26 Publikationen
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914105Schatschneider S, Schneider J, Blom J, Letisse F, Niehaus K, Goesmann A, Vorhölter F-J (2017)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Systems and synthetic biology perspective of the versatile plant-pathogenic and polysaccharide-producing bacterium Xanthomonas campestris.
MICROBIOLOGY-SGM 163(8): 1117-1144. -
2016 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2905827Weisshaar B, Himmelbauer H, Schmidt T, Holtgräwe D, Minoche AE, Dohm J, Stracke R, Zakrzewski F, Parol-Kryger R, Stadermann KB, Schneider J, Rosleff Sörensen T, Kraft T, Schulz B (2016)PUB | PDF
Sugar Beet BeetMap-3, and Steps to Improve the Genome Assembly and Genome Sequence Annotation (W875).
Presented at the Plant and Animal Genome XXIV Conference, San Diego, USA. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063Minoche AE, Dohm JC, Schneider J, Holtgräwe D, Viehöver P, Montfort M, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B, Himmelbauer H (2015)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction.
Genome Biology 16(1): 184. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp O, Brinkrolf K, Buerth C, Kunigo M, Schneider J, Jaenicke S, Goesmann A, Pühler A, Jaeger K-E, Ernst JF (2015)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms.
Journal of Biotechnology 211: 20-30. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Viehöver P, Schneider J, Schulz B, Borchardt D, Kraft T, Himmelbauer H, Weisshaar B (2014)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris).
PLoS ONE 9(10): e110113. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778Stracke R, Holtgräwe D, Schneider J, Pucker B, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B (2014)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris ).
BMC Plant Biology 14(1): 249. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2650913Ravin NV, Eldarov MA, Kadnikov VV, Beletsky AV, Schneider J, Mardanova ES, Smekalova EM, Zvereva MI, Dontsova OA, Mardanov AV, Skryabin KG (2013)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Genome sequence and analysis of methylotrophic yeast Hansenula polymorpha DL1.
BMC Genomics 14(1): 837. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2634390Müller S, Galliardt H, Schneider J, Barisas BG, Seidel T (2013)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Quantification of Förster resonance energy transfer by monitoring sensitized emission in living plant cells.
Frontiers in Plant Science 4: 413. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558914Zhao XQ, Aizawa T, Schneider J, Wang C, Shen RF, Sunairi M (2013)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete mitochondrial genome of the aluminum-tolerant fungus Rhodotorula taiwanensis RS1 and comparative analysis of Basidiomycota mitochondrial genomes.
MicrobiologyOpen 2(2): 308-317. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160Schröder J, Maus I, Meyer K, Wördemann S, Blom J, Jaenicke S, Schneider J, Trost E, Tauch A (2012)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient.
BMC Genomics 13(1): 141. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider J, Rupp O, Trost E, Jaenicke S, Passoth V, Goesmann A, Tauch A, Brinkrolf K (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities.
FEMS Yeast Research 12(3): 382-386. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774Schneider J, Andrea H, Blom J, Jaenicke S, Rückert C, Schorsch C, Szczepanowski R, Farwick M, Goesmann A, Pühler A, Schaffer S, Tauch A, Köhler T, Brinkrolf K (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10.
Eukaryotic Cell 11(12): 1582-1583. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf K, Schneider J, Knecht M, Rückert C, Tauch A (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media.
Journal of Bacteriology 194(21): 5968-5969. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518300Schröder J, Glaub A, Schneider J, Trost E, Tauch A (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Draft genome sequence of Corynebacterium bovis DSM 20582, which causes clinical mastitis in dairy cows.
Journal of Bacteriology 194(16): 4437-4437. -
2012 | Dissertation | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907327Schneider J (2012)PUB
Sequenzanalyse, Annotation und Stoffwechselrekonstruktion der biotechnologisch relevanten Hefen Wickerhamomyces ciferrii und Wickerhamomyces anomalus mit der RAPYD-Plattform. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354752Trost E, Al-Dilaimi A, Papavasiliou P, Schneider J, Viehöver P, Burkovski A, Soares SC, Almeida SS, Dorella FA, Miyoshi A, Azevedo V, Schneider MP, Silva A, Santos CS, Santos LS, Sabbadini P, Dias AA, Hirata RJ, Mattos-Guaraldi AL, Tauch A (2011)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Comparative analysis of two complete Corynebacterium ulcerans genomes and detection of candidate virulence factors.
BMC Genomics 12(1): 383. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473990Brune I, Götker S, Schneider J, Rodionov DA, Tauch A (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Negative transcriptional control of biotin metabolism genes by the TetR-type regulator BioQ in biotin-auxotrophic Corynebacterium glutamicum ATCC 13032.
Journal of Biotechnology 159(3): 225-234. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl A, Schneider J, Thallinger GG, Anderl I, Wibberg D, Hajek T, Jaenicke S, Brinkrolf K, Goesmann A, Szczepanowski R, Pühler A, Schwab H, Glieder A, Pichler H (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435.
Journal of Biotechnology 154(4): 312-320. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker J, Hackel M, Jakobi T, Rupp O, Schneider J, Szczepanowski R, Bekel T, Borth N, Goesmann A, Grillari J, Kaltschmidt C, Noll T, Pühler A, Tauch A, Brinkrolf K (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing.
Journal of Biotechnology 156(3): 227-235. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider J, Blom J, Jaenicke S, Linke B, Brinkrolf K, Neuweger H, Tauch A, Goesmann A (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data.
Journal of Biotechnology 155(1): 118-126. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439Trost E, Ott L, Schneider J, Schröder J, Jaenicke S, Goesmann A, Husemann P, Stoye J, Alves Dorella F, Souza Rocha F, de Castro Soares S, D'Afonseca V, Miyoshi A, Ruiz J, Silva A, Azevedo V, Burkovski A, Guiso N, Join-Lambert OF, Kayal S, Tauch A (2010)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence.
BMC Genomics 11(1): 728. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692Schneider J, Vorhölter F-J, Trost E, Blom J, Musa YR, Neuweger H, Niehaus K, Schatschneider S, Tauch A, Goesmann A (2010)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks.
Genetics and Molecular Research 9(3): 1660-1672. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, Linke B, Goesmann A, Pühler A, Shukla SK, Tauch A (2010)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion.
BMC Genomics 11(1): 91. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397394Goesmann A, Schneider J, Trost E, Tauch A (2009)PUB
Entschlüsselung mikrobieller Genomsequenzen im Schnellverfahren.
BIOspektrum 15(3): 279-281. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783813Neuweger H, Persicke M, Albaum S, Bekel T, Dondrup M, Hüser AT, Winnebald J, Schneider J, Kalinowski J, Goesmann A (2009)PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
Visualizing post genomics data-sets on customized pathway maps by ProMeTra – aeration-dependent gene expression and metabolism of Corynebacterium glutamicum as an example.
BMC Systems Biology 3(1): 82. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch A, Schneider J, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Gartemann K-H, Arnold W, Blom J, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, Weisshaar B, Goesmann A, Droege M, Pühler A (2008)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids.
Journal of Biotechnology 136(1-2): 22-30.