183 Publikationen
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984737Orlov, Y. L., Chen, M., Kolchanov, N. A., & Hofestädt, R. (2023). BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. https://doi.org/10.1515/jib-2023-0032
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960309Allmer, J., Elloumi, M., Comin, M., & Hofestädt, R. (2021). Special Issue of the 1st International Applied Bioinformatics Conference (iABC'21). Journal of Integrative Bioinformatics, 18(4). https://doi.org/10.1515/jib-2021-0042
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2957504Brinkrolf, C., Ochel, L., & Hofestädt, R. (2021). VANESA: An open-source hybrid functional Petri net modeling and simulation environment in systems biology. Biosystems, 104531. https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2021.104531
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2952999Ahsan, M. A., Liu, Y., Feng, C., Hofestädt, R., & Chen, M. (2021). OverCOVID: an integrative web portal for SARS-CoV-2 bioinformatics resources. Journal of integrative bioinformatics. https://doi.org/10.1515/jib-2020-0046
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939859Friedrichs, M., Shoshi, A., Chmura, P. J., Ison, J., Schwämmle, V., Schreiber, F., Hofestädt, R., et al. (2020). JIB.tools 2.0 – A Bioinformatics Registry for Journal Published Tools with Interoperability to bio.tools. Journal of Integrative Bioinformatics, 16(4), 20190059. doi:10.1515/jib-2019-0059
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937754Chen, M., Hofestädt, R., & Taubert, J. (2019). Integrative Bioinformatics: History and Future. Journal of integrative bioinformatics, 16(3), 20192001. doi:10.1515/jib-2019-2001
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938765Zolotareva, O., Saik, O. V., Königs, C., Bragina, E. Y., Goncharova, I. A., Freidin, M. B., Dosenko, V. E., et al. (2019). Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects. Scientific Reports, 9(1), 16302. doi:10.1038/s41598-019-52762-w
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938754Zhu, L., Hofestädt, R., & Ester, M. (2019). Tissue-Specific Subcellular Localization Prediction Using Multi-Label Markov Random Fields. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 16(5), 1471-1482. doi:10.1109/TCBB.2019.2897683
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2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938395Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Saik, O. V., Zolotareva, O., Goncharova, I. A., Ivanisenko, V. A., Dosenko, V. E., et al. (2019). Identification of the genetic factors underlying comorbidity between bronchial asthma and hypertension. EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 27, 1035-1036. London: Nature Publishing Group.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930278Biere, N., Ghaffar, M., Doebbe, A., Jaeger, D., Rothe, N., Friedrich, B. M., Hofestädt, R., et al. (2018). Heuristic Modeling and 3D Stereoscopic Visualization of a Chlamydomonas reinhardtii Cell. Journal of Integrative Bioinformatics, 15(2), 20180003. https://doi.org/10.1515/jib-2018-0003
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962349Hofestädt, R., Brinkrolf, C., & Reipke, P. (2018). OMPetri: A New Petri Net Simulation Environment Based on OpenModelica. Proceedings of the 2018 10th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology - ICBBT '18, 57-61. New York: ACM Press. https://doi.org/10.1145/3232059.3232073
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962353Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Hofestädt, R., & Allmer, J. (2018). Visualization and Analysis of miRNAs Implicated in Amyotrophic Lateral Sclerosis Within Gene Regulatory Pathways. Studies in Health Technology and Informatics, 253, 183-187. https://doi.org/10.3233/978-1-61499-896-9-183
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933313Shoshi, A., Hofestädt, R., Zolotareva, O., Friedrichs, M., Maier, A., Ivanisenko, V. A., Dosenko, V. E., et al. (2018). GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4), 20180049. doi:10.1515/jib-2018-0049
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915515Saik, O. V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Goncharova, I. A., Dosenko, V. E., et al. (2018). Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. BMC Medical Genomics, 11(1), 15. doi:10.1186/s12920-018-0331-4
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933309Bragina, E. Y., Goncharova, I. A., Garaeva, A. F., Nemerov, Evgeniy, V., Babovskaya, A. A., Karpov, A. B., Semenova, Yulia, V., et al. (2018). Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4), 20180052. doi:10.1515/jib-2018-0052
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933312Saik, Olga, V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, Timofey, V., Bragina, E. Y., Freidin, M. B., Dosenko, V. E., Zolotareva, O., et al. (2018). Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4), 20180054. doi:10.1515/jib-2018-0054
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933310Drevytska, T., Morhachov, R., Tumanovska, L., Portnichenko, G., Nagibin, V., Boldyriev, O., Lapikova-Bryhinska, T., et al. (2018). shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 15(4), 20180053. doi:10.1515/jib-2018-0053
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912290Shoshi, A., Müller, U., Shoshi, A., Ogultarhan, V., & Hofestädt, R. (2017). KALIS – An eHealth system for biomedical risk analysis of drugs. In D. Hayn & G. Schreier (Eds.), Studies in Health Technology and Informatics: Vol. 236. Health Informatics Meets eHealth: Digital Insight – Information-Driven Health & Care. Proceedings of the 11th eHealth2017 Conference (pp. 128-135). Amsterdam: IOS Press. https://doi.org/10.3233/978-1-61499-759-7-128
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2017 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962354Allmer J., Brinkrolf C., Hofestädt R., & Sacar Demirci M. D. (Eds.) (2017). Computational Systems Biology: German/Turkish Network of Bioinformatics - Report 2016. Berichte aus der Medizinischen Informatik und Bioinformatik
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910493Romano, P., Hofestädt, R., Lange, M., & D'Elia, D. (2017). The joint NETTAB/Integrative Bioinformatics 2015 Meeting: aims, topics and outcomes. BMC BIOINFORMATICS, 18(S5), 101. doi:10.1186/s12859-017-1532-0
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916589Hamzeiy, H., Suluyayla, R., Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Hofestädt, R., & Allmer, J. (2017). Visualization and Analysis of MicroRNAs within KEGG Pathways using VANESA. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 14(1). doi:10.1515/jib-2016-0004
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2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2912298Shoshi, A., Zolotareva, O., Kleine, M., Königs, C., & Hofestädt, R. (2017). Integrative analysis of mechanism of drug action and potential impact on the disease. Presented at the 13th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2017, Odense.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909099Li, Q., Zhou, Y., Jiao, Y., Zhang, Z., Bai, L., Tong, L., Yang, X., et al. (2016). DaTo: an atlas of biological databases and tools. JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, 13(4), 297. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-297
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V., & Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making, 15(1), 15. https://doi.org/10.1186/s12911-015-0139-5
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U., & Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 13(1), 1540007. https://doi.org/10.1142/S0219720015400077
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901356Meng, X., Wang, J., Yuan, C., Li, X., Zhou, Y., Hofestädt, R., & Chen, M. (2015). Cancernet: a database for decoding multilevel molecular interactions across diverse cancer types. Oncogenesis, 4(12), e177. doi:10.1038/oncsis.2015.40
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2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901626Allmer J., Brinkrolf C., Hofestädt R., & Sacar Demirci M. D. (Eds.) (2015). Computational Systems Biology: German/Russian/Turkish Network of Computational Systems Biology - Report 2015. Medizinische Informatik und Bioinformatik
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2788891Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Huebnert, U., Knaup-Gregori, P., Ose, C., Schmoor, C., et al. (2015). Good Medicine and Good Healthcare Demand Good Information (Systems). Methods of Information in Medicine, 54(5), 385-387. doi:10.3414/ME15-05-1001
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704586Popik, O. V., Sommer, B., Hofestädt, R., & Ivanisenko, V. A. (2014). Evaluation and Visualization of Pathway Efficiency based on Subcellular Protein Localizations (Workshop Abstract). In B. Sommer (Ed.), Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (pp. 9-10). Bielefeld: Bielefeld University. https://doi.org/10.2390/biecoll-next2014-3
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710884Popik, O. V., Saik, O. V., Petrovskiy, E. D., Sommer, B., Hofestädt, R., Lavrik, I. N., & Ivanisenko, V. A. (2014). Analysis of signaling networks distributed over intracellular compartments based on protein-protein interactions. BMC Genomics, 15(Suppl 12), S7. doi:10.1186/1471-2164-15-S12-S7
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709259Hofestädt R., & Shoshi A. (Eds.) (2014). German/Russian Network of Computational Systems Biology- Report 2014. Medizinische Informatik und Bioinformatik
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705648Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Knaup-Gregori, P., Ose, C., & Timmer, A. (2014). How to Use Information Technology to Improve Medication Safety. Methods of Information in Medicine, 53(5), 333-335. doi:10.3414/ME14-10-0007
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf, C., Janowski, S. J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D., & Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics, 11(2), 239. doi:10.2390/biecoll-jib-2014-239
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2014 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901693Chen M., & Hofestädt R. (Eds.) (2014). Approaches in Integrative Bioinformatics - Towards the Virtual Cell. Berlin: Springer.
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695Giegerich R., Hofestädt R., & Nattkemper T. W. (Eds.) (2014). German Conference on Bioinformatics 2014. GI-Edition: lecture notes in informatics, 235
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2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901694Chen, M., & Hofestädt, R. (2014). Integrative Bioinformatics. In M. Chen & R. Hofestädt (Eds.), Approaches in integrative bioinformatics. Towards the virtual cell (pp. 3-19). Berlin: Springer.
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2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709280Shoshi, A., Ogultarhan, V., & Hofestädt, R. (2013). KALIS - A web-based system for patient-specific risk assessment of drugs. In F. Schreiber, R. Hofestädt, M. Lange, U. Scholz, T. Czauderna, R. Schnee, & S. Weise (Eds.), Proceedings of the 9 th International Symposium on Integrative Bioinformatics 2013 (pp. 178-178).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P. S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A. V., et al. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340005. https://doi.org/10.1142/S0219720013400052
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811Lee, H. - M., Dietz, K. - J., & Hofestädt, R. (2013). Computational construction of specialized biological networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01), 1340003. doi:10.1142/S0219720013400039
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901701Hofestädt, R. (2013). Computerunterstützte Diagnose von Erkrankungen. Management & Krankenhaus(4), 22.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613116Winter, A., Hilgers, R. - D., Hofestädt, R., Knaup-Gregorit, P., Ose, C., & Timmer, A. (2013). More than Four Decades of Medical Informatics Education for Medical Students in Germany. New Recommendations Published. Methods Of Information In Medicine, 52(3), 181-183.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B., & Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics, 10(1), 226.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2545867Klenke, C., Janowski, S. J., Borck, D., Widera, D., Ebmeyer, J., Kalinowski, J., Leichtle, A., et al. (2012). Identification of Novel Cholesteatoma-related Gene Expression Signatures Using Full-genome Microarrays. PLoS One, 7(12), e52718. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0052718
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901730Proß, S., Bachmann, B., Janowski, S. J., & Hofestädt, R. (2012). A New Object-Oriented Petri Net Simulation Environment Based On Modelica. In C. Laroque (Ed.), Proceedings of the 2012 Winter Simulation Conference (WSC) (pp. 1-13). Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/WSC.2012.6465287
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547751Shoshi, A., Shoshi, A., & Hofestädt, R. (2012). KAIS: Ein webbasiertes System zur patientenindividuellen Arzneimittel-Interaktionsprüfung. In U. Goltz, M. Magnor, H. - J. Appelrath, H. K. Matthies, W. - T. Balke, & L. Wolf (Eds.), GI-Edition. Proceedings: Vol. 208. Informatik 2012: was bewegt uns in der/die Zukunft? 42. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI) (pp. 1565-1574). Bonn: Ges. für Informatik.
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901727Hofestädt R., & Kolchanov N. (Eds.) (2012). German/Russian Network of Computational Systems Biology: Report 2012. Medizinische Informatik und Bioinformatik
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2012 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901724Heiner M., & Hofestädt R. (Eds.) (2012). Biological Processes & Petri Nets. Proceedings of the 3rd International Workshop on Bioogical Processes & Petri Nets. CEUR workshop proceedings, 852
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901726Hofestädt, R. (2012). Modeling aspects of the virtuell cell. The Eighth International Conference on Bioinformatics of enome Regulation and Structur\Systems Biology. Abstracts, 122. Novosibirsk: Russian Academy of Sciences.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S. J., Töpel, T., & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427Hofestädt, R. (2011). Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks. In E. Wingender (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 162. Biological Petri Nets (1. Edition., pp. 1-2). Amsterdam: IOS Press.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491Hofestädt, R., & Thelen, S. (2011). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. In E. Wingender (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 162. Biological Petri Nets (1. Edition., pp. 3-16). Amsterdam: IOS Press.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523Chen, M., & Hofestädt, R. (2011). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In E. Wingender (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 162. Biological Petri Nets (1. Edition., pp. 38-55). Amsterdam: IOS Press.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112Chen, M., Hu, M., & Hofestädt, R. (2011). A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes. Applied Biochemistry and Biotechnology, 164(3), 338-352. https://doi.org/10.1007/s12010-010-9138-2
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B., & Spangardt, S. (2011). Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing, 10(3), 1077-1097. https://doi.org/10.1007/s11047-009-9151-y
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr557
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209Hofestädt, R. (2011). Fundamental Features of Metabolic Computing. In I. Batyrshin & G. Sidorov (Eds.), Lecture Notes in Computer Science: Vol. 7095. Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II (pp. 143-152). Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-25330-0_13
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski, S. J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., et al. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In E. Wingender (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 162. Biological Petri Nets (pp. 182-203). Amsterdam: IOS Press.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602Kormeier, B., Hippe, K., & Hofestädt, R. (2011). Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology, 53(5), 241-249. https://doi.org/10.1524/itit.2011.0649
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607Lee, H. - M., Dietz, K. - J., & Hofestädt, R. (2010). Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue), 7(3), 23-34. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2010-130
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 142. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2010-142
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S. J., & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2), 3-8. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2010-146
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S. J., & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik, LNI, 176, 720-725. Bonn: Ges. für Informatik.
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2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605Hofestädt R., & Kolchanov N. (Eds.) (2010). Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology. Medizinische Informatik und Bioinformatik
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F., & Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation, 31(1), E1081-E1088. https://doi.org/10.1002/humu.21169
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer, B., Tiys, E. S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S. J., Ivanisenko, T. V., Bragin, A. O., et al. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 148. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2010-148
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski, S. J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., et al. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383120Hofestädt, R. (2009). DNA-Programming Language of Life. HBSO, 13(1), 68-72.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383132Hofestädt, R., Kuhn, K., Müller, W., & Türker, C. (2009). Daten in den Lebenswissenschaften. Vom Paper über Datenbanken zur integrierten Informationsquelle. In S. Fischer, E. Maehle, & R. Reischuk (Eds.), LNI: Vol. 154. Informatik 2009 (pp. 33-34). Bonn: Ges. für Informatik.
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2009 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408644Chen M., & Hofestädt R. (Eds.) (2009). Proceedings International Workshop on Computational & Integrative Biology. University Hanzhou.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383105Hofestädt, R., & Mayr, E. - W. (2009). Bioinformatik. Informatik Spektrum, 32(4), 285-286. https://doi.org/10.1007/s00287-009-0353-6
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T., & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle, & R. Reischuk (Eds.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (pp. 704-708). Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).
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2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295Hofestädt R., & Töpel T. (Eds.) (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007 (4). Aachen: Shaker.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383350Hofestädt, R. (2008). DNA - Programming Language of Life?. Presented at the BGRS'08, Novosibirsk, Russia.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., & Hofestädt, R. (2008). Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. https://doi.org/10.1038/npre.2008.1943.1
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R., & Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease, 31, 289.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., & Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 4, 63-74.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A., & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2), 343-349. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2008-93
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378044Hofestädt, R. (2007). Extended Backus-systems for the representation and specification of the genome. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 5(02b), 457-466. https://doi.org/10.1142/S0219720007002904
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B., & Hofestädt, R. (2007). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07)
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T., & Hofestädt, R. (2007). SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems
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2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320Hofestädt R., & Töpel T. (Eds.) (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006 (3). Aachen: Shaker.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409256Töpel, T., Neumann, J., & Hofestädt, R. (2007). A medical case-based reasoning component for the rare metabolic diseases database RAMEDIS. In P. Kokol (Ed.), Proceedings. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2007) (pp. 7-11). Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S., & Trefz, F. K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, 30(Suppl. 1), 3.
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2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343Hofestädt R., & Töpel T. (Eds.) (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005 (2). Aachen: Shaker.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D., & Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics, 5(2), 115-118. https://doi.org/10.2165/00822942-200605020-00006
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2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376848Kolchanov N., Hofestädt R., & Milanesi L. (Eds.) (2006). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II 1. Edition. New York: Springer.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394332Hofestädt, R. (2006). An extended Backus System for the presentation and analysis of DNA sequences. In R. Hofestädt & N. Kolchanov (Eds.), Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure; BGRS'2006 (Vol. 1, pp. 48-52). Novosibirsk: Russian Academy of Sciences Siberian Branch; Institute of Cytology and Genetics.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409287Prins, B., & Hofestädt, R. (2006). MILAN - A medical information-system linking agents to metabolic networks. Journal of Integrative Bioinformatics, 3(2), 282-294. https://doi.org/10.2390/biecoll-jib-2006-45
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946589Chen, M., & Hofestädt, R. (2006). Integrative analysis of metabolic disorders by means of medical bioinformatics. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 1, 228-231. https://doi.org/10.1109/IEMBS.2005.1616385
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367Trefz, F. K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., & Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, 29(Suppl. 1), 84.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599808Chen, M., & Hofestädt, R. (2006). A medical bioinformatics approach for metabolic disorders: Biomedical data prediction, modeling, and systematic analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 39(2), 147-159. https://doi.org/10.1016/j.jbi.2005.05.005
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361Trefz, F. K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G., & Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders. JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE, 29(Suppl. 1), 84.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394350Chen, M., & Hofestädt, R. (2005). Prediction and Alignment of Metabolic Pathways. In N. A. Kolchanov, R. Hofestädt, & L. Milanesi (Eds.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II (pp. 355-365). New York: Springer.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378271Chen, M., & Hofestädt, R. (2005). An Algorithm for Linear Metabolic Pathway Alignment. In Silico Biology, 5(2), 111-128.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856Hofestädt, R., & Töpel, T. (2005). Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning. In U. Seiffert, L. Jain, & P. Schweizer (Eds.), Studies in Fuzziness and Soft Computing: Vol. 176. Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (1. Edition., pp. 1-24). Berlin: Springer.
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2005 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376634Hofestädt R. (Ed.) (2005). Yearbook Bioinformatics 2004 (1) 1. Edition. Bonn: Köllen.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376874Chen, M., Freier, A., & Hofestädt, R. (2005). Bioinformatics Approaches for Metabolic Pathways. In C. Sensen (Ed.), Handbook of Genome Research (1. Edition., Vol. 2, pp. 461-490). Weinheim: Wiley-VCH.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378654Hofestädt, R. (2005). Dagstuhl Seminar on Integrative Bioinformatics. In Silico Biology, 5(2), 81-82.
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2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394364Hofestädt, R. (2005). Bioinformatik. In T. Lehmann (Ed.), Handbuch der Medizinischen Informatik (2., vollst. neu bearb. Aufl., pp. 253-298). München: Hanser.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394766Hofestädt, R., & Chen, M. (2004). Metabolic Pathway Prediction/Alignment. Proceedings of the Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 2, 68-72.
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2004 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394758Hofestädt R., & Lenhof H. - P. (Eds.) (2004). Schwerpunktthema Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik, 46(1)
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2004 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376812Kolchanov N., & Hofestädt R. (Eds.) (2004). Bioinformatics of Genome Regulation and Structure 1. Edition. Boston: Kluwer Academic.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394762Hofestädt, R., & Lenhof, H. - P. (2004). Molekulare Bioinformatik. Informationstechnik und technische Informatik, 46(1), 3-4.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394774Chen, M., & Hofestädt, R. (2004). PathAligner: Metabolic Pathway Retrieval and Alignment. Applied Bioinformatics, 3(4), 241-252. https://doi.org/10.2165/00822942-200403040-00006
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606526Chen, M., & Hofestädt, R. (2004). Web-based information retrieval system for the prediction of metabolic pathways. IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 3(3), 192-199. https://doi.org/10.1109/TNB.2004.833691
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773836Chen, M., Lin, S., & Hofestädt, R. (2004). STCDB: Signal Transduction Classification Database. Nucleic Acids Research, 32(90001), D456-D458. https://doi.org/10.1093/nar/gkh079
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2003 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394778Hofestädt, R., Freier, A., & Lange, M. (2003). Integrative analysis of gene networks using dynamic process pattern modelling. In N. A. Kolčanov & R. Hofestädt (Eds.), Bioinformatics of Genome Regulation and Structure Boston: Kluwer.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378607Kolchanov, N., & Hofestädt, R. (2003). The 3rd International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure. In Silico Biology, 3(2)
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378667Chen, M., & Hofestädt, R. (2003). Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In Silico Biology, 3(3), 347-365.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378610Freier, A., Hofestädt, R., & Lange, M. (2003). IIUDB: An Object-Oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In Silico Biology, 3(2), 215-227.
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2002 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394797Collado-Vides J., & Hofestädt R. (Eds.) (2002). Gene Regulation and Metabolism. Post-Genomic Computational Approaches. Cambridge, Mass.: MIT Press.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394795Hofestädt, R. (2002). Bioinformatics. In R. Haux (Ed.), Yearbook of Medical Informatics: Vol. 2002. Medical imaging informatics (pp. 581-583). Stuttgart: Schattauer.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378624Hofestädt, R., Kolchanov, N., & Reinitz, J. (2002). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. In Silico Biology, 2(2), 35.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378648Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., Scholz, U., & Stephanik, A. (2002). BioDataServer: A SQL-based service for the online integration of life science data. In Silico Biology, 2(2), 37-57.
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2002 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376798Hofestädt, R., & Schnee, R. (2002). Studien- und Forschungsführer Bioinformatik 1. Edition. Heidelberg: Spektrum Akademischer Verlag.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867Freier, A., Hofestädt, R., & Töpel, T. (2002). Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In J. Borlak (Ed.), Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (1. Edition., pp. 233-252). Weinheim: Wiley-VCH.
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394838Freier, A., Hofestädt, R., & Lange, M. (2002). IIUDB: An Object-oriented System for Modelling, Integration and Analysis of Gene Controlled Metabolic Networks. In N. A. Kolčanov (Ed.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (Vol. 2, pp. 123-125).
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845Hofestädt, R., & Töpel, T. (2002). Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In P. Kokol (Ed.), Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (pp. 129-133). Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
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2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394806Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., & Scholz, U. (2002). Information Fusion and Metabolic Network Control. In J. Collado-Vides & R. Hofestädt (Eds.), Gene Regulation and Metabolism (pp. 49-84). Cambridge, Mass.: MIT Press.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818Töpel, T., & Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik, 14(3), 315.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T., & Scholz, U. (2001). Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases. In V. L. Patel (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 84. Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (pp. 353-356). Amsterdam: IOS Press.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378481Hofestädt, R., Lange, M., & Scholz, U. (2001). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. In G. Xue, Y. Xue, Z. Xu, & R. Holmes (Eds.), Gene Families (pp. 221-232). Singapore: World Scientific.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394854Hofestädt, R., Freier, A., & Lange, M. (2001). The electronical infrastructure for the analysis of metabolic networks. Abstracts' Book of the Workshop on CORBA and XML: Towards a Bioinformatics Integrated Network Environment, NETTAB 2001 - Network Tools and Applications in Biology, 38-43.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D., & Trefz, F. K. (2001). RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation. In V. L. Patel (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 84. Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (pp. 970-974). Amsterdam: IOS Press.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394959Stephanik, A., Hofestädt, R., Lange, M., & Freier, A. (2001). Metabolic Information Control System. In N. Callaos (Ed.), Proceedings. World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics Orlando, Fla.: IIIS.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394899Hofestädt, R., Reinitz, J., & Kolchanov, N. (2001). Information and Simulation Systems for the Analysis of Gene Regulation and Metabolic Pathways. Preprint. Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Informatik, 22, 37.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396863Hofestädt, R. (2000). Electronical infrastructure for the detection of inborn errors. In N. A. Kolčanov (Ed.), Proceedings of the Second International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (Vol. 1, pp. 212-213).
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2000 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396913Hofestädt, R., Pleißner, K. - P., & Stephanik, A. (2000). Informationssysteme in der Biotechnologie. Magdeburg: Fakultät für Informatik, Universität Magdeburg.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396846Hofestädt, R., Freier, A., Lange, M., & Scholz, U. (2000). An integrated architecture for modelling and simulation of metabolic networks. Presented at the World Congress on Biotechnology, 11th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Berlin, Germany.
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2000 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397010Hofestädt R. (Ed.) (2000). Bioinformatik 2000 - Forschungsführer Informatik in den Biowissenschaften. Berlin: BIOCOM.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396895Hofestädt, R., Mischke, U., & Scholz, U. (2000). Knowledge acquisition, management and representation for the diagnostic support in human inborn errors of metabolism. In A. Hasman (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 77. Medical infobahn for Europe: proceedings of MIE2000 and GMDS2000 (pp. 857-862). Amsterdam: IOS Press.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396922Hofestädt, R., Köhler, J., Lange, M., & Schulze-Kremer, S. (2000). Logical and Semantic Database Integration. IEEE International Symposium on Bio-Informatic and Biomedical Engineering, 77-80. Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397013Hofestädt, R. (1999). Bioinformatik 2000 - Von der Molekularen Biologie zum Metabolic Engineering. Informatik Spektrum, 22(5), 385-390.
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396999Hofestädt, R., Lange, M., & Scholz, U. (1999). Molecular Information Fusion for Metabolic Networks. Courses of The First International Bioinformatics Summer School
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397004Hofestädt, R., Mischke, U., Prüß, M., & Scholz, U. (1999). Metabolic Drug Pointing and Information Processing. Medical Informatics Europe, 68, 12-15.
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396954Collado-Vides, J., Hofestädt, R., Mavrovouniotis, M., & Michal, G. (1999). Modeling and simulation of gene regulation and metabolic pathways. BioSystems, 49(1), 79-82. https://doi.org/10.1016/S0303-2647(98)00081-1
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396985Freier, A., Hofestädt, R., Lange, M., & Scholz, U. (1999). MARGBench - An Approach for Integration, Modeling and Animation of Metabolic Networks. In E. Wingender, R. Hofestädt, R. Giegerich, T. Lengauer, W. Mewes, D. Schomburg, & M. Vingron (Eds.), Computer science and biology : proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB '99 (pp. 190-194). Braunschweig: GBF-Braunschweig, Dep. of Bioinformatics.
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397015Hofestädt, R. (1999). Das Bioinformatik-Dilemma. Laborjournal, 99(10), 12-13.
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398939Collado-Vides J., Hofestädt R., Mavrovouniotis M., & Michal G. (Eds.) (1998). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation and Metabolic Pathways. Dagstuhl-Seminar-Report, 215
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1998 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376682Hofestädt R. (Ed.) (1998). Molekulare Bioinformatik. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2461384Hofestädt, R., & Scholz, U. (1998). Information processing for the analysis of metabolic pathways and inborn errors. Biosystems, 47(1-2), 91-102. doi:10.1016/S0303-2647(98)00015-X
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398966Hofestädt, R., Freier, A., Höding, M., Lange, M., & Scholz, U. (1998). Molecular Database Integration: Analysis of Metabolic Network Control. Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'98), 1, 86-89.
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399037Hofestädt, R., Höding, M., Saake, G., & Scholz, U. (1998). Scheme Derivation for WWW Information Sources and their Integration with Databases in Bioinformatics. In W. Litwin, T. Morzy, & G. Vossen (Eds.), Lecture Notes in Computer Science: Vol. 1475. Advances in databases and information systems. Second East European Symposium ; Proceedings (pp. 296-304). Berlin: Springer Publishing.
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399253Hofestädt, R. (1998). An Integrative Molecular Information System. In B. Cesnik, A. T. McCray, & J. - R. Scherrer (Eds.), Studies in health technology and informatics: Vol. 52. MedInfo ’98 (pp. 361-365). Amsterdam: IOS Press.
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399272Hofestädt, R., Prüß, M., Scholz, U., & Urban, H. (1998). Molekulare Bioinformatik- Molekulare Informationssysteme zur Erkennung von angeborenen Stoffwechselerkrankungen. Magdeburger Wissenschaftsjournal, 3(1), 29-40.
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1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399291Hofestädt, R., & Thelen, S. (1998). Quantitative Modeling of Biochemical Networks. Silico Biology, 1(1), 39-53.
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1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399355Hofestädt, R. (1997). Computer Science and Biology. Biosystems, 43, 69-71.
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1997 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376702Hofestädt R., Lengauer T., Löffler M., & Schomburg D. (Eds.) (1997). Bioinformatics (LNCS, 1278) 1. Edition. Berlin: Springer.
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1997 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376666Hofestädt R., & Lim H. (Eds.) (1997). Molecular Bioinformatics. Berichte aus der medizinischen Informatik und Bioinformatik
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399441Hofestädt, R. (1997). Herausforderungen des elektronischen Krankenhausmanagements. In C. Steigner (Ed.), Arbeitsplatz-Rechensysteme (pp. 285-292). Koblenz: Fölbach Publishing.
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1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399458Hofestädt, R. (1997). Algorithms for the Microscopic and Macroscopic Analysis of Metabolic Processes (Diseases). Proceedings. 5th European Congress on Intelligent Techniques and Soft Computing, 3, 2293-2297. Aachen: Mainz.
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399735Hofestädt, R., Herre, H., & Trefz, F. (1996). Computerunterstützte Erkennung von Stoffwechselerkrankungen (Informatik-Berichte, 9). Leipzig: Universität Leipzig.
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1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378570Hofestädt, R., Huang, X., & Beerbohm, D. (1996). Simulation of load balancing with cellular automata. Simulation Practice and Theory, 4(2), 81-96. https://doi.org/10.1016/0928-4869(95)00045-3
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1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399707Hofestädt, R. (1996). Integrative Database Analysis for the Detection of Inborn Errors. In J. Brender (Ed.), Studies in health technology and informatics: Vol. 34. Medical Informatics Europe '96 (pp. 542-546). Amsterdam: IOS Press.
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1996 | Monographie | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378263Hofestädt, R. (1996). Theorie der regelbasierten Modellierung des Zellstoffwechsels (Medizinische Informatik und Bioinformatik) 1. Edition. Aachen: Shaker Verlag.
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1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399698Hofestädt, R., Colado-Vides, J., Mavrovouniotis, M., & Löffler, M. (1996). Modelling and Simulation of Metabolic Pathways, Gene Regulation and Cell Differentiation. BioEssays, 18(4), 333-335. https://doi.org/10.1002/bies.950180412
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1996 | Sonderausgabe Zeitschrift | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399722Hofestädt R., Lengauer T., & Löffler M. (Eds.) (1996). Informatik in den Biowissenschaften. Informationstechnik und technische Informatik, 38(5)
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399773Hofestädt, R., Löffler, M., & Möller, K. (1995). Modellierung des Immunsystems. Informatik Bericht Universität Bonn, 88.
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399829Hofestädt, R. (1995). Artificial Life. In K. Dautenhahn & GMD-Forschungszentrum Informationstechnik (Eds.), GMD-Studien: Vol. 271. Proceedings des Workshops "Artificial Life" (p. 246). Sankt Augustin: GMD-Forschungszentrum Informationstechnik.
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1995 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378599Collado-Vides J., Hofestädt R., Löffler M., & Mavrovouniotis M. (Eds.) (1995). Modelling and Simulation of Gene and Cell Regulation. Dagstuhl-Seminar-Report(130)
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399803Hofestädt, R. (1995). Metabolic Engineering. In A. Sydow (Ed.), Proceedings of the IMACS Symposium on Systems Analysis and Simulation (pp. 321-326). Amsterdam: Gordon and Breach.
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399815Hofestädt, R. (1995). A Rule Based System for the Detection of Metabolic Diseases. In R. A. Greenes, H. E. Petersen, & D. J. Protti (Eds.), Proceedings of the Eighth World Congress on Medical Informatics (pp. 994-999). Edmonton: Healthcare Computing & Communications Canada.
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1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399822Hofestädt, R., & Huang, X. (1995). Automaton-Based Load Balancing Simulation in a Workstation Cluster. Proceedings of APPT '95, 344-347. Publishing House of Electronics Industry.
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399784Hofestädt, R. (1995). Computer Science, Supercomputing and Biology - Bioinformatics. Journal EUROSIM - Simulation News Europe, 13, 7-15.
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1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2399789Hofestädt, R., & Meinecke, F. (1995). Interactive Modelling and Simulation of Biochemical Networks. Computers in Biology and Medicine, 25(3), 321-334.
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1994 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400405Hofestädt, R., Großpietsch, K. - E., & Steigner, C. (1994). Workshop Parallele Datenverarbeitung im Verbund von Hochleistungs-Workstations (Fachberichte Informatik, 9-94). Koblenz: Universitätf Koblenz.
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1994 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400417Beerbohm, D., Bresken, S., Hofestädt, R., & Huang, X. (1994). Automatengesteuertes skalierbares Verfahren zum Lastausgleich. In R. Flieger & R. Grebe (Eds.), Parallele Datenverarbeitung aktuell (pp. 100-108). Amsterdam: IOS Press.
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400427Hofestädt, R. (1994). Computer-Aided Metabolic Engineering. it+ti Nachrichten(6), 66-70.
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400441Hofestädt, R., Beerbohm, D., Bresken, S., & Huang, X. (1994). Dynamic load balancing based on the theory of cellular automata. In L. Dekker, W. Smit, & J. Zuidervaart (Eds.), Massively parallel processing applications and development : proceedings of the 1994 EUROSIM Conference on Massively Parallel Processing Applications and Development, Delft, The Netherlands, 21 - 23 June 1994 (pp. 235-242). Amsterdam: Elsevier.
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400387Hofestädt, R. (1994). Detection and Animation of Metabolic Bottlenecks. In H. A. Lim (Ed.), Proceedings of the Third International Conference on Bioinformatics and Genome Research (pp. 331-340). World Scientific.
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400433Hofestädt, R., & Ashauer, U. (1994). Ein wissensbasierter Ansatz zur Diagnose genetisch verursachter Stoffwechselkrankheiten. In H. Kunath (Ed.), Medizin und Information (pp. 115-119). München: MMV, Medizin-Verl.,.
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400471Hofestädt, R. (1994). Formale Sprachen zur Beschreibung von Zellstoffwechselprozessen. In S. J. Pöppl, H. - G. Lipinski, & T. Mansky (Eds.), Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie: Vol. 77. Medizinische Informatik. ein integrierender Teil arztunterstützender Technologien (pp. 245-249). München: MMV, Medizin-Verl.,.
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1994 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378596Hofestädt, R., & Hörkens, U. (1994). C.A.S.S - A Programming Environment for the Simulation of Nondeterministic Cellular Automata. Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 14(1), 1-14.
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1994 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400393Hofestädt, R. (1994). Modellierung und Simulation molekulargenetischer Prozesse. In G. Kampe & M. Zeitz (Eds.), Fortschritte in der Simulationstechnik: Vol. 9. Simulationstechnik (pp. 1-8). Wiesbaden: Vieweg.
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1993 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400450Hofestädt R., Krückeberg F., & Lengauer T. (Eds.) (1993). Informatik in den Biowissenschaften. 1. Fachtagung der GI-FG 4.0.2 „Informatik in den Biowissenschaften“, Bonn, 15./16. Februar 1993. Informatik Aktuell, VIII, 214.
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1993 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400486Hofestädt, R., Lautenbach, K., & Löffler, M. (1993). Workshop "Modellierung der Zelldifferenzierung" (Fachberichte Informatik, 16-93). Koblenz: Universitätf Koblenz.
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378358Hofestädt, R. (1993). Modelling molecular counters with stochastic cellular grammars. Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie, 24(4), 169-177.
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378301Hofestädt, R. (1993). Grammatical Formalization of Metabolic Processes. In L. Hunter, D. Searls, & J. Shavlik (Eds.), Proceedings. First International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB 93 (pp. 181-189). Menlo Park: AAAI Press.
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1993 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2400456Hofestädt, R., Beerbohm, D., & Huang, X. (1993). Dynamischer Lastausgleich mit Zellularautomaten. Proceedings of the PARS 1993, PARS Notes, 12, 92-101.
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1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378590Hofestädt, R. (1993). A Simulation Shell to Model Metabolic Pathways. Journal of Systems Analysis Modelling Simulation (SAMS), 11, 253-262.
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378542Hörkens, U., & Hofestädt, R. (1992). Cellular Automata Simulation Shell. In A. Sydow (Ed.), Computational Systems Analysis (pp. 325-330). Amsterdam: Elsevier.
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1992 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378557Hofestädt, R., & Müller, H. P. (1992). The Simulation of Genetic Processes. In A. Sydow (Ed.), Computational Systems Analysis (pp. 532-528). Amsterdam: Elsevier.