PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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• [26]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914105

  Systems and synthetic biology perspective of the versatile plant-pathogenic and polysaccharide-producing bacterium Xanthomonas campestris
  Schatschneider S, Schneider J, Blom J, Letisse F, Niehaus K, Goesmann A, Vorhölter F-J (2017)
  MICROBIOLOGY-SGM 163(8): 1117-1144.

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• [25]
  

  2016 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | PUB-ID: 2905827

  Sugar Beet BeetMap-3, and Steps to Improve the Genome Assembly and Genome Sequence Annotation (W875)
  Weisshaar B, Himmelbauer H, Schmidt T, Holtgräwe D, Minoche AE, Dohm J, Stracke R, Zakrzewski F, Parol-Kryger R, Stadermann KB, Schneider J, et al. (2016)
  Presented at the Plant and Animal Genome XXIV Conference, San Diego, USA.

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• [24]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063

  Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction
  Minoche AE, Dohm JC, Schneider J, Holtgräwe D, Viehöver P, Montfort M, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B, Himmelbauer H (2015)
  Genome Biology 16(1): 184.

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• [23]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605

  The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms
  Rupp O, Brinkrolf K, Buerth C, Kunigo M, Schneider J, Jaenicke S, Goesmann A, Pühler A, Jaeger K-E, Ernst JF (2015)
  Journal of Biotechnology 211: 20-30.

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• [22]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778

  Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris )
  Stracke R, Holtgräwe D, Schneider J, Pucker B, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B (2014)
  BMC Plant Biology 14(1): 249.

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• [21]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085

  Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris)
  Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Viehöver P, Schneider J, Schulz B, Borchardt D, Kraft T, Himmelbauer H, Weisshaar B (2014)
  PLoS ONE 9(10): e110113.

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• [20]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2650913

  Genome sequence and analysis of methylotrophic yeast Hansenula polymorpha DL1
  Ravin NV, Eldarov MA, Kadnikov VV, Beletsky AV, Schneider J, Mardanova ES, Smekalova EM, Zvereva MI, Dontsova OA, Mardanov AV, Skryabin KG (2013)
  BMC Genomics 14(1): 837.

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• [19]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2634390

  Quantification of Förster resonance energy transfer by monitoring sensitized emission in living plant cells
  Müller S, Galliardt H, Schneider J, Barisas BG, Seidel T (2013)
  Frontiers in Plant Science 4: 413.

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• [18]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558914

  Complete mitochondrial genome of the aluminum-tolerant fungus Rhodotorula taiwanensis RS1 and comparative analysis of Basidiomycota mitochondrial genomes
  Zhao XQ, Aizawa T, Schneider J, Wang C, Shen RF, Sunairi M (2013)
  MicrobiologyOpen 2(2): 308-317.

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• [17]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160

  Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient
  Schröder J, Maus I, Meyer K, Wördemann S, Blom J, Jaenicke S, Schneider J, Trost E, Tauch A (2012)
  BMC Genomics 13(1): 141.

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• [16]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002

  Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities
  Schneider J, Rupp O, Trost E, Jaenicke S, Passoth V, Goesmann A, Tauch A, Brinkrolf K (2012)
  FEMS Yeast Research 12(3): 382-386.

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• [15]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774

  Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10
  Schneider J, Andrea H, Blom J, Jaenicke S, Rückert C, Schorsch C, Szczepanowski R, Farwick M, Goesmann A, Pühler A, Schaffer S, et al. (2012)
  Eukaryotic Cell 11(12): 1582-1583.

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• [14]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530885

  Draft Genome Sequence of Turicella otitidis ATCC 51513, Isolated from Middle Ear Fluid from a Child with Otitis Media
  Brinkrolf K, Schneider J, Knecht M, Rückert C, Tauch A (2012)
  Journal of Bacteriology 194(21): 5968-5969.

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• [13]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518300

  Draft genome sequence of Corynebacterium bovis DSM 20582, which causes clinical mastitis in dairy cows
  Schröder J, Glaub A, Schneider J, Trost E, Tauch A (2012)
  Journal of Bacteriology 194(16): 4437-4437.

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• [12]
  

  2012 | Dissertation | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907327

  Sequenzanalyse, Annotation und Stoffwechselrekonstruktion der biotechnologisch relevanten Hefen Wickerhamomyces ciferrii und Wickerhamomyces anomalus mit der RAPYD-Plattform
  Schneider J (2012) .

  PUB
   
• [11]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354752

  Comparative analysis of two complete Corynebacterium ulcerans genomes and detection of candidate virulence factors
  Trost E, Al-Dilaimi A, Papavasiliou P, Schneider J, Viehöver P, Burkovski A, Soares SC, Almeida SS, Dorella FA, Miyoshi A, Azevedo V, et al. (2011)
  BMC Genomics 12(1): 383.

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• [10]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473990

  Negative transcriptional control of biotin metabolism genes by the TetR-type regulator BioQ in biotin-auxotrophic Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
  Brune I, Götker S, Schneider J, Rodionov DA, Tauch A (2011)
  Journal of Biotechnology 159(3): 225-234.

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• [9]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371

  High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435
  Küberl A, Schneider J, Thallinger GG, Anderl I, Wibberg D, Hajek T, Jaenicke S, Brinkrolf K, Goesmann A, Szczepanowski R, Pühler A, et al. (2011)
  Journal of Biotechnology 154(4): 312-320.

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• [8]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576

  Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing
  Becker J, Hackel M, Jakobi T, Rupp O, Schneider J, Szczepanowski R, Bekel T, Borth N, Goesmann A, Grillari J, Kaltschmidt C, et al. (2011)
  Journal of Biotechnology 156(3): 227-235.

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• [7]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445

  RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data
  Schneider J, Blom J, Jaenicke S, Linke B, Brinkrolf K, Neuweger H, Tauch A, Goesmann A (2011)
  Journal of Biotechnology 155(1): 118-126.

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• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439

  The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence
  Trost E, Ott L, Schneider J, Schröder J, Jaenicke S, Goesmann A, Husemann P, Stoye J, Alves Dorella F, Souza Rocha F, de Castro Soares S, et al. (2010)
  BMC Genomics 11(1): 728.

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• [5]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692

  CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks
  Schneider J, Vorhölter F-J, Trost E, Blom J, Musa YR, Neuweger H, Niehaus K, Schatschneider S, Tauch A, Goesmann A (2010)
  Genetics and Molecular Research 9(3): 1660-1672.

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• [4]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275

  Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion
  Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
  BMC Genomics 11(1): 91.

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• [3]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397394

  Entschlüsselung mikrobieller Genomsequenzen im Schnellverfahren
  Goesmann A, Schneider J, Trost E, Tauch A (2009)
  BIOspektrum 15(3): 279-281.

  PUB
   
• [2]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783813

  Visualizing post genomics data-sets on customized pathway maps by ProMeTra – aeration-dependent gene expression and metabolism of Corynebacterium glutamicum as an example
  Neuweger H, Persicke M, Albaum S, Bekel T, Dondrup M, Hüser AT, Winnebald J, Schneider J, Kalinowski J, Goesmann A (2009)
  BMC Systems Biology 3(1): 82.

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• [1]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939

  Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids
  Tauch A, Schneider J, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Gartemann K-H, Arnold W, Blom J, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, et al. (2008)
  Journal of Biotechnology 136(1-2): 22-30.

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