65 Publikationen
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2023 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980346Röchter, M., Thiesbrummel, S., Marchi, H., Fuchs, C. & Rudwaleit, M. (2023). Changes in diagnosing giant cell arteritis of the temporal artery over a 7.7 year period (Annals of the Rheumatic Diseases), 82(Suppl. 1), 1579. Gehalten auf der European Congress of Rheumatology (EULAR), London: BMJ Publishing Group. doi:10.1136/annrheumdis-2023-eular.3866.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2981131Reinkemeyer, C., Khazaei, Y., Weigert, M., Hannes, M., Le Gleut, R., Plank, M., Winter, S., Noreña, I., Meier, T., Xu, L., Rubio-Acero, R., Wiegrebe, S., Le Thi, T.G., Fuchs, C., Radon, K., Paunovic, I., Janke, C., Wieser, A., Küchenhoff, H., Hoelscher, M. & Castelletti, N. (2023). The Prospective COVID-19 Post-Immunization Serological Cohort in Munich (KoCo-Impf): Risk Factors and Determinants of Immune Response in Healthcare Workers. Viruses, 15(7): 1574. MDPI . doi:10.3390/v15071574.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2969305Marchi, H. & Fuchs, C. (2023). Hurdle-QAP models overcome dependency and sparsity in scientific collaboration count networks. The Journal of Mathematical Sociology, 1-28. Informa UK Limited. doi:10.1080/0022250X.2023.2180000.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2979171Wille, K., Brouka, M., Bernhardt, J., Rüfer, A., Niculescu-Mizil, E., Gotic, M., Isfort, S., Koschmieder, S., Barbui, T., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Meixner, R., Marchi, H., Fuchs, C., Stegelmann, F., Döhner, K., Kiladjian, J.-J. & Griesshammer, M. (2023). Outcome of 129 Pregnancies in Polycythemia Vera Patients: A Report of the European LeukemiaNET. HemaSphere, 7(5): e882. Wolters. doi:10.1097/HS9.0000000000000882.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2984094Wille, K., Deventer, E., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Hünerbein, K., Meixner, R., Jimenez-Munoz, M., Fuchs, C. & Griesshammer, M. (2023). Arterial and Venous Thromboembolic Complications in 832 Patients with BCR-ABL-Negative Myeloproliferative Neoplasms. Hämostaseologie . Georg Thieme . doi:10.1055/a-2159-8767.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980935Le Gleut, R., Plank, M., Pütz, P., Radon, K., Bakuli, A., Rubio-Acero, R., Paunovic, I., Rieß, F., Winter, S., Reinkemeyer, C., Schälte, Y., Olbrich, L., Hannes, M., Kroidl, I., Noreña, I., Janke, C., Wieser, A., Hoelscher, M., Fuchs, C., Castelletti, N., Ahmed, M.I.M., Alamoudi, E., Anderson, J., Baldassarre, V., Baumann, M., Becker, M., Bednarski, F., Behlen, M., Bemirayev, O., Beyerl, J., Bitzer, P., Böhnlein, R., Brand, I., Brauer, A., Britz, V., Bruger, J., Bünz, F., Caroli, F., Coleman, J., Contento, L., Czwienzek, A., Deák, F., Diefenbach, M.N., Diepers, P., Do, A., Dobler, G., Durner, J., Eser, T., Eberle, U., Eckstein, J., Falk, P., Feyereisen, M., Fingerle, V., Fischer, S., Frese, J., Forster, F., Fröschl, G., Geisenberger, O., Garí, M., Gasser, M., Gauder, S., Geier, R., Gillig, K., Geldmacher, C., Gezgin, K., Gilberg, L., Gillig, K., Girl, P., Golschan, E., Grauvogl, V., Noller, J.M.G., Guglielmini, E.M., Gutierrez, P., Haderer, A., Halfmann, C., Hartinger, L., Haselwarter, T., Hasenauer, J., Hernandez, A., Heller, L., Heiber, A., Herrmann, M., Hillari, L., Hillmann, S., Hinske, C., Hoefflin, J., Hofberger, T., Höfinger, M., Hofmann, L., Horn, S., Huber, K., Janke, C., Karger, L., Kappl, U., Keßler, A., Khan, Z., Kiani, C., Klugherz, I., Kreider, N., Kresin, J., Kroidl, A., Kunder, P., Lang, M., Lang, C., Lange, S., Lapteva, E., Laxy, M., Leidl, R., Liedl, L., Lindner, F., Lucaj, X., Lucke, E., Luppa, F., Nafziger, A.S., Maczka, A., Mang, P., Markgraf, A., Matcau, P., Mayrhofer, R., Mekota, A.-M., Metaxa, D., Mohr, E., Müller, H., Müller, K., Nascimento, N., Niermeyer, K., Nikolaides, S., Pattard, L., Pleimelding, C., Pletschette, M., Poll, V., Prückner, S., Puchinger, K., Pusl, K., Raimúndez, E., Raschka, J., Reich, J., Reinkemeyer, C., Rothe, C., Ruci, V., Saathoff, E., Schäfer, N., Schandelmaier, P., Schluse, B., Schneider, A., Schneider, L., Schultz, S., Schunk, M., Schwettmann, L., Sedlmeier, J., Sintu-Sempta, L., Soler, A., Sothmann, P., Strobl, K., Strüber, A., Strüber, L., Tang, J., Theis, F., Thiel, V., Thumser, E., Thur, N., Ullrich, J., Vollmayr, V., Von Lovenberg, E., Von Lovenberg, J., Vos, C., Waibel, J., Wallrauch, C., Weigl, N., Wölfl, R., Wolff, J., Wullinger, P., Würfel, T., Wustrow, P., Zange, S., Zeggini, E., Zielke, A., Zimmer, T., Zimmermann, T., Zielke, A. & Zuche, L. (2023). The representative COVID-19 cohort Munich (KoCo19): from the beginning of the pandemic to the Delta virus variant. BMC Infectious Diseases, 23(1): 466. Biomed Central. doi:10.1186/s12879-023-08435-1.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980348Pedron, S., Laxy, M., Radon, K., Le Gleut, R., Castelletti, N., Noller, J.M.G., Diefenbach, M.N., Hölscher, M., Leidl, R., Schwettmann, L., Forster, F., Bakuli, A., Eckstein, J., Froeschl, G., Geisenberger, O., Geldmacher, C., Heiber, A., Hoffmann, L., Huber, K., Metaxa, D., Pletschette, M., Rothe, C., Schunk, M., Wallrauch, C., Zimmer, T., Pritsch, M., Wieser, A., Olbrich, L., Thiel, V., Riess, F., Kroidl, I., Saathoff, E., Prückner, S., Zeggini, E., Fuchs, C., Hasenauer, J. & Theis, F. (2023). Socioeconomic and risk-related drivers of compliance with measures to prevent SARS-CoV-2 infection: evidence from the Munich-based KoCo19 study. BMC Public Health, 23(1): 860. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/s12889-023-15759-9.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2958646Contento, L., Castelletti, N., Raimúndez, E., Le Gleut, R., Schälte, Y., Stapor, P., Hinske, L.C., Hoelscher, M., Wieser, A., Radon, K., Fuchs, C. & Hasenauer, J. (2023). Integrative modelling of reported case numbers and seroprevalence reveals time-dependent test efficiency and infection rates. Epidemics, 43: 100681. Elsevier. doi:10.1016/j.epidem.2023.100681.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2958644Wille, K., Huenerbein, K., Jagenberg, E., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Meixner, R., Marchi, H., Fuchs, C. & Griesshammer, M. (2022). Bleeding complications in bcr-abl negative myeloproliferative neoplasms (MPN): a retrospective single-center study of 829 MPN patients. European Journal of Haematology, 108(2), 154-162. Wiley. doi:10.1111/ejh.13721.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980363Puchinger, K., Castelletti, N., Rubio-Acero, R., Geldmacher, C., Eser, T.M., Deák, F., Paunovic, I., Bakuli, A., Saathoff, E., von Meyer, A., Markgraf, A., Falk, P., Reich, J., Riess, F., Girl, P., Müller, K., Radon, K., Guggenbuehl Noller, J.M., Wölfel, R., Hoelscher, M., Kroidl, I., Wieser, A., Olbrich, L., Alamoudi, E., Anderson, J., Baumann, M., Behlen, M., Beyerl, J., Böhnlein, R., Brauer, A., Britz, V., Bruger, J., Caroli, F., Contento, L., Diekmannshemke, J., Do, A., Dobler, G., Eberle, U., Eckstein, J., Frese, J., Forster, F., Frahnow, T., Fröschl, G., Geisenberger, O., Gillig, K., Heiber, A., Hinske, C., Hoefflin, J., Hofberger, T., Höfinger, M., Hofmann, L., Horn, S., Huber, K., Janke, C., Kappl, U., Kiani, C., Kroidl, A., Laxy, M., Leidl, R., Lindner, F., Mayrhofer, R., Mekota, A.-M., Müller, H., Metaxa, D., Pattard, L., Pletschette, M., Prückner, S., Pusl, K., Raimúndez, E., Rothe, C., Schäfer, N., Schandelmaier, P., Schneider, L., Schultz, S., Schunk, M., Schwettmann, L., Seibold, H., Sothmann, P., Stapor, P., Theis, F., Thiel, V., Thiesbrummel, S., Thur, N., Waibel, J., Wallrauch, C., Winter, S., Wolff, J., Wullinger, P., Yaqine, H., Zange, S., Zeggini, E., Zimmermann, T., Zielke, A., Ibraheem, M., Ahmed, M., Becker, M., Diepers, P., Schälte, Y., Garí, M., Pütz, P., Pritsch, M., Fingerle, V., Le Gleut, R., Gilberg, L., Brand, I., Diefenbach, M., Eser, T., Weinauer, F., Martin, S., Quenzel, E.-M., Durner, J., Girl, P., Müller, K., Radon, K., Fuchs, C. & Hasenauer, J. (2022). The interplay of viral loads, clinical presentation, and serological responses in SARS-CoV-2 – Results from a prospective cohort of outpatient COVID-19 cases. Virology, 569, 37-43. Elsevier BV. doi:10.1016/j.virol.2022.02.002.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963169Pieschner, S., Hasenauer, J. & Fuchs, C. (2022). Identifiability analysis for models of the translation kinetics after mRNA transfection. Journal of Mathematical Biology, 84(7): 56. Springer . doi:10.1007/s00285-022-01739-x.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2988024Brand, I., Gilberg, L., Bruger, J., Garí, M., Wieser, A., Eser, T.M., Frese, J., Ahmed, M.I.M., Rubio-Acero, R., Guggenbuehl Noller, J.M., Castelletti, N., Diekmannshemke, J., Thiesbrummel, S., Huynh, D., Winter, S., Kroidl, I., Fuchs, C., Hoelscher, M., Roider, J., Kobold, S., Pritsch, M. & Geldmacher, C. (2021). Broad T Cell Targeting of Structural Proteins After SARS-CoV-2 Infection: High Throughput Assessment of T Cell Reactivity Using an Automated Interferon Gamma Release Assay. Frontiers in Immunology, 12. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fimmu.2021.688436.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959082Stegelmann, F., Wille, K., Marchi, H., Fuchs, C., Schauer, S., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Döhner, H., Stadler, R., Döhner, K. & Griesshammer, M. (2021). Publisher Correction: Significant association of cutaneous adverse events with hydroxyurea: results from a prospective non-interventional study in BCR-ABL1-negative myeloproliferative neoplasms (MPN) - on behalf of the German Study Group-MPN. Leukemia, 35, 3635. Springer Science and Business Media. doi:10.1038/s41375-021-01366-3.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944734Stegelmann, F., Wille, K., Busen, H., Fuchs, C., Schauer, S., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Döhner, H., Stadler, R., Döhner, K. & Griesshammer, M. (2021). Significant association of cutaneous adverse events with hydroxyurea: results from a prospective non-interventional study in BCR-ABL1-negative myeloproliferative neoplasms (MPN) - on behalf of the German Study Group-MPN. Leukemia, 35, 628-631. Springer Nature. doi:10.1038/s41375-020-0945-3.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957095Sekhri, R., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Huenerbein, K., Meixner, R., Marchi, H., Wallmann, R., Fuchs, C., Griesshammer, M. & Wille, K. (2021). Ruxolitinib-treated polycythemia vera patients and their risk of secondary malignancies. Annals of Hematology, 100(11), 2707-2716. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1007/s00277-021-04647-0.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956797Radon, K., Bakuli, A., Pütz, P., Gleut, R.L., Guggenbuehl Noller, J.M., Olbrich, L., Saathoff, E., Garí, M., Schälte, Y., Frahnow, T., Wölfel, R., Pritsch, M., Rothe, C., Pletschette, M., Rubio-Acero, R., Beyerl, J., Metaxa, D., Forster, F., Thiel, V., Castelletti, N., Rieß, F., Diefenbach, M.N., Fröschl, G., Bruger, J., Winter, S., Frese, J., Puchinger, K., Brand, I., Kroidl, I., Wieser, A., Hoelscher, M., Hasenauer, J. & Fuchs, C. (2021). From first to second wave: follow-up of the prospective Covid-19 cohort (KoCo19) in Munich (Germany). BMC Infectious Diseases, 21(1): 925. BioMed Central. doi:10.1186/s12879-021-06589-4.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944735Amrhein, L. & Fuchs, C. (2021). stochprofML: Stochastic Profiling Using Maximum Likelihood Estimation in R. BMC Bioinformatics, 22: 123. Springer Nature. doi:10.1186/s12859-021-03970-7.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957769Olbrich, L., Castelletti, N., Schälte, Y., Garí, M., Pütz, P., Bakuli, A., Pritsch, M., Kroidl, I., Saathoff, E., Guggenbuehl Noller, J., Fingerle, V., Le Gleut, R., Gilberg, L., Brand, I., Falk, P., Markgraf, A., Deák, F., Riess, F., Diefenbach, M., Eser, T., Weinauer, F., Martin, S., Quenzel, E.-M., Becker, M., Durner, J., Girl, P., Müller, K., Radon, K., Fuchs, C., Wölfel, R., Hasenauer, J., Hoelscher, M. & Wieser, A. (2021). Head-to-head evaluation of seven different seroassays including direct viral neutralisation in a representative cohort for SARS-CoV-2. Journal of General Virology, 102(10). Microbiology Society. doi:10.1099/jgv.0.001653.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957809Rubio-Acero, R., Beyerl, J., Muenchhoff, M., Roth, M.S., Castelletti, N., Paunovic, I., Radon, K., Springer, B., Nagel, C., Boehm, B., Böhmer, M.M., Graf, A., Blum, H., Krebs, S., Keppler, O.T., Osterman, A., Khan, Z.N., Hoelscher, M., Wieser, A., Emad, A., Jared, A., Abhishek, B., Maxilmilian, B., Marc, B., Franziska, B., Olimbek, B., Jessica, B., Patrick, B., Rebecca, B., Isabel, B., Jan, B., Friedrich, C., Noemi, C., Josephine, C., Lorenzo, C., Alina, C., Flora, D., Diefenbach Maximilian, N., Jana, D., Gerhard, D., Jürgen, D., Ute, E., Judith, E., Tabea, E., Philine, F., Manuela, F., Volker, F., Felix, F., Turid, F., Jonathan, F., Günter, F., Mercè, G., Otto, G., Christof, G., Leonard, G., Kristina, G., Philipp, G., Elias, G., Michelle, G.N.J., Maria, G.E., Pablo, G., Anslem, H., Marlene, H., Lena, H., Jan, H., Alejandra, H., Leah, H., Christian, H., Tim, H., Michael, H., Sacha, H., Kristina, H., Christian, J., Ursula, K., Antonia, K., Zohaib, K., Johanna, K., Inge, K., Arne, K., Magdalena, L., Clemens, L., Silvan, L., Michael, L., Ronan, L.G., Reiner, L., Leopold, L., Xhovana, L., Fabian, L., Sophie, N.A., Petra, M., Alisa, M., Rebecca, M., Dafni, M., Hannah, M., Katharina, M., Laura, O., Ivana, P., Michael, P., Claire, P., Michel, P., Michael, P., Stephan, P., Kerstin, P., Peter, P., Katja, R., Elba, R., Jakob, R., Friedrich, R., Camilla, R., Raquel, R.-A., Viktoria, R., Elmar, S., Nicole, S., Yannik, S., Benedikt, S., Lara, S., Mirjam, S., Lars, S., Alba, S., Peter, S., Kathrin, S., Jeni, T., Fabian, T., Verena, T., Sophie, T., Vincent, V., Emilia, V.L., Jonathan, V.L., Julia, W., Claudia, W., Andreas, W., Simon, W., Roman, W., Julia, W., Tobias, W., Sabine, Z., Eleftheria, Z., Anna, Z., Thorbjörn, Z. & Fuchs, C. (2021). Spatially resolved qualified sewage spot sampling to track SARS-CoV-2 dynamics in Munich - One year of experience. Science of The Total Environment, 797: 149031. Elsevier BV. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.149031.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957811Beyerl, J., Rubio-Acero, R., Castelletti, N., Paunovic, I., Kroidl, I., Khan, Z.N., Bakuli, A., Tautz, A., Oft, J., Hoelscher, M., Wieser, A. & Fuchs, C. (2021). A dried blood spot protocol for high throughput analysis of SARS-CoV-2 serology based on the Roche Elecsys anti-N assay. EBioMedicine, 70: 103502. Elsevier BV. doi:10.1016/j.ebiom.2021.103502.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2946318Krautenbacher, N., Kabesch, M., Horak, E., Braun-Fahrlander, C., Genuneit, J., Boznanski, A., von Mutius, E., Theis, F., Fuchs, C. & Ege, M.J. (2021). Asthma in farm children is more determined by genetic polymorphisms and in non-farm children by environmental factors. Pediatric allergy and immunology , 32(2), 295-304. Wiley. doi:10.1111/pai.13385.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2955537Brand, I., Gilberg, L., Bruger, J., Gari, M., Wieser, A., Eser, T.M., Frese, J., Ahmed, M.I.M., Rubio-Acero, R., Guggenbuehl Noller, J.M., Castelletti, N., Diekmannshemke, J., Thiesbrummel, S., Huynh, D., Winter, S., Kroidl, I., Fuchs, C., Hoelscher, M., Roider, J., Kobold, S., Pritsch, M. & Geldmacher, C. (2021). Broad T Cell Targeting of Structural Proteins After SARS-CoV-2 Infection: High Throughput Assessment of T Cell Reactivity Using an Automated Interferon Gamma Release Assay. Frontiers in Immunology, 12: 688436. Frontiers Media. doi:10.3389/fimmu.2021.688436.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951201Pritsch, M., Radon, K., Bakuli, A., Le Gleut, R., Olbrich, L., Guggenbuehl Noller, J.M., Saathoff, E., Castelletti, N., Garí, M., Pütz, P., Schaelte, Y., Frahnow, T., Wölfel, R., Rothe, C., Pletschette, M., Metaxa, D., Forster, F., Thiel, V., Riess, F., Diefenbach, M.N., Froeschl, G., Bruger, J., Winter, S., Frese, J., Puchinger, K., Brand, I., Kroidl, I., Hasenauer, J., Fuchs, C., Wieser, A. & Hoelscher, M. (2021). Prevalence and Risk Factors of Infection in the Representative COVID-19 Cohort Munich. International journal of environmental research and public health, 18(7): 3572. MDPI. doi:10.2139/ssrn.3745128.
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2021 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951202Olbrich, L., Castelletti, N., Schälte, Y., Garí, M., Pütz, P., Bakuli, A., Pritsch, M., Kroidl, I., Saathoff, E., Noller, J.M.G., Fingerle, V., Le Gleut, R., Gilberg, L., Brand, I., Falk, P., Markgraf, A., Deák, F., Riess, F., Diefenbach, M., Eser, T., Weinauer, F., Martin, S., Quenzel, E.-M., Becker, M., Durner, J., Girl, P., Müller, K., Radon, K., Fuchs, C., Wölfel, R., Hasenauer, J., Hoelscher, M. & Wieser, A. (2021). A Serology Strategy for Epidemiological Studies Based on the Comparison of the Performance of Seven Different Test Systems - The Representative COVID-19 Cohort Munich. bioRxiv. Cold Spring Harbor Laboratory. doi:10.1101/2021.01.13.21249735.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2946421Pieschner, S. & Fuchs, C. (2020). Bayesian inference for diffusion processes: using higher-order approximations for transition densities. Royal Society Open Science, 7(10): 200270. The Royal Society. doi:10.1098/rsos.200270.
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2020 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943872Marchi, H. & Fuchs, C. (2020). Modelling the impact of spatial proximity on scientific collaboration networks. Proceedings of the 35th International Workshop on Statistical Modelling (IWSM) 2020. Gehalten auf der 35th International Workshop on Statistical Modelling (IWSM) 2020.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944733Radon, K., Saathoff, E., Pritsch, M., Guggenbühl Noller, J.M., Kroidl, I., Olbrich, L., Thiel, V., Diefenbach, M., Riess, F., Forster, F., Theis, F., Wieser, A., Hoelscher, M., Bakuli, A., Eckstein, J., Froeschl, G., Geisenberger, O., Geldmacher, C., Heiber, A., Hoffmann, L., Huber, K., Metaxa, D., Pletschette, M., Rothe, C., Schunk, M., Wallrauch, C., Zimmer, T., Prückner, S., Fuchs, C., Hasenauer, J., Castelletti, N., Zeggini, E., Laxy, M., Leidl , R. & Schwettmann, L. (2020). Protocol of a population-based prospective COVID-19 cohort study Munich, Germany (KoCo19). BMC Public Health, 20(1): 1036. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/s12889-020-09164-9.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2943893Becker, M., Noll-Puchta, H., Amend, D., Nolte, F., Fuchs, C., Jeremias, I. & Braun, C.J. (2020). CLUE: a bioinformatic and wet-lab pipeline for multiplexed cloning of custom sgRNA libraries. Nucleic acids research, 48(13). Oxford University Press . doi:10.1093/nar/gkaa459.
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2020 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943873Amrhein, L. & Fuchs, C. (2020). Stochastic profiling of mRNA counts using HMC. Proceedings of the 35th International Workshop on Statistical Modelling (IWSM) 2020. Gehalten auf der 35th International Workshop on Statistical Modelling (IWSM) 2020.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937239Tirier, S.M., Park, J., Preusser, F., Amrhein, L., Gu, Z., Steiger, S., Mallm, J.-P., Krieger, T., Waschow, M., Eismann, B., Gut, M., Gut, I.G., Rippe, K., Schlesner, M., Theis, F., Fuchs, C., Ball, C.R., Glimm, H., Eils, R. & Conrad, C. (2019). Pheno-seq - linking visual features and gene expression in 3D cell culture systems. Scientific reports, 9(1): 12367. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-019-48771-4.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938376Hibbah, E.H., El Maroufy, H., Fuchs, C. & Ziad, T. (2019). An MCMC computational approach for a continuous time state-dependent regime switching diffusion process. JOURNAL OF APPLIED STATISTICS, 47, 1354-1374. Taylor & Francis Ltd. doi:10.1080/02664763.2019.1677573.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934063Krautenbacher, N., Flach, N., Bock, A., Laubhahn, K., Laimighofer, M., Theis, F.J., Ankerst, D.P., Fuchs, C. & Schaub, B. (2019). A strategy for high-dimensional multivariable analysis classifies childhood asthma phenotypes from genetic, immunological and environmental factors. Allergy, 74(7), 1364-1373. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/all.13745.
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2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2946521Wille, K., Stegelmann, F., Busen, H., Fuchs, C., Schauer, S., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Doehner, H., Doehner, K. & Griesshammer, M. (2019). Cutaneous adverse events (CAE) in MPN patients with cytoreductive therapy are strongly associated with hydroxyurea (HU): results from a prospective non-interventional study. ONCOLOGY RESEARCH AND TREATMENT (S. 96). Basel: Karger.
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2019 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2946520Wille, K., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Fuchs, C. & Griesshammer, M. (2019). No evidence for Ruxolitinib treatment being a potential risk factor for secondary primary malignancies (SPM) in 201 BCR/ABL-negative myeloproliferative neoplasm patients. ONCOLOGY RESEARCH AND TREATMENT (S. 71). Basel: Karger.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933522Wille, K., Sadjadian, P., Becker, T., Kolatzki, V., Horstmann, A., Fuchs, C. & Griesshammer, M. (2019). High risk of recurrent venous thromboembolism in BCR-ABL-negative myeloproliferative neoplasms after termination of anticoagulation. ANNALS OF HEMATOLOGY, 98(1), 93-100. Springer. doi:10.1007/s00277-018-3483-6.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933094Neschen, S., Wu, M., Fuchs, C., Kondofersky, I., Theis, F., de Angelis, M., Häring, H.-U. & Sartorius, T. (2018). Impact of Brain Fatty Acid Signaling on Peripheral Insulin Action in Mice. Experimental and Clinical Endocrinology & Diabetes, 128(01), 20-29. Georg Thieme Verlag. doi:10.1055/a-0735-9533.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892Dirmeier, S., Fuchs, C., Mueller, N.S. & Theis, F.J. (2017). netReg: network-regularized linear models for biological association studies. Bioinformatics, 34(5), 896-898. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/btx677.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934011Krautenbacher, N., Theis, F.J. & Fuchs, C. (2017). Correcting Classifiers for Sample Selection Bias in Two-Phase Case-Control Studies. Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2017: 7847531. Hindawi . doi:10.1155/2017/7847531.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934012Seyednasrollah, F., Koestler, D.C., Wang, T., Piccolo, S.R., Vega, R., Greiner, R., Fuchs, C., Gofer, E., Kumar, L., Wolfinger, R.D., Winner, K.K., Bare, C., Neto, E.C., Yu, T., Shen, L., Abdallah, K., Norman, T., Stolovitzky, G., Soule, H.R., Sweeney, C.J., Ryan, C., Scher, H.I., Sartor, O., Elo, L.L., Zhou, F.L., Guinney, J. & Costello, J.C. (2017). A DREAM challenge to build prediction models for short-term discontinuation of docetaxel in metastatic castration-resistant prostate cancer patients. JCO Clinical Cancer Informatics, 1(1), 1-15. American Society of Clinical Oncology. doi:10.1200/CCI.17.00018.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934014Kondofersky, I., Laimighofer, M., Kurz, C., Krautenbacher, N., Söllner, J.F., Dargatz, P., Scherb, H., Ankerst, D.P. & Fuchs, C. (2016). Three general concepts to improve risk prediction: good data, wisdom of the crowd, recalibration. F1000Research, 5: 2671. F1000 Research. doi:10.12688/f1000research.8680.1.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934015Köferle, A., Worf, K., Breunig, C., Baumann, V., Herrero, J., Wiesbeck, M., Hutter, L.H., Götz, M., Fuchs, C., Beck, S. & Stricker, S.H. (2016). CORALINA. A universal method for the generation of gRNA libraries for CRISPR-based screening. BMC Genomics, 17(1): 917. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-016-3268-z.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934017Kondofersky, I., Theis, F.J. & Fuchs, C. (2016). Inferring catalysis in biological systems. IET Systems Biology, 10(6), 210-218. Institution of Engineering and Technology (IET). doi:10.1049/iet-syb.2015.0087.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934013Guinney, J., Wang, T., Laajala, T.D., Winner, K.K., Bare, J.C., Neto, E.C., Khan, S.A., Peddinti, G., Airola, A., Pahikkala, T., Mirtti, T., Yu, T., Bot, B.M., Shen, L., Abdallah, K., Norman, T., Friend, S., Stolovitzky, G., Soule, H., Sweeney, C.J., Ryan, C.J., Scher, H.I., Sartor, O., Xie, Y., Aittokallio, T., Zhou, F.L., Costello, J.C., Abdallah, K., Aittokallio, T., Airola, A., Anghe, C., Azima, H., Baertsch, R., Ballester, P.J., Bare, C., Bhandari, V., Bot, B.M., Dang, C.C., Dunbar, M.B.-N., Buchardt, A.-S., Buturovic, L., Cao, D., Chalise, P., Cho, J., Chu, T.-M., Coley, R.Y., Conjeti, S., Correia, S., Costello, J.C., Dai, Z., Dai, J., Dargatz, P., Delavarkhan, S., Deng, D., Dhanik, A., Du, Y., Elangovan, A., Ellis, S., Elo, L.L., Espiritu, S.M., Fan, F., Farshi, A.B., Freitas, A., Fridley, B., Friend, S., Fuchs, C., Gofer, E., Peddinti, G., Graw, S., Greiner, R., Guan, Y., Guinney, J., Guo, J., Gupta, P., Guyer, A.I., Han, J., Hansen, N.R., Chang, B.H.W., Hirvonen, O., Huang, B., Huang, C., Hwang, J., Ibrahim, J.G., Jayaswa, V., Jeon, J., Ji, Z., Juvvadi, D., Jyrkkiö, S., Kanigel-Winner, K., Katouzian, A., Kazanov, M.D., Khan, S.A., Khayyer, S., Kim, D., Golinska, A.K., Koestler, D., Kokowicz, F., Kondofersky, I., Krautenbacher, N., Krstajic, D., Kumar, L., Kurz, C., Kyan, M., Laajala, T.D., Laimighofer, M., Lee, E., Lesinski, W., Li, M., Li, Y., Lian, Q., Liang, X., Lim, M., Lin, H., Lin, X., Lu, J., Mahmoudian, M., Manshaei, R., Meier, R., Miljkovic, D., Mirtti, T., Mnich, K., Navab, N., Neto, E.C., Newton, Y., Norman, T., Pahikkala, T., Pal, S., Park, B., Patel, J., Pathak, S., Pattin, A., Ankerst, D.P., Peng, J., Petersen, A.H., Philip, R., Piccolo, S.R., Pölsterl, S., Polewko-Klim, A., Rao, K., Ren, X., Rocha, M., Rudnicki, W.R., Ryan, C.J., Ryu, H., Sartor, O., Scherb, H., Sehgal, R., Seyednasrollah, F., Shang, J., Shao, B., Shen, L., Sher, H., Shiga, M., Sokolov, A., Söllner, J.F., Song, L., Soule, H., Stolovitzky, G., Stuart, J., Sun, R., Sweeney, C.J., Tahmasebi, N., Tan, K.-T., Tomaziu, L., Usset, J., Vang, Y.S., Vega, R., Vieira, V., Wang, D., Wang, D., Wang, J., Wang, L., Wang, S., Wang, T., Wang, Y., Wolfinger, R., Wong, C., Wu, Z., Xiao, J., Xie, X., Xie, Y., Xin, D., Yang, H., Yu, N., Yu, T., Yu, X., Zahedi, S., Zanin, M., Zhang, C., Zhang, J., Zhang, S., Zhang, Y., Zhou, F.L., Zhu, H., Zhu, S. & Zhu, Y. (2016). Prediction of overall survival for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer. Development of a prognostic model through a crowdsourced challenge with open clinical trial data. The Lancet Oncology, 18(1), 132-142. Elsevier BV. doi:10.1016/s1470-2045(16)30560-5.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934021Kaufmann, S., Fuchs, C., Gonik, M., Khrameeva, E.E., Mironov, A.A. & Frishman, D. (2015). Inter-Chromosomal Contact Networks Provide Insights into Mammalian Chromatin Organization. PLOS ONE, 10(5): e0126125. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0126125.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934023Sadic, D., Schmidt, K., Groh, S., Kondofersky, I., Ellwart, J., Fuchs, C., Theis, F.J. & Schotta, G. (2015). Atrx promotes heterochromatin formation at retrotransposons. EMBO reports, 16(7), 836-850. EMBO. doi:10.15252/embr.201439937.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934024Illner, K., Miettinen, J., Fuchs, C., Taskinen, S., Nordhausen, K., Oja, H. & Theis, F.J. (2015). Model selection using limiting distributions of second-order blind source separation algorithms. Signal Processing, 113, 95-103. Elsevier BV. doi:10.1016/j.sigpro.2015.01.017.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934025Kondofersky, I., Fuchs, C. & Theis, F.J. (2015). Identifying latent dynamic components in biological systems. IET Systems Biology, 9(5), 193-203. Institution of Engineering and Technology (IET). doi:10.1049/iet-syb.2014.0013.
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2015 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934045Illner, K., Fuchs, C. & Theis, F.J. (2015). Bayesian blind source separation applied to the lymphocyte pathway. In M. Gilli (Hrsg.), 21st International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT 2014). Proceedings of COMPSTAT 2014 (S. 625-632). Gehalten auf der COMPSTAT 2014, Red Hook, NJ.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934027Illner, K., Fuchs, C. & Theis, F.J. (2014). Bayesian Blind Source Separation for Data with Network Structure. Journal of Computational Biology, 21(11), 855-865. Mary Ann Liebert . doi:10.1089/cmb.2014.0117.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934046Bajikar, S.S., Fuchs, C., Roller, A., Theis, F.J. & Janes, K.A. (2014). Parameterizing cell-to-cell regulatory heterogeneities via stochastic transcriptional profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 111(5), E626-E635. National Academy of Sciences. doi:10.1073/pnas.1311647111.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934029Illner, K., Fuchs, C. & Theis, F.J. (2014). Single-cell analysis. Biology at high resolution. Separation - Science & Applications, 34, 24-26. Wiley-VCH.
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2014 | Zeitungsartikel | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934026Illner, K., Fuchs, C. & Theis, F.J. (20.10.2014) Einzelzellanalysen. Biologie in Hochauflösung. GIT Laborportal.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934030Fuchs, C. (2014). Mische und herrsche. Zelluläre Genexpression statistisch unterstützt analysieren. Laborpraxis, 2014(5), 20-22. Vogel Business Media.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934048Albrecht, E., Waldenberger, M., Krumsiek, J., Evans, A.M., Jeratsch, U., Breier, M., Adamski, J., Koenig, W., Zeilinger, S., Fuchs, C., Klopp, N., Theis, F.J., Wichmann, H.-E., Suhre, K., Illig, T., Strauch, K., Peters, A., Gieger, C., Kastenmüller, G., Doering, A. & Meisinger, C. (2013). Metabolite profiling reveals new insights into the regulation of serum urate in humans. Metabolomics, 10(1), 141-151. Springer Nature. doi:10.1007/s11306-013-0565-2.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934072Schneider, K., Fuchs, C., Dobay, A., Rottach, A., Qin, W., Wolf, P., Álvarez-Castro, J.M., Nalaskowski, M.M., Kremmer, E., Schmid, V., Leonhardt, H. & Schermelleh, L. (2013). Dissection of cell cycle–dependent dynamics of Dnmt1 by FRAP and diffusion-coupled modeling. Nucleic Acids Research, 41(9), 4860-4876. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkt191.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934050Wahl, S., Holzapfel, C., Yu, Z., Breier, M., Kondofersky, I., Fuchs, C., Singmann, P., Prehn, C., Adamski, J., Grallert, H., Illig, T., Wang-Sattler, R. & Reinehr, T. (2013). Metabolomics reveals determinants of weight loss during lifestyle intervention in obese children. Metabolomics, 9(6), 1157-1167. Springer Nature. doi:10.1007/s11306-013-0550-9.
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934073Illner, K., Fuchs, C. & Theis, F.J. (2012). Blind source separation using latent Gaussian graphical models. In A. Larjo, S. Schober, M. Farhan, M. Bossert, O. Yli-Harja & Tampere International Center for Signal Processing. (Hrsg.), Ninth International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2012 (S. 43-50). Gehalten auf der Ninth International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2012, Tampere, Finland.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934075Treu, G., Fuchs, F. & Dargatz, C. (2008). Implicit Authorization for Social Location Disclosure. Journal of Software, 3(1), 18-26. International Academy Publishing (IAP).
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934076Treu, G., Fuchs, F. & Dargatz, C. (2007). Implicit Authorization for Accessing Location Data in a Social Context. The Second International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES'07) (S. 263-272). Gehalten auf der The Second International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES'07), Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/ares.2007.98.
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