PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720

  Hippe, K.; Kormeier, B.; Janowski, S. J.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2011): DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.

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  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156

  Janowski, S. J.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Hippe, K.; Hofestädt, R.; Willassen, N.; Friesen, R.; Rubert, S.; Borck, D.; Haugen, P.; Chen, M. (2011): Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Edgar Wingender (Hrsg.): Biological Petri Nets. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 162). S. 182-203.

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  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2010): CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases Journal of Integrative Bioinformatics,7:(1):142

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  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Arrigo, P.; Töpel, T.; Janowski, S. J.; Hofestädt, R. (2010): Reconstruction of biological networks based on life science data integration Journal of Integrative Bioinformatics,7:(2): 3-8.

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  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780

  Hippe, K.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Janowski, S. J.; Hofestädt, R. (2010): DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. Bonn: Ges. für Informatik. (LNI, 176). S. 720-725.

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  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400

  Töpel, T.; Scheible, D.; Trefz, F.; Hofestädt, R. (2010): RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases Human Mutation,31:(1): E1081-E1088.

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• [23]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746

  Janowski, S. J.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Hippe, K.; Hofestädt, R.; Willassen, N.; Friesen, R.; Rubert, S.; Borck, D.; Haugen, P.; Chen, M. (2010): Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing In Silico Biology,10:(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48.

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  2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2009): CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Stefan Fischer; Erik Maehle; Rüdiger Reischuk (Hrsg.): Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI). S. 704-708.

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• [21]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634511

  Kaput, J.; Cotton, R. G. H.; Hardman, L.; Watson, M.; Al Aqeel, A. I.; Al-Aama, J. Y.; Al-Mulla, F.; Alonso, S.; Aretz, S.; Auerbach, A. D.; Bapat, B.; Bernstein, I. T.; Bhak, J.; Bleoo, S. L.; Bloecker, H.; Brenner, S. E.; Burn, J.; Bustamante, M.; Calone, R.; Cambon-Thomsen, A.; Cargill, M.; Carrera, P.; Cavedon, L.; Cho, Y. S.; Chung, Y. - J.; Claustres, M.; Cutting, G.; Dalgleish, R.; den Dunnen, J. T.; Diaz, C.; Dobrowolski, S.; dos Santos, M. R. N.; Ekong, R.; Flanagan, S. B.; Flicek, P.; Furukawa, Y.; Genuardi, M.; Ghang, H.; Golubenko, M. V.; Greenblatt, M. S.; Hamosh, A.; Hancock, J. M.; Hardison, R.; Harrison, T. M.; Hoffmann, R.; Horaitis, R.; Howard, H. J.; Barash, C. I.; Izagirre, N.; Jung, J.; Kojima, T.; Laradi, S.; Lee, Y. - S.; Lee, J. - Y.; Gil-da-Silva-Lopes, V. L.; Macrae, F. A.; Maglott, D.; Marafie, M. J.; Marsh, S. G. E.; Matsubara, Y.; Messiaen, L. M.; Moeslein, G.; Netea, M. G.; Norton, M. L.; Oefner, P. J.; Oetting, W. S.; O'Leary, J. C.; Oller de Ramirez, A. M.; Paalman, M. H.; Parboosingh, J.; Patrinos, G. P.; Perozzi, G.; Phillips, I. R.; Povey, S.; Prasad, S.; Qi, M.; Quin, D. J.; Ramesar, R. S.; Richards, C. S.; Savige, J.; Scheible, D. G.; Scott, R. J.; Seminara, D.; Shephard, E. A.; Sijmons, R. H.; Smith, T. D.; Sobrido, M. - J.; Tanaka, T.; Tavtigian, S. V.; Taylor, G. R.; Teague, J.; Töpel, T.; Ullman-Cullere, M.; Utsunomiya, J.; van Kranen, H. J.; Vihinen, M.; Webb, E.; Weber, T. K.; Yeager, M.; Yeom, Y. I.; Yim, S. - H.; Yoo, H. - S. (2009): Planning the Human Variome Project: The Spain Report HUMAN MUTATION,30:(4): 496-510.

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• [20]
  

  2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295

  Ralf Hofestädt; Thoralf Töpel (Hrsg.) (2008): Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. Aachen: Shaker.

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• [19]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654

  Hariharaputran, S.; Töpel, T.; Oberwahrenbrock, T.; Hofestädt, R. (2008): Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification Nature Precedings

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• [18]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666

  Trefz, F.; Scheible, D.; Götz, H.; Töpel, T.; Hofestädt, R.; Frauendienst-Egger, G. (2008): METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism Journal of Inherited Metabolic Disease,31: 289.

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• [17]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678

  Hariharaputran, S.; Töpel, T.; Brockschmidt, B.; Hofestädt, R. (2008): VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data Integrative Bioinformatics Yearbook 2007,4: 63-74.

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• [16]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955

  Töpel, T.; Kormeier, B.; Klassen, A.; Hofestädt, R. (2008): BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration Journal of Integrative Bioinformatics,5:(2): 343-349.

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• [15]
  

  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274

  Hariharaputran, S.; Töpel, T.; Brockschmidt, B.; Hofestädt, R. (2007): VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. In: Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).

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• [14]
  

  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265

  Hariharaputran, S.; Töpel, T.; Oberwahrenbrock, T.; Hofestädt, R. (2007): SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. In: Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.

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• [13]
  

  2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320

  Ralf Hofestädt; Thoralf Töpel (Hrsg.) (2007): Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. Aachen: Shaker.

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  2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474

  Scheible, D.; Töpel, T.; Frauendienst-Egger, G.; Hofestädt, R.; Wallner, S.; Trefz, F. K. (2007): Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE,30:(Suppl. 1): 3.

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• [11]
  

  2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343

  Ralf Hofestädt; Thoralf Töpel (Hrsg.) (2006): Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. Aachen: Shaker.

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• [10]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354

  Töpel, T.; Hofestädt, R.; Scheible, D.; Trefz, F. (2006): RAMEDIS, the rare metabolic diseases database Applied Bioinformatics,5:(2): 115-118.

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• [9]
  

  2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367

  Trefz, F. K.; Töpel, T.; Scheible, D.; Frauendienst-Egger, G.; Hofestädt, R. (2006): www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE,29:(Suppl. 1): 84.

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• [8]
  

  2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361

  Trefz, F. K.; Töpel, T.; Scheible, D.; Frauendienst-Egger, G.; Hofestädt, R. (2006): Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE,29:(Suppl. 1): 84.

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• [7]
  

  2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856

  Hofestädt, R.; Töpel, T. (2005): Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning. In: Udo Seiffert; Lakhmi Jain; Patrick Schweizer (Hrsg.): Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms. 1. Edition. Berlin: Springer. (Studies in Fuzziness and Soft Computing, 176). S. 1-24.

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• [6]
  

  2004 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302849

  Töpel, T. (2004): Untersuchung von Life-Science-Datenbeständen zur Identifikation von Genotyp-Phänotyp-Korrelationen. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.

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• [5]
  

  2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867

  Freier, A.; Hofestädt, R.; Töpel, T. (2002): Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In: Jürgen Borlak (Hrsg.): Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications. 1. Edition. Weinheim: Wiley-VCH. S. 233-252.

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• [4]
  

  2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845

  Hofestädt, R.; Töpel, T. (2002): Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In: Peter Kokol (Hrsg.): Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002). Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society. S. 129-133.

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• [3]
  

  2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818

  Töpel, T.; Hofestädt, R. (2002): Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data Medizinische Genetik,14:(3): 315.

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• [2]
  

  2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918

  Hofestädt, R.; Kauert, R.; Töpel, T.; Scholz, U. (2001): Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases. In: V. L. Patel (Hrsg.): Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 84). S. 353-356.

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• [1]
  

  2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974

  Hofestädt, R.; Mischke, U.; Scholz, U.; Töpel, T.; Scheible, D.; Trefz, F. K. (2001): RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation. In: V. L. Patel (Hrsg.): Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 84). S. 970-974.

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