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666Hofestädt, R., Lim, H. eds: Molecular Bioinformatics. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik. (1997).PUB
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441Hofestädt, R.: Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In: Steigner, C. (ed.) Arbeitsplatz-Rechensysteme. p. 285-292. Fölbach Publishing, Koblenz (1997).PUB
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458Hofestädt, R.: Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing. 3, p. 2293-2297. Mainz, Aachen (1997).PUB
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735Hofestädt, R., Herre, H., Trefz, F.: Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen. Informatik-Berichte, 9. Universität Leipzig, Leipzig (1996).PUB
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1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707Hofestädt, R.: Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors. In: Brender, J. (ed.) Medical Informatics Europe '96. Studies in health technology and informatics. 34, p. 542-546. IOS Press, Amsterdam (1996).PUB
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263Hofestädt, R.: Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels. Medizinische Informatik und Bioinformatik, 1. Edition. Shaker Verlag, Aachen (1996).PUB
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1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M., Löffler, M.: Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays. 18, 333-335 (1996).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M. eds: Informatik in den Biowissenschaften. Informationstechnik und technische Informatik. 38, (1996).PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773Hofestädt, R., Löffler, M., Möller, K.: Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn. 88 (1995).PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829Hofestädt, R.: Artificial Life. In: Dautenhahn, K. and GMD-Forschungszentrum Informationstechnik (eds.) Proceedings des Workshops "Artificial Life". GMD-Studien. 271, p. 246. GMD-Forschungszentrum Informationstechnik, Sankt Augustin (1995).PUB
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1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Löffler, M., Mavrovouniotis, M. eds: Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation. Dagstuhl-Seminar-Report. (1995).PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803Hofestädt, R.: Metabolic Engineering. In: Sydow, A. (ed.) Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation. p. 321-326. Gordon and Breach, Amsterdam (1995).PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815Hofestädt, R.: A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In: Greenes, R.A., Petersen, H.E., and Protti, D.J. (eds.) Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics. p. 994-999. Healthcare Computing & Communications Canada, Edmonton (1995).PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822Hofestädt, R., Huang, X.: Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95. p. 344-347. Publishing House of Electronics Industry (1995).PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784Hofestädt, R.: Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe. 13, 7-15 (1995).PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789Hofestädt, R., Meinecke, F.: Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine. 25, 321-334 (1995).PUB
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1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405Hofestädt, R., Großpietsch, K.-E., Steigner, C.: Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations. Fachberichte Informatik, 9-94. Universitätf Koblenz, Koblenz (1994).PUB
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1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R., Huang, X.: Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In: Flieger, R. and Grebe, R. (eds.) Parallele Datenverarbeitung aktuell. p. 100-108. IOS Press, Amsterdam (1994).PUB
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427Hofestädt, R.: Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten. 66-70 (1994).PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S., Huang, X.: Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In: Dekker, L., Smit, W., and Zuidervaart, J. (eds.) Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994. p. 235-242. Elsevier, Amsterdam (1994).PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387Hofestädt, R.: Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In: Lim, H.A. (ed.) Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research. p. 331-340. World Scientific (1994).PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433Hofestädt, R., Ashauer, U.: Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In: Kunath, H. (ed.) Medizin und Information. p. 115-119. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471Hofestädt, R.: Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen. In: Pöppl, S.J., Lipinski, H.-G., and Mansky, T. (eds.) Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien. Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie. 77, p. 245-249. MMV, Medizin-Verl.,, München (1994).PUB
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596Hofestädt, R., Hörkens, U.: C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 14, 1-14 (1994).PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393Hofestädt, R.: Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse. In: Kampe, G. and Zeitz, M. (eds.) Simulationstechnik. Fortschritte in der Simulationstechnik. 9, p. 1-8. Vieweg, Wiesbaden (1994).PUB
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1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450Hofestädt, R., Krückeberg, F., Lengauer, T. eds: Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993. Informatik Aktuell. VIII, 214 (1993).PUB
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1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486Hofestädt, R., Lautenbach, K., Löffler, M.: Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung". Fachberichte Informatik, 16-93. Universitätf Koblenz, Koblenz (1993).PUB
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358Hofestädt, R.: Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie. 24, 169-177 (1993).PUB
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301Hofestädt, R.: Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In: Hunter, L., Searls, D., and Shavlik, J. (eds.) Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93. p. 181-189. AAAI Press, Menlo Park (1993).PUB
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456Hofestädt, R., Beerbohm, D., Huang, X.: Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten. Proceedings of the PARS 1993. PARS Notes. 12, p. 92-101. (1993).PUB
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590Hofestädt, R.: A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS). 11, 253-262 (1993).PUB
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542Hörkens, U., Hofestädt, R.: Cellular Automata Simulation Shell. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 325-330. Elsevier, Amsterdam (1992).PUB
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557Hofestädt, R., Müller, H.P.: The Simulation of Genetic Processes. In: Sydow, A. (ed.) Computational Systems Analysis. p. 532-528. Elsevier, Amsterdam (1992).PUB