26 Publikationen
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914105Schatschneider, S., Schneider, J., Blom, J., Letisse, F., Niehaus, K., Goesmann, A., Vorhölter, F.-J.: Systems and synthetic biology perspective of the versatile plant-pathogenic and polysaccharide-producing bacterium Xanthomonas campestris. MICROBIOLOGY-SGM. 163, 1117-1144 (2017).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2016 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2905827Weisshaar, B., Himmelbauer, H., Schmidt, T., Holtgräwe, D., Minoche, A.E., Dohm, J., Stracke, R., Zakrzewski, F., Parol-Kryger, R., Stadermann, K.B., Schneider, J., Rosleff Sörensen, T., Kraft, T., Schulz, B.: Sugar Beet BeetMap-3, and Steps to Improve the Genome Assembly and Genome Sequence Annotation (W875). Presented at the Plant and Animal Genome XXIV Conference, San Diego, USA (2016).PUB | PDF
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063Minoche, A.E., Dohm, J.C., Schneider, J., Holtgräwe, D., Viehöver, P., Montfort, M., Rosleff Sörensen, T., Weisshaar, B., Himmelbauer, H.: Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction. Genome Biology. 16, : 184 (2015).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Pühler, A., Jaeger, K.-E., Ernst, J.F.: The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology. 211, 20-30 (2015).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085Holtgräwe, D., Rosleff Sörensen, T., Viehöver, P., Schneider, J., Schulz, B., Borchardt, D., Kraft, T., Himmelbauer, H., Weisshaar, B.: Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris). PLoS ONE. 9, : e110113 (2014).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778Stracke, R., Holtgräwe, D., Schneider, J., Pucker, B., Rosleff Sörensen, T., Weisshaar, B.: Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris ). BMC Plant Biology. 14, : 249 (2014).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2650913Ravin, N.V., Eldarov, M.A., Kadnikov, V.V., Beletsky, A.V., Schneider, J., Mardanova, E.S., Smekalova, E.M., Zvereva, M.I., Dontsova, O.A., Mardanov, A.V., Skryabin, K.G.: Genome sequence and analysis of methylotrophic yeast Hansenula polymorpha DL1. BMC Genomics. 14, : 837 (2013).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2634390Müller, S., Galliardt, H., Schneider, J., Barisas, B.G., Seidel, T.: Quantification of Förster resonance energy transfer by monitoring sensitized emission in living plant cells. Frontiers in Plant Science. 4, : 413 (2013).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558914Zhao, X.Q., Aizawa, T., Schneider, J., Wang, C., Shen, R.F., Sunairi, M.: Complete mitochondrial genome of the aluminum-tolerant fungus Rhodotorula taiwanensis RS1 and comparative analysis of Basidiomycota mitochondrial genomes. MicrobiologyOpen. 2, 308-317 (2013).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160Schröder, J., Maus, I., Meyer, K., Wördemann, S., Blom, J., Jaenicke, S., Schneider, J., Trost, E., Tauch, A.: Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient. BMC Genomics. 13, : 141 (2012).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A., Brinkrolf, K.: Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research. 12, 382-386 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774Schneider, J., Andrea, H., Blom, J., Jaenicke, S., Rückert, C., Schorsch, C., Szczepanowski, R., Farwick, M., Goesmann, A., Pühler, A., Schaffer, S., Tauch, A., Köhler, T., Brinkrolf, K.: Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10. Eukaryotic Cell. 11, 1582-1583 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885Brinkrolf, K., Schneider, J., Knecht, M., Rückert, C., Tauch, A.: Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media. Journal of Bacteriology. 194, 5968-5969 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518300Schröder, J., Glaub, A., Schneider, J., Trost, E., Tauch, A.: Draft genome sequence of Corynebacterium bovis DSM 20582, which causes clinical mastitis in dairy cows. Journal of Bacteriology. 194, 4437-4437 (2012).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2012 | Dissertation | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907327Schneider, J.: Sequenzanalyse, Annotation und Stoffwechselrekonstruktion der biotechnologisch relevanten Hefen Wickerhamomyces ciferrii und Wickerhamomyces anomalus mit der RAPYD-Plattform. (2012).PUB
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354752Trost, E., Al-Dilaimi, A., Papavasiliou, P., Schneider, J., Viehöver, P., Burkovski, A., Soares, S.C., Almeida, S.S., Dorella, F.A., Miyoshi, A., Azevedo, V., Schneider, M.P., Silva, A., Santos, C.S., Santos, L.S., Sabbadini, P., Dias, A.A., Hirata, R.J., Mattos-Guaraldi, A.L., Tauch, A.: Comparative analysis of two complete Corynebacterium ulcerans genomes and detection of candidate virulence factors. BMC Genomics. 12, : 383 (2011).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473990Brune, I., Götker, S., Schneider, J., Rodionov, D.A., Tauch, A.: Negative transcriptional control of biotin metabolism genes by the TetR-type regulator BioQ in biotin-auxotrophic Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. Journal of Biotechnology. 159, 225-234 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G.G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A., Pichler, H.: High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology. 154, 312-320 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., Borth, N., Goesmann, A., Grillari, J., Kaltschmidt, C., Noll, T., Pühler, A., Tauch, A., Brinkrolf, K.: Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology. 156, 227-235 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A., Goesmann, A.: RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology. 155, 118-126 (2011).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439Trost, E., Ott, L., Schneider, J., Schröder, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Husemann, P., Stoye, J., Alves Dorella, F., Souza Rocha, F., de Castro Soares, S., D'Afonseca, V., Miyoshi, A., Ruiz, J., Silva, A., Azevedo, V., Burkovski, A., Guiso, N., Join-Lambert, O.F., Kayal, S., Tauch, A.: The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence. BMC Genomics. 11, : 728 (2010).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692Schneider, J., Vorhölter, F.-J., Trost, E., Blom, J., Musa, Y.R., Neuweger, H., Niehaus, K., Schatschneider, S., Tauch, A., Goesmann, A.: CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks. Genetics and Molecular Research. 9, 1660-1672 (2010).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275Trost, E., Götker, S., Schneider, J., Schneiker-Bekel, S., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Arnold, W., Bekel, T., Blom, J., Gartemann, K.-H., Linke, B., Goesmann, A., Pühler, A., Shukla, S.K., Tauch, A.: Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion. BMC Genomics. 11, : 91 (2010).PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397394Goesmann, A., Schneider, J., Trost, E., Tauch, A.: Entschlüsselung mikrobieller Genomsequenzen im Schnellverfahren. BIOspektrum. 15, 279-281 (2009).PUB
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783813Neuweger, H., Persicke, M., Albaum, S., Bekel, T., Dondrup, M., Hüser, A.T., Winnebald, J., Schneider, J., Kalinowski, J., Goesmann, A.: Visualizing post genomics data-sets on customized pathway maps by ProMeTra – aeration-dependent gene expression and metabolism of Corynebacterium glutamicum as an example. BMC Systems Biology. 3, : 82 (2009).PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K.-H., Arnold, W., Blom, J., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Weisshaar, B., Goesmann, A., Droege, M., Pühler, A.: Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology. 136, 22-30 (2008).PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC