PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2731279

  Huja, S.; Oren, Y.; Trost, E.; Brzuszkiewicz, E.; Biran, D.; Blom, J.; Goesmann, A.; Gottschalk, G.; Hacker, J.; Ron, E. Z.; Dobrindt, U. (2015): Genomic Avenue to Avian Colisepticemia mBio,6:(1):e01681-14

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• [22]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2582332

  Guimarães, L. C.; Soares, S. C.; Albersmeier, A.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Azevedo, V.; Soriano, F.; Tauch, A.; Trost, E. (2013): Complete Genome Sequence of Corynebacterium urealyticum Strain DSM 7111, Isolated from a 9-Year-Old Patient with Alkaline-Encrusted Cystitis Genome announcements,1:(3):e00264-13

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• [21]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2552500

  Soares, S. C.; Silva, A.; Trost, E.; Blom, J.; Ramos, R.; Carneiro, A.; Ali, A.; Santos, A. R.; Pinto, A. C.; Diniz, C.; Barbosa, E. G. V.; Dorella, F. A.; Aburjaile, F.; Rocha, F. S.; Nascimento, K. K. F.; Guimares, L. C.; Almeida, S.; Hassan, S. S.; Bakhtiar, S. M.; Pereira, U. P.; Abreu, V. A. C.; Schneider, M. P. C.; Miyoshi, A.; Tauch, A.; Azevedo, V. (2013): The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains PLoS ONE,8:(1):e53818

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• [20]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614869

  Soares, S. C.; Trost, E.; Ramos, R. T. J.; Carneiro, A. R.; Santos, A. R.; Pinto, A. C.; Barbosa, E.; Aburjaile, F.; Ali, A.; Diniz, C. A. A.; Hassan, S. S.; Fiaux, K.; Guimarães, L. C.; Bakhtiar, S. M.; Pereira, U.; Almeida, S. S.; Abreu, V. A. C.; Rocha, F. S.; Dorella, F. A.; Miyoshi, A.; Silva, A.; Azevedo, V.; Tauch, A. (2013): Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production Journal of Biotechnology,167:(2): 135-141.

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• [19]
  

  2012 | Dissertation | PUB-ID: 2541645

  Trost, E. (2012): Das bakterielle Pangenom: komparative Genomanalysen zur Identifizierung neuer Virulenzfaktoren des Corynebacterium diphtheriae-Clusters. Bielefeld.

  PUB
   
• [18]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160

  Schröder, J.; Maus, I.; Meyer, K.; Wördemann, S.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Schneider, J.; Trost, E.; Tauch, A. (2012): Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient BMC Genomics,13:(1):141

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• [17]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2477132

  Soares, S. C.; Abreu, V. A. C.; Ramos, R. T. J.; Cerdeira, L.; Silva, A.; Baumbach, J.; Trost, E.; Tauch, A.; Hirata, R. J.; Mattos-Guaraldi, A. L.; Miyoshi, A.; Azevedo, V. (2012): PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software PLoS ONE,7:(2):e30848

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• [16]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2513347

  Trost, E.; Blom, J.; de Castro Soares, S.; Huang, I. - H.; Al-Dilaimi, A.; Schröder, J.; Jaenicke, S.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Schneider, M. P.; Silva, A.; Camello, T. C.; Sabbadini, P. S.; Santos, C. S.; Santos, L. S.; Hirata, R. J.; Mattos-Guaraldi, A. L.; Efstratiou, A.; Schmitt, M. P.; Ton-That, H.; Tauch, A. (2012): Pangenomic Study of Corynebacterium diphtheriae That Provides Insights into the Genomic Diversity of Pathogenic Isolates from Cases of Classical Diphtheria, Endocarditis, and Pneumonia Journal of bacteriology,194:(12): 3199-3215.

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• [15]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471667

  Sabbadini, P. S.; Assis, M. C.; Trost, E.; Gomes, D. L. R.; Moreira, L. O.; Dos Santos, C. S.; Pereira, G. A.; Nagao, P. E.; Azevedo, V. A. de C.; Hirata Junior, R.; Dos Santos, A. L. S.; Tauch, A.; Mattos-Guaraldi, A. L. (2012): Corynebacterium diphtheriae 67-72p hemagglutinin, characterized as the protein DIP0733, contributes to invasion and induction of apoptosis in HEp-2 cells Microbial Pathogenesis,52:(3): 165-176.

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• [14]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002

  Schneider, J.; Rupp, O.; Trost, E.; Jaenicke, S.; Passoth, V.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2012): Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities FEMS Yeast Research,12:(3): 382-386.

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• [13]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518300

  Schröder, J.; Glaub, A.; Schneider, J.; Trost, E.; Tauch, A. (2012): Draft genome sequence of Corynebacterium bovis DSM 20582, which causes clinical mastitis in dairy cows Journal of Bacteriology,194:(16): 4437-4437.

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• [12]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289971

  Ruiz, J. C.; D'Afonseca, V.; Silva, A.; Ali, A.; Pinto, A. C.; Santos, A. R.; Rocha, A. A. M. C.; Lopes, D. O.; Dorella, F. A.; Pacheco, L. G. C.; Costa, M. P.; Turk, M. Z.; Seyffert, N.; Moraes, P. M. R. O.; Soares, S. C.; Almeida, S. S.; Castro, T. L. P.; Abreu, V. A. C.; Trost, E.; Baumbach, J.; Tauch, A.; Schneider, M. P. C.; McCulloch, J.; Cerdeira, L. T.; Ramos, R. T. J.; Zerlotini, A.; Dominitini, A.; Resende, D. M.; Coser, E. M.; Oliveira, L. M.; Pedrosa, A. L.; Vieira, C. U.; Guimaraes, C. T.; Bartholomeu, D. C.; Oliveira, D. M.; Santos, F. R.; Rabelo, E. M.; Lobo, F. P.; Franco, G. R.; Costa, A. F.; Castro, I. M.; Costa Dias, S. R.; Ferro, J. A.; Ortega, J. M.; Paiva, L. V.; Goulart, L. R.; Almeida, J. F.; Ferro, M. I. T.; Carneiro, N. P.; Falcao, P. R. K.; Grynberg, P.; Teixeira, S. M. R.; Brommonschenkel, S.; Oliveira, S. C.; Meyer, R.; Moore, R. J.; Miyoshi, A.; Oliveira, G. C.; Azevedo, V. (2011): Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains PLoS ONE,6:(4):e18551

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• [11]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2442587

  Schröder, J.; Maus, I.; Trost, E.; Tauch, A. (2011): Complete genome sequence of Corynebacterium variabile DSM 44702 isolated from the surface of smear-ripened cheeses and insights into cheese ripening and flavor generation BMC Genomics,12:(1):545

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• [10]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354752

  Trost, E.; Al-Dilaimi, A.; Papavasiliou, P.; Schneider, J.; Viehöver, P.; Burkovski, A.; Soares, S. C.; Almeida, S. S.; Dorella, F. A.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Schneider, M. P.; Silva, A.; Santos, C. S.; Santos, L. S.; Sabbadini, P.; Dias, A. A.; Hirata, R. J.; Mattos-Guaraldi, A. L.; Tauch, A. (2011): Comparative analysis of two complete Corynebacterium ulcerans genomes and detection of candidate virulence factors BMC Genomics,12:(1):383

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• [9]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454721

  Cerdeira, L. T.; Cruz Schneider, M. P.; Pinto, A. C.; de Almeida, S. S.; dos Santos, A. R.; Vieira Barbosa, E. G.; Ali, A.; Aburjaile, F. F.; Carvalho de Abreu, V. A.; Guimaraes, L. C.; Soares, S. de C.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; Bol, E.; Caracciolo Gomes de Sa, P. H.; Lopes, T. S.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Juca Ramos, R. T.; da Rocha Coimbra, N. A.; Jeronimo Lima, A. R.; Barh, D.; Jain, N.; Tiwari, S.; Raja, R.; Zambare, V.; Ghosh, P.; Trost, E.; Tauch, A.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya Journal of Bacteriology,193:(24): 7025-7026.

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• [8]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411181

  Cerdeira, L. T.; Pinto, A. C.; Schneider, M. P. C.; de Almeida, S. S.; Dos Santos, A. R.; Barbosa, E. G. V.; Ali, A.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Ramos, R. T. J.; de Oliveira, R. S.; Barh, D.; Barve, N.; Zambare, V.; Belchior, S. E.; Guimaraes, L. C.; de Castro Soares, S.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; de Abreu, V. A. C.; Tauch, A.; Trost, E.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina Journal of Bacteriology,193:(22): 6420-6421.

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• [7]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1968054

  Silva, A.; Schneider, M. P. C.; Cerdeira, L.; Barbosa, M. S.; Ramos, R. T. J.; Carneiro, A. R.; Santos, R.; Lima, M.; D'Afonseca, V.; Almeida, S. S.; Santos, A. R.; Soares, S. C.; Pinto, A. C.; Ali, A.; Dorella, F. A.; Rocha, F.; Carvalho de Abreu, V. A.; Trost, E.; Tauch, A.; Shpigel, N.; Miyoshi, A.; Azevedo, V. (2011): Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I19, a Strain Isolated from a Cow in Israel with Bovine Mastitis Journal of Bacteriology,193:(1): 323-324.

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• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439

  Trost, E.; Ott, L.; Schneider, J.; Schröder, J.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Husemann, P.; Stoye, J.; Alves Dorella, F.; Souza Rocha, F.; de Castro Soares, S.; D'Afonseca, V.; Miyoshi, A.; Ruiz, J.; Silva, A.; Azevedo, V.; Burkovski, A.; Guiso, N.; Join-Lambert, O. F.; Kayal, S.; Tauch, A. (2010): The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence BMC Genomics,11:(1):728

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• [5]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692

  Schneider, J.; Vorhölter, F. - J.; Trost, E.; Blom, J.; Musa, Y. R.; Neuweger, H.; Niehaus, K.; Schatschneider, S.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2010): CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks Genetics and Molecular Research,9:(3): 1660-1672.

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• [4]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275

  Trost, E.; Götker, S.; Schneider, J.; Schneiker-Bekel, S.; Szczepanowski, R.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Arnold, W.; Bekel, T.; Blom, J.; Gartemann, K. - H.; Linke, B.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Shukla, S. K.; Tauch, A. (2010): Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion BMC Genomics,11:(1):91

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• [3]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397394

  Goesmann, A.; Schneider, J.; Trost, E.; Tauch, A. (2009): Entschlüsselung mikrobieller Genomsequenzen im Schnellverfahren BIOspektrum,15:(3): 279-281.

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• [2]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918

  Tauch, A.; Trost, E.; Tilker, A.; Ludewig, U.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Arnold, W.; Bekel, T.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Kalinowski, J.; Kamp, P. - B.; Lobo, F. P.; Viehöver, P.; Weisshaar, B.; Soriano, F.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing Journal of Biotechnology,136:(1-2): 11-21.

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• [1]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1868701

  Tauch, A.; Trost, E.; Bekel, T.; Goesmann, A.; Ludewig, U.; Pühler, A. (2006): Ultrafast de novo sequencing of Corynebacterium urealyticum using the Genome Sequencer 20 System Biochemica,4: 4-6.

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