207 Publikationen

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  • [207]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2984580
    Rogers, A. D.; Appiah-Madson, H.; Ardron, J. A.; Bax, N. J.; Bhadury, P.; Brandt, A.; Buttigieg, P. - L.; De Clerck, O.; Delgado, C.; Distel, D. L.; Glover, A.; Gobin, J.; Guilhon, M.; Hampton, S.; Harden-Davies, H.; Hebert, P.; Hynes, L.; Lowe, M.; MacIntyre, S.; Madduppa, H.; de Azevedo Mazzuco, A. C.; McCallum, A.; McOwen, C.; Nattkemper, T. W.; Odido, M.; O'Hara, T.; Osborn, K.; Pouponneau, A.; Provoost, P.; Rabone, M.; Ramirez-Llodra, E.; Scott, L.; Sink, K. J.; Turk, D.; Watanabe, H. K.; Weatherdon, L. V.; Wernberg, T.; Williams, S.; Woodall, L.; Wright, D. J.; Zeppilli, D.; Steeds, O. (2023): Accelerating ocean species discovery and laying the foundations for the future of marine biodiversity research and monitoring Frontiers in Marine Science ,10:1224471
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  • [206]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2981135 OA
    van Kevelaer, R.; Langenkämper, D.; Nilssen, I.; Buhl-Mortensen, P.; Nattkemper, T. W. (2023): A data science approach for multi-sensor marine observatory data monitoring cold water corals (Paragorgia arborea) in two campaigns PLOS ONE,18:(7):e0282723
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  • [205]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2979717
    Momber, A. W.; Langenkämper, D.; Möller, T.; Nattkemper, T. W. (2023): The exploration and annotation of large amounts of visual inspection data for protective coating systems on stationary marine steel structures Ocean Engineering,278:114337
    PUB | DOI | WoS
     
  • [204]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2969165 OA
    Kloster, M.; Burfeid-Castellanos, A. M.; Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W.; Beszteri, B. (2023): Improving deep learning-based segmentation of diatoms in gigapixel-sized virtual slides by object-based tile positioning and object integrity constraint PLOS ONE,18:(2):e0272103
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  • [203]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2968512
    Momber, A.; Langenkämper, D.; Möller, T.; Nattkemper, T. W. (2023): Eine Online-Plattform für die Verarbeitung digitaler visueller Daten zur Zustandsbeschreibung von Beschichtungssystemen an maritimen Stahlbauten Stahlbau
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  • [202]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965093 OA
    Langenkämper, D.; Mogstad, A. A.; Hansen, I. M.; Baussant, T.; Bergsagel, O.; Nilssen, I.; Frost, T. K.; Nattkemper, T. W. (2022): Exploring time series of hyperspectral images for cold water coral stress response analysis PLoS ONE ,17:(8):e0272408
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  • [201]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964556 OA
    Tan, M.; Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W. (2022): The Impact of Data Augmentations on Deep Learning-Based Marine Object Classification in Benthic Image Transects Sensors,22:(14):5383
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  • [200]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964311 OA
    Tzanakis, K.; Nattkemper, T. W.; Niehaus, K.; Albaum, S. (2022): MetHoS: a platform for large-scale processing, storage and analysis of metabolomics data BMC Bioinformatics,23:(1):267
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  • [199]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2966492 OA
    Burfeid-Castellanos, A. M.; Kloster, M.; Beszteri, S.; Postel, U.; Spyra, M.; Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W.; Beszteri, B. (2022): A Digital Light Microscopic Method for Diatom Surveys Using Embedded Acid-Cleaned Samples Water,14:(20):3332
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  • [198]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964509
    Schoening, T.; Durden, J. M.; Faber, C.; Felden, J.; Heger, K.; Hoving, H. - J. T.; Kiko, R.; Koser, K.; Krammer, C.; Kwasnitschka, T.; Moller, K. O.; Nakath, D.; NaSS, A.; Nattkemper, T. W.; Purser, A.; Zurowietz, M. (2022): Making marine image data FAIR Scientific data,9:(1):414
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  • [197]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964756
    Schoening, T.; Durden, J. M.; Faber, C.; Felden, J.; Heger, K.; Hoving, H. - J. T.; Kiko, R.; Koser, K.; Krammer, C.; Kwasnitschka, T.; Moller, K. O.; Nakath, D.; NaSS, A.; Nattkemper, T. W.; Purser, A.; Zurowietz, M. (2022): Publisher Correction: Making marine image data FAIR Scientific Data ,9:(1):445
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  • [196]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962701
    Momber, A. W.; Nattkemper, T. W.; Langenkämper, D.; Möller, T.; Bruen, D.; Schaumann, P.; Shojai, S. (2022): Corrigendum to “A data-based model for condition monitoring and maintenance planning for protective coating systems for wind tower structures” [Renew. Energy 186 (2022) 957–973] Renewable Energy ,188: 1184.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [195]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960547
    Momber, A. W.; Nattkemper, T. W.; Langenkämper, D.; Möller, T.; Brün, D.; Schaumann, P.; Shojai, S. (2022): A data-based model for condition monitoring and maintenance planning for protective coating systems for wind tower structures Renewable Energy
    PUB | DOI
     
  • [194]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959631 OA
    Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W. (2021): Current Trends and Future Directions of Large Scale Image and Video Annotation: Observations From Four Years of BIIGLE 2.0 Frontiers in Marine Science,8:760036
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  • [193]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2952736 OA
    Canals, M.; Pham, C. K.; Bergmann, M.; Gutow, L.; Hanke, G.; van Sebille, E.; Angiolillo, M.; Buhl-Mortensen, L.; Cau, A.; Ioakeimidis, C.; Kammann, U.; Lundsten, L.; Papatheodorou, G.; Purser, A.; Sanchez-Vidal, A.; Schulz, M.; Vinci, M.; Chiba, S.; Galgani, F.; Langenkämper, D.; Moller, T.; Nattkemper, T. W.; Ruiz, M.; Suikkanen, S.; Woodall, L.; Fakiris, E.; Jack, M. E. M.; Giorgetti, A. (2021): The quest for seafloor macrolitter: a critical review of background knowledge, current methods and future prospects Environmental Research Letters ,16:(2):023001
    PUB | PDF | DOI | WoS
     
  • [192]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2960196
    Momber, A. W.; Möller, T.; Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W.; Bruen, D. (2021): A Digital Twin concept for the prescriptive maintenance of protective coating systems on wind turbine structures Wind Engineering,0309524X211060550
    PUB | DOI | WoS
     
  • [191]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2949959
    Muskat, L.; Kerkhoff, Y.; Humbert, P.; Nattkemper, T. W.; Eilenberg, J.; Patel, A. V. (2021): Image analysis-based quantification of fungal sporulation by automatic conidia counting and gray value correlation MethodsX,101218
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  • [190]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956291
    Momber, A.; Nattkemper, T. W.; Langenkämper, D.; Möller, T.; Bruen, D.; Schaumann, P.; Shojai, S. (2021): Digitalisierung und Verarbeitung von Sensordaten für die Zustandsbewertung von Oberflächenschutzsystemen stählerner Türme von Onshore-Windenergieanlagen Stahlbau,90:(7): 528-541.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [189]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951226 OA
    Wüllems, K.; Zurowietz, A.; Zurowietz, M.; Schneider, R.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2021): Fast Visual Exploration of Mass Spectrometry Images with Interactive Dynamic Spectral Similarity Pseudocoloring Scientific Reports,11:4606
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  • [188]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2950877 OA
    Möller, T.; Nattkemper, T. W. (2021): ALMI - A Generic Active Learning System for Computational Object Classification in Marine Observation Images Sensors,21:(4):1134
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  • [187]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942079 OA
    Gemeinholzer, B.; Vences, M.; Beszteri, B.; Bruy, T.; Felden, J.; Kostadinov, I.; Mirailes, A.; Nattkemper, T. W.; Printzen, C.; Renz, J.; Rybalka, N.; Schuster, T.; Weibulat, T.; Wilke, T.; Renner, S. S. (2020): Data storage and data re-use in taxonomy-the need for improved storage and accessibility of heterogeneous data ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION,20:(1): 1-8.
    PUB | PDF | DOI | WoS
     
  • [186]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945723 OA
    Kloster, M.; Langenkämper, D.; Zurowietz, M.; Beszteri, B.; Nattkemper, T. W. (2020): Deep learning-based diatom taxonomy on virtual slides Scientific Reports,10:(1):14416
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  • [185]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943901 OA
    Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W. (2020): An Interactive Visualization for Feature Localization in Deep Neural Networks Frontiers in Artificial Intelligence - Machine Learning and Artificial Intelligence ,3:49
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  • [184]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2943127
    Miralles, A.; Bruy, T.; Wolcott, K.; Scherz, M. D.; Begerow, D.; Beszteri, B.; Bonkowski, M.; Felden, J.; Gemeinholzer, B.; Glaw, F.; Glockner, F. O.; Hawlitschek, O.; Kostadinov, I.; Nattkemper, T. W.; Printzen, C.; Renz, J.; Rybalka, N.; Stadler, M.; Weibulat, T.; Wilke, T.; Renner, S. S.; Vences, M. (2020): Repositories for Taxonomic Data: Where We Are and What is Missing. Systematic biology
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  • [183]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945097 OA
    Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W. (2020): Unsupervised Knowledge Transfer for Object Detection in Marine Environmental Monitoring and Exploration IEEE Access,8
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  • [182]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948381
    Langenkämper, D.; Zurowietz, M.; Schoening, T.; Nattkemper, T. W. (2020): Corrigendum: BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections Frontiers in Marine Science,7:617268
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  • [181]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944758 OA
    Langenkämper, D.; van Kevelaer, R.; Purser, A.; Nattkemper, T. W. (2020): Gear-Induced Concept Drift in Marine Images and Its Effect on Deep Learning Classification Frontiers in Marine Science,7:506
    PUB | PDF | DOI | WoS
     
  • [180]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936089 OA
    Wüllems, K.; Kölling, J.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Hans, V. H.; Nattkemper, T. W. (2019): Detection and visualization of communities in mass spectrometry imaging data. BMC Bioinformatics,20:(1):303
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [179]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936069 OA
    Langenkämper, D.; Simon-Lledó, E.; Hosking, B.; Jones, D. O. B.; Nattkemper, T. W. (2019): On the impact of Citizen Science-derived data quality on deep learning based classification in marine images PLOS ONE,14:(6):e0218086
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [178]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931637
    Nattkemper, T. W.; Hattab, G. (2019): SeeVis — 3D space-time cube rendering for visualization of microfluidics image data Bioinformatics,35:(10): 1802-1804.
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  • [177]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935488 OA
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Jarnegren, J.; Van Engeland, T.; Buhl-Mortensen, P.; Nattkemper, T. W. (2019): Computer vision enables short- and long-term analysis of Lophelia pertusa polyp behaviour and colour from an underwater observatory. Scientific reports,9:(1):6578
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  • [176]
    2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935366
    Zurowietz, M.; Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W. (2019): BIIGLE2Go - A scalable image annotation system for easy deployment on cruises. In: Proceedings of IEEE OCEANS 2019.
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  • [175]
    2019 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2937705
    Möller, T.; Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W. (In Press): Wind turbine segmentation performing kNN-clustering on superpixel segmentations. In: Lorenzo Bruzzone; Francesca Bovolo (Hrsg.): Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. (Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Proceedings, 11155).
    PUB
     
  • [174]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918218 OA
    Hattab, G.; Wiesmann, V.; Becker, A.; Munzner, T.; Nattkemper, T. W. (2018): A Novel methodology for characterizing cell subpopulations in automated time-lapse microscopy Frontiers in Bioengineering and Biotechnology,6:17
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [173]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932066 OA
    Zurowietz, M.; Langenkämper, D.; Hosking, B.; Ruhl, H.; Nattkemper, T. W. (2018): MAIA - A machine learning assisted image annotation method for environmental monitoring and exploration PLoS ONE,13:(11):e0207498
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [172]
    2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921040
    Möller, T.; Nillsen, I.; Nattkemper, T. W. (2018): Tracking Sponge Size and Behaviour with Fixed Underwater Observatories. In: Zhaoxiang Zhang; David Suter; Yingli Tian; Alexandra Branzan Albu; Nicolas Sidère; Hugo Jair Escalante (Hrsg.): Pattern Recognition and Information Forensics. ICPR 2018 International Workshops, CVAUI, IWCF, and MIPPSNA, Beijing, China, August 20-24, 2018, Revised Selected Papers. Cham: Springer. ( Lecture Notes in Computer Science, 11188). S. 45-54.
    PUB | DOI
     
  • [171]
    2018 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2921039 OA
    Langenkämper, D.; van Kevelaer, R.; Nattkemper, T. W. (Accepted): Strategies for Tackling the Class Imbalance Problem in Marine Image Classification.
    PUB | PDF
     
  • [170]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911830 OA
    Hattab, G.; Schlüter, J. - P.; Becker, A.; Nattkemper, T. W. (2017): ViCAR: An Adaptive and Landmark-Free Registration of Time Lapse Image Data from Microfluidics Experiments Frontiers in Genetics,8:69
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [169]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909190 OA
    Langenkämper, D.; Zurowietz, M.; Schoening, T.; Nattkemper, T. W. (2017): BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections Frontiers in Marine Science,4:(March):83
    PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS
     
  • [168]
    2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915349
    Möller, T.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2017): Active learning for the classification of species in underwater images from a fixed observatory. In: Proceedings of The IEEE International Conference on Computer Vision Workships (ICCVW). Piscataway, NJ: IEEE. S. 2891-2897.
    PUB
     
  • [167]
    2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908753 OA
    Osterloff, J.; Möller, T.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2017): Extracting Scalar Quantities from Underwater Images - a Toolbox for Image Data from Fixed Observatories.
    PUB | PDF
     
  • [166]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901477
    Ahmed Raza, S. E.; Langenkämper, D.; Sirinukunwattana, K.; Epstein, D.; Nattkemper, T. W.; Rajpoot, N. M. (2016): Robust normalization protocols for multiplexed fluorescence bioimage analysis BioData Mining,9:(1):11
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [165]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900943
    Langenkämper, D.; Jakobi, T.; Feld, D.; Jelonek, L.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W. (2016): Comparison of Acceleration Techniques for Selected Low-Level Bioinformatics Operations Frontiers in Genetics,7:5
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [164]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903712 OA
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Eide, I.; de Oliveira Figueiredo, M. A.; de Souza Tâmega, F. T.; Nattkemper, T. W. (2016): Computational Visual Stress Level Analysis of Calcareous Algae Exposed to Sedimentation PLOS ONE,11:(6):e0157329
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [163]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907705
    Brink, B.; Seidel, A.; Kleinbölting, N.; Nattkemper, T. W.; Albaum, S. (2016): Omics Fusion - A Platform for Integrative Analysis of Omics Data Journal of Integrative Bioinformatics,13:(4: SI):296
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [162]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901413 OA
    Gorzolka, K.; Kölling, J.; Nattkemper, T. W.; Niehaus, K. (2016): Spatio-Temporal Metabolite Profiling of the Barley Germination Process by MALDI MS Imaging PLOS ONE,11:(3):e0150208
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [161]
    2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904671
    Möller, T.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2016): Change Detection in Marine Observatory Image Streams using Bi-Domain Feature Clustering. In: 2016 23rd International Conference on Pattern Recognition (ICPR). Piscataway, NJ: IEEE. S. 793-798.
    PUB | DOI
     
  • [160]
    2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906524
    Möller, T.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2016): Data-driven Long Term Change Analysis in Marine Observatory Image Streams. In: 2016 ICPR 2nd Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI 2016) . Proceedings. Piscataway, NJ: IEEE. S. 13-18.
    PUB
     
  • [159]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2902750 OA
    Schoening, T.; Osterloff, J.; Nattkemper, T. W. (2016): RecoMIA - Recommendations for marine image annotation: Lessons learned and future directions Frontiers in Marine Science,3:59
    PUB | PDF | DOI | WoS
     
  • [158]
    2016 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2904670
    Langenkämper, D.; Nattkemper, T. W. (Accepted): COATL - A Learning Architecture for Online Real-Time Detection and Classification Assistance for Environmental Data. In: Proceedings of the International Conference on Pattern Recognition (ICPR).
    PUB
     
  • [157]
    2016 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903653
    Durden, J.; Schoening, T.; Althaus, F.; Friedmann, A.; Garica, R.; Glover, A. G.; Greinert, J.; Stout, N. J.; Jones, D. O. B.; Jordt, A.; Kaeli, J. W.; Koser, K.; Kuhnz, L. A.; Lindsay, D.; Morris, K. J.; Nattkemper, T. W.; Osterloff, J.; Ruhl, H.; Singh, H.; Tran, M.; Bett, B. J. (2016): Perspectives in Visual Imaging for Marine Biology and Ecology: From Acquisition to Understanding. In: R.N. Hughes; D.J. Hughes; I.P. Smith; A.C. Dale (Hrsg.): Oceanography and Marine Biology: An Annual Review. Boca Raton: CRC Press. (54, ). S. 1-72.
    PUB | WoS
     
  • [156]
    2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903711
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2016): Computational Coral Feature Monitoring for the fixed underwater Observatory LoVe. In: Proceedings of IEEE OCEANS 2016.
    PUB | DOI
     
  • [155]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903363
    Durden, J. M.; Bett, B. J.; Schoening, T.; Morris, K. J.; Ruhl, H. A.; Nattkemper, T. W. (2016): Comparison of image annotation data generated by multiple investigators for benthic ecology Marine Ecology Progress Series,552: 61-70.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [154]
    2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906522
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Järnegren, J.; Buhl-Mortensen, P.; Nattkemper, T. W. (2016): Polyp activity estimation and monitoring for cold water corals with a deep learning approach. In: Proceedigs of CVAUI 2016 (ICPR Workshop).
    PUB | DOI
     
  • [153]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2902749
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2016): A computer vision approach for monitoring the spatial and temporal shrimp distribution at the LoVe observatory Methods in Oceanography,15-16: 114-128.
    PUB | DOI
     
  • [152]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Angenommen | PUB-ID: 2902857
    Schoening, T.; Kuhn, T.; Jones, D. O. B.; Simon-Lledo, E.; Nattkemper, T. W. (Accepted): Fully automated image segmentation for benthic resource assessment of poly-metallic nodules Methods in Oceanography,15-16: 78-89.
    PUB | DOI
     
  • [151]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905905
    Nuno Gomes-Pereira, J.; Auger, V.; Beisiegel, K.; Benjamin, R.; Bergmann, M.; Bowden, D.; Buhl-Mortensen, P.; De Leo, F. C.; Dionísio, G.; Durden, J. M.; Edwards, L.; Friedman, A.; Greinert, J.; Jacobsen-Stout, N.; Lerner, S.; Leslie, M.; Nattkemper, T. W.; Sameoto, J. A.; Schoening, T.; Schouten, R.; Seager, J.; Singh, H.; Soubigou, O.; Tojeira, I.; van den Beld, I.; Dias, F.; Tempera, F.; Santos, R. S. (2016): Current and future trends in marine image annotation software Progress in Oceanography,149: 106-129.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [150]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722138 OA
    Kessler, N.; Bonte, A.; Albaum, S.; Mäder, P.; Messmer, M.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Langenkämper, G.; Nattkemper, T. W. (2015): Learning to classify organic and conventional wheat - a machine-learning driven approach using the MeltDB 2.0 metabolomics analysis platform Frontiers in Bioinformatics and Computational Biology,3:35
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [149]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2724431 OA
    Schoening, T.; Kuhn, T.; Bergmann, M.; Nattkemper, T. W. (2015): DELPHI - fast and adaptive computational laser point detection and visual footprint quantification for arbitrary underwater image collections Frontiers in Marine Science,2:20
    PUB | PDF | DOI | WoS
     
  • [148]
    2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775951 OA
    Möller, T.; Nilssen, I.; Sumida, P.; Osterloff, J.; Nattkemper, T. W. (2015): Change Detection in underwater time laps videos from stationary observatories.
    PUB | PDF
     
  • [147]
    2015 | Datenpublikation | PUB-ID: 2777409 OA
    Schlueter, J. - P.; McIntosh, M.; Hattab, G.; Nattkemper, T. W.; Becker, A. (2015): Phase Contrast and Fluorescence Bacterial Time-Lapse Microscopy Image Data. Bielefeld University.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI
     
  • [146]
    2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775956 OA
    Steinbrink, B.; Schoening, T.; Brün, D.; Nattkemper, T. W. (2015): Integrated Digital Marine Image Analysis and Management - new solutions to handle large image collections in environmental monitoring and exploration.
    PUB | PDF
     
  • [145]
    2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2735538 OA
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; Möller, T.; Nattkemper, T. W. (2015): Computational analysis of spatial species distribution for integrated stationary environmental monitoring.
    PUB | PDF
     
  • [144]
    2015 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2775947
    Schoening, T.; Langenkämper, D.; Steinbrink, B.; Brün, D.; Nattkemper, T. W. (In Press): Rapid image processing and classification in underwater exploration using advanced high performance computing. In: Proc. of the IEEE Oceans. Washington DC, USA: IEEE.
    PUB
     
  • [143]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2655889
    Osterloff, J.; Schoening, T.; Bergmann, M.; Nattkemper, T. W. (2014): An overview and rating of benthic image pre-processings for color constancy. S. 1-1.
    PUB
     
  • [142]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705712 OA
    Langenkämper, D.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W. (2014): AKE - The Accelerated k-mer Exploration Web-Tool for Rapid Taxonomic Classification and Visualization BMC Bioinformatics,15:(1):384
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [141]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656048 OA
    Möller, T.; Nilssen, I.; Nattkemper, T. W. (2014): Introduction of image-based water transparency descriptors to quantify marine snow and turbidity features. A study with data from a stationary observatory.
    PUB | PDF
     
  • [140]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2706029 OA
    Kessler, N.; Walter, F.; Persicke, M.; Albaum, S.; Kalinowski, J.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2014): ALLocator: An Interactive Web Platform for the Analysis of Metabolomic LC-ESI-MS Datasets, Enabling Semi-Automated, User-Revised Compound Annotation and Mass Isotopomer Ratio Analysis PLoS ONE,9:(11):e113909
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [139]
    2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2683648
    Osterloff, J.; Schoening, T.; Bergmann, M.; Durden, J. M.; Ruhl, H. A.; Nattkemper, T. W. (2014): Ranking Color Correction Algorithms using Cluster Indices.
    PUB | DOI | Download (ext.)
     
  • [138]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690300
    Kölling, J.; Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W. (2014): Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging.
    PUB | Download (ext.)
     
  • [137]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676320 OA
    Osterloff, J.; Nilssen, I.; de Oliveira Figueiredo, M. A.; de Souza Tâmega, F. T.; Möller, T.; Nattkemper, T. W. (2014): Automated Image based Biomass Quantification in Mesocosm Studies.
    PUB | PDF
     
  • [136]
    2014 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2690335
    Rathke, M.; Kölling, J.; Gorzolka, K.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (In Press): Interactive and dynamic web-based visual exploration of high dimensional bioimages with real time clustering.
    PUB
     
  • [135]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Im Druck | PUB-ID: 2690436 OA
    Kölling, J.; Gorzolka, K.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (In Press): Spatio-temporal analysis of metabolite profiles during barley germination.
    PUB | PDF
     
  • [134]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690322
    Kölling, J.; Zurowietz, M.; Nattkemper, T. W. (2014): Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging. ISCB.
    PUB | Download (ext.)
     
  • [133]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676334
    Möller, T.; Nilssen, I.; Sumida, P. Y. G.; Elbers, K. L.; Nattkemper, T. W. (2014): Novelty detection in time lapse image data.
    PUB
     
  • [132]
    2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695
    Robert Giegerich; Ralf Hofestädt; Tim Wilhelm Nattkemper (Hrsg.) (2014): German Conference on Bioinformatics 2014, In: Robert Giegerich; Ralf Hofestädt; Tim Wilhelm Nattkemper (Hrsg.), GI-Edition: lecture notes in informatics,235
    PUB
     
  • [131]
    2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717407
    Schoening, T.; Kuhn, T.; Nattkemper, T. W. (2014): Seabed Classification Using a Bag-of-Prototypes Feature Representation. In: Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI), 2014 ICPR Workshop on. S. 17-24.
    PUB | DOI
     
  • [130]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775961
    Schoening, T.; Brün, D.; Kuhn, T.; Nattkemper, T. W. (2014): Image-based marine resource exploration and biodiversity assessment with MAMAS (Marine data Asset Management and Analysis System).
    PUB
     
  • [129]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610505
    Purser, A.; Ontrup, J.; Schoening, T.; Thomsen, L.; Tong, R.; Unnithan, V.; Nattkemper, T. W. (2013): Microhabitat and shrimp abundance within a Norwegian cold-water coral ecosystem Biogeosciences,10:(9): 5779-5791.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [128]
    2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2610134
    Schoening, T.; Steinbrink, B.; Brün, D.; Kuhn, T.; Nattkemper, T. W. (In Press): Ultra-fast segmentation and quantification of poly-metallic nodule coverage in high-resolution digital images. In: Proceedings of the UMI 2013.
    PUB
     
  • [127]
    2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2537912
    Rubiano Castellanos, C. C.; Merkle, T.; Nattkemper, T. W. (In Press): Using random forest to find Nuclear Export Signals (NESs) in proteins of Arabidopsis thaliana.
    PUB
     
  • [126]
    2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656054
    Schoening, T.; Bergmann, M.; Nattkemper, T. W. (2013): A machine-learning system for the automated detection of megafauna and its applicability unseen footage.
    PUB
     
  • [125]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2625914
    Bergmann, T.; Maeder, U.; Fiebich, M.; Dickob, M.; Nattkemper, T. W.; Anselmetti, D. (2013): Categorization of two-photon microscopy images of human cartilage into states of osteoarthritis Osteoarthritis And Cartilage,21:(8): 1074-1082.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [124]
    2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610762
    Nattkemper, T. W. (2013): Cluster Analysis. In: Werner Dubitzky; Olaf Wolkenhauer; Kwang-Hyun Cho; Hiroki Yokota (Hrsg.): Encyclopedia of Systems Biology. New York, NY : Springer.
    PUB
     
  • [123]
    2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656093
    Kuhn, T.; Rühlemann, C.; Wiedicke-Hombach, M.; Schoening, T.; Nattkemper, T. W. (2013): Application of Hydro-Acoustic and Video Data for the Exploration of Manganese Nodule Fields.
    PUB
     
  • [122]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
    Kessler, N.; Bonte, A.; Langenkämper, G.; Niehaus, K.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W. (2013): MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system Bioinformatics,29:(19): 2452-2459.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [121]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2542584
    Held, C.; Nattkemper, T. W.; Palmisano, R.; Wittenberg, T. (2013): Approaches to automatic parameter fitting in a microscopy image segmentation pipeline: An exploratory parameter space analysis Journal of Pathology Informatics,4:(2):5
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [120]
    2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2538625
    Bonte, A.; Kessler, N.; Nattkemper, T. W.; Goesmann, A.; Cecile, T.; Mäder, P.; Niehaus, K.; Langenkämper, G. (In Press): Einsatz von Protein- und Metabolit-Profiling-Methoden zur Unterscheidung von ökologischem und konventionellem Weizen.
    PUB
     
  • [119]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2494458 OA
    Schoening, T.; Bergmann, M.; Purser, A.; Dannheim, J.; Gutt, J.; Nattkemper, T. W. (2012): Semi-automated image analysis for the assessment of megafaunal densities at the Arctic deep-sea observatory HAUSGARTEN PLoS ONE,7:(6):e38179
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [118]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2455753 OA
    Raza, S. - E. - A.; Epstein, D.; Nattkemper, T. W.; Rajpoot, N. (2012): RAMTaB: Robust Alignment of Multi-Tag Bioimages PLoS ONE,7:(2):e30894
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [117]
    2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656105
    Figueiredo Creed, M.; Coutinho, R.; Reynier, M. V.; Cesar Paiva, P.; Villas, A. B.; Bôas, A. B.; Tapajó s de Souza Tâmega, F.; Nattkemper, T. W.; Eide, I. (2012): Effects of drill cuttings on a deep water rhodolith bed: an integrated approach.
    PUB
     
  • [116]
    2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656050
    Schoening, T.; Kuhn, T.; Nattkemper, T. W. (2012): Estimation of poly-metallic nodule coverage in benthic images. In: Proc. of the 41st Conference of the Underwater Mining Institute (UMI).
    PUB
     
  • [115]
    2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656067
    Schoening, T.; Bergmann, M.; Purser, A.; Gutt, J.; Dannheim, J.; Taylor, J.; Nattkemper, T. W.; Boetius, A. (2012): The impact of experts’ inter- and intra-observer agreements on computational object classification in images from the deep seafloor of the HAUSGARTEN observatory.
    PUB
     
  • [114]
    2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2515687 OA
    Kölling, J.; Rathke, M.; Abouna, S.; Khan, M.; Nattkemper, T. W. (2012): Analyzing Multi-Tag Bioimages with BIOIMAX colocation mining tools.
    PUB | PDF
     
  • [113]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498232
    Trötschel, C.; Albaum, S.; Wolff, D.; Schröder, S.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W.; Poetsch, A. (2012): Protein turnover quantification in a multi-labeling approach - from data calculation to evaluation Molecular & Cellular Proteomics,11:(8): 512-526.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [112]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2536156
    Zhou, L.; Pelengaris, S.; Abouna, S.; Young, J.; Epstein, D.; Herold, J.; Nattkemper, T. W.; Nakhai, H.; Khan, M. (2012): Re-Expression of IGF-II Is Important for Beta Cell Regeneration in Adult Mice PLoS ONE,7:(9):e43623
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [111]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783 OA
    Kölling, J.; Langenkämper, D.; Sylvie, A.; Michale, K.; Nattkemper, T. W. (2012): WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages Bioinformatics,28:(8): 1143-1150.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [110]
    2012 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2515596 OA
    Nattkemper, T. W. (In Press): Are we ready for Science 2.0?
    PUB | PDF
     
  • [109]
    2012 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 2515700
    Schoening, T.; Bergmann, M.; Boetius, A.; Nattkemper, T. W. (2012): Investigation of hidden parameters influencing the automated object detection in benthic images.
    PUB
     
  • [108]
    2012 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 2515671
    Held, C.; Nattkemper, T. W.; Wittenberg, T. (2012): Approaches to automatic parameter fitting in a microscopy image segmentation pipeline: An exploratory parameter space analysis.
    PUB
     
  • [107]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300114
    Loyek, C.; Bunkowski, A.; Vautz, W.; Nattkemper, T. W. (2011): Web2.0 paves new ways for collaborative and exploratory analysis of Chemical Compounds in Spectrometry Data Journal of Integrative Bioinformatics,8:(2): 158.
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [106]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300063 OA
    Albaum, S.; Hahne, H.; Otto, A.; Haußmann, U.; Becher, D.; Poetsch, A.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W. (2011): A guide through the computational analysis of isotope-labeled mass spectrometry-based quantitative proteomics data: an application study Proteome Science,9:(1):30
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [105]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300073 OA
    Martin, C.; Tauchen, A.; Becker, A.; Nattkemper, T. W. (2011): A Normalized Tree Index for identification of correlated clinical parameters in microarray data BioData Mining,4:(1):2
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [104]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300082 OA
    Loyek, C.; Khan, M.; Rajpoot, N.; Nattkemper, T. W. (2011): BIOIMAX - A Web 2.0 approach for easy exploratory and collaborative access to multivariate bioimage data BMC Bioinformatics,12:(1):297
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [103]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300092
    Bergmann, M.; Langwald, N.; Ontrup, J.; Soltwedel, T.; Schewe, I.; Klages, M.; Nattkemper, T. W. (2011): Megafaunal assemblages from two shelf stations west of Svalbard Marine Biology Research,7:(6): 525-539.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [102]
    2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300232 OA
    Loyek, C.; Kölling, J.; Langenkämper, D.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2011): A Web2.0 Strategy for the Collaborative Analysis of Complex Bioimages. In: João Gama; Elizabeth Bradley; Jaakko Hollmén (Hrsg.): Advances in Intelligent Data Analysis X: 10th International Symposium, IDA 2011, Porto, Portugal, October 29-31, 2011. Proceedings. Berlin, Heidelberg: Springer. (Lecture Notes in Computer Science, 7014). S. 258-269.
    PUB | PDF | DOI
     
  • [101]
    2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300237 OA
    Langenkämper, D.; Kölling, J.; Khan, M.; Rajpoot, N.; Nattkemper, T. W. (2011): Towards Protein Network Analysis using TIS Imaging and Exploratory Data Analysis.
    PUB | PDF
     
  • [100]
    2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656082
    Purser, A.; Ontrup, J.; Schoening, T.; Thomsen, L.; Unnithan, V.; Nattkemper, T. W. (2011): How to squeeze even more from your Terabytes of video data!. Hermione Newsletter. (8). S. 3-4.
    PUB
     
  • [99]
    2011 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2315356
    Bergmann, T.; Fiebich, T. M.; Nattkemper, T. W.; Anselmetti, D. (In Press): Categorization of 2-photon microscopy images of human articular cartilage into states of arthritis. Freiburg, Germany.
    PUB
     
  • [98]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2373808
    Herold, J.; Loyek, C.; Nattkemper, T. W. (2011): Multivariate Image Mining Wiley Interdisciplinary Reviews: DATA MINING AND KNOWLEDGE DISCOVERY,1:(1): 2-13.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [97]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300102
    Arif, M.; Rajpoot, N.; Technow, U.; Chakraborty, T.; Fisch, N.; Jensen, N. A.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2011): Quantification of Cell Infection Caused by Listeria monocytogenes Invasion Journal of Biotechnology,154:(1): 76-83.
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [96]
    2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2323705 OA
    Langenkämper, D.; Kölling, J.; Abouna, S.; Khan, M.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2011): TICAL - a web-tool for multivariate image clustering and data topology preserving visualization.
    PUB | PDF | Download (ext.)
     
  • [95]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093532
    Scherbart, A.; Nattkemper, T. W. (2011): Looking inside self-organizing map ensembles with resampling and negative correlation learning Neural Networks,24:(1): 130-141.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [94]
    2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300235
    Schoening, T.; Hans, V.; Nattkemper, T. W. (2011): Towards improved epilepsia diagnosis by unsupervised segmentation of neuropathology tissue sections using Ripley’s-L features. In: Bildverarbeitung für die Medizin 2011:Algorithmen - Systeme - Anwendungen Proceedings des Workshops vom 20. - 22. März 2011 in Lübeck. Berlin, Heidelberg: Springer. (Informatik aktuell, ). S. 44-48.
    PUB | DOI
     
  • [93]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929340
    Burgemeister, S.; Nattkemper, T. W.; Noll, T.; Hoffrogge, R.; Flaschel, E. (2010): CellViCAM-Cell viability classification for animal cell cultures using dark field micrographs JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,149:(4): 310-316.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [92]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1794419
    Herold, J.; Zhou, L.; Abouna, S.; Pelengaris, S.; Epstein, D.; Khan, M.; Nattkemper, T. W. (2010): Integrating semantic annotation and information visualization for the analysis of multichannel fluorescence micrographs from pancreatic tissue Computerized Medical Imaging and Graphics,34:(6): 446-452.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [91]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929311
    Gölzhäuser, A.; Nattkemper, T. W.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Sauer, M. (2010): BioImaging: Contributions from biology, physics and informatics Journal of Biotechnology,149:(4): 227-228.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [90]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929335
    Herold, J.; Schubert, W.; Nattkemper, T. W. (2010): Automated detection and quantification of fluorescently labeled synapses in murine brain tissue sections for high throughput applications JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,149:(4): 299-309.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [89]
    2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018390
    Herold, J.; Abouna, S.; Zhou, L.; Pelengaris, S.; Epstein, D. B. A.; Khan, M.; Nattkemper, T. W. (2009): A way towards analyzing high-content bioimage data by means of semantic annotation and visual data mining. In: SPIE Medical Imaging. SPIE.
    PUB | DOI
     
  • [88]
    2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018422
    Ontrup, J.; Ehnert, N.; Bergmann, M.; Nattkemper, T. W. (2009): BIIGLE - Web 2.0 enabled labelling and exploring of images from the Arctic deep-sea observatory HAUSGARTEN. In: OCEANS 2009 - Europe. Bremen.
    PUB | DOI
     
  • [87]
    2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018427
    Qureshi, H.; Rajpoot, N.; Nattkemper, T. W.; Hans, V. (2009): A Robust Adaptive Wavelet-based Method for Classification of Meningioma Histology Images. In: MICCAI«2009 Workshop on Optical Tissue Image Analysis in Microscopy, Histology, and Endoscopy.
    PUB
     
  • [86]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314 OA
    Diaz, N. N.; Krause, L.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2009): TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach BMC Bioinformatics,10:(1): 56.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [85]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
    Albaum, S.; Neuweger, H.; Fraenzel, B.; Lange, S.; Mertens, D.; Troetschel, C.; Wolters, D.; Kalinowski, J.; Nattkemper, T. W.; Goesmann, A. (2009): Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments Bioinformatics,25:(23): 3128-3134.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [84]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783
    Purser, A.; Bergmann, M.; Ontrup, J.; Nattkemper, T. W. (2009): Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study Marine Ecology Progress Series,397: 241-251.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [83]
    2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591448
    Saalbach, A.; Lange, O.; Nattkemper, T. W.; Meyer-Baese, A. (2009): On the application of (topographic) independent and tree-dependent component analysis for the examination of DCE-MRI data. In: Biomedical Signal Processing and Control. ELSEVIER SCI LTD. (BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL, 4). S. 247-253.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [82]
    2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018440
    Schoening, T.; Ehnert, N.; Ontrup, J.; Nattkemper, T. W. (2009): BIIGLE Tools - A Web 2.0 Approach for Visual Bioimage Database Mining. In: IV 09 - Intl. Conference on Information Visualization. IEEE.
    PUB | DOI
     
  • [81]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018405
    Loyek, C.; Woermann, F. G.; Nattkemper, T. W. (2008): Detection of Focal Cortical Dysplasia in MRI Using Textural Features. In: Thomas Tolxdorff (Hrsg.): Proceedings of BVM 2008. Berlin, Heidelberg: Springer Verlag. (Informatik aktuell, ). S. 432-436.
    PUB | DOI
     
  • [80]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280 OA
    Timm, W.; Scherbart, A.; Boecker, S.; Kohlbacher, O.; Nattkemper, T. W. (2008): Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics BMC Bioinformatics,9:(1): 443.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [79]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611 OA
    Wei, N.; Flaschel, E.; Friehs, K.; Nattkemper, T. W. (2008): A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification BMC Bioinformatics,9:(1): 449.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [78]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587052
    Martin, C.; Diaz, N. N.; Ontrup, J.; Nattkemper, T. W. (2008): Hyperbolic SOM-based clustering of DNA fragment features for taxonomic visualization and classification Bioinformatics,24:(14): 1568-1574.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [77]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588286
    Twellmann, T.; Meyer-Baese, A.; Lange, O.; Foo, S.; Nattkemper, T. W. (2008): Model-free visualization of suspicious lesions in breast MRI based on supervised and unsupervised learning ENGINEERING APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE,21:(2): 129-140.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [76]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783364 OA
    Krause, L.; Diaz, N. N.; Goesmann, A.; Kelley, S.; Nattkemper, T. W.; Rohwer, F.; Edwards, R. A.; Stoye, J. (2008): Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments Nucleic Acids Research,36:(7): 2230-2239.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [75]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018409
    Martin, C.; Nattkemper, T. W. (2008): A Tree Index to Support Clustering Based Exploratory Data Analysis. In: Bioinformatics Research and Development : Second International Conference, BIRD 2008 Vienna, Austria, July 7-9, 2008 Proceedings. Berlin, Heidelberg: Springer. (Communications in Computer and Information Science, 13). S. 1-15.
    PUB | DOI
     
  • [74]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018435
    Scherbart, A.; Timm, W.; Böcker, S.; Nattkemper, T. W. (2008): Improved Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction by Adaptive Feature Weighting. In: International Conference on Neural Information Processing. Auckland, New Zealand.
    PUB | DOI
     
  • [73]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018381
    Albaum, S.; Neuweger, H.; Lange, S.; Mertens, D.; Runte, K.; Kalinowski, J.; Nattkemper, T. W.; Goesmann, A. (2008): ProSE - "Software as a Service" for Quantitative Proteomics (Poster abstract). In: HUPO 7th Annual World Congress.
    PUB
     
  • [72]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018398
    Herold, J.; Friedenberger, M.; Bode, M.; Rajpoot, N.; Schubert, W.; Nattkemper, T. W. (2008): Flexible Synapse Detection in Fluorescence Micrographs by Modeling Human Expert Grading. In: Proc. of 2008 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging.
    PUB | DOI
     
  • [71]
    2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018432
    Scherbart, A.; Nattkemper, T. W. (2008): The Diversity of Regression Ensembles Combining Bagging and Random Subspace Method. In: International Conference on Neural Information Processing.
    PUB | DOI
     
  • [70]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630738
    Pobigaylo, N.; Szymczak, S.; Nattkemper, T. W.; Becker, A. (2008): Identification of genes relevant to symbiosis and competitiveness in Sinorhizobium meliloti using signature-tagged mutants MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS,21:(2): 219-231.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [69]
    2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018412 OA
    Martin, C.; Díaz Solórzano, N. N.; Ontrup, J.; Nattkemper, T. W. (2007): Genome feature exploration using hyperbolic Self-Organizing Maps. In: Proceedings of the 6th International Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 2007). Bielefeld: Bielefeld University.
    PUB | PDF | DOI
     
  • [68]
    2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714045 OA
    Scherbart, A.; Timm, W.; Böcker, S.; Nattkemper, T. W. (2007): SOM-based Peptide Prototyping for Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction. In: Proceedings of the 6th Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 07). Bielefeld: Bielefeld University.
    PUB | PDF | DOI
     
  • [67]
    2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714002
    Lessmann, B.; Wang, Y.; Bergmann, M.; Kämpfe, T.; Nattkemper, T. W. (2007): Use of automated image analysis to detect changes in megafaunal densities at HAUSGARTEN (79°N west off Svalbard) between 2002 and 2004.
    PUB
     
  • [66]
    2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714021
    Nattkemper, T. W.; Degenhard, A.; Twellmann, T. (2007): Breast Tumor Classification and Visualization with Machine-Learning Approaches. In: M. A. Hayat (Hrsg.): Cancer Imaging - Lung and breast carcinomas. Amsterdam : Academic Press. (1). S. 309-321.
    PUB
     
  • [65]
    2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714040
    Scherbart, A.; Timm, W.; Boecker, S.; Nattkemper, T. W. (2007): Neural Network Approach for Mass Spectrometry Prediction by Peptide Prototyping. In: Joaquim Marque Sá de (Hrsg.): Artificial Neural Networks – ICANN 2007 - 17th International Conference, Porto, Portugal, September 9-13, 2007, Proceedings, Part II. Berlin: Springer. (Lecture Notes in Computer Science, 4669). S. 90-99.
    PUB | DOI
     
  • [64]
    2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714032
    Lessmann, B.; Nattkemper, T. W.; Kessar, P.; Pointon, L.; Khazen, M.; Leach, M. O.; Degenhard, A. (2007): Multiscale Analysis of MR Mammography Data Zeitschrift für Medizinische Physik (german journal of medical physics),17:(3): 166-171.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [63]
    2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595739
    Wei, N.; You, J.; Friehs, K.; Flaschel, E.; Nattkemper, T. W. (2007): In situ dark field microscopy for on-line monitoring of yeast cultures BIOTECHNOLOGY LETTERS,29:(3): 373-378.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [62]
    2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593120
    Wei, N.; You, J.; Friehs, K.; Flaschel, E.; Nattkemper, T. W. (2007): An in situ probe for on-line monitoring of cell density and viability on the basis of dark field microscopy in conjunction with image processing and supervised machine learning Biotechnology and Bioengineering,97:(6): 1489-1500.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [61]
    2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630749
    Lessmann, B.; Nattkemper, T. W.; Hans, V. H.; Degenhard, A. (2007): A method for linking computed image features to histological semantics in neuropathology Journal of Biomedical Informatics,40:(6): 631-641.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [60]
    2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783345 OA
    Krause, L.; McHardy, A. C.; Nattkemper, T. W.; Pühler, A.; Stoye, J.; Meyer, F. (2007): GISMO - gene identification using a support vector machine for ORF classification Nucleic Acids Research,35:(2): 540-549.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [59]
    2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018416
    Nattkemper, T. W.; Degenhard, A.; Twellmann, T. (2007): Breas. In: M. A. Hayat (Hrsg.): Cancer Imaging - Lung and breast carcinomas. Academic Press. (1). S. 309-324.
    PUB
     
  • [58]
    2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714075
    Deters grosse, H.; Timm, W.; Nattkemper, T. W. (2006): REEFSOM - A Metaphoric Data Display for Exploratory Data Mining : journal of new media in neural and cognitive science and education Brains, Minds and Media,2:(bmm305)
    PUB | Download (ext.)
     
  • [57]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374232
    Varini, C.; Lessmann, B.; Degenhard, A.; Hans, V. H.; Nattkemper, T. W. (2006): Visual Exploration of Pathology Images by a Discrete Wavelet Transform Preprocessed Locally Linear Embedding. In: Heinz Handels; Jan Ehrhardt; Alexander Horsch; Hans-Peter Meinzer; Thomas Tolxdorff; Gesellschaft für Informatik (Hrsg.): Bildverarbeitung für die Medizin. Berlin : Springer. (Informatik aktuell, ). S. 66-70.
    PUB | Download (ext.)
     
  • [56]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714148
    Twellmann, T.; Lange, O.; Nattkemper, T. W.; Meyer, A. (2006): Visualizations of Suspicious Lesions in Breast MRI Based on Intelligent Neural Systems. In: Intelligent Computing: Theory and Applications IV. San Diego, CA: SPIE. (Proceedings of SPIE, 6229).
    PUB | DOI
     
  • [55]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374254
    Lessmann, B.; Nattkemper, T. W.; Huth, J.; Loyek, C.; Kessar, P.; Khazen, M.; Pointon, L.; Leach, M. O.; Degenhard, A. (2006): Content Based Image Retrieval for Dynamic Time Series Data. In: Proceedings of BVM. S. 61-65.
    PUB
     
  • [54]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374494
    Timm, W.; Böcker, S.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W. (2006): Peak intensity prediction for pmf mass spectra using support vector regression. In: Proc. of the 7th International FLINS Conference on Applied Artificial Intelligence. WORLD SCIENTIFIC. S. 565-572.
    PUB | DOI
     
  • [53]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714060
    Lessmann, B.; Hans, V.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W. (2006): Feature space exploration of pathology images using Content-Based Database Visualization. In: Medical Imaging 2006: Image Processing. San Diego, CA: SPIE. (Proceedings of SPIE, 6144).
    PUB | DOI
     
  • [52]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714065
    Varini, C.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W. (2006): Histologic Characterization of DCE-MRI Tumors with Dimensional Data Reduction. In: Medical Imaging 2006: Image Processing. San Diego, CA: SPIE. (Proceedings of SPIE, 6144).
    PUB | DOI
     
  • [51]
    2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600329
    Miksch, G.; Bettenworth, F.; Friehs, K.; Flaschel, E.; Saalbach, A.; Nattkemper, T. W. (2006): A rapid reporter system using GFP as a reporter protein for identification and screening of synthetic stationary-phase promoters in Escherichia coli APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY,70:(2): 229-236.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [50]
    2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597259
    Martin, C.; Deters, H. grosse; Nattkemper, T. W. (2006): Fusing biomedical multi-modal data for exploratory data analysis. In: Stefanos Kollias (Hrsg.): ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS - ICANN 2006, PT 2. Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. (4132). S. 798-807.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [49]
    2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598838
    Pobigaylo, N.; Wetter, D.; Szymczak, S.; Schiller, U.; Kurtz, S.; Meyer, F.; Nattkemper, T. W.; Becker, A. (2006): Construction of a large signature-tagged mini-Tn5 transposon library and its application to mutagenesis of Sinorhizobium meliloti APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY,72:(6): 4329-4337.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [48]
    2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596731
    Varini, C.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W. (2006): Visual exploratory analysis of DCE-MRI data in breast cancer by dimensional data reduction: A comparative study BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL,1:(1): 56-63.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [47]
    2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598535
    Varini, C.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W. (2006): ISOLLE: LLE with geodesic distance NEUROCOMPUTING,69:(13-15): 1768-1771.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [46]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603560
    Nattkemper, T. W.; Arnrich, B.; Lichte, O.; Timm, W.; Degenhard, A.; Pointon, L.; Hayes, C.; Leach, M. O. (2005): Evaluation of radiological features for breast tumour classification in clinical screening with machine learning methods ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE,34:(2): 129-139.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [45]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714153
    Lessmann, B.; Nattkemper, T. W.; Degenhard, A.; Pointon, L.; Kessar, P.; Khazen, M.; Leach, M. O. (2005): Clustering approach for wavelet transformed MR image data. In: Proceedings of the 14th International Conference of Medical Physics. S. 1412.
    PUB
     
  • [44]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714331
    Saalbach, A.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W. (2005): Spectral Clustering for Data Categorization based on Self-Organizing Maps. In: Nasrabadi Nasser M. (Hrsg.): Applications of Neural Networks and Machine Learning in Image Processing IX. San Jose, CA. (5673). S. 12-18.
    PUB
     
  • [43]
    2005 | Monographie | PUB-ID: 2714309
    Bettenworth, F.; Miksch, G.; Fries, K.; Flaschel, E.; Saalbach, A.; Eickmeyer, J.; Nattkemper, T. W. (2005): An Online Monitoring System for the Screening of Stationary-Phase Promoters in E. Coli using GFP as a Reporter Protein.
    PUB
     
  • [42]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374666
    Twellmann, T.; Lichte, O.; Saalbach, A.; Wismüller, A.; Nattkemper, T. W. (2005): An Adaptive Colour Scale for Comparison of Pseudo Colouring Techniques for DCE-MRI Data. Workshop für Bildverarbeituing für die Medizin 2005.
    PUB
     
  • [41]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374546
    Saalbach, A.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W.; Wismüller, A.; Ontrup, J.; Ritter, H. (2005): A hyperbolic topographic mapping for proximity data. In: Proc. of the IASTED International Conference of Artificial Intelligence and Applications. (2005). S. 106-111.
    PUB
     
  • [40]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714263
    Twellmann, T.; Lichte, O.; Nattkemper, T. W. (2005): An Adaptive Tissue Characterisation Network for Model-Free Visualisation of Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Image Data IEEE Transactions on Medical Imaging,24:(10): 1256-1266.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [39]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714340
    Nattkemper, T. W.; Wismüller, A. (2005): Tumour feature analysis with unsupervised machine learning Medical Image Analysis,9:(4): 344-351.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [38]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374187
    Saalbach, A.; Ontrup, J.; Ritter, H.; Nattkemper, T. W. (2005): Image fusion based on topographic mappings using the hyperbolic space Information Visualization,4:(4): 266-275.
    PUB | DOI
     
  • [37]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603030
    Nattkemper, T. W.; Wismuller, A. (2005): Tumor feature visualization with unsupervised learning MEDICAL IMAGE ANALYSIS,9:(4): 344-351.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [36]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946602
    Wei, N.; Flaschel, E.; Saalbach, A.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W. (2005): Reagent-free automatic cell viability determination using neural networks based machine vision and dark-field microscopy in Saccharomyces cerevisiae Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc,6: 6305-6308.
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [35]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602344
    Prank, K.; Schulze, E.; Eckert, O.; Nattkemper, T. W.; Bettendorf, M.; Maser-Gluth, C.; Sejnowski, T. J.; Grote, A.; Penner, E.; von zur Muhlen, A.; Brabant, G. (2005): Machine learning approaches for phenotype-genotype mapping: predicting heterozygous mutations in the CYP21B gene from steroid profiles EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY,153:(2): 301-305.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [34]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601519
    Varini, C.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W. (2005): ISOLLE: Locally linear embedding with geodesic distance. In: Alípio Jorge (Hrsg.): KNOWLEDGE DISCOVERY IN DATABASES: PKDD 2005. Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. (Lecture notes in computer science ; 3721 : Lecture notes in artificial intelligence, 3721). S. 331-342.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [33]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601848
    Miksch, G.; Bettenworth, F.; Friehs, K.; Flaschel, E.; Saalbach, A.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W. (2005): Libraries of synthetic stationary-phase and stress promoters as a tool for fine-tuning of expression of recombinant proteins in Escherichia coli. In: Journal of Biotechnology. ELSEVIER SCIENCE BV. (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 120). S. 25-37.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [32]
    2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601906
    Lessmann, B.; Degenhard, A.; Kessar, P.; Pointon, L.; Khazen, M.; Leach, M. O.; Nattkemper, T. W. (2005): SOM-based wavelet filtering for the exploration of medical images. In: Włodzisław Duch (Hrsg.): ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS: BIOLOGICAL INSPIRATIONS - ICANN 2005, PT 1, PROCEEDINGS. Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. (Lecture notes in computer science, 3696). S. 671-676.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [31]
    2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602177
    Twellmann, T.; Lichte, O.; Nattkemper, T. W. (2005): An adaptive tissue characterization network for model-free visualization of dynamic contrast-enhanced magnetic resonance image data IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING,24:(10): 1256-1266.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [30]
    2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1666510 OA
    Twellmann, T.; Saalbach, A.; Gerstung, O.; Leach, M. O.; Nattkemper, T. W. (2004): Image fusion for dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging Biomed Eng Online,3:(1):35
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [29]
    2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946892
    Nattkemper, T. W. (2004): Automatic segmentation of digital micrographs: a survey Stud Health Technol Inform,107:(Pt 2): 847-851.
    PUB | PubMed | Europe PMC
     
  • [28]
    2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946838
    Twellmann, T.; Saalbach, A.; Müller, C.; Nattkemper, T. W.; Wismuller, A. (2004): Detection of suspicious lesions in dynamic contrast enhanced MRI data The 26th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society,1: 454-457.
    PUB | PubMed | Europe PMC
     
  • [27]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714397
    Kämpfe, T.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (2004): AQUISAR: Image Retrieval in Underwater Webcam Images. In: WIAMIS 2004 : 5th International Workshop on Image Analysis for Multimedia Interactive Services. Lisboa, Portugal.
    PUB
     
  • [26]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714346
    Lessmann, B.; Twellmann, T.; Degenhard, A.; Nattkemper, T. W.; Leach, M. O. (2004): Wavelet features for improved tumour detection in DCE-MRI. In: Daniel Rueckert; Jo Hajnal; Guang-Zhong Yang (Hrsg.): Proceedings of Medical Image Understanding and Analysis (MIUA). London, UK: BMVA. S. 93-96.
    PUB
     
  • [25]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714369
    Varini, C.; Nattkemper, T. W.; Degenhard, A.; Wismüller, A. (2004): Breast MRI data analysis by LLE. In: Proceedings of International Joint Conference on Neural Networks. Montreal, Canada: IEEE. (3). S. 2449-2554.
    PUB | DOI
     
  • [24]
    2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714465
    Nattkemper, T. W. (2004): Multivariate image analysis in biomedicine: a methodological review Journal of Biomedical Informatics,37:(5): 380-391.
    PUB
     
  • [23]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714382
    Saalbach, A.; Twellmann, T.; Nattkemper, T. W.; White, M. J.; Khazen, M.; Leach, M. O. (2004): Visualization of Multivariate Image Data using Image Fusion and Perceptually Optimized Color Scales based on sRGB. In: Jr. Robert L. Galloway (Hrsg.): Medical Imaging 2004: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display. San Diego, CA: SPIE. (Proceedings of SPIE, 5367).
    PUB | DOI
     
  • [22]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375262
    Varini, C.; Nattkemper, T. W.; Degenhard, A.; Wismüller, A. (2004): Visualisation of Breast Tumour DCE-MRI Data using LLE. In: Proc. Medical Image Understanding and Analysis (MIUA). BMVA. S. 97-100.
    PUB
     
  • [21]
    2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606041
    Nattkemper, T. W. (2004): Multivariate image analysis in biomedicine JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS,37:(5): 380-391.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [20]
    2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017550 OA
    Nattkemper, T. W.; Schubert, W.; Hermann, T.; Ritter, H. (2004): A Hybrid System for Cell Detection in Digital Micrographs. In: B. Tilg (Hrsg.): Biomedical Engineering, Proc.. Innsbruck, Austria: ACTA Press. (417).
    PUB | PDF
     
  • [19]
    2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017545 OA
    Nattkemper, T. W.; Hermann, T.; Schubert, W.; Ritter, H. (2003): Look & Listen: Sonification and Visualization of Multiparameter Micrographs. In: Engineering in Medicine and Biology Society. Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE. Cancun, Mexico: IEEE. (2). S. 1311-1314.
    PUB | PDF
     
  • [18]
    2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714487
    Twellmann, T.; Saalbach, A.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (2003): Artificial Neural Networks Machine Learning Approaches for Multivariate Image Analysis. In: Proceedings Linking mathematical and biological models in cancer research. Magdeburg.
    PUB
     
  • [17]
    2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714496
    Ontrup, J.; Nattkemper, T. W.; Gerstung, O.; Ritter, H. (2003): A MeSH Term based Distance Measure for Document Retrieval and Labeling Assistance. In: Proc. of EMBC2003. Cancun, Mexico: IEEE EMBS.
    PUB
     
  • [16]
    2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612741
    Nattkemper, T. W.; Twellmann, T.; Ritter, H.; Schubert, W. (2003): Human vs. machine: evaluation of fluorescence micrographs Computers in Biology and Medicine,33:(1): 31-43.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [15]
    2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1613503
    Nattkemper, T. W.; Wersing, H.; Schubert, W.; Ritter, H. (2002): A neural network architecture for automatic segmentation of fluorescence micrographs. In: Neurocomputing. ELSEVIER SCIENCE BV. (NEUROCOMPUTING, 48). S. 357-367.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [14]
    2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1886441
    Schubert, W.; Friedenberger, M.; Haars, R.; Bode, M.; Philipsen, L.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (2002): Automatic recognition of muscle invasive T-lymphocytes expressing dipeptidyl-peptidase IV (CD26) and analysis of the associated cell surface phenotypes Journal of Theoretical Medicine,4:(1): 67-74.
    PUB | DOI
     
  • [13]
    2001 | Datenpublikation | PUB-ID: 2763993 OA
    Hermann, T.; Nattkemper, T. W. (2001): Multi-Channel Image Data Analysis using Sonification. Bielefeld University.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI
     
  • [12]
    2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304068 OA
    Nattkemper, T. W. (2001): A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
    PUB | Dateien verfügbar
     
  • [11]
    2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375220
    Twellmann, T.; Nattkemper, T. W.; Schubert, W.; Ritter, H. (2001): Cell Detection in Micrographs of Tissue Sections Using Support Vector Machines. In: Proc. of. ICANN 2001 Workshop on Kernel and Subspace Methods for Computer Vision.
    PUB
     
  • [10]
    2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1617028
    Nattkemper, T. W.; Ritter, H.; Schubert, W. (2001): A neural classifier enabling high-throughput topological analysis of lymphocytes in tissue sections IEEE TRANSACTIONS ON INFORMATION TECHNOLOGY IN BIOMEDICINE,5:(2): 138-149.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [9]
    2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1886493
    Kämpfe, T.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (2001): Combining Independent Component Analysis and Self-organizing Maps for Cell Image Classification. In: Bernd Radig; Stefan Florczyk (Hrsg.): Pattern Recognition. Berlin: Springer. (LNCS, 2191). S. 262-268.
    PUB
     
  • [8]
    2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017374 OA
    Hermann, T.; Nattkemper, T. W.; Schubert, W.; Ritter, H. (2000): Sonification of Multi-Channel Image Data. In: V. Falavar (Hrsg.): Proc. of the Mathematical and Engineering Techniques in Medical and Biological Sciences. Las Vegas: CSREA Press. S. 745-750.
    PUB | PDF
     
  • [7]
    2000 | Datenpublikation | PUB-ID: 2701103 OA
    Hermann, T.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (2000): Supplementary Material for "Sonification of Multi-Channel Image Data". Bielefeld University.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI
     
  • [6]
    2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375211
    Nattkemper, T. W.; Wersing, H.; Schubert, W.; Ritter, H. (2000): A Neural Network Architecture for Automatic Segmentation of Fluorescence Micrographs. In: Michel Verleysen (Hrsg.): Proc. of the 8th Europ. Symp. on Art. Neur. Netw. (ESANN).
    PUB
     
  • [5]
    2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374799
    Nattkemper, T. W.; Wersing, H.; Schubert, W.; Ritter, H. (2000): Fluorescence Micrograph Segmentation by Gestalt-Based Feature Binding. In: Proc. of the Int. Joint Conf. on Neur. Netw. (IJCNN). Como, Italy. (1). S. 248-254.
    PUB
     
  • [4]
    2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714744
    Nattkemper, T. W.; Wersing, H.; Schubert, W.; Ritter, H. (2000): Automatic Evaluation of Multi-Parameter Fluorescence Micrographs with a Neural Network Architecture. In: Proceedings of the International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences, METMBS '00. Las Vegas, USA. (2). S. 739-744.
    PUB
     
  • [3]
    1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374786
    Nattkemper, T. W.; Ritter, H.; Schubert, W. (1999): Extracting Patterns of Lymphocyte Fluorescence from Digital Microscope Images. In: Intelligent Data Analysis in Medicine and Pharmacology (IDAMAP 99), Workshop Notes. AMIA 1999, Washington DC. S. 79-88.
    PUB
     
  • [2]
    1998 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714985
    Heidemann, G.; Nattkemper, T. W.; Ritter, H. (1998): Farbe und Symmetrie für die datengetriebene Generierung prägnanter Fokuspunkte. In: Volker Rehrmann (Hrsg.): 4. Workshop Farbbildverarbeitung. Koblenz: Fölbach. (Koblenzer Schriften zur Informatik, 9). S. 65-71.
    PUB
     
  • [1]
    1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2715168
    Heidemann, G.; Nattkemper, T. W.; Menkhaus, G.; Ritter, H. (1996): Blicksteuerung durch präattentive Fokussierungspunkte. In: Bärbel Mertsching (Hrsg.): Aktives Sehen in technischen und biologischen Systemen : Beiträge zum Workshop der GI-Fachgruppe 1.0.4 Bildverstehen, 3. und 4. Dezember 1996, Hamburg. Sankt Augustin: Infix. (Proceedings in artificial intelligence, 4). S. 109-116.
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