Tim Wilhelm Nattkemper
tim.nattkemper@uni-bielefeld.dehttps://orcid.org/0000-0002-7986-1158
PEVZ-ID
207 Publikationen
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2984580Rogers, A.D., Appiah-Madson, H., Ardron, J.A., Bax, N.J., Bhadury, P., Brandt, A., Buttigieg, P.-L., De Clerck, O., Delgado, C., Distel, D.L., Glover, A., Gobin, J., Guilhon, M., Hampton, S., Harden-Davies, H., Hebert, P., Hynes, L., Lowe, M., MacIntyre, S., Madduppa, H., de Azevedo Mazzuco, A.C., McCallum, A., McOwen, C., Nattkemper, T.W., Odido, M., O'Hara, T., Osborn, K., Pouponneau, A., Provoost, P., Rabone, M., Ramirez-Llodra, E., Scott, L., Sink, K.J., Turk, D., Watanabe, H.K., Weatherdon, L.V., Wernberg, T., Williams, S., Woodall, L., Wright, D.J., Zeppilli, D. & Steeds, O. (2023). Accelerating ocean species discovery and laying the foundations for the future of marine biodiversity research and monitoring. Frontiers in Marine Science , 10: 1224471. Frontiers . doi:10.3389/fmars.2023.1224471.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2981135van Kevelaer, R., Langenkämper, D., Nilssen, I., Buhl-Mortensen, P. & Nattkemper, T.W. (2023). A data science approach for multi-sensor marine observatory data monitoring cold water corals (Paragorgia arborea) in two campaigns. PLOS ONE, 18(7): e0282723. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0282723.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2979717Momber, A.W., Langenkämper, D., Möller, T. & Nattkemper, T.W. (2023). The exploration and annotation of large amounts of visual inspection data for protective coating systems on stationary marine steel structures. Ocean Engineering, 278: 114337. Elsevier. doi:10.1016/j.oceaneng.2023.114337.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2969165Kloster, M., Burfeid-Castellanos, A.M., Langenkämper, D., Nattkemper, T.W. & Beszteri, B. (2023). Improving deep learning-based segmentation of diatoms in gigapixel-sized virtual slides by object-based tile positioning and object integrity constraint. PLOS ONE, 18(2): e0272103. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0272103.
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2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2968512Momber, A., Langenkämper, D., Möller, T. & Nattkemper, T.W. (2023). Eine Online-Plattform für die Verarbeitung digitaler visueller Daten zur Zustandsbeschreibung von Beschichtungssystemen an maritimen Stahlbauten. Stahlbau . Wiley. doi:10.1002/stab.202200080.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965093Langenkämper, D., Mogstad, A.A., Hansen, I.M., Baussant, T., Bergsagel, O., Nilssen, I., Frost, T.K. & Nattkemper, T.W. (2022). Exploring time series of hyperspectral images for cold water coral stress response analysis. PLoS ONE , 17(8): e0272408. Public Library of Science. doi:10.1371/journal.pone.0272408.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964556Tan, M., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (2022). The Impact of Data Augmentations on Deep Learning-Based Marine Object Classification in Benthic Image Transects. Sensors, 22(14): 5383. MDPI AG. doi:10.3390/s22145383.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964311Tzanakis, K., Nattkemper, T.W., Niehaus, K. & Albaum, S. (2022). MetHoS: a platform for large-scale processing, storage and analysis of metabolomics data. BMC Bioinformatics, 23(1): 267. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/s12859-022-04793-w.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2966492Burfeid-Castellanos, A.M., Kloster, M., Beszteri, S., Postel, U., Spyra, M., Zurowietz, M., Nattkemper, T.W. & Beszteri, B. (2022). A Digital Light Microscopic Method for Diatom Surveys Using Embedded Acid-Cleaned Samples. Water, 14(20): 3332. MDPI. doi:10.3390/w14203332.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964509Schoening, T., Durden, J.M., Faber, C., Felden, J., Heger, K., Hoving, H.-J.T., Kiko, R., Koser, K., Krammer, C., Kwasnitschka, T., Moller, K.O., Nakath, D., NaSS, A., Nattkemper, T.W., Purser, A. & Zurowietz, M. (2022). Making marine image data FAIR. Scientific data, 9(1): 414. Springer Nature. doi:10.1038/s41597-022-01491-3.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964756Schoening, T., Durden, J.M., Faber, C., Felden, J., Heger, K., Hoving, H.-J.T., Kiko, R., Koser, K., Krammer, C., Kwasnitschka, T., Moller, K.O., Nakath, D., NaSS, A., Nattkemper, T.W., Purser, A. & Zurowietz, M. (2022). Publisher Correction: Making marine image data FAIR. Scientific Data , 9(1): 445. Springer Nature. doi:10.1038/s41597-022-01567-0.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2962701Momber, A.W., Nattkemper, T.W., Langenkämper, D., Möller, T., Bruen, D., Schaumann, P. & Shojai, S. (2022). Corrigendum to “A data-based model for condition monitoring and maintenance planning for protective coating systems for wind tower structures” [Renew. Energy 186 (2022) 957–973]. Renewable Energy , 188, 1184. Elsevier. doi:10.1016/j.renene.2022.02.079.
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2960547Momber, A.W., Nattkemper, T.W., Langenkämper, D., Möller, T., Brün, D., Schaumann, P. & Shojai, S. (2022). A data-based model for condition monitoring and maintenance planning for protective coating systems for wind tower structures. Renewable Energy. Elsevier BV. doi:10.1016/j.renene.2022.01.022.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959631Zurowietz, M. & Nattkemper, T.W. (2021). Current Trends and Future Directions of Large Scale Image and Video Annotation: Observations From Four Years of BIIGLE 2.0. Frontiers in Marine Science, 8: 760036. Frontiers Media. doi:10.3389/fmars.2021.760036.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2952736Canals, M., Pham, C.K., Bergmann, M., Gutow, L., Hanke, G., van Sebille, E., Angiolillo, M., Buhl-Mortensen, L., Cau, A., Ioakeimidis, C., Kammann, U., Lundsten, L., Papatheodorou, G., Purser, A., Sanchez-Vidal, A., Schulz, M., Vinci, M., Chiba, S., Galgani, F., Langenkämper, D., Moller, T., Nattkemper, T.W., Ruiz, M., Suikkanen, S., Woodall, L., Fakiris, E., Jack, M.E.M. & Giorgetti, A. (2021). The quest for seafloor macrolitter: a critical review of background knowledge, current methods and future prospects. Environmental Research Letters , 16(2): 023001. IOP. doi:10.1088/1748-9326/abc6d4.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2960196Momber, A.W., Möller, T., Langenkämper, D., Nattkemper, T.W. & Bruen, D. (2021). A Digital Twin concept for the prescriptive maintenance of protective coating systems on wind turbine structures. Wind Engineering: 0309524X211060550. Sage . doi:10.1177/0309524X211060550.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2949959Muskat, L., Kerkhoff, Y., Humbert, P., Nattkemper, T.W., Eilenberg, J. & Patel, A.V. (2021). Image analysis-based quantification of fungal sporulation by automatic conidia counting and gray value correlation. MethodsX: 101218. Elsevier BV. doi:10.1016/j.mex.2021.101218.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956291Momber, A., Nattkemper, T.W., Langenkämper, D., Möller, T., Bruen, D., Schaumann, P. & Shojai, S. (2021). Digitalisierung und Verarbeitung von Sensordaten für die Zustandsbewertung von Oberflächenschutzsystemen stählerner Türme von Onshore-Windenergieanlagen. Stahlbau, 90(7), 528-541. Ernst & Sohn. doi:10.1002/stab.202100020.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2951226Wüllems, K., Zurowietz, A., Zurowietz, M., Schneider, R., Bednarz, H., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2021). Fast Visual Exploration of Mass Spectrometry Images with Interactive Dynamic Spectral Similarity Pseudocoloring. Scientific Reports, 11: 4606. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-021-84049-4.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2950877Möller, T. & Nattkemper, T.W. (2021). ALMI - A Generic Active Learning System for Computational Object Classification in Marine Observation Images. Sensors, 21(4): 1134. MDPI. doi:10.3390/s21041134.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942079Gemeinholzer, B., Vences, M., Beszteri, B., Bruy, T., Felden, J., Kostadinov, I., Mirailes, A., Nattkemper, T.W., Printzen, C., Renz, J., Rybalka, N., Schuster, T., Weibulat, T., Wilke, T. & Renner, S.S. (2020). Data storage and data re-use in taxonomy-the need for improved storage and accessibility of heterogeneous data. ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION, 20(1), 1-8. Springer Heidelberg. doi:10.1007/s13127-019-00428-w.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945723Kloster, M., Langenkämper, D., Zurowietz, M., Beszteri, B. & Nattkemper, T.W. (2020). Deep learning-based diatom taxonomy on virtual slides. Scientific Reports, 10(1): 14416. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-020-71165-w.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943901Zurowietz, M. & Nattkemper, T.W. (2020). An Interactive Visualization for Feature Localization in Deep Neural Networks. Frontiers in Artificial Intelligence - Machine Learning and Artificial Intelligence , 3: 49. Frontiers Media. doi:10.3389/frai.2020.00049.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2943127Miralles, A., Bruy, T., Wolcott, K., Scherz, M.D., Begerow, D., Beszteri, B., Bonkowski, M., Felden, J., Gemeinholzer, B., Glaw, F., Glockner, F.O., Hawlitschek, O., Kostadinov, I., Nattkemper, T.W., Printzen, C., Renz, J., Rybalka, N., Stadler, M., Weibulat, T., Wilke, T., Renner, S.S. & Vences, M. (2020). Repositories for Taxonomic Data: Where We Are and What is Missing. Systematic biology. Oxford University Press. doi:10.1093/sysbio/syaa026.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945097Zurowietz, M. & Nattkemper, T.W. (2020). Unsupervised Knowledge Transfer for Object Detection in Marine Environmental Monitoring and Exploration. IEEE Access, 8. IEEE. doi:10.1109/ACCESS.2020.3014441.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948381Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2020). Corrigendum: BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 7: 617268. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fmars.2020.617268.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944758Langenkämper, D., van Kevelaer, R., Purser, A. & Nattkemper, T.W. (2020). Gear-Induced Concept Drift in Marine Images and Its Effect on Deep Learning Classification. Frontiers in Marine Science, 7: 506. Frontiers Media . doi:10.3389/fmars.2020.00506.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936089Wüllems, K., Kölling, J., Bednarz, H., Niehaus, K., Hans, V.H. & Nattkemper, T.W. (2019). Detection and visualization of communities in mass spectrometry imaging data. BMC Bioinformatics, 20(1): 303. Springer Nature. doi:10.1186/s12859-019-2890-6.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936069Langenkämper, D., Simon-Lledó, E., Hosking, B., Jones, D.O.B. & Nattkemper, T.W. (2019). On the impact of Citizen Science-derived data quality on deep learning based classification in marine images. PLOS ONE, 14(6): e0218086. Public Library of Science. doi:10.1371/journal.pone.0218086.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931637Nattkemper, T.W. & Hattab, G. (2019). SeeVis — 3D space-time cube rendering for visualization of microfluidics image data. Bioinformatics, 35(10), 1802-1804. Oxford Acad. doi:10.1093/bioinformatics/bty889.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935488Osterloff, J., Nilssen, I., Jarnegren, J., Van Engeland, T., Buhl-Mortensen, P. & Nattkemper, T.W. (2019). Computer vision enables short- and long-term analysis of Lophelia pertusa polyp behaviour and colour from an underwater observatory. Scientific reports, 9(1): 6578. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-019-41275-1.
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2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935366Zurowietz, M., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (2019). BIIGLE2Go - A scalable image annotation system for easy deployment on cruises. Proceedings of IEEE OCEANS 2019. Gehalten auf der IEEE OCEANS. doi:10.1109/OCEANSE.2019.8867417.
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2019 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2937705Möller, T., Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Wind turbine segmentation performing kNN-clustering on superpixel segmentations (Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Proceedings). In L. Bruzzone & F. Bovolo (Hrsg.), Image and Signal Processing for Remote Sensing XXV. Gehalten auf der SPIE REMOTE SENSING.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918218Hattab, G., Wiesmann, V., Becker, A., Munzner, T. & Nattkemper, T.W. (2018). A Novel methodology for characterizing cell subpopulations in automated time-lapse microscopy. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 6: 17. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fbioe.2018.00017.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932066Zurowietz, M., Langenkämper, D., Hosking, B., Ruhl, H. & Nattkemper, T.W. (2018). MAIA - A machine learning assisted image annotation method for environmental monitoring and exploration . PLoS ONE, 13(11): e0207498. PLoS. doi:10.1371/journal.pone.0207498.
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921040Möller, T., Nillsen, I. & Nattkemper, T.W. (2018). Tracking Sponge Size and Behaviour with Fixed Underwater Observatories ( Lecture Notes in Computer Science). In Z. Zhang, D. Suter, Y. Tian, A. Branzan Albu, N. Sidère & H. Jair Escalante (Hrsg.), Pattern Recognition and Information Forensics. ICPR 2018 International Workshops, CVAUI, IWCF, and MIPPSNA, Beijing, China, August 20-24, 2018, Revised Selected Papers (S. 45-54). Cham: Springer. doi:10.1007/978-3-030-05792-3_5.
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2018 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2921039Langenkämper, D., van Kevelaer, R. & Nattkemper, T.W. (Accepted). Strategies for Tackling the Class Imbalance Problem in Marine Image Classification. Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition 2018, Computer Vision for Automated Analysis of Underwater Imagery Workshop.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911830Hattab, G., Schlüter, J.-P., Becker, A. & Nattkemper, T.W. (2017). ViCAR: An Adaptive and Landmark-Free Registration of Time Lapse Image Data from Microfluidics Experiments. Frontiers in Genetics, 8: 69. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fgene.2017.00069.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909190Langenkämper, D., Zurowietz, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2017). BIIGLE 2.0 - Browsing and Annotating Large Marine Image Collections. Frontiers in Marine Science, 4(March): 83. Frontiers Media. doi:10.3389/fmars.2017.00083.
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915349Möller, T., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2017). Active learning for the classification of species in underwater images from a fixed observatory. Proceedings of The IEEE International Conference on Computer Vision Workships (ICCVW) (S. 2891-2897). Piscataway, NJ: IEEE.
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2017 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908753Osterloff, J., Möller, T., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2017). Extracting Scalar Quantities from Underwater Images - a Toolbox for Image Data from Fixed Observatories. Gehalten auf der Marine Imaging Workshop 2017.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901477Ahmed Raza, S.E., Langenkämper, D., Sirinukunwattana, K., Epstein, D., Nattkemper, T.W. & Rajpoot, N.M. (2016). Robust normalization protocols for multiplexed fluorescence bioimage analysis. BioData Mining, 9(1): 11. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s13040-016-0088-2.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900943Langenkämper, D., Jakobi, T., Feld, D., Jelonek, L., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2016). Comparison of Acceleration Techniques for Selected Low-Level Bioinformatics Operations. Frontiers in Genetics, 7: 5. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fgene.2016.00005.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903712Osterloff, J., Nilssen, I., Eide, I., de Oliveira Figueiredo, M.A., de Souza Tâmega, F.T. & Nattkemper, T.W. (2016). Computational Visual Stress Level Analysis of Calcareous Algae Exposed to Sedimentation. PLOS ONE, 11(6): e0157329. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0157329.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907705Brink, B., Seidel, A., Kleinbölting, N., Nattkemper, T.W. & Albaum, S. (2016). Omics Fusion - A Platform for Integrative Analysis of Omics Data. Journal of Integrative Bioinformatics, 13(4: SI): 296. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-296.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901413Gorzolka, K., Kölling, J., Nattkemper, T.W. & Niehaus, K. (2016). Spatio-Temporal Metabolite Profiling of the Barley Germination Process by MALDI MS Imaging. PLOS ONE, 11(3): e0150208. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0150208.
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2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904671Möller, T., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2016). Change Detection in Marine Observatory Image Streams using Bi-Domain Feature Clustering. 2016 23rd International Conference on Pattern Recognition (ICPR) (S. 793-798). Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition (ICPR), Piscataway, NJ: IEEE. doi:10.1109/ICPR.2016.7899732.
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2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906524Möller, T., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2016). Data-driven Long Term Change Analysis in Marine Observatory Image Streams. 2016 ICPR 2nd Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI 2016) . Proceedings (S. 13-18). Gehalten auf der 2nd Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI), ICPR Workshop, Piscataway, NJ: IEEE.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2902750Schoening, T., Osterloff, J. & Nattkemper, T.W. (2016). RecoMIA - Recommendations for marine image annotation: Lessons learned and future directions. Frontiers in Marine Science, 3: 59. Frontiers Media. doi:10.3389/fmars.2016.00059.
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2016 | Konferenzbeitrag | Angenommen | PUB-ID: 2904670Langenkämper, D. & Nattkemper, T.W. (Accepted). COATL - A Learning Architecture for Online Real-Time Detection and Classification Assistance for Environmental Data. Proceedings of the International Conference on Pattern Recognition (ICPR). Gehalten auf der International Conference on Pattern Recognition (ICPR).
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2016 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903653Durden, J., Schoening, T., Althaus, F., Friedmann, A., Garica, R., Glover, A.G., Greinert, J., Stout, N.J., Jones, D.O.B., Jordt, A., Kaeli, J.W., Koser, K., Kuhnz, L.A., Lindsay, D., Morris, K.J., Nattkemper, T.W., Osterloff, J., Ruhl, H., Singh, H., Tran, M. & Bett, B.J. (2016). Perspectives in Visual Imaging for Marine Biology and Ecology: From Acquisition to Understanding (54). In R.N. Hughes, D.J. Hughes, I.P. Smith & A.C. Dale (Hrsg.), Oceanography and Marine Biology: An Annual Review (S. 1-72). Boca Raton: CRC Press.
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2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903711Osterloff, J., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2016). Computational Coral Feature Monitoring for the fixed underwater Observatory LoVe. Proceedings of IEEE OCEANS 2016. Gehalten auf der IEEE Oceans. doi:10.1109/OCEANS.2016.7761417.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903363Durden, J.M., Bett, B.J., Schoening, T., Morris, K.J., Ruhl, H.A. & Nattkemper, T.W. (2016). Comparison of image annotation data generated by multiple investigators for benthic ecology. Marine Ecology Progress Series, 552, 61-70. INTER-RESEARCH. doi:10.3354/meps11775.
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2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906522Osterloff, J., Nilssen, I., Järnegren, J., Buhl-Mortensen, P. & Nattkemper, T.W. (2016). Polyp activity estimation and monitoring for cold water corals with a deep learning approach. Proceedigs of CVAUI 2016 (ICPR Workshop). Gehalten auf der 2nd Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI), ICPR Workshop. doi:10.1109/CVAUI.2016.013.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2902749Osterloff, J., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2016). A computer vision approach for monitoring the spatial and temporal shrimp distribution at the LoVe observatory. Methods in Oceanography, 15-16, 114-128. Elsevier. doi:10.1016/j.mio.2016.03.002.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Angenommen | PUB-ID: 2902857Schoening, T., Kuhn, T., Jones, D.O.B., Simon-Lledo, E. & Nattkemper, T.W. (Accepted). Fully automated image segmentation for benthic resource assessment of poly-metallic nodules. Methods in Oceanography, 15-16, 78-89. Elsevier. doi:10.1016/j.mio.2016.04.002.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905905Nuno Gomes-Pereira, J., Auger, V., Beisiegel, K., Benjamin, R., Bergmann, M., Bowden, D., Buhl-Mortensen, P., De Leo, F.C., Dionísio, G., Durden, J.M., Edwards, L., Friedman, A., Greinert, J., Jacobsen-Stout, N., Lerner, S., Leslie, M., Nattkemper, T.W., Sameoto, J.A., Schoening, T., Schouten, R., Seager, J., Singh, H., Soubigou, O., Tojeira, I., van den Beld, I., Dias, F., Tempera, F. & Santos, R.S. (2016). Current and future trends in marine image annotation software. Progress in Oceanography, 149, 106-129. Elsevier BV. doi:10.1016/j.pocean.2016.07.005.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722138Kessler, N., Bonte, A., Albaum, S., Mäder, P., Messmer, M., Goesmann, A., Niehaus, K., Langenkämper, G. & Nattkemper, T.W. (2015). Learning to classify organic and conventional wheat - a machine-learning driven approach using the MeltDB 2.0 metabolomics analysis platform. Frontiers in Bioinformatics and Computational Biology, 3: 35. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fbioe.2015.00035.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2724431Schoening, T., Kuhn, T., Bergmann, M. & Nattkemper, T.W. (2015). DELPHI - fast and adaptive computational laser point detection and visual footprint quantification for arbitrary underwater image collections. Frontiers in Marine Science, 2: 20. Frontiers Media SA. doi:10.3389/fmars.2015.00020.
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2015 | Datenpublikation | PUB-ID: 2777409Schlueter, J.-P., McIntosh, M., Hattab, G., Nattkemper, T.W. & Becker, A. (2015). Phase Contrast and Fluorescence Bacterial Time-Lapse Microscopy Image Data. Bielefeld University. doi:10.4119/unibi/2777409.
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2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775956Steinbrink, B., Schoening, T., Brün, D. & Nattkemper, T.W. (2015). Integrated Digital Marine Image Analysis and Management - new solutions to handle large image collections in environmental monitoring and exploration. Gehalten auf der GEOHAB.
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2015 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2775947Schoening, T., Langenkämper, D., Steinbrink, B., Brün, D. & Nattkemper, T.W. (In Press). Rapid image processing and classification in underwater exploration using advanced high performance computing. Proc. of the IEEE Oceans. Gehalten auf der IEEE Oceans, Washington DC, USA: IEEE.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2655889Osterloff, J., Schoening, T., Bergmann, M. & Nattkemper, T.W. (2014). An overview and rating of benthic image pre-processings for color constancy (S. 1-1). Gehalten auf der Marine Imaging Workshop.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705712Langenkämper, D., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2014). AKE - The Accelerated k-mer Exploration Web-Tool for Rapid Taxonomic Classification and Visualization. BMC Bioinformatics, 15(1): 384. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12859-014-0384-0.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656048Möller, T., Nilssen, I. & Nattkemper, T.W. (2014). Introduction of image-based water transparency descriptors to quantify marine snow and turbidity features. A study with data from a stationary observatory. Gehalten auf der MIW 2014 - Marine Imaging Workshop.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2706029Kessler, N., Walter, F., Persicke, M., Albaum, S., Kalinowski, J., Goesmann, A., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2014). ALLocator: An Interactive Web Platform for the Analysis of Metabolomic LC-ESI-MS Datasets, Enabling Semi-Automated, User-Revised Compound Annotation and Mass Isotopomer Ratio Analysis. PLoS ONE, 9(11): e113909. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0113909.
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2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2683648Osterloff, J., Schoening, T., Bergmann, M., Durden, J.M., Ruhl, H.A. & Nattkemper, T.W. (2014). Ranking Color Correction Algorithms using Cluster Indices. Gehalten auf der ICPR Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery. doi:10.1109/CVAUI.2014.13.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690300Kölling, J., Zurowietz, M. & Nattkemper, T.W. (2014). Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging. Gehalten auf der 4th Symposium on Biological Data Visualization (BioVis).
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2014 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2690335Rathke, M., Kölling, J., Gorzolka, K., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (In Press). Interactive and dynamic web-based visual exploration of high dimensional bioimages with real time clustering. Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics (GCB).
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690322Kölling, J., Zurowietz, M. & Nattkemper, T.W. (2014). Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging. Gehalten auf der 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), ISCB.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676334Möller, T., Nilssen, I., Sumida, P.Y.G., Elbers, K.L. & Nattkemper, T.W. (2014). Novelty detection in time lapse image data. Gehalten auf der Geohab 2014.
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2014 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901695German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (2014). German Conference on Bioinformatics 2014 (GI-Edition: lecture notes in informatics). (R. Giegerich, R. Hofestädt & T.W. Nattkemper, Hrsg.), 235. Gehalten auf der German Conference on Bioinformatics, Bonn: Ges. für Informatik.
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2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717407Schoening, T., Kuhn, T. & Nattkemper, T.W. (2014). Seabed Classification Using a Bag-of-Prototypes Feature Representation. Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery (CVAUI), 2014 ICPR Workshop on (S. 17-24). Gehalten auf der ICPR. doi:10.1109/CVAUI.2014.9.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775961Schoening, T., Brün, D., Kuhn, T. & Nattkemper, T.W. (2014). Image-based marine resource exploration and biodiversity assessment with MAMAS (Marine data Asset Management and Analysis System). Gehalten auf der UMI (Underwater Mining Institute).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610505Purser, A., Ontrup, J., Schoening, T., Thomsen, L., Tong, R., Unnithan, V. & Nattkemper, T.W. (2013). Microhabitat and shrimp abundance within a Norwegian cold-water coral ecosystem. Biogeosciences, 10(9), 5779-5791. Copernicus GmbH. doi:10.5194/bg-10-5779-2013.
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2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2610134Schoening, T., Steinbrink, B., Brün, D., Kuhn, T. & Nattkemper, T.W. (In Press). Ultra-fast segmentation and quantification of poly-metallic nodule coverage in high-resolution digital images. Proceedings of the UMI 2013. Gehalten auf der Underwater Mining Institute.
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2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2537912Rubiano Castellanos, C.C., Merkle, T. & Nattkemper, T.W. (In Press). Using random forest to find Nuclear Export Signals (NESs) in proteins of Arabidopsis thaliana. Gehalten auf der BIOINFORMATICS Conf.
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2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656054Schoening, T., Bergmann, M. & Nattkemper, T.W. (2013). A machine-learning system for the automated detection of megafauna and its applicability unseen footage. Gehalten auf der GEOHAB.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2625914Bergmann, T., Maeder, U., Fiebich, M., Dickob, M., Nattkemper, T.W. & Anselmetti, D. (2013). Categorization of two-photon microscopy images of human cartilage into states of osteoarthritis. Osteoarthritis And Cartilage, 21(8), 1074-1082. Elsevier BV. doi:10.1016/j.joca.2013.04.019.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610762Nattkemper, T.W. (2013). Cluster Analysis. In W. Dubitzky, O. Wolkenhauer, K.-H. Cho & H. Yokota (Hrsg.), Encyclopedia of Systems Biology. New York, NY : Springer.
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2013 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656093Kuhn, T., Rühlemann, C., Wiedicke-Hombach, M., Schoening, T. & Nattkemper, T.W. (2013). Application of Hydro-Acoustic and Video Data for the Exploration of Manganese Nodule Fields. Gehalten auf der ISOPE OMS.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2013). MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics, 29(19), 2452-2459. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt414.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2542584Held, C., Nattkemper, T.W., Palmisano, R. & Wittenberg, T. (2013). Approaches to automatic parameter fitting in a microscopy image segmentation pipeline: An exploratory parameter space analysis. Journal of Pathology Informatics, 4(2): 5. Medknow. doi:10.4103/2153-3539.109831.
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2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2538625Bonte, A., Kessler, N., Nattkemper, T.W., Goesmann, A., Cecile, T., Mäder, P., Niehaus, K. & Langenkämper, G. (In Press). Einsatz von Protein- und Metabolit-Profiling-Methoden zur Unterscheidung von ökologischem und konventionellem Weizen. Gehalten auf der 12. Wissenschaftstagung Ökologischer Landbau „Ideal und Wirklichkeit – Perspektiven Ökologischer Landbewirtschaftung“.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2494458Schoening, T., Bergmann, M., Purser, A., Dannheim, J., Gutt, J. & Nattkemper, T.W. (2012). Semi-automated image analysis for the assessment of megafaunal densities at the Arctic deep-sea observatory HAUSGARTEN. PLoS ONE, 7(6): e38179. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0038179.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2455753Raza, S.-E.-A., Epstein, D., Nattkemper, T.W. & Rajpoot, N. (2012). RAMTaB: Robust Alignment of Multi-Tag Bioimages. PLoS ONE, 7(2): e30894. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0030894.
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656105Figueiredo Creed, M., Coutinho, R., Reynier, M.V., Cesar Paiva, P., Villas, A.B., Bôas, A.B., Tapajó s de Souza Tâmega, F., Nattkemper, T.W. & Eide, I. (2012). Effects of drill cuttings on a deep water rhodolith bed: an integrated approach. Gehalten auf der V International Rhodolith Workshop.
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2012 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656050Schoening, T., Kuhn, T. & Nattkemper, T.W. (2012). Estimation of poly-metallic nodule coverage in benthic images. Proc. of the 41st Conference of the Underwater Mining Institute (UMI). Gehalten auf der Underwater Mining Institute (UMI).
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2012 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656067Schoening, T., Bergmann, M., Purser, A., Gutt, J., Dannheim, J., Taylor, J., Nattkemper, T.W. & Boetius, A. (2012). The impact of experts’ inter- and intra-observer agreements on computational object classification in images from the deep seafloor of the HAUSGARTEN observatory. Gehalten auf der 13th International Deep-Sea Biology Symposium.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498232Trötschel, C., Albaum, S., Wolff, D., Schröder, S., Goesmann, A., Nattkemper, T.W. & Poetsch, A. (2012). Protein turnover quantification in a multi-labeling approach - from data calculation to evaluation. Molecular & Cellular Proteomics, 11(8), 512-526. American Society for Biochemistry & Molecular Biology (ASBMB). doi:10.1074/mcp.M111.014134.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2536156Zhou, L., Pelengaris, S., Abouna, S., Young, J., Epstein, D., Herold, J., Nattkemper, T.W., Nakhai, H. & Khan, M. (2012). Re-Expression of IGF-II Is Important for Beta Cell Regeneration in Adult Mice. PLoS ONE, 7(9): e43623. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0043623.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783Kölling, J., Langenkämper, D., Sylvie, A., Michale, K. & Nattkemper, T.W. (2012). WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages. Bioinformatics, 28(8), 1143-1150. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts104.
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2012 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 2515700Schoening, T., Bergmann, M., Boetius, A. & Nattkemper, T.W. (2012). Investigation of hidden parameters influencing the automated object detection in benthic images. Gehalten auf der IEEE OCEANS 2012 MTS/IEEE.
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2012 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 2515671Held, C., Nattkemper, T.W. & Wittenberg, T. (2012). Approaches to automatic parameter fitting in a microscopy image segmentation pipeline: An exploratory parameter space analysis. Gehalten auf der Histopathology Image Analysis (HIMA) workshop at MICCAI 2012.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300114Loyek, C., Bunkowski, A., Vautz, W. & Nattkemper, T.W. (2011). Web2.0 paves new ways for collaborative and exploratory analysis of Chemical Compounds in Spectrometry Data. Journal of Integrative Bioinformatics, 8(2), 158. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2011-158.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300063Albaum, S., Hahne, H., Otto, A., Haußmann, U., Becher, D., Poetsch, A., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2011). A guide through the computational analysis of isotope-labeled mass spectrometry-based quantitative proteomics data: an application study. Proteome Science, 9(1): 30. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1477-5956-9-30.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300073Martin, C., Tauchen, A., Becker, A. & Nattkemper, T.W. (2011). A Normalized Tree Index for identification of correlated clinical parameters in microarray data. BioData Mining, 4(1): 2. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1756-0381-4-2.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300082Loyek, C., Khan, M., Rajpoot, N. & Nattkemper, T.W. (2011). BIOIMAX - A Web 2.0 approach for easy exploratory and collaborative access to multivariate bioimage data. BMC Bioinformatics, 12(1): 297. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-12-297.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300092Bergmann, M., Langwald, N., Ontrup, J., Soltwedel, T., Schewe, I., Klages, M. & Nattkemper, T.W. (2011). Megafaunal assemblages from two shelf stations west of Svalbard. Marine Biology Research, 7(6), 525-539. Informa UK Limited. doi:10.1080/17451000.2010.535834.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300232Loyek, C., Kölling, J., Langenkämper, D., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). A Web2.0 Strategy for the Collaborative Analysis of Complex Bioimages (Lecture Notes in Computer Science). In J. Gama, E. Bradley & J. Hollmén (Hrsg.), Advances in Intelligent Data Analysis X: 10th International Symposium, IDA 2011, Porto, Portugal, October 29-31, 2011. Proceedings (S. 258-269). Gehalten auf der IDA (The 10th International Symposium on Intelligent Data Analysis), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-24800-9_25.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656082Purser, A., Ontrup, J., Schoening, T., Thomsen, L., Unnithan, V. & Nattkemper, T.W. (2011). How to squeeze even more from your Terabytes of video data! (S. 3-4). Hermione Newsletter.
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2011 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2315356Bergmann, T., Fiebich, T.M., Nattkemper, T.W. & Anselmetti, D. (In Press). Categorization of 2-photon microscopy images of human articular cartilage into states of arthritis. Gehalten auf der Tagung der Biomedizinischen Technik (BMT), Freiburg, Germany.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300102Arif, M., Rajpoot, N., Technow, U., Chakraborty, T., Fisch, N., Jensen, N.A., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). Quantification of Cell Infection Caused by Listeria monocytogenes Invasion. Journal of Biotechnology, 154(1), 76-83. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.03.008.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2323705Langenkämper, D., Kölling, J., Abouna, S., Khan, M., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2011). TICAL - a web-tool for multivariate image clustering and data topology preserving visualization. Gehalten auf der Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB).
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093532Scherbart, A. & Nattkemper, T.W. (2011). Looking inside self-organizing map ensembles with resampling and negative correlation learning. Neural Networks, 24(1), 130-141. Elsevier BV. doi:10.1016/j.neunet.2010.08.004.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300235Schoening, T., Hans, V. & Nattkemper, T.W. (2011). Towards improved epilepsia diagnosis by unsupervised segmentation of neuropathology tissue sections using Ripley’s-L features (Informatik aktuell). Bildverarbeitung für die Medizin 2011:Algorithmen - Systeme - Anwendungen Proceedings des Workshops vom 20. - 22. März 2011 in Lübeck (S. 44-48). Gehalten auf der Bildverarbeitung für die Medizin (BVM), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-19335-4_11.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929340Burgemeister, S., Nattkemper, T.W., Noll, T., Hoffrogge, R. & Flaschel, E. (2010). CellViCAM-Cell viability classification for animal cell cultures using dark field micrographs. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 149(4), 310-316. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.07.020.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1794419Herold, J., Zhou, L., Abouna, S., Pelengaris, S., Epstein, D., Khan, M. & Nattkemper, T.W. (2010). Integrating semantic annotation and information visualization for the analysis of multichannel fluorescence micrographs from pancreatic tissue. Computerized Medical Imaging and Graphics, 34(6), 446-452. Elsevier BV. doi:10.1016/j.compmedimag.2009.10.004.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929311Gölzhäuser, A., Nattkemper, T.W., Niehaus, K., Pühler, A. & Sauer, M. (2010). BioImaging: Contributions from biology, physics and informatics. Journal of Biotechnology, 149(4), 227-228. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.08.015.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929335Herold, J., Schubert, W. & Nattkemper, T.W. (2010). Automated detection and quantification of fluorescently labeled synapses in murine brain tissue sections for high throughput applications. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 149(4), 299-309. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.03.004.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018390Herold, J., Abouna, S., Zhou, L., Pelengaris, S., Epstein, D.B.A., Khan, M. & Nattkemper, T.W. (2009). A way towards analyzing high-content bioimage data by means of semantic annotation and visual data mining. SPIE Medical Imaging. SPIE. doi:10.1117/12.811710.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018422Ontrup, J., Ehnert, N., Bergmann, M. & Nattkemper, T.W. (2009). BIIGLE - Web 2.0 enabled labelling and exploring of images from the Arctic deep-sea observatory HAUSGARTEN. OCEANS 2009 - Europe. Gehalten auf der OCEANS 2009, Bremen. doi:10.1109/oceanse.2009.5278332.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018427Qureshi, H., Rajpoot, N., Nattkemper, T.W. & Hans, V. (2009). A Robust Adaptive Wavelet-based Method for Classification of Meningioma Histology Images. MICCAI«2009 Workshop on Optical Tissue Image Analysis in Microscopy, Histology, and Endoscopy. Gehalten auf der OPTIMHisE.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314Diaz, N.N., Krause, L., Goesmann, A., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2009). TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach. BMC Bioinformatics, 10(1), 56. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-10-56.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531Albaum, S., Neuweger, H., Fraenzel, B., Lange, S., Mertens, D., Troetschel, C., Wolters, D., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2009). Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments. Bioinformatics, 25(23), 3128-3134. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp568.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783Purser, A., Bergmann, M., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2009). Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study. Marine Ecology Progress Series, 397, 241-251. Inter-Research Science Center. doi:10.3354/meps08154.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591448Saalbach, A., Lange, O., Nattkemper, T.W. & Meyer-Baese, A. (2009). On the application of (topographic) independent and tree-dependent component analysis for the examination of DCE-MRI data (BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL). Biomedical Signal Processing and Control (S. 247-253). ELSEVIER SCI LTD. doi:10.1016/j.bspc.2009.03.010.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018405Loyek, C., Woermann, F.G. & Nattkemper, T.W. (2008). Detection of Focal Cortical Dysplasia in MRI Using Textural Features (Informatik aktuell). In T. Tolxdorff (Hrsg.), Proceedings of BVM 2008 (S. 432-436). Berlin, Heidelberg: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-540-78640-5_87.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O. & Nattkemper, T.W. (2008). Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics, 9(1), 443. BIOMED CENTRAL LTD. doi:10.1186/1471-2105-9-443.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611Wei, N., Flaschel, E., Friehs, K. & Nattkemper, T.W. (2008). A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification. BMC Bioinformatics, 9(1), 449. BIOMED CENTRAL LTD. doi:10.1186/1471-2105-9-449.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587052Martin, C., Diaz, N.N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2008). Hyperbolic SOM-based clustering of DNA fragment features for taxonomic visualization and classification. Bioinformatics, 24(14), 1568-1574. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btn257.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588286Twellmann, T., Meyer-Baese, A., Lange, O., Foo, S. & Nattkemper, T.W. (2008). Model-free visualization of suspicious lesions in breast MRI based on supervised and unsupervised learning. ENGINEERING APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE, 21(2), 129-140. PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD. doi:10.1016/j.engappai.2007.04.005.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783364Krause, L., Diaz, N.N., Goesmann, A., Kelley, S., Nattkemper, T.W., Rohwer, F., Edwards, R.A. & Stoye, J. (2008). Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments. Nucleic Acids Research, 36(7), 2230-2239. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkn038.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018409Martin, C. & Nattkemper, T.W. (2008). A Tree Index to Support Clustering Based Exploratory Data Analysis (Communications in Computer and Information Science). Bioinformatics Research and Development : Second International Conference, BIRD 2008 Vienna, Austria, July 7-9, 2008 Proceedings (S. 1-15). Gehalten auf der BIRD«08 (2nd International Conference on Bioinformatics Research and Development), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-540-70600-7_1.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018435Scherbart, A., Timm, W., Böcker, S. & Nattkemper, T.W. (2008). Improved Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction by Adaptive Feature Weighting. International Conference on Neural Information Processing. Gehalten auf der ICONIP 2008, Auckland, New Zealand. doi:10.1007/978-3-642-02490-0_63.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018381Albaum, S., Neuweger, H., Lange, S., Mertens, D., Runte, K., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2008). ProSE - "Software as a Service" for Quantitative Proteomics (Poster abstract). HUPO 7th Annual World Congress.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018398Herold, J., Friedenberger, M., Bode, M., Rajpoot, N., Schubert, W. & Nattkemper, T.W. (2008). Flexible Synapse Detection in Fluorescence Micrographs by Modeling Human Expert Grading. Proc. of 2008 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. Gehalten auf der ISBI. doi:10.1109/isbi.2008.4541254.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018432Scherbart, A. & Nattkemper, T.W. (2008). The Diversity of Regression Ensembles Combining Bagging and Random Subspace Method. International Conference on Neural Information Processing. Gehalten auf der ICONIP 2008. doi:10.1007/978-3-642-03040-6_111.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630738Pobigaylo, N., Szymczak, S., Nattkemper, T.W. & Becker, A. (2008). Identification of genes relevant to symbiosis and competitiveness in Sinorhizobium meliloti using signature-tagged mutants. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 21(2), 219-231. AMER PHYTOPATHOLOGICAL SOC. doi:10.1094/MPMI-21-2-0219.
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018412Martin, C., Díaz Solórzano, N.N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2007). Genome feature exploration using hyperbolic Self-Organizing Maps. Proceedings of the 6th International Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 2007). Gehalten auf der WSOM 2007, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-wsom2007-140 .
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2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714045Scherbart, A., Timm, W., Böcker, S. & Nattkemper, T.W. (2007). SOM-based Peptide Prototyping for Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction. Proceedings of the 6th Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 07). Gehalten auf der Proceedings of the 6th Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 07), Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-wsom2007-157.
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2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714002Lessmann, B., Wang, Y., Bergmann, M., Kämpfe, T. & Nattkemper, T.W. (2007). Use of automated image analysis to detect changes in megafaunal densities at HAUSGARTEN (79°N west off Svalbard) between 2002 and 2004. Gehalten auf der EMBS - 42nd European Marine Biology Symposium.
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2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714021Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Twellmann, T. (2007). Breast Tumor Classification and Visualization with Machine-Learning Approaches. In M.A. Hayat (Hrsg.), Cancer Imaging - Lung and breast carcinomas (S. 309-321). Amsterdam : Academic Press.
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2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714040Scherbart, A., Timm, W., Boecker, S. & Nattkemper, T.W. (2007). Neural Network Approach for Mass Spectrometry Prediction by Peptide Prototyping (Lecture Notes in Computer Science). In J.M. Sá de (Hrsg.), Artificial Neural Networks – ICANN 2007 - 17th International Conference, Porto, Portugal, September 9-13, 2007, Proceedings, Part II (S. 90-99). Berlin: Springer. doi:10.1007/978-3-540-74695-9_10.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714032Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Kessar, P., Pointon, L., Khazen, M., Leach, M.O. & Degenhard, A. (2007). Multiscale Analysis of MR Mammography Data. Zeitschrift für Medizinische Physik (german journal of medical physics), 17(3), 166-171. Elsevier. doi:10.1016/j.zemedi.2006.11.009.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595739Wei, N., You, J., Friehs, K., Flaschel, E. & Nattkemper, T.W. (2007). In situ dark field microscopy for on-line monitoring of yeast cultures. BIOTECHNOLOGY LETTERS, 29(3), 373-378. SPRINGER. doi:10.1007/s10529-006-9245-x.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593120Wei, N., You, J., Friehs, K., Flaschel, E. & Nattkemper, T.W. (2007). An in situ probe for on-line monitoring of cell density and viability on the basis of dark field microscopy in conjunction with image processing and supervised machine learning. Biotechnology and Bioengineering, 97(6), 1489-1500. Wiley. doi:10.1002/bit.21368.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630749Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Hans, V.H. & Degenhard, A. (2007). A method for linking computed image features to histological semantics in neuropathology. Journal of Biomedical Informatics, 40(6), 631-641. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2007.06.007.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783345Krause, L., McHardy, A.C., Nattkemper, T.W., Pühler, A., Stoye, J. & Meyer, F. (2007). GISMO - gene identification using a support vector machine for ORF classification. Nucleic Acids Research, 35(2), 540-549. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl1083.
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2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018416Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Twellmann, T. (2007). Breas. In M.A. Hayat (Hrsg.), Cancer Imaging - Lung and breast carcinomas (S. 309-324). Academic Press.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714075Deters grosse, H., Timm, W. & Nattkemper, T.W. (2006). REEFSOM - A Metaphoric Data Display for Exploratory Data Mining : journal of new media in neural and cognitive science and education. Brains, Minds and Media, 2(bmm305). Bielefeld Univ., Faculty of Biology.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374232Varini, C., Lessmann, B., Degenhard, A., Hans, V.H. & Nattkemper, T.W. (2006). Visual Exploration of Pathology Images by a Discrete Wavelet Transform Preprocessed Locally Linear Embedding. (Informatik aktuell). In H. Handels, J. Ehrhardt, A. Horsch, H.-P. Meinzer, T. Tolxdorff & Gesellschaft für Informatik (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin (S. 66-70). Berlin : Springer.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714148Twellmann, T., Lange, O., Nattkemper, T.W. & Meyer, A. (2006). Visualizations of Suspicious Lesions in Breast MRI Based on Intelligent Neural Systems (Proceedings of SPIE). Intelligent Computing: Theory and Applications IV. San Diego, CA: SPIE. doi:10.1117/12.668674.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374254Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Huth, J., Loyek, C., Kessar, P., Khazen, M., Pointon, L., Leach, M.O. & Degenhard, A. (2006). Content Based Image Retrieval for Dynamic Time Series Data. Proceedings of BVM (S. 61-65).
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374494Timm, W., Böcker, S., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2006). Peak intensity prediction for pmf mass spectra using support vector regression. Proc. of the 7th International FLINS Conference on Applied Artificial Intelligence (S. 565-572). WORLD SCIENTIFIC. doi:10.1142/9789812774118_0080.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714060Lessmann, B., Hans, V., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2006). Feature space exploration of pathology images using Content-Based Database Visualization (Proceedings of SPIE). Medical Imaging 2006: Image Processing. Gehalten auf der Medical Imaging 2006, San Diego, CA: SPIE. doi:10.1117/12.652101.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714065Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2006). Histologic Characterization of DCE-MRI Tumors with Dimensional Data Reduction (Proceedings of SPIE). Medical Imaging 2006: Image Processing. Gehalten auf der Medical Imaging 2006, San Diego, CA: SPIE. doi:10.1117/12.653273.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600329Miksch, G., Bettenworth, F., Friehs, K., Flaschel, E., Saalbach, A. & Nattkemper, T.W. (2006). A rapid reporter system using GFP as a reporter protein for identification and screening of synthetic stationary-phase promoters in Escherichia coli. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 70(2), 229-236. SPRINGER. doi:10.1007/s00253-005-0060-4.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597259Martin, C., Deters, H. grosse & Nattkemper, T.W. (2006). Fusing biomedical multi-modal data for exploratory data analysis. In S. Kollias (Hrsg.), ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS - ICANN 2006, PT 2 (S. 798-807). Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11840930_83.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598838Pobigaylo, N., Wetter, D., Szymczak, S., Schiller, U., Kurtz, S., Meyer, F., Nattkemper, T.W. & Becker, A. (2006). Construction of a large signature-tagged mini-Tn5 transposon library and its application to mutagenesis of Sinorhizobium meliloti. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 72(6), 4329-4337. AMER SOC MICROBIOLOGY. doi:10.1128/AEM.03072-05.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596731Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2006). Visual exploratory analysis of DCE-MRI data in breast cancer by dimensional data reduction: A comparative study. BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL, 1(1), 56-63. ELSEVIER SCI LTD. doi:10.1016/j.bspc.2006.05.001.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603560Nattkemper, T.W., Arnrich, B., Lichte, O., Timm, W., Degenhard, A., Pointon, L., Hayes, C. & Leach, M.O. (2005). Evaluation of radiological features for breast tumour classification in clinical screening with machine learning methods. ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE, 34(2), 129-139. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.artmed.2004.09.001.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714153Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Degenhard, A., Pointon, L., Kessar, P., Khazen, M. & Leach, M.O. (2005). Clustering approach for wavelet transformed MR image data. Proceedings of the 14th International Conference of Medical Physics (S. 1412). Gehalten auf der 14th International Conference of Medical Physics.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714331Saalbach, A., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2005). Spectral Clustering for Data Categorization based on Self-Organizing Maps. In N. Nasser M. (Hrsg.), Applications of Neural Networks and Machine Learning in Image Processing IX (S. 12-18). Gehalten auf der Applications of Neural Networks and Machine Learning in Image Processing IX, San Jose, CA.
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2005 | Monographie | PUB-ID: 2714309Bettenworth, F., Miksch, G., Fries, K., Flaschel, E., Saalbach, A., Eickmeyer, J. & Nattkemper, T.W. (2005). An Online Monitoring System for the Screening of Stationary-Phase Promoters in E. Coli using GFP as a Reporter Protein.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374666Twellmann, T., Lichte, O., Saalbach, A., Wismüller, A. & Nattkemper, T.W. (2005). An Adaptive Colour Scale for Comparison of Pseudo Colouring Techniques for DCE-MRI Data. Gehalten auf der Workshop für Bildverarbeiteung für die Medzin, Workshop für Bildverarbeituing für die Medizin 2005.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374546Saalbach, A., Twellmann, T., Nattkemper, T.W., Wismüller, A., Ontrup, J. & Ritter, H. (2005). A hyperbolic topographic mapping for proximity data. Proc. of the IASTED International Conference of Artificial Intelligence and Applications (S. 106-111).
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714263Twellmann, T., Lichte, O. & Nattkemper, T.W. (2005). An Adaptive Tissue Characterisation Network for Model-Free Visualisation of Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Image Data. IEEE Transactions on Medical Imaging, 24(10), 1256-1266. IEEE. doi:10.1109/TMI.2005.854517.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714340Nattkemper, T.W. & Wismüller, A. (2005). Tumour feature analysis with unsupervised machine learning. Medical Image Analysis, 9(4), 344-351. Elsevier. doi:10.1016/j.media.2005.01.004.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374187Saalbach, A., Ontrup, J., Ritter, H. & Nattkemper, T.W. (2005). Image fusion based on topographic mappings using the hyperbolic space. Information Visualization, 4(4), 266-275. Palgrave Macmillan. doi:10.1057/palgrave.ivs.9500106.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603030Nattkemper, T.W. & Wismuller, A. (2005). Tumor feature visualization with unsupervised learning. MEDICAL IMAGE ANALYSIS, 9(4), 344-351. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.media.2005.01.004.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946602Wei, N., Flaschel, E., Saalbach, A., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2005). Reagent-free automatic cell viability determination using neural networks based machine vision and dark-field microscopy in Saccharomyces cerevisiae. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 6, 6305-6308. IEEE. doi:10.1109/iembs.2005.1615939.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602344Prank, K., Schulze, E., Eckert, O., Nattkemper, T.W., Bettendorf, M., Maser-Gluth, C., Sejnowski, T.J., Grote, A., Penner, E., von zur Muhlen, A. & Brabant, G. (2005). Machine learning approaches for phenotype-genotype mapping: predicting heterozygous mutations in the CYP21B gene from steroid profiles. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY, 153(2), 301-305. BIO SCIENTIFICA LTD. doi:10.1530/eje.1.01957.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601519Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2005). ISOLLE: Locally linear embedding with geodesic distance (Lecture notes in computer science ; 3721 : Lecture notes in artificial intelligence). In A. Jorge (Hrsg.), KNOWLEDGE DISCOVERY IN DATABASES: PKDD 2005 (S. 331-342). Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11564126_34.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601848Miksch, G., Bettenworth, F., Friehs, K., Flaschel, E., Saalbach, A., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2005). Libraries of synthetic stationary-phase and stress promoters as a tool for fine-tuning of expression of recombinant proteins in Escherichia coli (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY). Journal of Biotechnology (S. 25-37). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2005.04.027.
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2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601906Lessmann, B., Degenhard, A., Kessar, P., Pointon, L., Khazen, M., Leach, M.O. & Nattkemper, T.W. (2005). SOM-based wavelet filtering for the exploration of medical images (Lecture notes in computer science). In W. Duch (Hrsg.), ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS: BIOLOGICAL INSPIRATIONS - ICANN 2005, PT 1, PROCEEDINGS (S. 671-676). Berlin, Heidelberg: SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11550822_104.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602177Twellmann, T., Lichte, O. & Nattkemper, T.W. (2005). An adaptive tissue characterization network for model-free visualization of dynamic contrast-enhanced magnetic resonance image data. IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING, 24(10), 1256-1266. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/TMI.2005.854517.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1666510Twellmann, T., Saalbach, A., Gerstung, O., Leach, M.O. & Nattkemper, T.W. (2004). Image fusion for dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging. Biomed Eng Online, 3(1): 35. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/1475-925X-3-35.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946892Nattkemper, T.W. (2004). Automatic segmentation of digital micrographs: a survey. Stud Health Technol Inform, 107(Pt 2), 847-851. IOS Press {[u.a.].
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946838Twellmann, T., Saalbach, A., Müller, C., Nattkemper, T.W. & Wismuller, A. (2004). Detection of suspicious lesions in dynamic contrast enhanced MRI data. The 26th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, 1, 454-457. IEEE.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714397Kämpfe, T., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (2004). AQUISAR: Image Retrieval in Underwater Webcam Images. WIAMIS 2004 : 5th International Workshop on Image Analysis for Multimedia Interactive Services. Lisboa, Portugal.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714346Lessmann, B., Twellmann, T., Degenhard, A., Nattkemper, T.W. & Leach, M.O. (2004). Wavelet features for improved tumour detection in DCE-MRI. In D. Rueckert, J. Hajnal & G.-Z. Yang (Hrsg.), Proceedings of Medical Image Understanding and Analysis (MIUA) (S. 93-96). Gehalten auf der 8th Medical Image Understanding and Analysis, London, UK: BMVA.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714369Varini, C., Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Wismüller, A. (2004). Breast MRI data analysis by LLE. Proceedings of International Joint Conference on Neural Networks (S. 2449-2554). Gehalten auf der International Joint Conference on Neural Networks 2004, Montreal, Canada: IEEE. doi:10.1109/IJCNN.2004.1381012.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714465Nattkemper, T.W. (2004). Multivariate image analysis in biomedicine: a methodological review. Journal of Biomedical Informatics, 37(5), 380-391. Elsevier.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714382Saalbach, A., Twellmann, T., Nattkemper, T.W., White, M.J., Khazen, M. & Leach, M.O. (2004). Visualization of Multivariate Image Data using Image Fusion and Perceptually Optimized Color Scales based on sRGB (Proceedings of SPIE). In J. Robert L. Galloway (Hrsg.), Medical Imaging 2004: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display. Gehalten auf der Medical Imaging 2004: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display, San Diego, CA: SPIE. doi:10.1117/12.534419.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375262Varini, C., Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Wismüller, A. (2004). Visualisation of Breast Tumour DCE-MRI Data using LLE. Proc. Medical Image Understanding and Analysis (MIUA) (S. 97-100). BMVA.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606041Nattkemper, T.W. (2004). Multivariate image analysis in biomedicine. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 37(5), 380-391. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2004.07.010.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017550Nattkemper, T.W., Schubert, W., Hermann, T. & Ritter, H. (2004). A Hybrid System for Cell Detection in Digital Micrographs. In B. Tilg (Hrsg.), Biomedical Engineering, Proc.. Gehalten auf der BIOMED 2004, Innsbruck, Austria: ACTA Press.
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2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017545Nattkemper, T.W., Hermann, T., Schubert, W. & Ritter, H. (2003). Look & Listen: Sonification and Visualization of Multiparameter Micrographs. Engineering in Medicine and Biology Society. Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE (S. 1311-1314). Cancun, Mexico: IEEE.
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2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714487Twellmann, T., Saalbach, A., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (2003). Artificial Neural Networks Machine Learning Approaches for Multivariate Image Analysis. Proceedings Linking mathematical and biological models in cancer research. Gehalten auf der International Conference: Linking mathematical and biological models in cancer research, Magdeburg.
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2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714496Ontrup, J., Nattkemper, T.W., Gerstung, O. & Ritter, H. (2003). A MeSH Term based Distance Measure for Document Retrieval and Labeling Assistance. Proc. of EMBC2003. Gehalten auf der 25th Annual Int. Conf. of the IEEE Engineering in Med. and Biol. Soc., Cancun, Mexico: IEEE EMBS.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612741Nattkemper, T.W., Twellmann, T., Ritter, H. & Schubert, W. (2003). Human vs. machine: evaluation of fluorescence micrographs. Computers in Biology and Medicine, 33(1), 31-43. Pergamon-Elsevier. doi:10.1016/S0010-4825(02)00060-4.
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1613503Nattkemper, T.W., Wersing, H., Schubert, W. & Ritter, H. (2002). A neural network architecture for automatic segmentation of fluorescence micrographs (NEUROCOMPUTING). Neurocomputing (S. 357-367). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/S0925-2312(01)00642-7.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1886441Schubert, W., Friedenberger, M., Haars, R., Bode, M., Philipsen, L., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (2002). Automatic recognition of muscle invasive T-lymphocytes expressing dipeptidyl-peptidase IV (CD26) and analysis of the associated cell surface phenotypes. Journal of Theoretical Medicine, 4(1), 67-74. Hindawi Limited. doi:10.1080/10273660290015189.
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2001 | Datenpublikation | PUB-ID: 2763993Hermann, T. & Nattkemper, T.W. (2001). Multi-Channel Image Data Analysis using Sonification. Bielefeld University. doi:10.4119/unibi/2763993.
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2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304068Nattkemper, T.W. (2001). A neural network-based system for high throughput fluorescence micrograph evaluation. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375220Twellmann, T., Nattkemper, T.W., Schubert, W. & Ritter, H. (2001). Cell Detection in Micrographs of Tissue Sections Using Support Vector Machines. Proc. of. ICANN 2001 Workshop on Kernel and Subspace Methods for Computer Vision.
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2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1617028Nattkemper, T.W., Ritter, H. & Schubert, W. (2001). A neural classifier enabling high-throughput topological analysis of lymphocytes in tissue sections. IEEE TRANSACTIONS ON INFORMATION TECHNOLOGY IN BIOMEDICINE, 5(2), 138-149. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/4233.924804.
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2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1886493Kämpfe, T., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (2001). Combining Independent Component Analysis and Self-organizing Maps for Cell Image Classification (LNCS). In B. Radig & S. Florczyk (Hrsg.), Pattern Recognition (S. 262-268). Gehalten auf der 23. DAGM Symposium Pattern Recognition, Berlin: Springer.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017374Hermann, T., Nattkemper, T.W., Schubert, W. & Ritter, H. (2000). Sonification of Multi-Channel Image Data. In V. Falavar (Hrsg.), Proc. of the Mathematical and Engineering Techniques in Medical and Biological Sciences (S. 745-750). Gehalten auf der METMBS 2000, Las Vegas: CSREA Press.
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2000 | Datenpublikation | PUB-ID: 2701103Hermann, T., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (2000). Supplementary Material for "Sonification of Multi-Channel Image Data". Bielefeld University. doi:10.4119/unibi/2701103.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375211Nattkemper, T.W., Wersing, H., Schubert, W. & Ritter, H. (2000). A Neural Network Architecture for Automatic Segmentation of Fluorescence Micrographs. In M. Verleysen (Hrsg.), Proc. of the 8th Europ. Symp. on Art. Neur. Netw. (ESANN). Gehalten auf der 8th European Symposium on Artificial Neural Networks.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374799Nattkemper, T.W., Wersing, H., Schubert, W. & Ritter, H. (2000). Fluorescence Micrograph Segmentation by Gestalt-Based Feature Binding. Proc. of the Int. Joint Conf. on Neur. Netw. (IJCNN) (S. 248-254). Como, Italy.
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2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714744Nattkemper, T.W., Wersing, H., Schubert, W. & Ritter, H. (2000). Automatic Evaluation of Multi-Parameter Fluorescence Micrographs with a Neural Network Architecture. Proceedings of the International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences, METMBS '00 (S. 739-744). Gehalten auf der International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences, Las Vegas, USA.
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1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374786Nattkemper, T.W., Ritter, H. & Schubert, W. (1999). Extracting Patterns of Lymphocyte Fluorescence from Digital Microscope Images. Intelligent Data Analysis in Medicine and Pharmacology (IDAMAP 99), Workshop Notes (S. 79-88). AMIA 1999, Washington DC.
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1998 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2714985Heidemann, G., Nattkemper, T.W. & Ritter, H. (1998). Farbe und Symmetrie für die datengetriebene Generierung prägnanter Fokuspunkte (Koblenzer Schriften zur Informatik). In V. Rehrmann (Hrsg.), 4. Workshop Farbbildverarbeitung (S. 65-71). Koblenz: Fölbach.
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1996 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2715168Heidemann, G., Nattkemper, T.W., Menkhaus, G. & Ritter, H. (1996). Blicksteuerung durch präattentive Fokussierungspunkte (Proceedings in artificial intelligence). In B. Mertsching (Hrsg.), Aktives Sehen in technischen und biologischen Systemen : Beiträge zum Workshop der GI-Fachgruppe 1.0.4 Bildverstehen, 3. und 4. Dezember 1996, Hamburg (S. 109-116). Gehalten auf der Workshop der GI-Fachgruppe 1.0.4 Bildverstehen, Sankt Augustin: Infix.