183 Publikationen
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984737Orlov, Y. L., Chen, M., Kolchanov, N. A., and Hofestädt, R. (2023). BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration. Journal of Integrative Bioinformatics.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960309Allmer, J., Elloumi, M., Comin, M., and Hofestädt, R. (2021). Special Issue of the 1st International Applied Bioinformatics Conference (iABC'21). Journal of Integrative Bioinformatics 18.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2957504Brinkrolf, C., Ochel, L., and Hofestädt, R. (2021). VANESA: An open-source hybrid functional Petri net modeling and simulation environment in systems biology. Biosystems:104531.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2952999Ahsan, M. A., Liu, Y., Feng, C., Hofestädt, R., and Chen, M. (2021). OverCOVID: an integrative web portal for SARS-CoV-2 bioinformatics resources. Journal of integrative bioinformatics.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939859Friedrichs, M., Shoshi, A., Chmura, P. J., Ison, J., Schwämmle, V., Schreiber, F., Hofestädt, R., and Sommer, B. (2020). JIB.tools 2.0 – A Bioinformatics Registry for Journal Published Tools with Interoperability to bio.tools. Journal of Integrative Bioinformatics 16:20190059.PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937754Chen, M., Hofestädt, R., and Taubert, J. (2019). Integrative Bioinformatics: History and Future. Journal of integrative bioinformatics 16: 20192001.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938765Zolotareva, O., Saik, O. V., Königs, C., Bragina, E. Y., Goncharova, I. A., Freidin, M. B., Dosenko, V. E., Ivanisenko, V. A., and Hofestädt, R. (2019). Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects. Scientific Reports 9:16302.PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938754Zhu, L., Hofestädt, R., and Ester, M. (2019). Tissue-Specific Subcellular Localization Prediction Using Multi-Label Markov Random Fields. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 16, 1471-1482.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938395Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Saik, O. V., Zolotareva, O., Goncharova, I. A., Ivanisenko, V. A., Dosenko, V. E., and Hofestädt, R. (2019). “Identification of the genetic factors underlying comorbidity between bronchial asthma and hypertension” in EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, vol. 27, (London: Nature Publishing Group), 1035-1036.PUB | WoS
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B. M., Hofestädt, R., Schreiber, F., Kruse, O., and Sommer, B. (2018). Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. Journal of Integrative Bioinformatics 15:20180003.PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962349Hofestädt, R., Brinkrolf, C., and Reipke, P. (2018). “OMPetri: A New Petri Net Simulation Environment Based on OpenModelica” in Proceedings of the 2018 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology - ICBBT '18 (New York: ACM Press), 57-61.PUB | DOI
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962353Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Hofestädt, R., and Allmer, J. (2018). Visualization and Analysis of miRNAs Implicated in Amyotrophic Lateral Sclerosis Within Gene Regulatory Pathways. Studies in Health Technology and Informatics 253, 183-187.PUB | DOI
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V. A., Dosenko, V. E., and Bragina, E. Y. (2018). GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15:20180049.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515Saik, O. V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Goncharova, I. A., Dosenko, V. E., Zolotareva, O., Hofestädt, R., Lavrik, I. N., et al. (2018). Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics 11:15.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309Bragina, E. Y., Goncharova, I. A., Garaeva, A. F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A. A., Karpov, A. B., Semenova, Yulia, V., Zhalsanova, I. Z., Gomboeva, D. E., Saik, Olga, V., et al. (2018). Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15:20180052.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312Saik, Olga, V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Dosenko, V. E., Zolotareva, O., Choynzonov, E. L., Hofestädt, R., and Ivanisenko, V. A. (2018). Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15:20180054.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., Gurianova, V., Dons'koi, B., Freidin, M., et al. (2018). shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 15:20180053.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V., and Hofestädt, R. (2017). “KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs” in Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference, Hayn, D., and Schreier, G. eds. Studies in Health Technology and Informatics, vol. 236, (Amsterdam: IOS Press), 128-135.PUB | PDF | DOI
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2017 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962354Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., and Sacar Demirci, M. D. eds. (2017). Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016. Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik.PUB
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M., and D'Elia, D. (2017). The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS 18:101.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Hofestädt, R., and Allmer, J. (2017). Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 14.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C., and Hofestädt, R. (2017).“Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease”. Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense.PUB
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., Sommer, B., Hofestädt, R., and Chen, M. (2016). DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS 13:297.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V., and Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making 15:15.PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U., and Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology 13:1540007.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R., and Chen, M. (2015). Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis 4:e177.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626Allmer, J., Brinkrolf, C., Hofestädt, R., and Sacar Demirci, M. D. eds. (2015). Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015. Medizinische Informatik und Bioinformatik.PUB
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., Timmer, A., and Wege, D. (2015). Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine 54, 385-387.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586Popik, O. V., Sommer, B., Hofestädt, R., and Ivanisenko, V. A. (2014). “Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract)” in Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop, Sommer, B. ed. (Bielefeld: Bielefeld University), 9-10.PUB | PDF | DOI
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884Popik, O. V., Saik, O. V., Petrovskiy, E. D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I. N., and Ivanisenko, V. A. (2014). Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics 15:S7.PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259Hofestädt, R., and Shoshi, A. eds. (2014). German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014. Medizinische Informatik und Bioinformatik.PUB | Download (ext.)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C., and Timmer, A. (2014). How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine 53, 333-335.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D., and Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics 11, 239.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2014 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693Chen, M., and Hofestädt, R. eds. (2014). Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. Berlin: Springer.PUB
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695Giegerich, R., Hofestädt, R., and Nattkemper, T. W. eds. (2014). German Conference on Bioinformatics 2014. GI-Edition: lecture notes in informatics 235.PUB
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694Chen, M., and Hofestädt, R. (2014). “Integrative Bioinformatics” in Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell, Chen, M., and Hofestädt, R. eds. (Berlin: Springer), 3-19.PUB
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2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709280Shoshi, A., Ogultarhan, V., and Hofestädt, R. (2013). “KALIS - A web-based system for patient-specific risk assessment of drugs” in Proceedings of the 9 th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013, Schreiber, F., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., Czauderna, T., Schnee, R., and Weise, S. eds. 178-178.PUB
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P. S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A. V., Ivanisenko, V. A., Kolchanov, N. A., and Hofestädt, R. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11:1340005.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811Lee, H. - M., Dietz, K. - J., and Hofestädt, R. (2013). Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11:1340003.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701Hofestädt, R. (2013). Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus, 22.PUB
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C., and Timmer, A. (2013). More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine 52, 181-183.PUB | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B., and Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics 10, 226.PUB
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867Klenke, C., Janowski, S. J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., Hofestädt, R., Upile, T., Kaltschmidt, C., et al. (2012). Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One 7:e52718.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S. J., and Hofestädt, R. (2012). “A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica” in Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC), Laroque, C. ed. (Piscataway, NJ: IEEE), 1-13.PUB | DOI
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751Shoshi, A., Shoshi, A., and Hofestädt, R. (2012). “KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung” in Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Goltz, U., Magnor, M., Appelrath, H. - J., Matthies, H. K., Balke, W. - T., and Wolf, L. eds. GI-Edition. Proceedings, vol. 208, (Bonn: Ges. für Informatik), 1565-1574.PUB | Download (ext.)
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727Hofestädt, R., and Kolchanov, N. eds. (2012). German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012. Medizinische Informatik und Bioinformatik.PUB
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724Heiner, M., and Hofestädt, R. eds. (2012). Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets. CEUR workshop proceedings 852.PUB
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726Hofestädt, R. (2012). “Modeling aspects of the virtuell cell” in The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts (Novosibirsk: Russian Academy of Sciences), 122.PUB
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S. J., Töpel, T., and Hofestädt, R. (2011). “DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data” in Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427Hofestädt, R. (2011). “Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks” in Biological Petri Nets, Wingender, E. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition. (Amsterdam: IOS Press), 1-2.PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491Hofestädt, R., and Thelen, S. (2011). “Quantitative Modeling of Biochemical Networks” in Biological Petri Nets, Wingender, E. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition. (Amsterdam: IOS Press), 3-16.PUB
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523Chen, M., and Hofestädt, R. (2011). “Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell” in Biological Petri Nets, Wingender, E. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 162, 1. Edition. (Amsterdam: IOS Press), 38-55.PUB
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112Chen, M., Hu, M., and Hofestädt, R. (2011). A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology 164, 338-352.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., and Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics 27, 3321-3322.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209Hofestädt, R. (2011). “Fundamental Features of Metabolic Computing” in Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II, Batyrshin, I., and Sidorov, G. eds. Lecture Notes in Computer Science, vol. 7095, (Berlin, Heidelberg: Springer), 143-152.PUB | DOI
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski, S. J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., et al. (2011). “Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing” in Biological Petri Nets, Wingender, E. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 162, (Amsterdam: IOS Press), 182-203.PUB | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607Lee, H. - M., Dietz, K. - J., and Hofestädt, R. (2010). Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue) 7, 23-34.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., and Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics 7:142.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S. J., and Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics 7, 3-8.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S. J., and Hofestädt, R. (2010). “DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data” in Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik LNI, vol. 176, (Bonn: Ges. für Informatik), 720-725.PUB
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2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605Hofestädt, R., and Kolchanov, N. eds. (2010). Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology. Medizinische Informatik und Bioinformatik.PUB
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F., and Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation 31, E1081-E1088.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer, B., Tiys, E. S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S. J., Ivanisenko, T. V., Bragin, A. O., Arrigo, P., Demenkov, P. S., Kochetov, A. V., et al. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics 7, 148.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski, S. J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P., et al. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology 10, 27-48.PUB
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120Hofestädt, R. (2009). DNA-Programming Language of Life. HBSO 13, 68-72.PUB
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W., and Türker, C. (2009). “Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle” in Informatik 2009, Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk, R. eds. LNI, vol. 154, (Bonn: Ges. für Informatik), 33-34.PUB
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644Chen, M., and Hofestädt, R. eds. (2009). Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou.PUB
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., and Hofestädt, R. (2009). “CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases” in Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck, Fischer, S., Maehle, E., and Reischuk , R. eds. (Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI), 704-708.PUB | Download (ext.)
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2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295Hofestädt, R., and Töpel, T. eds. (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. 4, Aachen: Shaker.PUB
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350Hofestädt, R. (2008).“DNA - Programming Language of Life?”. Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia.PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R., and Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease 31, 289.PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., and Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007 4, 63-74.PUB
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A., and Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics 5, 343-349.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044Hofestädt, R. (2007). Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology 5, 457-466.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., and Hofestädt, R. (2007). “VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data.” in Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).PUB
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., and Hofestädt, R. (2007). “SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information” in Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.PUB
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2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320Hofestädt, R., and Töpel, T. eds. (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. 3, Aachen: Shaker.PUB
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256Töpel, T., Neumann, J., and Hofestädt, R. (2007). “A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS” in Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007), Kokol, P. ed. (Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society), 7-11.PUB
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S., and Trefz, F. K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 30, 3.PUB | WoS
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2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343Hofestädt, R., and Töpel, T. eds. (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. 2, Aachen: Shaker.PUB
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D., and Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics 5, 115-118.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
-
2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848Kolchanov, N., Hofestädt, R., and Milanesi, L. eds. (2006). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. 1. Edition. New York: Springer.PUB
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332Hofestädt, R. (2006). “An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences.” in Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006, Hofestädt, R., and Kolchanov, N. eds., vol. 1, (Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics), 48-52.PUB
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589Chen, M., and Hofestädt, R. (2006). Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc 1, 228-231.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367Trefz, F. K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., and Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 29, 84.PUB | WoS
-
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808Chen, M., and Hofestädt, R. (2006). A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS 39, 147-159.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361Trefz, F. K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., and Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE 29, 84.PUB | WoS
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350Chen, M., and Hofestädt, R. (2005). “Prediction and Alignment of Metabolic Pathways” in Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II, Kolchanov, N. A., Hofestädt, R., and Milanesi, L. eds. (New York: Springer), 355-365.PUB
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271Chen, M., and Hofestädt, R. (2005). An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology 5, 111-128.PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856Hofestädt, R., and Töpel, T. (2005). “Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning” in Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms, Seiffert, U., Jain, L., and Schweizer, P. eds. Studies in Fuzziness and Soft Computing, vol. 176, 1. Edition. (Berlin: Springer), 1-24.PUB
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2005 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634Hofestädt, R. ed. (2005). Yearbook Bioinformatics 2004. 1, 1. Edition. Bonn: Köllen.PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874Chen, M., Freier, A., and Hofestädt, R. (2005). “Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways” in Handbook of Genome Research, Sensen, C. ed., vol. 2, 1. Edition. (Weinheim: Wiley-VCH), 461-490.PUB
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654Hofestädt, R. (2005). Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology 5, 81-82.PUB
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364Hofestädt, R. (2005). “Bioinformatik” in Handbuch der Medizinischen Informatik, Lehmann, T. ed. 2., vollst. neu bearb. Aufl. (München: Hanser), 253-298.PUB
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766Hofestädt, R., and Chen, M. (2004). “Metabolic Pathway Prediction/Alignment” in Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, vol. 2, 68-72.PUB
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758Hofestädt, R., and Lenhof, H. - P. eds. (2004). Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik 46.PUB
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2004 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812Kolchanov, N., and Hofestädt, R. eds. (2004). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. 1. Edition. Boston: Kluwer Academic.PUB
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762Hofestädt, R., and Lenhof, H. - P. (2004). Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik 46, 3-4.PUB
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774Chen, M., and Hofestädt, R. (2004). PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics 3, 241-252.PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
-
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526Chen, M., and Hofestädt, R. (2004). Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE 3, 192-199.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778Hofestädt, R., Freier, A., and Lange, M. (2003). “Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling” in Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Kolčanov, N. A., and Hofestädt, R. eds. (Boston: Kluwer).PUB
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607Kolchanov, N., and Hofestädt, R. (2003). The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology 3.PUB
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667Chen, M., and Hofestädt, R. (2003). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology 3, 347-365.PUB | PubMed | Europe PMC
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610Freier, A., Hofestädt, R., and Lange, M. (2003). IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology 3, 215-227.PUB | PubMed | Europe PMC
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2002 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797Collado-Vides, J., and Hofestädt, R. eds. (2002). Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. Cambridge, Mass.: MIT Press.PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795Hofestädt, R. (2002). “Bioinformatics” in Medical imaging informatics, Haux, R. ed. Yearbook of Medical Informatics, vol. 2002, (Stuttgart: Schattauer), 581-583.PUB
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624Hofestädt, R., Kolchanov, N., and Reinitz, J. (2002). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology 2, 35.PUB
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., and Stephanik, A. (2002). BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology 2, 37-57.PUB | PubMed | Europe PMC
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2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798Hofestädt, R., and Schnee, R. (2002). Studien- und Forschungsführer Bioinformatik. 1. Edition. Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag.PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867Freier, A., Hofestädt, R., and Töpel, T. (2002). “Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling” in Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications, Borlak, J. ed. 1. Edition. (Weinheim: Wiley-VCH), 233-252.PUB
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838Freier, A., Hofestädt, R., and Lange, M. (2002). “IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks” in Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research, Kolčanov, N. A. ed., vol. 2, 123-125.PUB
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845Hofestädt, R., and Töpel, T. (2002). “Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data” in Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002), Kokol, P. ed. (Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society), 129-133.PUB
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., and Scholz, U. (2002). “Information Fusion and Metabolic Network Control” in Gene Regulation and Metabolism, Collado-Vides, J., and Hofestädt, R. eds. (Cambridge, Mass.: MIT Press), 49-84.PUB
-
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818Töpel, T., and Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik 14, 315.PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T., and Scholz, U. (2001). “Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases” in Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics, Patel, V. L. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 84, (Amsterdam: IOS Press), 353-356.PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481Hofestädt, R., Lange, M., and Scholz, U. (2001). “Molecular Information Fusion for Metabolic Networks” in Gene Families, Xue, G., Xue, Y., Xu, Z., and Holmes, R. eds. (Singapore: World Scientific), 221-232.PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854Hofestädt, R., Freier, A., and Lange, M. (2001). “The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks” in Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology 38-43.PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D., and Trefz, F. K. (2001). “RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation” in Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics, Patel, V. L. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 84, (Amsterdam: IOS Press), 970-974.PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M., and Freier, A. (2001). “Metabolic Information Control System” in Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics, Callaos, N. ed. (Orlando, Fla.: IIIS).PUB
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899Hofestädt, R., Reinitz, J., and Kolchanov, N. (2001). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik 22, 37.PUB
-
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863Hofestädt, R. (2000). “Electronical infrastructure for the detection of inborn errors” in Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Kolčanov, N. A. ed., vol. 1, 212-213.PUB
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2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913Hofestädt, R., Pleißner, K. - P., and Stephanik, A. (2000). Informationssysteme in der Biotechnologie. Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg.PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M., and Scholz, U. (2000).“An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks”. Presented at the World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Berlin, Germany.PUB
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2000 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010Hofestädt, R. ed. (2000). Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. Berlin: BIOCOM.PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895Hofestädt, R., Mischke, U., and Scholz, U. (2000). “Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism” in Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000, Hasman, A. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 77, (Amsterdam: IOS Press), 857-862.PUB
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M., and Schulze-Kremer, S. (2000). “Logical and Semantic Database Integration” in IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering (Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society), 77-80.PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013Hofestädt, R. (1999). Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum 22, 385-390.PUB
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999Hofestädt, R., Lange, M., and Scholz, U. (1999). “Molecular Information Fusion for Metabolic Networks” in Courses of The First International Bioinformatics Summer School.PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M., and Scholz, U. (1999). Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe 68, 12-15.PUB
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., and Scholz, U. (1999). “MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks” in Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99, Wingender, E., Hofestädt, R., Giegerich, R., Lengauer, T., Mewes, W., Schomburg, D., and Vingron, M. eds. (Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics), 190-194.PUB
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015Hofestädt, R. (1999). Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal 99, 12-13.PUB
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M., and Michal, G. eds. (1998). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways. Dagstuhl-Seminar-Report 215.PUB
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682Hofestädt, R. ed. (1998). Molekulare Bioinformatik. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik.PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384Hofestädt, R., and Scholz, U. (1998). Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems 47, 91-102.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
-
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M., and Scholz, U. (1998). “Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control” in Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98), vol. 1, 86-89.PUB
-
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G., and Scholz, U. (1998). “Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics” in Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings, Litwin, W., Morzy, T., and Vossen, G. eds. Lecture Notes in Computer Science, vol. 1475, (Berlin: Springer Publishing), 296-304.PUB
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253Hofestädt, R. (1998). “An Integrative Molecular Information System” in MedInfo ’98, Cesnik, B., McCray, A. T., and Scherrer, J. - R. eds. Studies in health technology and informatics, vol. 52, (Amsterdam: IOS Press), 361-365.PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U., and Urban, H. (1998). Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal 3, 29-40.PUB
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291Hofestädt, R., and Thelen, S. (1998). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology 1, 39-53.PUB
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1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355Hofestädt, R. (1997). Computer Science and Biology. Biosystems 43, 69-71.PUB
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1997 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702Hofestädt, R., Lengauer, T., Löffler, M., and Schomburg, D. eds. (1997). Bioinformatics. LNCS, 1278, 1. Edition. Berlin: Springer.PUB
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1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666Hofestädt, R., and Lim, H. eds. (1997). Molecular Bioinformatics. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik.PUB
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441Hofestädt, R. (1997). “Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements” in Arbeitsplatz-Rechensysteme, Steigner, C. ed. (Koblenz: Fölbach Publishing), 285-292.PUB
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458Hofestädt, R. (1997). “Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases)” in Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing, vol. 3, (Aachen: Mainz), 2293-2297.PUB
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735Hofestädt, R., Herre, H., and Trefz, F. (1996). Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen. Informatik-Berichte, 9, Leipzig: Universität Leipzig.PUB
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1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707Hofestädt, R. (1996). “Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors” in Medical Informatics Europe '96, Brender, J. ed. Studies in health technology and informatics, vol. 34, (Amsterdam: IOS Press), 542-546.PUB
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263Hofestädt, R. (1996). Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels. Medizinische Informatik und Bioinformatik, 1. Edition. Aachen: Shaker Verlag.PUB
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1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M., and Löffler, M. (1996). Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays 18, 333-335.PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
-
1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722Hofestädt, R., Lengauer, T., and Löffler, M. eds. (1996). Informatik in den Biowissenschaften. Informationstechnik und technische Informatik 38.PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773Hofestädt, R., Löffler, M., and Möller, K. (1995). Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn, 88.PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829Hofestädt, R. (1995). “Artificial Life” in Proceedings des Workshops "Artificial Life", Dautenhahn, K., and GMD-Forschungszentrum Informationstechnik eds. GMD-Studien, vol. 271, (Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik), 246.PUB
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1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Löffler, M., and Mavrovouniotis, M. eds. (1995). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation. Dagstuhl-Seminar-Report.PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803Hofestädt, R. (1995). “Metabolic Engineering” in Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation, Sydow, A. ed. (Amsterdam: Gordon and Breach), 321-326.PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815Hofestädt, R. (1995). “A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases” in Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics, Greenes, R. A., Petersen, H. E., and Protti, D. J. eds. (Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada), 994-999.PUB
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822Hofestädt, R., and Huang, X. (1995). “Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster” in Proceedings of APPT '95 (Publishing House of Electronics Industry), 344-347.PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784Hofestädt, R. (1995). Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe 13, 7-15.PUB
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789Hofestädt, R., and Meinecke, F. (1995). Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine 25, 321-334.PUB
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1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405Hofestädt, R., Großpietsch, K. - E., and Steigner, C. (1994). Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations. Fachberichte Informatik, 9-94, Koblenz: Universitätf Koblenz.PUB
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1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R., and Huang, X. (1994). “Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich” in Parallele Datenverarbeitung aktuell, Flieger, R., and Grebe, R. eds. (Amsterdam: IOS Press), 100-108.PUB
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427Hofestädt, R. (1994). Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten, 66-70.PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S., and Huang, X. (1994). “Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata” in Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994, Dekker, L., Smit, W., and Zuidervaart, J. eds. (Amsterdam: Elsevier), 235-242.PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387Hofestädt, R. (1994). “Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks” in Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research, Lim, H. A. ed. (World Scientific), 331-340.PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433Hofestädt, R., and Ashauer, U. (1994). “Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten” in Medizin und Information, Kunath, H. ed. (München: MMV, Medizin-Verl.,), 115-119.PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471Hofestädt, R. (1994). “Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen” in Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien, Pöppl, S. J., Lipinski, H. - G., and Mansky, T. eds. Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, vol. 77, (München: MMV, Medizin-Verl.,), 245-249.PUB
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596Hofestädt, R., and Hörkens, U. (1994). C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS) 14, 1-14.PUB
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393Hofestädt, R. (1994). “Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse” in Simulationstechnik, Kampe, G., and Zeitz, M. eds. Fortschritte in der Simulationstechnik, vol. 9, (Wiesbaden: Vieweg), 1-8.PUB
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1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450Hofestädt, R., Krückeberg, F., and Lengauer, T. eds. (1993). Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993. Informatik Aktuell, VIII, 214.PUB
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1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486Hofestädt, R., Lautenbach, K., and Löffler, M. (1993). Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung". Fachberichte Informatik, 16-93, Koblenz: Universitätf Koblenz.PUB
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358Hofestädt, R. (1993). Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 24, 169-177.PUB
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301Hofestädt, R. (1993). “Grammatical Formalization of Metabolic Processes” in Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93, Hunter, L., Searls, D., and Shavlik, J. eds. (Menlo Park: AAAI Press), 181-189.PUB
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456Hofestädt, R., Beerbohm, D., and Huang, X. (1993). “Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten” in Proceedings of the PARS 1993 PARS Notes, vol. 12, 92-101.PUB
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590Hofestädt, R. (1993). A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS) 11, 253-262.PUB
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542Hörkens, U., and Hofestädt, R. (1992). “Cellular Automata Simulation Shell” in Computational Systems Analysis, Sydow, A. ed. (Amsterdam: Elsevier), 325-330.PUB
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557Hofestädt, R., and Müller, H. P. (1992). “The Simulation of Genetic Processes” in Computational Systems Analysis, Sydow, A. ed. (Amsterdam: Elsevier), 532-528.PUB