26 Publikationen
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914105Schatschneider, S., Schneider, J., Blom, J., Letisse, F., Niehaus, K., Goesmann, A. & Vorhölter, F.-J. (2017). Systems and synthetic biology perspective of the versatile plant-pathogenic and polysaccharide-producing bacterium Xanthomonas campestris. MICROBIOLOGY-SGM, 163(8), 1117-1144. Microbiology Soc. doi:10.1099/mic.0.000473.
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2016 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2905827Weisshaar, B., Himmelbauer, H., Schmidt, T., Holtgräwe, D., Minoche, A.E., Dohm, J., Stracke, R., Zakrzewski, F., Parol-Kryger, R., Stadermann, K.B., Schneider, J., Rosleff Sörensen, T., Kraft, T. & Schulz, B. (2016). Sugar Beet BeetMap-3, and Steps to Improve the Genome Assembly and Genome Sequence Annotation (W875). Gehalten auf der Plant and Animal Genome XXIV Conference.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063Minoche, A.E., Dohm, J.C., Schneider, J., Holtgräwe, D., Viehöver, P., Montfort, M., Rosleff Sörensen, T., Weisshaar, B. & Himmelbauer, H. (2015). Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction. Genome Biology, 16(1): 184. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/s13059-015-0729-7.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Pühler, A., Jaeger, K.-E. & Ernst, J.F. (2015). The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology, 211, 20-30. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.06.423.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085Holtgräwe, D., Rosleff Sörensen, T., Viehöver, P., Schneider, J., Schulz, B., Borchardt, D., Kraft, T., Himmelbauer, H. & Weisshaar, B. (2014). Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris). PLoS ONE, 9(10): e110113. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0110113.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778Stracke, R., Holtgräwe, D., Schneider, J., Pucker, B., Rosleff Sörensen, T. & Weisshaar, B. (2014). Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris ). BMC Plant Biology, 14(1): 249. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12870-014-0249-8.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2650913Ravin, N.V., Eldarov, M.A., Kadnikov, V.V., Beletsky, A.V., Schneider, J., Mardanova, E.S., Smekalova, E.M., Zvereva, M.I., Dontsova, O.A., Mardanov, A.V. & Skryabin, K.G. (2013). Genome sequence and analysis of methylotrophic yeast Hansenula polymorpha DL1. BMC Genomics, 14(1): 837. Springer (Biomed Central Ltd.). doi:10.1186/1471-2164-14-837.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2634390Müller, S., Galliardt, H., Schneider, J., Barisas, B.G. & Seidel, T. (2013). Quantification of Förster resonance energy transfer by monitoring sensitized emission in living plant cells. Frontiers in Plant Science, 4: 413. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fpls.2013.00413.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558914Zhao, X.Q., Aizawa, T., Schneider, J., Wang, C., Shen, R.F. & Sunairi, M. (2013). Complete mitochondrial genome of the aluminum-tolerant fungus Rhodotorula taiwanensis RS1 and comparative analysis of Basidiomycota mitochondrial genomes. MicrobiologyOpen, 2(2), 308-317. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/mbo3.74.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160Schröder, J., Maus, I., Meyer, K., Wördemann, S., Blom, J., Jaenicke, S., Schneider, J., Trost, E. & Tauch, A. (2012). Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient. BMC Genomics, 13(1): 141. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-13-141.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2012). Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research, 12(3), 382-386. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1567-1364.2012.00791.x.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774Schneider, J., Andrea, H., Blom, J., Jaenicke, S., Rückert, C., Schorsch, C., Szczepanowski, R., Farwick, M., Goesmann, A., Pühler, A., Schaffer, S., Tauch, A., Köhler, T. & Brinkrolf, K. (2012). Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10. Eukaryotic Cell, 11(12), 1582-1583. American Society for Microbiology. doi:10.1128/EC.00258-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf, K., Schneider, J., Knecht, M., Rückert, C. & Tauch, A. (2012). Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media. Journal of Bacteriology, 194(21), 5968-5969. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.01412-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518300Schröder, J., Glaub, A., Schneider, J., Trost, E. & Tauch, A. (2012). Draft genome sequence of Corynebacterium bovis DSM 20582, which causes clinical mastitis in dairy cows. Journal of Bacteriology, 194(16), 4437-4437. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.00839-12.
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2012 | Dissertation | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907327Schneider, J. (2012). Sequenzanalyse, Annotation und Stoffwechselrekonstruktion der biotechnologisch relevanten Hefen Wickerhamomyces ciferrii und Wickerhamomyces anomalus mit der RAPYD-Plattform.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354752Trost, E., Al-Dilaimi, A., Papavasiliou, P., Schneider, J., Viehöver, P., Burkovski, A., Soares, S.C., Almeida, S.S., Dorella, F.A., Miyoshi, A., Azevedo, V., Schneider, M.P., Silva, A., Santos, C.S., Santos, L.S., Sabbadini, P., Dias, A.A., Hirata, R.J., Mattos-Guaraldi, A.L. & Tauch, A. (2011). Comparative analysis of two complete Corynebacterium ulcerans genomes and detection of candidate virulence factors. BMC Genomics, 12(1): 383. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-12-383.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473990Brune, I., Götker, S., Schneider, J., Rodionov, D.A. & Tauch, A. (2011). Negative transcriptional control of biotin metabolism genes by the TetR-type regulator BioQ in biotin-auxotrophic Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. Journal of Biotechnology, 159(3), 225-234. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.12.001.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G.G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A. & Pichler, H. (2011). High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology, 154(4), 312-320. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.04.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., Borth, N., Goesmann, A., Grillari, J., Kaltschmidt, C., Noll, T., Pühler, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2011). Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology, 156(3), 227-235. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.09.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A. & Goesmann, A. (2011). RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology, 155(1), 118-126. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.10.076.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439Trost, E., Ott, L., Schneider, J., Schröder, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Husemann, P., Stoye, J., Alves Dorella, F., Souza Rocha, F., de Castro Soares, S., D'Afonseca, V., Miyoshi, A., Ruiz, J., Silva, A., Azevedo, V., Burkovski, A., Guiso, N., Join-Lambert, O.F., Kayal, S. & Tauch, A. (2010). The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence. BMC Genomics, 11(1): 728. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-728.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692Schneider, J., Vorhölter, F.-J., Trost, E., Blom, J., Musa, Y.R., Neuweger, H., Niehaus, K., Schatschneider, S., Tauch, A. & Goesmann, A. (2010). CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks. Genetics and Molecular Research, 9(3), 1660-1672. Genetics and Molecular Research. doi:10.4238/vol9-3gmr901.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275Trost, E., Götker, S., Schneider, J., Schneiker-Bekel, S., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Arnold, W., Bekel, T., Blom, J., Gartemann, K.-H., Linke, B., Goesmann, A., Pühler, A., Shukla, S.K. & Tauch, A. (2010). Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion. BMC Genomics, 11(1): 91. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-91.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397394Goesmann, A., Schneider, J., Trost, E. & Tauch, A. (2009). Entschlüsselung mikrobieller Genomsequenzen im Schnellverfahren. BIOspektrum, 15(3), 279-281. Springer Science + Business Media.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783813Neuweger, H., Persicke, M., Albaum, S., Bekel, T., Dondrup, M., Hüser, A.T., Winnebald, J., Schneider, J., Kalinowski, J. & Goesmann, A. (2009). Visualizing post genomics data-sets on customized pathway maps by ProMeTra – aeration-dependent gene expression and metabolism of Corynebacterium glutamicum as an example. BMC Systems Biology, 3(1): 82. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1752-0509-3-82.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K.-H., Arnold, W., Blom, J., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Weisshaar, B., Goesmann, A., Droege, M. & Pühler, A. (2008). Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 22-30. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.03.004.